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Sebastian Armando Gil De Freitas AMINOÁCIDOS Son los monómeros estructurales de las proteínas. Todas las proteínas contienen los mismos 20 aminoácidos en diferentes combinaciones Se unen a través de enlaces peptídicos IMPORTANCIA BIOLÓGICA Y FUNCIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS Son precursores de: ➢ Hormonas (insulina, glucagón, hormona del crecimiento, tiroxina, triyodotironina). Todas estas hormonas son de naturaleza proteíca. Existen otras hormonas que provienen, por ejemplo, del colesterol (hormonas esteroideas) ➢ Metabolitos intermediarios Los metabolitos intermediarios son sustratos que se encuentran en vías metabolicas especificas. ➢ Neurotransmisores como la serotonina (triptofano), GABA (ácido G-aminobutírico) La serotonina es el neurotransmisor encargado de la felicidad. Su precursor es el triptofano. El GABA es un neurotransmisor inhibidor. Sebastian Armando Gil De Freitas ESTRUCTURA GENERAL Los aminoácidos comparten una estructura básica que consiste en un átomo central de carbono, también llamado carbono alfa (α), unido a un grupo amino (NH2), un grupo carboxilo (COOH) y un átomo de hidrógeno. Cada aminoácido también tiene otro átomo o grupo de átomos unidos al átomo central, conocido como el grupo R, que determina la identidad del aminoácido. QUIRALIDAD Es la propiedad de un objeto de no ser superponible con su imagen especular. Está asociada a la presencia de carbonos asimétricos. En su mayoría, los aminoácidos son quirales Si el carbono α está enlazado a dos o más grupos sustituyentes iguales, entonces el aminoácido no es quiral La glicina es el único aminoácido aquiral ISOMERÍA ESTRUCTURAL Los isómeros son compuestos que tienen la misma composición atómica, pero diferente fórmula estructural. El número de isómeros depende de los centros quirales. Número de isómeros = 2n, donde n = número de centros quirales Los aminoácidos solo tienen un par de isómeros porque tienen un solo centro quiral Sebastian Armando Gil De Freitas PROYECCIÓN DE FISHER Emil Fischer (químico alemán) sugirió un método basado en la proyección de un átomo de carbono tetraédrico sobre una superficie plana. Según Fisher: - Los átomos de carbono deben estar alineados. - Las líneas horizontales se dirigen hacia afuera del papel (se representan con una línea oscura) y las verticales hacia adentro (se representan con una línea pespunteada). - La parte más oxidada está hacia arriba y la más reducida hacia abajo. Los aminoácidos pueden existir en cualquier forma de sus imágenes especulares. Enantiómeros: imágenes especulares no superponibles L: levógiro. El grupo amino se orienta hacia la izquierda D: dextrogiro. El grupo amino se orienta hacia la derecha Si coloco mi mano izquierda sobre el L-aminoácido, mi pulgar se orientará hacia donde se orienta el grupo amino. Lo mismo ocurre si coloco mi mano derecha sobre el D-aminoácido En las proteínas, los aminoácidos se encuentran en su configuración L. ISOMERÍA ÓPTICA Determinada por Louis Pasteur (químico y bacteriólogo francés) Los compuestos tienen la capacidad de desviar el plano de luz polarizada hacia la derecha (dextrógiros: d) o hacia la izquierda (levógiros: l) l: levógiro. Desvía el plano de la luz polarizada hacia la izquierda d: dextrogiro. Desvía el plano de la luz polarizada hacia la derecha Para valorar este parámetro, se utiliza el polarímetro. Cuenta con una fuente luminosa, un polarizador, un tubo y una escala. El polarizador genera un haz de luz que pasa por el tubo (donde se encuentra el aminoácido o sustancia opticamente activa) y la escala indica el grado de desviación de la luz. Sebastian Armando Gil De Freitas Un aminoácido L no necesariamente es l al igual que un aminoácido D no es estrictamente d. CLASIFICACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS Aminoácidos hidrofóbicos con grupos R no polares o alifáticos. Aminoácidos con grupos R aromáticos Aminoácidos polares con grupos R sin carga Aminoácidos polares con grupos R cargados positivamente o básicos Aminoácidos polares con grupos R cargados negativamente o ácidos Sus cadenas laterales contienen únicamente hidrógeno y carbono. Sus cadenas laterales contienen un átomo electronegativo que acapara los electrones (carácter polar) Sus cadenas laterales están cargadas positivamente Sus cadenas laterales se encuentras cargadas negativamente y son ácidas. Glicina, alanina, valina, leucina, isoleucina, metionina y prolina. Fenilalanina, tirosina y triptófano Serina, treonina, cisteína, asparagina y glutamina. Lisina, arginina, histidina Aspartato (ácido aspartico) , glutamato (ácido glutamico) El grupo R de la prolina es una cadena hidrocarbonada. Se enlaza con el grupo alfa amino y se denomina iminoácido. Estos aminoácidos le confieren a las proteínas la capacidad de abosorber luz UV a una longitud de onda de 280 nm. La serina y la treonina poseen un grupo OH en su grupo R que les confiere el carácter polar. La cisteína tiene un grupo sulfhidrilo Gracias a él se genera el puente disulfuro. La asparagina y la glutamina presentan en su grupo R una carboxamida terminal. La arginina tiene un grupo guanidinio, mientras que la histidina tiene un grupo imidazol El aspartato y el glutamato se diferencian de la asparagina y la glutamina porque poseen un grupo carboxilo, en lugar de una carboxamida en el grupo R. Sebastian Armando Gil De Freitas Puente disulfuro: unión covalente entre dos átomos de azufre. Este tipo de enlaces se forman por la oxidación de dos grupos sulfhidrilo (SH), cada uno perteneciente a una molécula de cisteína. AMINOÁCIDOS NO COMUNES Son generados por la modificación de los aminoácidos comunes cuando se incorporan en una proteína. Algunos son: 4-Hidroxiprolina Proviene de: prolina Se hidroxila el carbono 4 de la prolina 5-Hidroxilisina Proviene de: lisina Se hidroxila el carbono 5 de la prolina Es un componente del colágeno 6-N-Metilisina Provienen de: lisina Presenta un grupo metilo en el carbono 6 Es constituyente de la miosina γ-Carboxiglutamato Proviene de: gluitamato Presenta un grupo carboxilo desprotonado en el carbono γ Forma parte de la protrombina Selenocisteína Es considerado el aminoácido 21. Proviene de: serina (por aminoacilación de su ARNt) Se encuentra en bacterias o arqueobacterias Ornitina Citrulina Provienen de: arginina (en el caso de la ornitina) y la rnitina (en el caso de la citrulina) Son de gran importancia en el ciclo de la urea Se localizan en el ciclo de la urea AMINOÁCIDOS ESENCIALES Son aquellos que no pueden ser sintetizados por el organismo, por lo que deben ser suministrados a través de los alimentos. Sebastian Armando Gil De Freitas IONIZACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS Los aminoácidos son moléculas anfóteras. Son disociables. Sus grupos amino y carboxilo terminal pueden aceptar y perder protones. Todos los aminoácidos se disocian, pero lo hacen a distintos pH Zwitterion: forma iónica dipolar de los aminoácidos que poseen cargas formalmente positivas y negativas, lo que lo hace eléctricamente neutro, es decir su carga neta es 0. Sebastian Armando Gil De Freitas El ácido: A pH ácido: predomina su forma completamente protonada A pH básico: predomina su forma completamente desprotonada Siempre se desprotona primero el grupo carboxilo PK Es el valor del pH a la cual las concentraciones de las formas protonadas y desprotonadas son iguales. pK1: valor de pH en el cual las concentraciones de las formas protonadas y desprotonadas del grupo carboxilo son iguales. pK2: valor de pH en el cual las concentraciones de las formas protonadas y desprotonadas del grupo amino son iguales. CLASIFICACIÓN DE LOS ÁCIDOS SEGÚN SU IONIZACIÓN Los aminoácidos se pueden clasificar, según su ionización,en: - Aminoácidos con grupos R ionizables - Aminoácidos con grupos R no ionizables Aminoácidos con grupos R no ionizables: solo sus grupos amino y carboxilo terminal son ionizables, por lo que solo poseen dos valores de pk. Todos los aminoacidos alifaticos (no polares) pertenecen a esta clasificación Aminoácidos con grupos R ionizables: poseen tres valores de pk, debido a que tienen tres posibles grupos ionizables. Ejemplo: lisina, arginina, histidina, aspartato, glutamato, tirosina y cisteína. Sebastian Armando Gil De Freitas Las cargas eléctricas se denotan con los signos + y -. Lo que no tiene signo, no tiene carga TITULACIÓN Es una técnica que se utiliza para determinar la cantidad de ácido en una solución determinada. Curva de titulación: representación gráfica de la variación del pH mediante la adición de equivalentes OH en una solución. Permite medir el pk de los grupos ionizables de un aminoácido, calcular el punto isoeléctrico del aminoácido y determinar formas ionizables del aminoácido y carga eléctrica. Punto isoeléctrico: valor de pH en el cual una sustancia anfotérica posee carga neta igual a cero. Es el valor de pH en el cual el aminoácido se encuentra totalmente en su forma zwitterion. Es el promedio de los pK CURVA DE TITULACIÓN PARA AMINOÁCIDOS CON GRUPOS R NO IONIZABLES 𝒑𝑰 = 𝒑𝑲𝟏 + 𝒑𝒌𝟐 𝟐 CURVA DE TITULACIÓN PARA AMINOÁCIDOS CON GRUPOS R IONIZABLES 𝒑𝑰 = 𝒑𝑲𝟏$𝒑𝒌𝑹 𝟐 Las curvas de pK1 y pKR casi se solapan. Esto es una característica de aminoácidos ácidos o aminoácidos con grupos R cargados negativamente. Sebastian Armando Gil De Freitas p 𝑰 = 𝒑𝑲𝟐$𝒑𝒌𝑹 𝟐 Las curvas de pK2 y pKR se solapan. Esto es una característica de aminoácidos básicos o aminoácidos con grupos cargados positivamente. 𝒑𝑰 = 𝒑𝑲𝟐$𝒑𝒌𝑹 𝟐 La histidina es un aminoácido básico que posee un grupo R ionizable con pK cercano al pH neutro (pH fisiológico) La curva tiene un comportamiento similar al de los aminoácidos con grupos R no ionizables La presencia de la histidina en las proteínas hace que estas no se desestabilicen de manera sencilla. La histidina es el aminoácido buffer por excelencia de las proteínas, ya que a pH fisiológico la histidina tiene una zona buffer y puede amortiguar los cambios de pH. El punto isoeléctrico se calcula tomando en cuenta los valores del pK anterior y del pK posterior a la forma zwitterion del aminoácido El pK1 siempre se corresponde con el grupo carboxilo. El pK2 lo hace con el grupo amino y el pKR con el grupo R Si el aminoácido tiene un grupo carboxilo en su cadena lateral, es ácido. Si el aminoácido tiene un grupo amino en su cadena lateral, es básico. Si el aminoácido tiene una cadena carbonada en su cadena lateral, es no polar. Sebastian Armando Gil De Freitas FORMACIÓN DEL ENLACE PEPTÍDICO Es un enlace covalente fuerte que se produce entre: o El grupo alfa amino de un aminoácido o El grupo alfa carboxilo de otro aminoácido § El OH del grupo carboxilo se une a uno de los H del grupo amino para formar una molécula de agua que se libera. § La unión se da entre el carbono del grupo carboxilo y el nitrógeno del grupo amino CARACTERÍSTICAS DEL ENLACE PEPTÍDICO § Es un enlace de tipo amida. § Puede considerarse como un hibrido de resonancia: En la formación del enlace peptídico participan dos átomos sumamente electronegativos, el oxígeno y el nitrógeno. Estos átomos atraen los electrones hacia si. Existe entonces un flujo de electrones. Resonancia: sistema de doble enlace entre átomos de una molécula, que gracias a la distribución de sus electrones, genera mayor estabilidad que con un enlace simple. • Es coplanar. Debido a su resonancia, los enlaces carboxilo y amino son paralelos, lo que genera poca posibilidad de giro alrededor del enlace C—N. • La incapacidad de giro le confiere cierta rigidez. • Por su carácter coplanar puede adquirir dos configuraciones posibles (Cis o Trans) Cis: los átomos se orientan hacia un mismo plano de la estructura. Trans: los átomos se orientan hacia planos distintos de la estructura. Para evitar repulsión repulsión e inactividad en una proteína, se favorece la forma trans. El enlace peptídico tiene carácter parcial de doble enlace (60%) porque hay un par de electrones fluyendo entre el oxígeno y el nitrógeno. Oligopéptido: 2-15 aa Péptido: 15-100 aa Proteína: >100 aa Cuando los aminoácidos forman las proteínas, se denominan residuos.
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