Acidos_nucleicos_pptx

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Componentes
3 componentes principales
Base Nitrogenada
Pentosa 
Grupo fosfato
Pentosas
Ribosa
Desoxirribosa
Ambos con B-furanosas. No es un anillo plano
3
Bases Nitrogenadas
Purinas
Doble anillo
Pirimidinas
Anillo simple
Enlace N-β Glucosídico
Unión con el carbono 1’ de la pentosa 
Purinas: N-9
Pirimidinas: N-1
Nucleósidos
Enlace entre pentosa y base nitrogenada
Nucleótidos 
(Desoxi)ribonucleósidos 5’ - Monofosfato
Enlace fosfodiéster 
Puentes de grupo fosfato en hidroxilo 5’ de un nucleótido e hidroxilo 3’ de otro
ARN
Tipos de ARN
ARNno codificante. (sARN)
Son fragmentos de ARN que no codifican para proteína pero que tienen una función específica, principalmente catalítica.
Ejemplos:
	rARN
	tARN
	RNasa P (maduración de tARN)
	SRP (transporta proteínas al ER)
		
ARN
Tipos de ARN
Ribosomal. (rARN)
Moléculas que forman parte de los ribosomas. Los ribosomas son 
Complejos formados por
ARN y proteínas.
ARN de hebra sencilla
Proteína
ARN
Tipos de ARN
RNA de Transferencia. (tARN)
Moléculas que transportan aminoácidos activados a los ribosomas para la elongación de la proteína naciente.
ARN
Tipos de ARN
RNA mensajero. (mARN)
Moléculas que codifican la secuencia de aminoácidos en la proteína a sintetizar.
Síntesis de proteínas
Cromosoma eucariótico
EL CROMOSOMA EUCARIOTA
El cromosoma en metafase es el más apropiado para el estudio de su morfología.
Técnicas especiales según se trate de material vegetal o animal.
El cromosoma eucariótico
CROMOSOMA EUCARIOTA
Las cromátidas: Son estructuras idénticas en morfología e información. Cada una contiene una molécula de ADN.
	
El centrómero: Es la región que se fija al huso acromático y responsable de la segregación en la mitosis y meiosis. Constricción primaria, que divide a cada cromátida del cromosoma en dos brazos. Está compuesto de proteínas de unión a los microtúbulos y puede poseer gran cantidad de ADN repetitivo
Brazos: porciones de cromátida comprendidas entre el centrómero y el extremo del cromosoma.
Cromosomas con satélite
EL CROMOSOMA EUCARIOTA
Constricción secundaria: se ubican a lo largo del cromosoma. No existen en todos los cromosomas, pero son constantes en los que las portan.
Telómero: es la región más extrema del cromosoma.
Le dan estabilidad al cromosoma. También son importantes en el ordenamiento de los cromosomas y la relación con la membrana nuclear. 
Tiene un rol en el apareamiento cromosómico y la arquitectura tridimensional del núcleo. También en el envejecimiento celular.
El organizador nucleolar: En algunos cromosomas se encuentra la región del organizador nucleolar (NOR). El NOR es la región del cromosoma donde están localizados los genes que codifican para el RNA ribosómico, esta íntimamente relacionada con el nucléolo (donde se producen los ribosomas) 
El satélite (SAT): Es el segmento del cromosoma entre el organizador nucleolar y el telómero correspondiente. Sólo poseen satélite aquellos cromosomas que tienen NOR. 
CLASIFICACIÓN DE ACUERDO CON LA POSICIÓN DEL CENTRÓMERO
Telocéntrico
Levan en 1964, propuso cálculos para determinar la posición del centrómero (d, r e ic)
Cromosoma eucariótico
El cromosoma eucariótico atraviesa por ciclos de condensación y descondensación durante la división celular.
En la interfase, los cromosomas están desenrollados, no se observan como tales sino como cromatina. 
Cromatina y cromosomas son dos estadios funcionales de una misma sustancia. 
Existe una relación entre el grado de enrollamiento de la fibra y la capacidad del ADN de transcribirse en ARN y de replicarse.
En profase se pueden ver los cromómeros, que son enrrollamientos de la fibra de cromatina que se encuentra recorriendo el eje de los cromosomas. Dispuestos linealmente, le dan al cromosoma un aspecto de collar con cuentas.
Composición química de los cromosomas:
Cromatina y cromosomas son un conjunto complejo de ADN, ARN y proteínas: Histónicas (PH)y no histónicas (PNH).
El contenido de ARN y PNH varía en las diferentes células.
ADN y PH se encuentran siempre en una relación 1:1 de peso con el ADN.
Existen cinco clases de PH: H1, H2A, H2B, H3, H4. .
Son básicas porque contienen aproximadamente entre un 10 y un 20% de aminoácidos básicos como arginina y lisina.
H2A, H2B, H3, H4 son semejantes en diversas especies.
H1 es distinta en las especies diferentes y hasta en los distintos tejidos de la misma especie
	HISTONAS	PESO 
MOLECULAR	AMINOACIDOS	 VARIACIÓN
 EN LAS 
ESPECIES
	H1	20.000 Da	Ricas en lisina	Amplia
	H2A	13.700 Da	Relat. Ricas en lisina	Relativ 
conservadas
	H2B	13.700 Da		
	H3	15.700 Da	Ricas en arginina	Muy conservadas
	H4	11.200 Da		
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Estructura de la cromatina
Varios autores consideran solo la asociación del ADN y las histonas formando una estructura molecular definida: los nucleosomas
Nucleosoma: médula y ligador.
Médula: octámero de proteínas: H2A, H2B, H3, H4.
Existe un modelo de ensamblaje de las Histonas
Ligador: ADN.
La H1 está relacionada con el plegamiento de la fibra de cromatina
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 Doble hélice 
Nucleosoma (Octámero de Histonas) 
Solenoide (Histona H1)
De ADN a cromosoma metafásico
Cromosoma metafásico
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DNA 
Nucleosoma
Fibra cromatina (Solenoide)
Andamio (Scaffold) 
Bucles de cromatina
Cromátida
ADN
Son enzimas que enrollan y desenrollan el ADN equilibrando fuerzas de torsión introducidas en las hebras para controlar la síntesis de proteínas y facilitar la replicación.
Topoisomerasas
Forma tridimensional del DNA
Isidro Espinosa
A01228189
Debido a que el DNA es una molécula muy flexible la rotación es posible.
Causas de la rotación
Rotación alrededor de los diferentes tipos de enlace azúcar-fosfato en la columna. 
La fluctuación térmica que puede producir flexión, estiramiento y la separación de hebra.
Debido a las restricciones estéricas, las purinas solo pueden tener dos conformaciones estables con respecto a la desoxirribosa, llamadas syn y anti.
Las pirimidinas están restringidas a la conformación anti por su interferencia estérica entre el azúcar y el oxígeno carbonilo. 
Variantes estructurales del DNA
La estructura de Watson-Crick es también llamada B-DNA. 
Esta forma es la más estructuralmente estable para una secuencia aleatoria de DNA sobre condiciones fisiológicas. 
		A-Form	B-Form	Z-Form
	Sentido de la hélice	Dextrógira	Dextrógira 	Levógira
	Pares de base por vuelta de hélice	11	10.5	12
	Inclinación respecto a la base de la hélice	20o	6o	7o
	Conformación del enlace glicosídico	Anti	Anti	Anti para pirimidinas;
Syn para purinas
Palíndromo: secuencia de DNA o RNA que es lo mismo leída de 5´ a 3´ en una hebra o 5´a 3´ en la hebra complementaria con la que forma la doble hélice. 
Espejo repetido: repetición inversa en una hebra individual del DNA. 
Los palíndromos pueden adquirir una forma de pasador o de cruz.
La secuencia de espejo repetido no tiene secuencias complementarias en la misma hebra y por lo tanto no pueden adquirir forma de pasador o de cruz.
Algunas estructuras pueden tener tres o cuatro hebras de DNA. 
Los nucleótidos pueden formar puentes de hidrógeno adicionales, en especial con los grupos funcionales del surco mayor.
Cuatro hebras de DNA forman un tetraplex, sólo ocurre cuando las secuencias de DNA tienen una gran proporción de residuos de guanosina.
Metilación de bases de DNA 
Metilación enzimática 
A y C más frecuentes 
1. Mecanismo de defensa celular: distingue DNA propio y al otro lo marca con un metilo para después destruirlo
2. Sistema de reparación de bases incorrectas: 
a) Metilación de residuos de adenosina: N6 metiladenosina, Sistema de reparación en replicación 
b) Metilación de citosina: 5-metilcitosina, estructura Z.
Metilación: suprime migración transposones. 
Método electroforético para secuenciación de cadenas largas 
Separación de hebras de DNA, difieren en 1 solo nucleótido 
Poliacrilamida: matriz de geles de DNA corto 
Agarosa: DNA largo
Método Sanger & Maxamy método de Gilbert
Principios: 
A) generan 4 grupos de fragmentos modificados 
B) Reacción para generar cada grupo es específica x base
C) longitud de fragmentos = posición de la base en la secuencia. 
Método de Sanger
Síntesis enzimática de una hebra de DNA complementaria a la analizada con DNA polimerasas
Cebador (oligonucleótido corto) marcado con radiactividad detiene crecimiento.
Didesoxinucleótidos 
Secuenciación automática: didesoxinucleótidos marcados con fluoróforos que emiten luz de diferente color. 
Obtención de secuencia
-Proyecto del Genoma Humano
Síntesis química de oligonucleótidos para la síntesis de ácidos nucleicos 
Otras funciones 
Transportadores de energía.
Hidrólisis de nucleosidos trifosfato: energía para impulsar reacciones químicas
Ribosa con 3 grupos fosfato: α, β, γ (anhidros de ácido fosfórico)
Ejemplo: ATP 
Nucleótidos de adenina: componentes de cofactores de enzimas
Moléculas reguladoras: captan señales extracelulares con receptores
Receptor: segundo mensajero, es un nucleótido
Cambios adaptativos en el interior de la célula 
AMP cíclico adenosina 3’,5’-monofosfato cíclico: formado por ATP en reacción catalizada por adenilil ciclasa 
En respuesta a hormonas y otras señales químicas.