TAXONOMÍA Y EVOLUCIÓN BACTERIANA

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TAXONOMÍA Y EVOLUCIÓN BACTERIANA
Taxonomía. Clasificación Biológica:
En 1969 Whittaker propuso sistema de clasificación de los seres vivos en 5 reinos, según:
Nivel de organización celular: Unicelular o pluricelular
Tipo celular: Procariota o eucariota
Nutrición: autótrofo o heterótrofo
Tipo de reproducción: sexual o asexual
5 Reinos…
Reino Monera: 	Cel. Procariota- Unicelulares- asexual (fisión binaria)- heterótrofos/autótrofos. 
Ej:Bacterias y Arqueas.
Reino Protista:	 Cel. Eucariota- Uni/Pluricelulares- sexual o asexual - autótrofos/heterótrofos.
Ej: Protozoos y Algas.
Reino Fungi: Cel. Eucariota- Uni/Pluricelulares- sexual o asexual -heterótrofos (por absorción). 
Ej: Hongos .
Reino Plantae:	 Cel. Eucariota- Pluricelulares- sexual o asexual- autótrofos (fotosíntesis). 
Ej: Plantas.
Reino Animalia: Cel. Eucariota- Pluricelulares- sexual o asexual -heterótrofos (por ingestión). 
Ej: Animales.
Virus
Priones
No pertenecen a ningún reino, ya que no están formados por células y son parásitos intracelulares obligados.
Con base en la clasificación propuesta por Carl Woese en 1990, los seres vivos se dividen en tres dominios: Bacteria, Archaea y Eukarya. 
DOMINIO BACTERIA: El dominio Bacteria está conformado por el reino Bacteria (eubacteria).
DOMINIO ARCHAEA: Hasta 1977 las arqueas estaban clasificadas como bacterias (arqueobacterias, reino Monera, en la antigua clasificación de cinco reinos). En 1990, con base en los datos de las secuencias de ARNr 16S y 18S, Woese propuso incluirlas en un reino y un dominio independientes: Archaea. Por tanto, el dominio Archaea está conformado por el reino archaea. Sus células son, desde luego, procariotas. 
DOMINIO EUKARYA: El dominio Eukarya incluye a todos los organismos conformados por células cuyo material genético se halla dentro un núcleo rodeado por una membrana, de ahí su nombre (eu: verdadero; karion: núcleo). 
Los reinos que pertenecen al dominio Eucarya son: Protista, Fungi, Plantae y Animalia. 
SISTEMATICA BACTERIANA
LA SISTEMATICA BACTERIANA ESTUDIA LOS DIVERSOS ORGANISMOS Y SUS RELACIONES E INCLUYE:
La CLASIFICACION: ordenación de los organismos en grupos taxonómicos( familia, género, especies, etc. )
LA TAXONOMIA: ciencia que estudia la clasificación y denominación correcta de los organismos.
 LA IDENTIFICACION: permite encuadrar un organismo determinado en un grupo taxonómico particular de una clasificación previamente establecida.
LA NOMENCLATURA: trata de asignar a los organismos vivos un nombre científico, correcto y admitido internacionalmente.
LA FILOGENIA: estudia la historia evolutiva de los organismos.
Taxonomía bacteriana: 
CLÁSICA	
Caracteres fenotípicos (morfología, nutrición, etc.)
Algunos genotípicos: 
% G+C (Guanina y Citosina).
Hibridación ADN-ADN (es el proceso más común para detectar un gen particular o un segmento de un ácido nucleico) .
Características fenotípicas clásicas de valor taxonómico
Morfología: forma, tamaño y tinción
Nutrición y fisiología: fotótrofo, quimiótrofo, aerobio o anaerobio, temperatura y pH óptimos, fuentes alternativas de C, N y S.
Movilidad: tipo y disposición de flagelos.
Otros: pigmentos, inclusiones celulares, sensibilidad a antibióticos, patogenicidad.
Características genotípicas clásicas
Contenido G+C 
% G+C 
Amplio rango en procariotas: 20 al 80%
Poca información para la caracterización taxonómica
Criterio de exclusión: %GC > 3, probablemente especies diferentes.
		 %GC > 10, probablemente géneros diferentes.
La taxonomía HOY:
Taxonomia clásica se ha modificado debido al empleo de técnicas de biología molecular:
Secuenciación de proteínas
Perfiles de proteínas celulares
Composición de bases nitrogenadas del ADN
Hibridación de ácidos nucleicos
Estudio de ARN ribosómico
Hibridación ADN-ADN
Depende de la secuencia completa del genoma
Útil en organismos estrechamente relacionados
Determinación por: 
	 % hibridación de ADN1 - ADN2
Es el criterio actual de definición de especie.
Definición metodológica estándar: 
		- % de hibridación ADN1-ADN2 > 70%
Concepto en revisión continua
POLIFÁSICA
Es la tendencia moderna. Consenso en la integración de distintos tipos de caracteres:
Fenotípicos: 	- clásicos (morfología, nutrición, etc) 
	- marcadores quimiotaxonómicos
	- perfil de proteínas totales y enzimas.
Genotípicos: clásicos: 	% G+C
 		 	hibridación DNA-DNA
Nuevos: Fingerprinting (ej. perfiles moleculares 	por restricción o amplificación de ADN)
Filogenéticos: basados en el gen del ARNr 16S.
RANGOS TAXONOMICOS EN CLASIFICACION BACTERIANA
Taxones: Dominio
Phylum
Clase
Orden
Familia
Género
Especie: En microbiología la unidad taxonómica básica es la especie.
Sub-especie: Importancia en estudios clínicos y ecológicos.
Categorías Taxonómicas
 Dominio → Bacteria
 Phylum → Proteobacteria
 Clase → Gamma Proteobacteria
 Orden → Zymobacteria
 Familia → Enteroacteriaceae 
 Género → Escherichia
 Especie → coli
Ej: Escherichia coli.
Nomenclatura - Carl Von Linneo
Es la rama de la taxonomía que se ocupa de la asignación de nombres a grupos taxonómicos de conformidad con normas publicadas.
La identificación constituye el lado práctico de la taxonomía, el proceso de determinar que un determinado organismo pertenece a un taxón reconocido.
Sistema binominal Nombre del género y la especie .
De acuerdo con la convención que establece el sistema binomial de nomenclatura, cada especie biológica lleva un nombre latinizado que consiste en dos palabras: la primera indica el grupo (género) a que pertenece y se escribe con mayúscula, y la segunda palabra indica la especie de ese género que se escribe con minúscula.
Los nombres científicos de las bacterias deben ser escritos en letra cursiva (Itálica) o en su defecto cada palabra debe ser subrayada.
Sthapylococcus aureus	
 del griego sthayle= racimo y Kokkos= grano
aureus alude al pigmento amarillo dorado
 Las reglas de la nomenclatura están descriptas en: The International Code of Nomenclature of Bacteria
La actualización de la taxonomia se publica en la revista International Journal of systematic Bacteriology y la Sistematizacion taxonómica se recoge en el Manual de Bergey
Bergey´s Manual of Determinative Bacteriology 
1923 (1ed)-1994 (9ed)
Bergey´s Manual of Systematic Bacteriology 1a Ed 1984(vol 1)-1989(vol 4)
Bergey´s manual of Systematic Bacteriology 2a Ed 2001(vol 1)
The Prokaryotes (http:/www.prokaryotes.com).