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Enzimas: Regulación de actividades Generalidades: - La regulación del flujo de metabolitos puede ser activa o pasiva. Las enzimas que operan a su tasa máxima no pueden aumentar su rendimiento para adaptarse a aumentos repentinos de la disponibilidad de sustrato y sólo pueden responder a decrementos precipitados de la concentración de sustrato. En consecuencia, los valores de Km para casi todas las enzimas tienden a ser cercanos a la concentración intracelular promedio de sus sustratos, de modo que los cambios de la concentración de sustrato generan cambios correspondientes del flujo de metabolitos. Las respuestas a cambios de la concentración de sustrato representan un medio importante pero pasivo para coordinar el flujo de metabolitos. Sin embargo, su capacidad para mostrar respuesta a cambios en variables ambientales es limitada. A continuación se comentan los mecanismos que regulan la eficiência de las enzimas de una manera activa en respuesta a señales internas y externas. - La compartimentación asegura la eficiência metabólica y simplifica la regulación. En eucariontes, las vías anabólicas y catabólicas que sintetizan y desintegran biomoléculas comunes a menudo están físicamente separadas unas de otras. - El control de una enzima que cataliza una reacción limitante regula una via metabólica completa. Regulacción de la cantidad de enzima: -La capacidad catalítica de la reacción limitante en una vía metabólica es el producto de la concentración de moléculas de enzima y su eficiencia catalítica intrínseca. Por ende, resulta que la capacidad catalítica puede ser controlada mediante cambiar la cantidad de enzima presente y alterar su eficiencia catalítica intrínseca o una combinación de ambos. - Hay múltiples opciones para regular la actividad catalítica , los cambios de la eficiencia catalítica intrínseca por unión de ligandos disociables (regulación alostérica) o por modificación covalente logran regulación de la actividad enzimática en segundos. En consecuencia, los cambios en la concentración de proteína suelen dominar cuando se encuentran requerimientos adaptativos a largo plazo, mientras que los cambios de la eficiencia catalítica favorecen alteraciones rápidas y transitorias del flujo de metabolitos. - Los efectores alostéricos regulan ciertas enzimas. Inhibición por retroalimentación se refiere al proceso mediante el cual el producto terminal de una vía biosintética de múltiples pasos se une a, e inhibe, una enzima que cataliza uno de los primeros pasos en esa vía. Casi siempre, los inhibidores por retroalimentación inhiben la enzima que cataliza el primer paso comprometido en una secuencia biosintética particular. -La regulación por retroalimentación no es sinónimo de inhibición por retroalimentación. En células tanto de mamífero como de bacterias, algunos productos terminales producen “retroalimentación” de su propia síntesis, y la controlan, en muchos casos por medio de inhibición por retroalimentación de una enzima biosintética temprana. Es necesario distinguir entre regulación por retroalimentación, término fenomenológico desprovisto de inferencias mecanicistas, e inhibición por retroalimentación, mecanismo para la regulación de la actividad enzimática. Hormonas: -Muchas hormonas actúan mediante segundos mensajeros alostéricos. Los impulsos nerviosos —y la unión de muchas hormonas a receptores de superficie celular— desencadenan cambios del índice de reacciones catalizadas por enzima dentro de células blanco, al inducir liberación o síntesis de efectores alostéricos especializados llamados segundos mensajeros. El mensajero primario, o “primer mensajero”, es la molécula de hormona o el impulso nervioso. Los segundos mensajeros incluyen 3’,5’- cAMP, sintetizado a partir de ATP por la enzima adenilil ciclasa en respuesta a la hormona adrenalina, y Ca21, que se almacena dentro del retículo endoplásmico de casi todas las células. La despolarización de membrana originada por un impulso nervioso abre un canal de membrana que libera ion calcio hacia el citoplasma donde se unen a enzimas comprendidas en la regulación de la contracción muscular y la movilización de glucosa almacenada desde glucógeno, y las activan. La glucosa después satisface las demandas de energía aumentadas de la contracción muscular. Otros segundos mensajeros incluyen el 3’,5’-cGMP, óxido nítrico y los polifosfoinositoles, producidos por la hidrólisis de inositol fosfolípidos por fosfolipasas reguladas por hormona. - Las modificaciones covalentes reguladoras pueden ser reversibles o irreversibles. En células de mamífero, ocurre un amplio rango de modificaciones covalentes reguladoras. La proteólisis parcial y la fosforilación, por ejemplo, se emplean a menudo para regular la actividad catalítica de enzimas. Por otro lado, las histonas y otras proteínas de unión a DNA en la cromatina están sujetas a modificación extensa mediante acetilación, metilación, ribosilación de ADP, así como fosforilación. Estas últimas modificaciones, que modulan la manera en la cual las proteínas dentro de la cromatina interactúan entre sí, así como el DNA mismo, constituyen la base para el “código de histona”. Los cambios resultantes de la estructura de la cromatina dentro de la región afectada pueden hacer a los genes más accesibles a la proteína que se encarga de su transcripción, lo que aumenta la expresión de gen o, a mayor escala, facilita la replicación de todo el genoma. Por otro lado, se dice que los cambios de la estructura de la cromatina que restringen la accesibilidad de genes a factores de transcripción, RNA polimerasas dependientes de DNA, etc., lo que inhibe la transcripción, silencian la expresión de gen. Proteína: - Las proteasas pueden secretarse como proenzimas inactivas desde el punto de vista catalítico. Ciertas proteínas son sintetizadas y secretadas como proteínas precursoras inactivas conocidas como proproteínas. Las proproteínas de enzimas se denominan proenzimas o zimógenos. La proteólisis selectiva o parcial convierte una proproteína por medio de uno o más “cortes” proteolíticos sucesivos en una forma que muestra la actividad característica de la proteína madura, por ejemplo, su actividad catalítica. -La modificación covalente reversible regula proteínas clave de mamífero. Miles de proteínas de mamíferos son modificadas mediante fosforilación covalente. Las proteínas de mamífero son los blancos de una amplia gama de procesos de modificación covalente. Las modificaciones como prenilación, glucosilación, hidroxilación y acilación de ácido graso introducen características estructurales singulares en proteínas recién sintetizadas, que tienden a persistir durante toda la vida de la proteína. Las proteína cinasas fosforilan proteínas al catalizar la transferencia del grupo fosforilo terminal de ATP hacia los grupos hidroxilo de residuos serilo, treonilo o tirosilo, lo que forma residuos O-fosfoserilo, O-fosfotreonilo, u O- fosfotirosilo, respectivamente. Algunas proteína cinasas se dirigen hacia las cadenas laterales de residuos histidilo, lisilo, arginilo y aspartilo. La forma no modificada de la proteína puede regenerarse mediante eliminación hidrolítica de grupos fosforilo, catalizada por proteína fosfatasas. -La fosforilación de proteína es en extremo versátil. La fosforilación-desfosforilación de proteína es un proceso muy versátil y selectivo. No todas las proteínas están sujetas a fosforilación; esta última sólo se dirige a uno, o un pequeño subgrupo, de los muchos grupos hidroxilo sobre la superficie de una proteína. Si bien la función enzimática afectada más a menudo es la eficiencia catalítica de la proteína, la fosforilación también puede alterar su ubicación dentro de la célula, la susceptibilidada la degradación proteolítica, o la capacidad de respuesta a regulación por ligandos alostéricos. La fosforilación puede incrementar la eficiencia catalítica de una enzima y convertirla en su forma activa en una proteína, mientras que la fosforilación de otra proteína la convierte en una forma intrínsecamente ineficiente, o inactiva. - Eventos reguladores individuales se combinan para formar redes de control complejas. Las células llevan a cabo una compleja gama de procesos metabólicos que deben regularse en respuesta a una amplia gama de factores ambientales. En consecuencia, las enzimas interconvertibles, y las enzimas de las cuales depende su interconversión no actúan como conmutadores de “encendido” y “apagado” aislados. Para satisfacer las demandas de mantener la homeostasis, estos bloques de construcción están enlazados para formar redes reguladoras integradas. Puntos relevantes: -La homeostasis incluye mantener un ambiente intracelular y dentro de órganos relativamente constante pese a amplias fluctuaciones en el ambiente externo. Esto se logra por medio de cambios apropiados en los índices de reacciones bioquímicas en respuesta a necesidad fisiológica. - Los sustratos para casi todas las enzimas por lo general están presentes a una concentración cercana a su Km. Esto facilita el control pasivo de los índices de formación de producto en respuesta a cambios de las concentraciones de intermediários metabólicos. -El control activo del flujo de metabolitos comprende cambios de la concentración, la actividad catalítica, o ambos, de una enzima que cataliza una reacción limitante comprometida. -La proteólisis selectiva de proenzimas inactivas desde el punto de vista catalítico, inicia cambios conformacionales que Forman el sitio activo. La secreción como una proenzima inactiva facilita la movilización rápida de actividad en respuesta a lesión o necesidad fisiológica, y puede proteger al tejido de origen (p. ej., autodigestión por proteasas). -La unión de metabolitos y segundos mensajeros a sitios distintos del sitio catalítico de enzimas desencadena câmbios conformacionales que alteran la Vmáx o la Km. -La fosforilación por proteína cinasas de residuos serilo, treonilo o tirosilo específicos —y la desfosforilación subsiguiente por proteína fosfatasas— regula la actividad de muchas enzimas de humanos. -Las proteína cinasas y fosfatasas que participan en cascadas de regulación que responden a informes hormonales o de segundo mensajero, constituyen redes reguladoras que pueden procesar e integrar información ambiental compleja para producir una respuesta celular apropiada e integral. -Muchas enzimas metabólicas son modificadas por la acetilación-desacetilación de residuos de lisina. Se cree que el grado de acetilación de estas proteínas está modulado por la disponibilidad de acetil-CoA, el sustrato donador de acetilo para lisina acetiltransferasas, y NAD1, un sustrato para las desacetilasas sirtuína. -La capacidad de las proteína cinasas, proteína fosfatasas, lisina acetilasas, y lisina desacetilasas para establecer como objetivo tanto múltiples proteínas como múltiples sitios en proteínas, es clave para la formación de redes reguladoras integradas.
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