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UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO FACULTAD DE QUÍMICA PRODUCCIÓN, PURIFICACIÓN Y CARACTERIZACIÓN DE LA PECTIN-LIASA DE Aspergillus flavus CECT 2687 QUE PARA OBTENER EL TÍTULO DE QUÍMICA DE ALIMENTOS PRESENTA MICHELLE MONSERRATH CAMACHO LARA MÉXICO, D.F. AÑO 2014 UNAM – Dirección General de Bibliotecas Tesis Digitales Restricciones de uso DERECHOS RESERVADOS © PROHIBIDA SU REPRODUCCIÓN TOTAL O PARCIAL Todo el material contenido en esta tesis esta protegido por la Ley Federal del Derecho de Autor (LFDA) de los Estados Unidos Mexicanos (México). El uso de imágenes, fragmentos de videos, y demás material que sea objeto de protección de los derechos de autor, será exclusivamente para fines educativos e informativos y deberá citar la fuente donde la obtuvo mencionando el autor o autores. Cualquier uso distinto como el lucro, reproducción, edición o modificación, será perseguido y sancionado por el respectivo titular de los Derechos de Autor. ii JURADO ASIGNADO: PRESIDENTE Wacher Rodarte María del Carmen VOCAL Aguilar Osorio José Guillermo de Jesús SECRETARIO Martín Fuentes Ruth Edith 1° SUPLENTE Giles Gómez Martha 2° SUPLENTE Camacho de la Rosa Norma Angélica SITIO EN DONDE SE DESARROLLÓ EL TEMA: Grupo de Fisiología de Hongos Filamentosos del Departamento de Alimentos y Biotecnología, Conjunto E Laboratorio 312, de la Facultad de Química de la Universidad Nacional Autónoma de México bajo la dirección del Dr. Guillermo Aguilar Osorio. ASESOR DEL TEMA: Dr. Guillermo Aguilar Osorio ________________________ SUSTENTANTE: Michelle Monserrath Camacho Lara ________________________ iii La presente investigación fue realizada con recursos del Programa de Apoyo a Proyectos de Investigación e Innovación Tecnológica (PAPIIT) de la UNAM. Proyecto; Identificación de enzimas degradadoras de polisacáridos producidas por cepas autóctonas del grupo Flavi durante su crecimiento en sustratos complejos, clave IN219813. Agradezco a la Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA) la beca recibida. iv CONTENIDO INTRODUCCIÓN ................................................................................................................................. 1 OBJETIVOS ......................................................................................................................................... 4 2.1 OBJETIVO GENERAL ...................................................................................................... 4 2.2 OBJETIVOS PARTICULARES ......................................................................................... 4 2.3 JUSTIFICACIÒN ............................................................................................................... 5 ANTECEDENTES ................................................................................................................................ 6 3.1 El género Aspergillus ...................................................................................................... 6 3.1.1 Aspergillus flavus ................................................................................................................ 8 3.1.2 Aflatoxinas ......................................................................................................................... 10 3.1.3 Efecto de la contaminación por aflatoxinas de cultivos agrícolas en México .............. 12 3.2 Polisacáridos estructurales de la pared celular vegetal ............................................. 14 3.2.1 Sustancias pécticas .......................................................................................................... 16 3.3 Enzimas fúngicas degradadoras de la pared celular de plantas ............................... 18 3.3.1 Pectinasas ......................................................................................................................... 19 3.3.2 Transeliminasas ................................................................................................................ 22 3.3.2.1 Pectin liasas ............................................................................................................... 23 3.3.3 Regulación genética de las enzimas degradadoras de pared celular en Aspergillus. 25 3.3.3.1 Expresión coordinada de los genes que codifican para el sistema pectinolítico . 25 3.3.3.2 Represión catabólica por fuente de carbono ........................................................... 25 3.3.3.3 Expresión de genes dependiente de pH .................................................................. 26 3.4 Aislamiento y purificación de Proteínas ...................................................................... 26 3.4.1 Cromatografía ................................................................................................................... 26 3.4.1.1 Cromatografía de intercambio iónico y cromatografía de filtración en gel............ 27 3.4.1.2 Separación de proteínas por precipitación con sales (salting out) ........................ 28 MATERIAL Y MÉTODOS ................................................................................................................. 29 4.1 Cultivo del microorganismo ......................................................................................... 29 4.2 Producción de enzimas en medio líquido.................................................................... 30 4.2.1 Medios y condiciones de cultivo............................................................................... 30 4.3 Obtención de filtrados enzimáticos crudos ................................................................. 30 4.3.1 Inóculo para fermentación ........................................................................................ 30 v 4.3.2 Fermentación en lote ................................................................................................ 31 4.3.3 Actividad exo-pectinolítica medida por grupos reductores .................................... 31 4.3.4 Actividad de pectin liasas ......................................................................................... 31 4.3.5 Concentración de los filtrados enzimáticos por liofilización y precipitación con Sulfato de Amonio ...................................................................................................................... 32 4.4 Purificación .................................................................................................................... 32 4.4.1 Cromatografía de intercambio iónico ....................................................................... 32 4.4.2 Pre-tratamiento de las fracciones enzimáticas provenientes de una cromatografía para su uso en geles de SDS-PAGE (SDS Polyacrilamide-Gel Electrophoresis) ................ 33 4.4.3 Obtención de geles de SDS-PAGE ......................................................................... 34 4.4.4 Zimogramas ............................................................................................................... 34 4.5 Caracterización .............................................................................................................. 35 4.5.1 Medición de proteína por el método de Bradford ........................................................... 35 4.5.2 Preferencia de sustrato .................................................................................................... 35 4.5.3 Determinación del pH óptimo........................................................................................... 36 4.5.4 Determinación de temperaturaóptima ............................................................................ 36 4.5.5 Determinación del efecto de iones .................................................................................. 36 4.5.6 Estabilidad al pH ............................................................................................................... 37 4.5.7 Estabilidad a la temperatura ............................................................................................ 37 4.5.8 Cinética enzimática ........................................................................................................... 37 4.6 Esquema general de la producción, purificación y caracterización de pectin liasas de Aspergillus flavus CECT 2687 ....................................................................................... 38 RESULTADOS Y DISCUSIÓN ......................................................................................................... 39 5.1 Efecto de la concentración de la fuente de carbono sobre la producción de pectinasas en fermentaciones en lote ............................................................................... 39 5.1.1 Comportamiento del pH a través del tiempo durante la producción de pectinasas .... 42 5.1.2 Comportamiento de la actividad de las transelminasas durante su producción ......... 43 5.1.3 Determinación del tipo de síntesis de las transeliminasas producidas por Aspergillus flavus CECT 2687; síntesis constitutiva o inductiva. ............................................................... 44 5.2 Medición de la actividad de transeliminasas y factores que la afectan..................... 46 5.2.1 Determinación del efecto del pH y de la presencia del ión Calcio sobre la actividad de pectin liasas. ............................................................................................................................... 47 5.3 Purificación de pectin liasas por cromatografía de intercambio Iónico. ................... 48 5.3.1 Reproducibilidad de la producción y purificación de pectin liasas................................ 49 vi 5.3.2 Pruebas de nivel de purificación de pectin liasas (gel SDS-PAGE y zimograma) ...... 51 5.3.3 Rendimiento de la purificación ......................................................................................... 55 5.4 Caracterización de la pectin liasa pura ........................................................................ 56 5.4.1 Preferencia de sustrato .................................................................................................... 57 5.4.2 Determinación del pH óptimo........................................................................................... 59 5.4.3 Determinación de la temperatura óptima ........................................................................ 60 5. 4.4 Ecuación de Arrhenius y Ea ............................................................................................ 61 5.4.5 Efecto de iones sobre la actividad ................................................................................... 62 5.4.6 Determinación de la estabilidad al pH............................................................................. 64 5.4.7 Determinación de la estabilidad a la temperatura .......................................................... 64 5.4.8 Cinética enzimática ........................................................................................................... 66 5.5 Identificación de proteínas por espectrometría de masas de alta definición ........... 70 CONCLUSIONES .............................................................................................................................. 75 REFERENCIAS .................................................................................................................................. 78 INTRODUCCIÓN | 1 1 CAPÍTULO 1 INTRODUCCIÓN La presencia de hongos en las actividades humanas, principalmente las relacionadas con la alimentación, tienen un fuerte impacto sobre las mismas. Algunos son deseables por ejemplo en la producción de quesos, mientras que otros son indeseables principalmente en la agricultura y almacenamiento de semillas requeridas para su consumo animal o humano. En contraste, muchos hongos, incluyendo a Aspergillus, aprovechan los recursos que las actividades humanas les proporcionan para su desarrollo, lo que resulta en la asociación de grandes poblaciones de hongos con diversas actividades humanas, principalmente las relacionadas con la agricultura (Cotty et al, 1994). La diseminación de hongos está asociada con la mayoría de los objetos que residen en los campos, incluidos los insectos, pues éstos pueden servir como vectores de propagación. Aspergillus flavus crece y se multiplica fácilmente en cosechas dañadas por insectos, excrementos de insectos y en los insectos muertos y otros hospederos parasitados (Cotty et al, 1994). El género Aspergillus se encuentra distribuido en todo el mundo y de él se derivan secciones como Flavi, Circumdati, Fumigati, Nigri (Samson et al, 2006), entre otras, las que, en conjunto, se componen por más de 180 especies oficialmente reconocidas. A pesar de que incluye uno de los principales patógenos para los seres humanos; Aspergillus fumigatus, la mayor parte de los miembros de este género son INTRODUCCIÓN | 1 2 microorganismos útiles en la naturaleza para la degradación de plantas y polisacáridos, además de tener una importancia significativa en la industria para la producción a gran escala de enzimas homólogas y heterólogas. Entre ellos, Aspergillus oryzae y Aspergillus niger se encuentran reconocidos generalmente como seguros (GRAS, por sus siglas en ingles) por la Food and Drug Administration (FDA, por sus siglas en inglés) en Estados Unidos (Ward et al, 2006). Durante periodos de sequía se ha observado el rápido incremento y desarrollo de varios Aspergilli en asociación con cultivos. Estos Aspergilli incluyen a A. flavus, el cual a principios de los años 60´s, fue identificado como productor de aflatoxinas, las cuales han intoxicado y causado cáncer de hígado a diversas especies animales. (Cotty et al, 1994). El tipo de aflatoxina más común, la aflatoxina B1, es un potente hepatocarcinógeno, por lo que el contenido de aflatoxinas es regulado en alimentos, especialmente en productos para infantes (Cotty et al, 1994), siendo entonces la producción de aflatoxinas, para muchos, el tema de mayor interés del grupo fúngico A. flavus. Además de la importancia de la exposición y efecto de las aflatoxinas en humanos al consumir alimentos provenientes de cultivos contaminados, también se presenta un interés de estudiar y controlar la contaminación por razones económicas al limitar el valor y uso de productos agrícolas y ganaderos. Aunque el grupo de A. flavus no es comúnmente reconocido como benéfico, estos organismos ubicuos pueden convertirse en miembros dominantes de la microflora en determinadas circunstancias. Estos hongos son microorganismos degradadores importantes de restos de cultivos y pueden jugar un papel en la solubilización y el reciclaje de nutrientes para los cultivos y el suelo. A. flavus, incluso es capaz de degradar la lignina. Como patógenos de insectos, estos hongos son útiles para limitar las poblaciones de plagas e incluso han sido considerados como agentes potenciales de reemplazar a los insecticidas químicos (Cotty et al, 1994). INTRODUCCIÓN | 1 3 Por otro lado, los hongos del grupo A. flavus han tenido una larga historia en el procesamiento de productos para aumentar su utilidad y valor, por ejemplo, produciendo las enzimas del procesamiento de alimentos y otros usos industriales e incluso para producir productos terapéuticos. Entre las especies utilizadas para estos fines destacan A. sojae y A. oryzae.A lo largo de este trabajo, la característica mayormente descrita y de mayor importancia para los fines que nos incumben de Aspergillus flavus es la producción de enzimas. Este hongo filamentoso produce enzimas pectinolíticas, celulolíticas y xilanolíticas, que utiliza para degradar los polisacáridos de la pared celular y así poder penetrar y establecerse en el tejido vegetal. Las pectinasas, particularmente, son las primeras enzimas degradadoras de la pared celular en ser producidas por patógenos fúngicos al cultivarlos y durante una infección de tejido vegetal (Whitehead, 1995; Mellon, 2007), siendo de especial atención que, a la fecha, sólo se han caracterizado 4 pectinasas de A. flavus, a pesar de que el fitopatógeno tiene al menos 18 genes que codifican para ese tipo de enzimas (Cleveland et al, 2009). La importancia del estudio y caracterización de las enzimas producidas por A. flavus en este trabajo se debe a la naturaleza saprófita de este hongo en cultivos agrícolas y semillas de consumo humano y animal, además de los posibles efectos de las enzimas sobre la planta para poder crecer y desarrollarse en la misma. Por lo anterior, y aunado al impacto económico y en la salud que Aspergillus flavus tiene sobre la cadena alimenticia y la falta de trabajos que permitan elucidar la razón por la cuál es capaz de infectar el tejido de plantas vivas aún teniendo un arsenal enzimático más limitado que el de otras especies del género, este trabajo se enfoca a la evaluación de la producción de un tipo de enzimas degradadoras de la pared celular como factor de patogenicidad, las pectin liasas, provenientes de Aspegillus flavus. OBJETIVOS | 2 4 CAPÍTULO 2 OBJETIVOS 2.1 OBJETIVO GENERAL - Producir, purificar y caracterizar pectin liasas producidas por Apergillus flavus CECT 2687 empleando como sustrato desechos agroindustriales. 2.2 OBJETIVOS PARTICULARES - Desarrollar una metodología que permita producir las pectin liasas de Aspergillus flavus CECT 2687. - Desarrollar una metodología que permita purificar las pectin liasas de Aspergillus flavus CECT 2687. - Determinar el grado de purificación de las pectin liasas mediante el empleo geles de electroforesis (SDS-PAGE) y zimogramas. - Determinar las constantes cinéticas de las pectin liasas obtenidas de A. flavus CECT 2687 como son Km, Vmax, Ea y temperatura y pH óptimos de trabajo. - Determinar la sensibilidad y estabilidad a la temperatura y el pH de pectin liasas aisladas de A. flavus CECT 2687. OBJETIVOS | 2 5 2.3 JUSTIFICACIÒN El interés por estudiar los sistemas enzimáticos producidos por Aspergillus flavus CECT 2687 se debe a que son considerados como factores de virulencia que permiten la propagación y colonización de tejidos vegetales por este hongo. Esto tiene una repercusión económica debido a la pérdida de cultivos de maíz, cacahuate y algodón principalmente, por la posible presencia de aflatoxinas, toxinas producidas por A. flavus, lo cual tiene graves implicaciones de salud. El conocimiento de las características de enzimas degradadoras de pared celular vegetal que produce el hongo durante la colonización de diversos tejidos vegetales, como lo son las pectin liasas, proporcionará información útil para la formulación de estrategias que permitan controlar el desarrollo de A. flavus en los cultivos. ANTECEDENTES | 3 6 CAPÍTULO 3 ANTECEDENTES 3.1 El género Aspergillus Especies de Aspergillus pertenecen a los primeros organismos fúngicos que fueron cultivados en medios artificiales y estudiados por sus propiedades bioquímicas, además son de los hongos más comunes en el ambiente. La primera descripción de Aspergillus data de 1727, provista por Micheli con una clara descripción del género mediante un diagnóstico e ilustraciones simples siendo la morfología de su conidióforo- estructura que alberga las esporas asexuales- la característica taxonómica más importante (Smith et al, 1994; De Vries y Visser, 2001). Aspergillus es uno de los microorganismos más comunes en la tierra. Existen más de 180 especies, todos agrupados juntos porque forman estructuras reproductivas asexuales similares. Las especies de Aspergillus son capaces de producir un gran número de conidiosporas. Sus esporas son clonales, por lo que la esporulación de una colonia de este género da como resultado la formación de millones de propágulos genéticamente idénticos (Bennett, 2009). Las características macro y micromorfológicas, tales como el color de los conidios, la forma de la cabeza, la superficie y dimensiones del conidióforo, la forma y textura de las esporas, han permitido agrupar los aspergilos en secciones, por ejemplo, Circumdati, Flavi, Fumigati, Nigri y otras, o grupos como: A. flavus, A. ochraceus, A. niger, entre otros (Carrillo, 2003, Samson et al, 2006). ANTECEDENTES | 3 7 La mayoría de los Aspergilli pueden ser fácilmente identificados cuando son cultivados en Czapek y agar extracto de malta. Samson y Pitt (1985) recomendaron agar Czapek- levadura y agar extracto de malta mayormente para obtener especies anamórficas (Smith et al, 1994) siendo los Aspergilli, en su mayoría, un género que se reproduce sólo por esporas asexuales (Bennett, 2009). La principal característica macroscópica para la identificación de los grupos de Aspergillus es el color. Poseen distintos tonos de verde, pardo, amarillo, blanco, gris y negro. Bajo el microscopio se pueden observar cabezas conidiales en cuatro formas básicas: globosa, hemisférica, columnar y claviforme (Fig. 1) (Carrillo, 2003). Fig. 1 Representación esquemática de la estructura microscópica de los tipos de conidióforos del género Aspergillus (Carrillo, 2003). En los aspergilos, los conidios constituyen cadenas que se originan en la célula conidiógena o fiálide. En algunos Aspergilli hay células adyacentes a las fiálides denominadas métulas o células de soporte (Carrillo, 2003). La base del conidióforo es en forma de “T” o “L” y se llama célula de pie, a pesar de que no es una célula ANTECEDENTES | 3 8 separada. La célula de pie es una característica del conidióforo de Aspergillus (Bennett, 2009). Este género contiene varias especies de importancia económica ya sea positiva o negativa para la industria, la agricultura y la medicina. Desde tiempos remotos han sido empleados en la fermentación de alimentos. Dentro de este género se encuentran algunas especies potencialmente patógenas como A. parasiticus, A. flavus, A. niger, A. nidulans, A. terreus y otras. Existen diversos tipos de patógenos; patógenos de plantas o de insectos, saprófitos y oportunistas. Los patógenos saprófitos y oportunistas presentan el espectro más amplio de proteínas y enzimas de degradación de polisacáridos, indicativos de un estado nutricional menos especializado. A. flavus se considera un patógeno oportunista (Bennett, 2009) que, por definición, ataca a cultivos especialmente en estrés, inmunosupresión o dañados. La identificación de especies de este género tradicionalmente se hace en base a las características macro y micromorfológicas en diversos medios de cultivo incubados a distintas temperaturas, debido a la necesidad de conocer el contaminante para orientar la búsqueda de micotoxinas en un producto. Además, se han desarrollado métodos inmunológicos y moleculares rápidos para la identificación de los hongos contaminantes de granos y otros productos vegetales. (Carrillo, 2003). Se usan algunos medios especializados para el aislamiento e identificación de Aspergilli potencialmente aflatoxigénicos (Smith et al, 1994). Es de considerar que el volumen de medio vaciado en la caja de petri influye sobre el diámetro de las colonias y otras características (Carrillo, 2003). 3.1.1 Aspergillus flavus Aspergillus flavus es un hongo saprófitoque tiene una distribución mundial y frecuentemente aislado de cultivos agrícolas. Crece en un muy vasto número de sustratos (particularmente bajo condiciones de alta humedad ambiental), teniendo la capacidad de crecer en medios simples y complejos, ya que contiene un amplio paquete enzimático. Este fitopatógeno crece preferentemente en cultivos de maíz, ANTECEDENTES | 3 9 algodón y cacahuate; aunque se ha aislado de mandioca, chiles, mijo, arroz, sorgo, semillas de girasol, nueces, trigo y una gran variedad de especias. Aspergillus flavus crece de forma agresiva en todas las etapas de la cadena alimenticia: en el campo, en el almacenamiento y en casa. Pertenece a la subdivisión de los Fungi Imperfecti que incluye a los hongos que se reproducen por mecanismos asexuales. Su ciclo de vida puede comprender de 2 etapas, una etapa asexual; conidiación o producción de esporas por mitosis, y otra sexual; formación de cleistotecios con formación de esporas por meiosis. En relación a las características macroscópicas de Aspergillus flavus, las colonias son de color verde oliváceo a verde amarillento, micelio blanco, esclerocios (masas redondeadas de micelio parecidos a los cleistotecios pero sin esporas asexuales), cuando están presentes, de color marrón oscuro a negro, variables en forma y tamaño; reverso incoloro, marrón claro y/o anaranjado; textura de la colonia variable, generalmente lanosa o aterciopelada (Abarca, 2000). Tanto los esclerocios como los cleistotecios, son estructuras morfológicas que sirven como identificación entre una cepa y otra. Bennet (2010) comenta que los esclerocios, sirven como estructuras de descanso que permiten a las especies sobrevivir a condiciones adversas de crecimiento. Este organismo es un patógeno oportunista y tiene importancia agronómica debido a que algunas de las especies que comprenden el grupo A. flavus, como A. flavus y A. parasiticus, tienen la capacidad de producir metabolitos altamente tóxicos y carcinógenos llamados aflatoxinas. Puede producir la sustancia carcinogénica natural más potente conocida, aflatoxina B1, durante la infección de semillas, lo que resulta en la disminución del valor de los cultivos (Mellon et al, 2002), considerándola además como una gran amenaza para la salud humana y el ganado. Sin embargo, los factores de patogenicidad aún no han podido ser puestos en manifiesto por la secuencia de ADN o estudios de genómica funcional (Bennett, 2009). ANTECEDENTES | 3 10 El desarrollo óptimo de A. flavus ocurre a 36°C con una actividad de agua de 0.95, mientras que la producción de aflatoxinas es favorecida por una temperatura de 33°C a una actividad de agua 0.99, aunque pueda ser formada aún a 15°C con una actividad de agua de 0.95, por lo que su cultivo es relativamente seguro, debido a la baja posible exposición a las aflatoxinas (Carrillo, 2003). Además de los efectos patogénicos de algunas cepas de este grupo, otras también han tenido una larga historia en el tratamiento para aumentar utilidad y valor de productos. Cepas del grupo A. flavus, como A. oryzae y A. sojae, se utilizan para producir enzimas para el procesamiento de alimentos y otros usos industriales e incluso para producir productos terapéuticos tales como urato oxidasa y lactoferrina. Por otro lado, hongos del grupo A. flavus son degradadores importantes de restos de cultivos y pueden jugar un papel en la solubilización y el reciclaje de nutrientes de los cultivos y el suelo. Como patógenos de insectos, estos hongos pueden servir para limitar poblaciones de plagas e incluso se han considerado potenciales agentes sustitutos de los insecticidas químicos (Cotty et al, 1994). 3.1.2 Aflatoxinas Químicamente, las aflatoxinas son un grupo de metabolitos secundarios heterocíclicos, estrechamente relacionados entre sí, sintetizados y excretados por Aspergillus flavus y Aspergillus parasíticus principalmente (Armijo & Calderón, 2009), y se consideran el cancerígeno biológico más potente conocido. Aunque han sido identificados al menos 20 tipos diferentes de aflatoxinas, las más comunes son: Aflatoxina B1 (AFB1); es metabolizada a aflatoxina M1 (AFM1) (Fig.2). Aflatoxina B2 (AFB2). Aflatoxina G1 (AFG1). Aflatoxina G2 (AFG2)(Moreno et al, 2000). ANTECEDENTES | 3 11 Fig.2 Biotransformación de la aflatoxina B1 a aflatoxina M1 La AFB1 es la más común de las cuatro y presenta mayor toxicidad. La aflatoxina M1 (AFM1) es el derivado 4-hidroxi de la AFB1 y es excretada en la leche de las hembras de mamíferos que consumen AFB1 en su dieta. Tanto la AFB1 como la AFM1 son compuestos hepatotóxicos y carcinogénicos y sus efectos sobre la salud pública constituyen una preocupación constante. (Armijo & Calderón, 2009). Estas micotoxinas se producen y consumen con alimentos contaminados, se acumulan por años en el ADN, causan efectos dañinos como mutaciones, malformaciones en fetos, abortos y cánceres diversos (de hígado, páncreas, colorectal, de pulmón, y/o cervicouterino). Las aflatoxinas no se ven, carecen de sabor y olor, son resistentes al calor (soportan entre 260 y 320°C sin descomponerse) y a procesos como cocción, ultrapasteurización, nixtamalización y fermentación (Carvajal, 2013). Además de los efectos adversos en la salud de animales y humanos, las aflatoxinas tienen un efecto negativo en la economía debido a las pérdidas de cultivos por contaminación. Por lo anterior, el contenido de aflatoxinas es regulado en alimentos, especialmente en productos para infantes. En los países donde la regulación es insuficiente en la comida o es aplicada inadecuadamente puede producirse la ingestión rutinaria de las aflatoxinas. En poblaciones con una exposición relativamente alta a las aflatoxinas, se ANTECEDENTES | 3 12 sugiere como un factor de riesgo de contraer cáncer primario de hígado en los seres humanos (Cotty et al, 1994). Por su importancia, las aflatoxinas han sido estudiadas constantemente y las ruta de su biosíntesis se ha convertido en un modelo para el estudio de la bioquímica y la biología molecular del metabolismo secundario de hongos (Bennett, 2009). 3.1.3 Efecto de la contaminación por aflatoxinas de cultivos agrícolas en México El estudio intensivo y sistemático de las micotoxinas se inició a principios de la década de 1960 con el descubrimiento de las aflatoxinas, las cuales son productos del metabolismo secundario de ciertos hongos del género Aspergillus, de donde derivaron su nombre (Moreno et al, 2000). Los mohos verde-amarillentos que pertenecen al grupo Aspergillus flavus son los únicos capaces de producir aflatoxinas. No obstante, se debe indicar que no todos las especies de este grupo fúngico producen aflatoxinas, por lo que la presencia de Aspergillus no necesariamente implica la presencia de estas toxinas. Por el contrario, la ausencia de Aspergillus en el alimento no necesariamente implica que el alimento no tenga aflatoxinas, debido a que la toxina puede persistir aun después que el moho ha desaparecido e incluso después de la cocción del alimento (Armijo & Calderón, 2009). Las aflatoxinas se han detectado en la leche, queso, maíz, cacahuate, algodón, nueces, almendras, higos y una gran variedad de alimentos para animales. Leche, huevos y carne son contaminados algunas veces por el consumo de alimento contaminado por animales. Sin embargo, los productos básicos con el más alto riesgo de contaminación por aflatoxinas son el maíz, cacahuate y semillas de algodón (Armijo & Calderón, 2009). La contaminación por aflatoxinas es un problema agrícola peculiar y frustrante, porque menos de 1 % de la cosecha puede estar contaminado con niveles suficientemente altos como para que la media de toda la cosecha exceda las concentraciones permisibles (Cotty et al, 1994) que en México esde 20 µg/kg de producto (NOM-188- ANTECEDENTES | 3 13 SSA1-2002). La manera más efectiva de evitar los problemas ocasionados por las aflatoxinas es impedir que el hongo crezca en el sustrato (Moreno et al, 2000). Su impacto económico incluye la pérdida de vidas humanas y animales, el incremento en los costos de salud y atención veterinaria, reducción en la producción animal y otros problemas económicos y comerciales (Quezada et al, 2011). Las aflatoxinas muestran ser productos químicos no nutritivos y agentes de control biológico de otras especies en el medio ambiente. Son metabolitos secundarios de los cuales su función principal es desconocida, sin embargo, su valor adaptativo resulta ser de importancia cuando se habla de interacciones entre las aflatoxinas, Aspergillus y la agricultura. Además el grupo A. flavus normalmente contiene una amplia gama de otros metabolitos tóxicos. Algunos de estos metabolitos no se encuentran en otras estructuras fúngicas y en combinación con aflatoxinas, estas toxinas pueden formar un sistema de defensa química dirigida a la protección de los esclerocios de la depredación de insectos. El ácido kójico, metabolito de la mayoría de las cepas de A. flavus, puede aumentar sinérgicamente la toxicidad de las aflatoxinas. Desde la floración hasta la maduración, las semillas y frutos son vulnerables a diversas perturbaciones. Durante la maduración la mayoría de los cultivos son susceptibles a la contaminación por aflatoxinas. Heridas o estrés de los frutos pueden llevar al aumento de las porciones de los cultivos con niveles muy altos de toxina por predisposición a la infección, sin embargo, los hongos son capaces de infectar organismos sanos (Cotty et al, 1994). En México se ha reportado la incidencia de aflatoxinas en granos y productos elaborados a base de maíz en diferentes regiones geográficas (Quezada et al, 2011). En México el grano de maíz es el más importante para la alimentación humana, destacándose por sembrarse anualmente en casi 8,000,000 de hectáreas, produciendo alrededor de 21,000,000 de toneladas, con un rendimiento promedio de 2.63 ton/ha. La productividad del maíz se afecta por factores bióticos, abióticos y de manejo agronómico, desde la preparación de la siembra hasta el almacenaje poscosecha. ANTECEDENTES | 3 14 En un estudio hecho en el estado de Guerrero en 2010 se determinó que la cantidad de maíz contaminado del total producido en almacenamiento es del 5% con niveles de aflatoxinas superiores al límite permisible. Entre los agricultores de bajos recursos las pérdidas globales en poscosecha están entre 10 y 40%, demostrándose que las más importantes (arriba del 50%) ocurren cuando las condiciones de manejo y asistencia técnica son deficientes. En regiones tropicales y subtropicales comúnmente la infestación por plagas puede iniciar en campo y posteriormente en el almacén. En México se han realizado investigaciones sobre pérdidas poscosecha; las cuales reportan que, en regiones de clima húmedo la incidencia de plagas supera el 80%, y es la primera causa de pérdidas en grano almacenado (SAGARPA, 2011). 3.2 Polisacáridos estructurales de la pared celular vegetal Los polisacáridos de la pared celular son los compuestos orgánicos más abundantes en la naturaleza. Ellos constituyen el 90 % de la pared celular vegetal y se pueden dividir en tres grupos: celulosa, hemicelulosa y sustancias pécticas (de Vries & Visser, 2001) organizados de tal manera que la pared celular es químicamente estable y físicamente sólida. Las paredes celulares de las plantas forman una matriz extracelular única y continua a través del cuerpo de la planta y las paredes de muchas células juntas forman el esqueleto de los tejidos vegetales. Estas, además de controlar el crecimiento celular, influyendo en tamaño y forma, actúan como una barrera estructural pre-existente a la invasión de microorganismos (Schols & Voragen, 1996). La pared celular es la primera línea de defensa de las plantas, que tiene un importante papel en la prevención de infecciones. Su composición puede cambiar de acuerdo a la edad y las condiciones fisiológicas de la planta (Biscaro et al, 2009). ANTECEDENTES | 3 15 Si bien la composición química de los polímeros que componen la pared celular ha sido descrita en detalle, no existe un modelo definitivo acerca de la disposición tridimensional de estos componentes. El modelo más aceptado, propone que las microfibrillas de celulosa estarían entrecruzadas por xiloglucanos y que las pectinas estarían ocupando los espacios libres. En la figura 3, se esquematiza dicho modelo. Se observa por sobre la pared celular primaria la lámina media, que es una zona rica en pectinas entre las paredes primarias de dos células y que proporciona conexiones intercelulares (Guillermo, 2007). Fig.3.Representaciòn esquemática de la disposición de polisacáridos en la pared celular vegetal (Prasanna et al, 2007). Además, los componentes poliméricos de la pared celular tienen interacciones entre sí, teniendo una importancia en el arreglo y propiedades de la misma. Una representación simple y general de dichas interacciones se muestra en la figura 4. ANTECEDENTES | 3 16 Fig. 4 Esquema general de las interacciones presentadas entre los polisacáridos de la pared celular vegetal (Guillermo, 2007). 3.2.1 Sustancias pécticas Uno de los componentes importantes de las paredes celulares de las plantas está formado por el grupo de sustancias pécticas. Las sustancias pécticas son complejos glicosídicos de alta masa molecular. Son macromoléculas encontradas en las plantas superiores. Se encuentran presentes en la pared celular primaria y son los componentes principales de las laminillas medias, actuando como adhesivo extracelular en una delgada capa formada entre las paredes de las células jóvenes adyacentes. En consecuencia, son en gran parte responsables de la integridad estructural y la cohesión de los tejidos de las plantas. Con frecuencia la palabra pectina se utiliza como un nombre genérico para las sustancias pécticas. Las sustancias pécticas se clasifican de acuerdo con su nivel de esterificación; pectina tiene al menos 75% de los grupos carboxilo metilados; ácido pectínico tiene menos del 75% de los grupos carboxilo metilados; ácido péctico o ácido poligalacturónico no tiene ningún grupo carboxilo metil esterificado (Biscaro et al, 2009).Estas macromoléculas tienen carga negativa y son ácidas. Representan entre el 0,5 al 4% del peso fresco de material vegetal, no tienen un peso molecular definido. Las masas moleculares relativas de las sustancias pécticas van desde 25 hasta 360 kDa (Singh et al, 2005). ANTECEDENTES | 3 17 En general, las pectinas son el grupo de componentes mayoritarios en la pared celular de los frutos y pueden llegar a conformar la mitad del contenido polimérico de la pared (Guillermo, 2007). La pectina es un material polimérico que tiene grupos carboxílicos esterificados con metanol. Se puede dividir en dos regiones; “región lisa” y “región vellosa”, dependiendo del grado de ramificaciones que contenga la cadena de ácido galacturónico. El grado de esterificación depende de la fuente de la que se obtenga. En su mayoría se compone estructuralmente de tres tipos de polisacáridos bien caracterizados; homogalacturonano (HGA), ramnogalacturonano I (RGI) y ramnogalaturonano II (RGII). Estos tres polisacáridos forman una red compleja (Yadav et al, 2009). El HGA representa la cadena principal de la molécula de pectina, que contiene enlaces α-1,4 entre residuos de ácido-D-galacturónico que pueden estar metilados en la posición 6 (Yadav et al, 2009). Es conocido como la región lisa de la pectina (Fig. 5). RGI se compone de la repetición del disacárido ramnosa-ácido galacturónico. Losresiduos galacturónicos pueden ser acetilados y ambos residuos puede llevar cadenas laterales de azúcares neutras como galactosa, arabinosa y xilosa (Fig. 6). RGII es, a pesar de su nombre, una cadena de homogalacturonano con cadenas laterales de complejos unidos a los residuos de ácido galacturónico (Fig. 7) (Biscaro et al, 2009). Fig. 5 Representación esquemática del Homogalacturonano (HGA) (Guillermo, 2007). ANTECEDENTES | 3 18 Fig. 6 Representación esquemática del Ramnogalacturonano I (RI) (Guillermo, 2007). Fig. 7 Representación esquemática del Ramnogalacturonano II (RII) (Guillermo, 2007). 3.3 Enzimas fúngicas degradadoras de la pared celular de plantas Los patógenos de plantas atacan a las células diana mediante la producción de un número de enzimas degradadoras de la pared, facilitando así la entrada y expansión del patógeno en el tejido del huésped. Tales enzimas fitopatógenas incluyen pectinasas, celulasas, xilanasas y proteasas (Yadav et al, 2009). ANTECEDENTES | 3 19 La producción de múltiples formas de enzimas mejora la capacidad del microorganismo de adaptación a las modificaciones del medio ambiente. La mayoría de los microorganismos patógenos producen una gran variedad de enzimas degradadoras de la pared celular de las plantas y algunos estudios muestran que, a este respecto, poligalacturonasas juegan un importante papel en la virulencia de algunos hongos y bacterias (Biscaro et al, 2009). Particularmente los hongos secretan ácidos y enzimas a su ambiente circundante, para romper las moléculas poliméricas en otras más simples como estrategia nutricional (Pradal, 2012). En el género Aspergillus se han identificado cuatro tipos de celulasas, aunque el número de isoenzimas producidas por diferentes especies, e incluso diferentes cepas de la misma especie, puede variar. Además, se ha observado la producción de celulasas y xilanasas por Aspergillus bajo la presencia de ciertas fuentes de celulosa y xilosa respectivamente en el medio de cultivo (Pradal, 2012). Cepas de A. flavus producen grandes cantidades de enzimas; pectinasas, celulasas, proteasas y xilanasas, que probablemente aumentan su capacidad de utilizar una amplia gama de recursos orgánicos (Cotty et al, 1994), incrementando así su capacidad de penetración e invasión de los cultivos. 3.3.1 Pectinasas Las pectinasas son un gran grupo de enzimas que descomponen los polisacáridos pécticos de tejidos vegetales en moléculas simples como ácido galacturónico (Biscaro et al, 2009). Dado que las sustancias pécticas son un grupo de macromoléculas muy complejo, se necesitan varias enzimas pectinolíticas para degradarlas por completo (Biscaro et al, 2009). En la región peluda actúan enzimas como la exogalacturonasa, la ramnogalacturonano hidrolasa, la ramnogalacturonano ramnohidrolasa y α- ANTECEDENTES | 3 20 ramnosidasa, mientras que en la región suave actúan enzimas como las endo- y exo- poligalacturonasas y liasas. Las pectinasas son unas de las enzimas más ampliamente distribuidas en las bacterias, los hongos y las plantas (Singh et al, 2005). Estas se producen abundantemente por hongos saprófitos en tejido vegetal en descomposición, que representa el sustrato más común para los microorganismos productores de pectinasas (Biscaro et al, 2009). Casi todas las preparaciones comerciales de pectinasas se producen a partir fuentes fúngicas. Aspergillus niger es la especie fúngica más comúnmente utilizada para la producción industrial de enzimas pectinolíticas (Singh et al, 2005). El ataque de plantas por microorganismos por lo general comienza por el ataque de enzimas pectinolíticas al ser las sustancias pécticas más accesibles que otras fibras en el tejido vegetal (Biscaro et al, 2009). Estas enzimas desempeñan un papel fundamental en la completa degradación de la pared celular de la planta, ya que la despolimerización de pectina expone a otros componentes de la pared (Kitamoto et al, 2001). Además, las enzimas pectinolíticas endógenas en plantas son de gran importancia para el ablandamiento de algunos tejidos durante la maduración y el almacenamiento. Estas también ayudan a mantener el equilibrio ecológico, causando la descomposición y el reciclaje de materiales de plantas de residuos. El deterioro de frutas y verduras por podredumbre es otra de las manifestaciones principales de las enzimas pectinolíticas (Singh et al, 2005). Varios estudios sobre las enzimas microbianas, de diversas cepas, han demostrado la producción de múltiples formas moleculares de pectinasas que difieren en propiedades físicas y cinéticas (Biscaro et al, 2009). Las pectinasas comprenden un número de enzimas clasificadas en varias clases y subclases dependiendo la especificidad de sustrato y modo de acción (Yadav et al, 2009). Entre las pectinasas se distinguen dos grupos: las pectinesterasas, las cuales ANTECEDENTES | 3 21 remueven los grupos metoxilo, y las despolimerasas (hidrolasas y liasas) que degradan la cadena principal (Vallejo et al, 2009). Las diferencias estructurales entre las cadenas principales de la región ramificada y la región lisa de la pectina tienen implicaciones en las enzimas que degradan cada región (Pradal, 2012). Enzimas como protopectinasas, poligalacturonasas, pectina liasas y esterasas son algunas de las enzimas pectinolíticas más ampliamente estudiadas. Las protopectinasas catalizan la solubilización de protopectina. Las poligalacturonasas hidrolizan la cadena de ácido poligalacturónico mediante la adición de agua y son los más abundantes entre todas las enzimas pectinolíticas. Las liasas catalizan la escisión por trans-eliminación del polímero de ácido galacturónico. Las pectinesterasas liberan metanol por desesterificación de los enlaces éster en la cadena principal de la pectina (Singh et al, 2005). Las enzimas más importantes que participan en la degradación de la cadena principal pueden dividirse en hidrolasas y liasas. En Aspergillus se han identificado seis tipos de hidrolasas La cadena principal de la región lisa puede ser hidrolizada por pectin liasas, pectato liasas y poligalacturonasas. En la región rugosa, participan un gran número de enzimas degradadoras. Tanto enzimas que actúan en la región rugosa como la exogalacturonasa, la ramnogalacturonano hidrolasa, la ramnogalacturonano ramnohidrolasa y la ramnosidasa; como las endo- y exo-poligalacturonasas que actúan en la región lisa, hidrolizan el sustrato vía un mecanismo de inversión. Las liasas rompen la cadena principal de la pectina mediante β-eliminación (Pradal, 2012). La producción de enzimas pectinolíticas se ha encontrado al hacer crecer a hongos en pectina de betabel, pectina de manzana, ácido poligalacturónico, una combinación de ramnosa y ácido galacturónico, y harina de frijol de soya. Sin embargo, también se ha reportado que algunas enzimas pectinolíticas y algunos genes que codifican para poligalacturonasas se producen y se expresan constitutivamente en A. flavus, A. parasiticus y A. niger (Pradal, 2012). ANTECEDENTES | 3 22 La regulación de los genes pectinolíticos parece ser compleja, pues la expresión en cada organismo se presenta en diferentes momentos y en respuesta a diferentes fuentes de carbono que contienen ácido D-galacturónico (Biscaro et al, 2009), lo que resulta en una posible producción de una gran variedad de enzimas pectinolíticas. La capacidad de algunos microorganismos fitopatógenos de producir una variedad de enzimas pectinolíticas que difieren en sus características, principalmente en su especificidad de sustrato, puede darles más eficacia en la degradación de la pectina de la pared celular y por consiguiente más éxito en la infección de plantas (Biscaro et al, 2009). Tabla 1 Resumen de las principales enzimas pécticas 3.3.2Transeliminasas Las pectin liasas y pectato liasas son conocidas como transeliminasas por su modo de acción sobre la pectina. Ambas escinden la cadena principal de pectina por β- eliminación, lo que resulta en la formación de un extremo no reductor 4,5-insaturado (fig. 8), dando como resultado una conjugación con el resto del carbonilo del metil ester que presenta una fuerte absorción de radiación UV a 235 nm (Famurewa et al, 1993). ANTECEDENTES | 3 23 Fig. 8 Representación esquemática de la reacción de despolimerización de la pectina por acción de las pectin liasas (Singh et al, 2005). Entre todas las pectinasas, las liasas son de particular interés porque degradan polímeros de pectina directamente por el mecanismo de β-eliminación, mientras que otras pectinasas actúan secuencialmente para degradar la molécula de pectina completamente (Yadav et al, 2009). Las pectin liasas prefieren sustratos con un alto grado de metilesterificación (De Vries & Visser, 2001) y actúan sobre los enlaces glucosídicos próximos a los grupos carboxílicos metil esterificados (Gummadi & Sunil, 2005), mientras que las pectato liasas prefieren aquellos con un bajo grado de esterificación. Una distinción más clara entre estos dos tipos de enzimas se puede hacer basado en el requisito absoluto de iones Ca2+ para la catálisis por pectato liasas a diferencia de las pectin liasa que son independientes de este ión (De Vries & Visser, 2001). El aumento del pH del medio promueve el descenso en la producción de poligalacturonasas y aumento en liasas cuyo pH óptimo de actividad suele ser alcalino (pH 8-10) (Guevara, 1997). 3.3.2.1 Pectin liasas Las pectin liasas catalizan la escisión aleatoria de pectina, preferentemente de pectina altamente esterificada. Estas enzimas no requieren estrictamente de Ca2+, pero son estimuladas por este y otros cationes. Hasta ahora todas las pectin liasas descritas son endo pectin liasas (Biscaro et al, 2009). Las endo pectin liasas son las únicas enzimas conocidas capaces de escindir sin la acción previa de otras enzimas (Singh et al, 2005) pectinolíticas como las pectinesterasas. ANTECEDENTES | 3 24 Para la degradación completa del sustrato de pectina se requiere además de enzimas que escindan la cadena del ramnogalacturonano (Biscaro et al, 2009). Se ha reportado que en su mayoría las pectin liasas se obtienen de microorganismos y existen escasos reportes de su presencia en plantas y animales (Singh et al, 2005). Estas enzimas se cree que juegan un papel importante en el proceso de la infección inicial y la maceración de los tejidos vegetales (Famurewa et al, 1993). Las pectin liasas y otras pectinasas son enzimas inducibles y su producción está influenciada por la fuente de carbono (Gummadi & Sunil, 2005), siendo las que contienen en su estructura ácido-D-galacturónico las que promueven mayoritariamente su producción. Albersheim et al (1960) fue el primer grupo de trabajadores en informar sobre la capacidad de las enzimas para romper los enlaces glicosídicos de sustancias pécticas para liberar unidades de galacturónidos insaturados dividiendo el enlace en el C-4 con la eliminación simultánea de H+ del C-5. Desde entonces, esta reacción ha sido reportada para un gran número de bacterias y hongos, además se ha documentado que se requiere de la presencia de pectina para la inducción de la producción de otro tipo de transeliminasas para un gran número de microorganismos, lo que indica que las transeliminasas pueden ser de carácter constitutivo e inductivo. Todas las enzimas que hasta el momento se han reportado contribuyentes a la maceración de tejidos y la muerte celular vegetal son las capaces de dividir el enlace α-1,4-D–glicosídico de las sustancias pécticas. Por lo tanto, la maceración y la muerte celular en los tejidos vegetales pueden ser debido a la directa descomposición de sustancias pécticas presentes y accesibles en los tejidos de células huésped infectadas (Famurewa et al, 1993). Existen escasos informes sobre la producción de pectin liasas reportados en la literatura. Se ha reportado que son las pectin liasas son en su mayoría sintetizadas por hongos, por ejemplo, Aspergillus japonicus, Penicillium paxilli, Penicillium sp., Pythium splendens, Pinus Pichia, Aspergillus sp, Thermoascus auratniacus (Singh et al, 2005). ANTECEDENTES | 3 25 El efecto de la aireación y agitación en la morfología de hongos es crucial para la máxima producción de pectin liasas (Gummadi & Sunil, 2005). 3.3.3 Regulación genética de las enzimas degradadoras de pared celular en Aspergillus 3.3.3.1 Expresión coordinada de los genes que codifican para el sistema pectinolítico La producción de enzimas que hidrolizan la cadena central de la pectina se detecta cuando Aspergillus se desarrolla en medios con pectina de remolacha azucarera, pectina de manzana, ácido poligalacturónico y harina de soya. Por otra parte, algunas enzimas pectinolíticas se producen constitutivamente. Adicionalmente se ha obtenido evidencia de que el ácido galacturónico y el ácido glucurónico, adicionados o liberados como monómero a parir de un polisacárido, funcionan como inductor general de los genes que codifican para las enzimas del sistema pectinolítico (De Vries & Visser, 2001). 3.3.3.2 Represión catabólica por fuente de carbono La represión catabólica por fuente de carbono en Aspergillus es predominantemente mediado por la proteína represora de unión al ADN llamada CreA (Dowser & Kelly, 1991, Ruijter & Visser 1997). En presencia de fuentes de carbono que pueden ser fácilmente metabolizados (por ejemplo, D-glucosa, D-fructosa), CreA reprime la expresión de un gran número de genes mediante la unión a sitios específicos a los promotores de estos genes. CreA juega un papel importante en la regulación de la expresión de genes de Aspegillus que codifican para los sistemas de degradación de la pared celular vegetal. La represión por CreA ha sido reportado para los genes que codifican para arabinasas (Ruijter et al, 1997), endoxilanasas (Fernández-Espinar et al, 1994; Pinaga et al, 1994), β-xilosidasa (Kumar &Ramón, 1996), arabinoxilan arabinofuranohidrolasa (Gielkens et al, 1997), feruroilesterasas (De Vries et al, 2002),y varias pectinasas (Bussink et al, 1991; Maldanado et al, 1989; Solis-Perreira et al, 1993) ANTECEDENTES | 3 26 3.3.3.3 Expresión de genes dependiente de pH Al igual que CreA en represión catabólica, PacC es la principal proteína involucrada en regulación genética regulada por pH en Aspergillus. A pH alcalino PacC activa genes que reprime a pH ácido, por lo que PacC tiene funciones duales. En condiciones alcalinas PacC se activa mediante proteólisis en la región C-terminal, lo cual le permite unirse a sitios clave en el promotor de los genes blanco. Específicamente la regulación genética por pH de las enzimas que degradan la pared celular de plantas, no ha sido estudiada a detalle, sin embargo se han obtenido indicios de una expresión dependiente de pH en los sistemas xilanolítico y pectinolítico (De Vries & Visser, 2001). 3.4 Aislamiento y purificación de Proteínas La purificación de enzimas nos es de utilidad para la caracterización de las mismas, siendo una importante línea de investigación que permite la discriminación entre los componentes de complejos enzimáticos sobre mecanismo de degradación del sustrato, las condiciones óptimas de actividad y regulación de la síntesis de la enzima. (Biscaro et al, 2009). Las pectin liasas producidas por A. flavus son enzimas extracelulares debido a la función que cumplen (ruptura de la pared celular de plantas), pudiendo entonces separar las células del medio de cultivo y purificarlas a partir de este último mediante diversos procedimientos dependiendo de las características de cada enzima. Algunasde las características y técnicas mayormente aprovechadas para la purificación de pectinasas del género Aspergillus han sido: solubilidad; salting in o salting out, carga iónica; cromatografía de intercambio iónico, y tamaño molecular; cromatografía de filtración por geles 3.4.1 Cromatografía La cromatografía es la técnica más potente de que se dispone para la purificación de enzimas y proteínas en general. Los métodos más comunes a nivel en laboratorio e ANTECEDENTES | 3 27 industria son clasificados de acuerdo con la característica de la enzima en que está basada la técnica. Las técnicas más comunes en la recuperación de proteínas son la cromatografía de intercambio iónico y de permeación en gel. Son de fácil implementación y permiten obtener elevados factores de purificación (incremento en la actividad especìfica) Ambas tecnicas han sido empleadas en la purificaciòn de pectin liasas de Aspergillus flavus (Yadav et al, 2008 y Yadav et al, 2007) y pectinasas, por lo que desde esta perspectiva, son herramientas que pueden ser de utilidad en la determinacion de protocolos de purificación de otras pectinasas producidas por distintas cepas de esta especie 3.4.1.1 Cromatografía de intercambio iónico y cromatografía de filtración en gel La cromatografìa de intercambio iónico es relativamente simple. Se requiere de un material hidrofìlico insolubles de carga opuesta a la carga neta de la proteìna. Se cuenta asì con resinas de intercambio ionico catiònico o intercambio anionico. Una vez unida la enzima a la resina y separada del resto de las proteìnas, es selectivamente eluida incrementando la concentraciòn de sal o bien modificando el pH. (Garcìa et al, 1993). Por otro lado el buffer en el que se aplica la enzima debe ser de baja fuerza iònica (de 10 a 50mM), siendo el pH uno de los parámetros a seleccionar si se conoce el punto isoeléctrico de la enzima. La selecciòn de soportes para la cromatografía de permeación en gel es directo, pues el principal factor a considerar en que el peso molecular de la enzima esté ubicado ANTECEDENTES | 3 28 dentro del rango de fraccionamiento del gel. Esta técnica permite por lo tanto, previa estandarización, tener una idea del peso molecular de la enzima (García et al, 1993). 3.4.1.2 Separación de proteínas por precipitación con sales (salting out) La multiplicidad de grupos ácidos y básicos de una proteínas hace que su solubilidad dependa de las concentraciones de las sales disueltas (Voet & Voet, 2006), lo cual se traduce a un cambio en la fuerza iónica del medio. A fuerzas iónicas elevadas se reduce la solubilidad de las proteínas, como la de la mayoría de las sustancias. Este efecto, conocido como salting out (reducción de la solubilidad por sales) es sobre todo resultado de la competencia por las moléculas de solvatación entre los iones salinos agregados y los otros solutos disueltos. En términos termodinámicos, se reduce la actividad del solvente (Voet & Voet, 2006). El sulfato de amonio es el reactivo más utilizado para el salting out de las proteínas, ya que su solubilidad elevada permite obtener soluciones de gran fuerza iónica. Los iones que reducen la solubilidad de las proteìnas estabilizan sus estructuras nativas, de manera que las proteínas sometidas a salting out no sufren desnaturalización (Voet & Voet, 2006). MATERIAL Y MÉTODOS| 4 29 CAPÍTULO 4 MATERIAL Y MÉTODOS 4.1 Cultivo del microorganismo Se utilizó la cepa de Aspergillus flavus CECT-2687, obtenida de la Colección Española de Cultivos Tipo, Parque Científico de la Universidad de Valencia, en Paterna España, productora de aflatoxinas. La cepa se activó en agar papa dextrosa (PDA) mediante tres o cuatro perlas de esporas liofilizadas. Las placas se incubaron a 37°C por 72h. Se tomó una asada del cultivo con un asa micológica estéril, que fue depositada al centro de una placa con agar Sabouraud; a continuación, el inóculo fue extendido en toda la placa utilizando un asa de Drigalsky. La placa se incubó a 37°C por 72h. La cepa se manejó en una suspensión de esporas; se resembró quincenalmente en placas con agar Sabouraud (SA) mediante siembra masiva para mantener la cepa viable y hacer una nueva suspensión de esporas. Las placas se incubaron a 37°C por 72 h, tras lo cual se mantuvieron en refrigeración a 4°C durante quince días. Para la cosecha de esporas se vertieron 10 mL de solución salina isotónica (0.9% p/v) con Tween 80 (0.005% v/v) estéril en una de las cajas sembradas, y se raspó suavemente su superficie con un asa Drigalsky para recuperar las esporas. Una vez que las esporas estuvieron suspendidas en la solución, esta se transfirió con pipeta a un tubo estéril para centrífuga con tapón. Para lavar las esporas, se centrifugó la suspensión a 500 rpm por 5 min y se desechó el sobrenadante; a continuación, las MATERIAL Y MÉTODOS| 4 30 esporas se resuspendieron hasta alcanzar un volumen de 10 mL de solución salina con Tween; dicho lavado se realizó cuatro veces más. 4.2 Producción de enzimas en medio líquido 4.2.1 Medios y condiciones de cultivo Para la producción de las enzimas, se inocularon matraces de 500 mL, con 100 mL de medio, con una cantidad total de 1x106 esporas de Aspergillus flavus CECT-2687 en el total de volumen. Los medios de cultivo contenían medio basal (KH2PO4 2g/L, K2HPO4 2 g/L y (NH4)2SO4 5 g/L) y 1% p/v de cáscara de limón seca, triturada y lavada con etanol previamente como fuente de carbono. Se prepararon dos soluciones y se esterilizaron por separado. La solución de fosfatos fue preparada a una concentración de 4g/L y se ajustó, con NaOH o H2SO4, a un pH de 9, mientras que la solución de cáscara de limón al 2% con (NH4)2SO4 10g/L se ajustó a un pH de 6. Se esterilizaron a 121°C y 15 psi por 20 min. Una vez estériles ambas soluciones se mezclaron en los matraces en una proporción 50:50 con el fin de obtener un pH aproximado de 8 y un medio con una concentración de 2 g/L KH2PO4, 2 g/L K2HPO4, 5 g/L (NH4)2SO4 y 1% p/v de cáscara de limón. Los matraces fueron incubados a 37°C por 72 horas en una incubadora con movimiento recíproco a 300 rpm, para favorecer la aireación y homogenización del medio. 4.3 Obtención de filtrados enzimáticos crudos 4.3.1 Inóculo para fermentación Se concentró la suspensión de esporas de Aspergillus flavus CECT 2687, obtenida de cajas de agar Sabouraud incubadas durante 72h a 37°C y recién cosechadas con la solución salina isotónica (0.9% p/v) y Tween 80 (0.005% v/v), por centrifugación a 4500 rpm por 5 minutos, se resuspendió en 5 mL de solución salina isotónica(0.9% p/v) y Tween 80 (0.005% v/v) y se determinó el número de esporas/mL en la cámara Neubauer. Con esto se inocularon los matraces con medio líquido, con una concentración final en el medio de cultivo de 1x106 esporas. MATERIAL Y MÉTODOS| 4 31 4.3.2 Fermentación en lote Los matraces con los medios de cultivo líquidos se muestrearon a diferentes tiempos (0, 24, 48 y 72 horas), tomando en cada muestra 5 mL, los cuales se filtraron usando papel filtro Whatman 1 para retener la biomasa y la cáscara de limón residual. Los filtrados libres de células y sustrato se almacenaron en refrigeración a 4°C, hasta la determinación de sus actividades enzimáticas. 4.3.3 Actividad exo-pectinolítica medida por grupos reductores Se determinó por la cuantificación de azúcares reductores liberados por la pectina por el método DNS, usando una curva patrón de ácido galacturónico. La mezcla de reacción consistió de 0.5 mL de una solución de pectina cítrica 1% (p/v) a pH 5 en agua destilada, 0.4 mL de solución amortiguadora de acetatos 100 mM a pH 5 y la reacción se inició con la adición de 0.1 mL de filtrado libre de células, se incubó durante 20 minutos a 45°C. Al término de estetiempo de incubación se agregaron 2 mL de reactivo DNS, la mezcla se calentó a ebullición en baño María por 5 min, se agregaron 5 mL de agua destilada y se homogeneizaron en un vortex. Finalmente se centrifugó a 500 rpm durante 5 min para eliminar la pectina insoluble y se leyó a una longitud de onda de 575 nm en el espectrofotómetro para medir los azúcares reductores producidos por la degradación del sustrato. Respecto a los blancos, se incubaron sin muestra y tras la adición del DNS se le añadió 0.1mL de filtrado enzimático y se continuó con el mismo tratamiento que se le dio a las muestras. La actividad se expresó en unidades enzimáticas (U), definidas como la cantidad de enzima necesaria para producir 1 µmol de ácido galacturónico en las condiciones de ensayo. 4.3.4 Actividad de pectin liasas Se determinó a partir del incremento en la absorbancia como consecuencia del doble enlace formado en la reacción de β-eliminación. La mezcla de reacción constó de 0.5 mL de buffer de Tris-acetatos 100 mM con CaCl2 12 mM (pH 9), 0.5 mL de solución de pectina cítrica 1% p/v (pH 5.0) y 0.2 mL de filtrado enzimático. Los reactivos se adicionaron en ese orden en tubos de ensayo de 12x75 mm, y se consideró que la reacción iniciaba al momento de agregar el filtrado; se incubó durante 1 h a 40°C, y la reacción se detuvo adicionando 0.1 mL de HCl 1N. A partir de ello se hizo una dilución MATERIAL Y MÉTODOS| 4 32 1:10, colocando 0.2 mL de la mezcla de reacción en otro tubo de ensayo de 12x75 mm y adicionándole 1.8 mL de HCl 10 mM. Se leyó la absorbancia de las muestras a una longitud de onda de 235 nm. En el caso de los blancos, éstos se incubaron sin muestra y tras la adición del HCl 1N se les añadieron los 0.2 mL de filtrado enzimático. La actividad de pectin liasas se expresó en unidades enzimáticas (U), siendo que cada unidad causa el incremento de 1.0 en la absorbancia a 235nm debido a la liberación del Δ-4,5 urónido insaturado producido a partir de la β-eliminación que tiene una fuerte absorción a esa longitud de onda. 4.3.5 Concentración de los filtrados enzimáticos por liofilización y precipitación con Sulfato de Amonio Se tomó el total de volumen de filtrado enzimático previamente centrifugado a 6000 rpm durante 20 minutos, los cuales fueron congelados a -70°C, y liofilizados a 5x10-3 mbar y -50°C por 48 horas. El sólido obtenido se resuspendió en una décima parte del volumen inicial con buffer de acetatos 100 mM (pH 5). Una vez resuspendido el sólido, se adicionó sulfato de amonio hasta una saturación del 80% para precipitar las proteínas, dejándolo en agitación durante 20 minutos y en reposo durante 24 horas en refrigeración a 4°C. La suspensión se centrifugó a 16000 rpm durante 20 minutos. Se decantó la solución y se desechó el líquido remanente. El pellet obtenido se resuspendió en la décima parte del volumen original. Este último concentrado se dializó contra agua de la llave durante media hora, durante media hora más contra agua destilada y una vez más contra buffer de renaturalización (Tris-HCl 10 mM pH 7.5) durante una hora. 4.4 Purificación 4.4.1 Cromatografía de intercambio iónico El filtrado enzimático se diluyó 3:10 con agua destilada. Se inyectó al equipo 1 mL de la dilución. Se utilizó una columna de intercambio iónico: High Q Cartdridge (BIO RAD), y el equipo Fast Protein Liquid Chromatography (FPLC), Pharmacia Biotech. MATERIAL Y MÉTODOS| 4 33 Columna de intercambio iónico Econo-Pac High Q Cartridge. BIORAD. Tipo: fuerte intercambio iónico. Grupo Funcional: -N+(CH3)3 Volumen: 5 mL Capacidad de unión de proteína: ≥75 mg ferritina Capacidad iónica de la matriz: 190 ± 40 µeq Diámetro de partícula 50 µm Tamaño de poro: 1000 A Intervalo de pH: 2-12 Para la elución de proteína de la columna de intercambio iónico Econo-Pac High Q Cartridge BIORAD, se utilizó una solución amortiguadora de fosfatos 100 mM a pH 6, 1M de NaCl. Todas las soluciones empleadas para la cromatografía se desaerearon durante 20 minutos. Se empleó un flujo de 1mL/min, un gradiente de NaCl de 0 a 1M a partir de la fracción 10 hasta la 40, colectando un total de 45 fracciones de 3mL cada una. 4.4.2 Pre-tratamiento de las fracciones enzimáticas provenientes de una cromatografía para su uso en geles de SDS-PAGE (SDS Polyacrilamide-Gel Electrophoresis) Se midió la actividad de pectin liasas a cada fracción obtenida de la cromatografía de intercambio iónico y se seleccionaron las ocho fracciones que presentaron la mayor actividad. Cada fracción seleccionada se colocó en un tubo de diálisis Spectra/Por, se dializó una vez contra agua destilada por 1 hora con agitación constante; se dializó dos veces más contra buffer de renaturalización (Tris-HCl 10 mM pH 7.5) durante 1 hora en cada ocasión, con agitación constante. MATERIAL Y MÉTODOS| 4 34 Cada fracción se colocó en un tubo de ensayo de 12x75 mm, fueron congelados a - 70°C, y liofilizados a 5x10-3 mbar. Los sólidos obtenidos se resuspendieron en 50 μL de buffer de tanque 1x (0.025 M TRIZMA-BASE, 0.192 M glicina, 0.1% SDS, pH 8.3). 4.4.3 Obtención de geles de SDS-PAGE La preparación de los geles de poliacrilamida de 8x8 cm con SDS se realizó en condiciones desnaturalizantes. Se tomaron 5 μL de muestra concentrada a la cual se adicionó un volumen equivalente de buffer de tratamiento desnaturalizante (SDS 4%, glicerol 20%, 2-β-mercaptoetanol 10%, buffer Tris-HCl 125 mM a pH 6.8 y azul de bromofenol 0.005%) 2X. El gel separador se preparó al 10% de acrilamida. La electroforesis se corrió a corriente constante (15 mA/gel), por alrededor de 1 hora, a través de una unidad de geles verticales de 1.0 mm Mini-PROTEAN Tetra Cell (Bio- Rad Laboratories, Inc.). Los geles para determinar peso molecular se sumergieron en una solución de azul de Coomasie R-250 al 0.025%, metanol al 40% v/v y ácido acético al 7% v/v durante una hora con agitación suave (40 rpm) para teñir la proteína y se destiñeron con una solución de ácido acético al 10% v/v. 4.4.4 Zimogramas Cada vez que se corrió un gel para determinar proteína, uno análogo se corrió para generar su zimograma. Los geles de acrilamida, por separado, se incubaron en buffer de renaturalización (Tris-HCl 10 mM pH 7.5) a 37°C por 1 h; se decantaron e incubaron en buffer de Tris- acetatos 100 mM (pH 9.0) a 37°C durante 30 min. Se decantaron y se incubaron, para observar la actividad de las pectin liasa, en una mezcla 50:50 de pectina cítrica al 1% p/v (pH 5) y buffer Tris-acetatos 100mM (pH 9.0), a 37°C por 1 h. Se decantaron y se eliminó el exceso de sustrato con agua destilada; se deshidrataron en etanol al 96% a temperatura ambiente por 15 min, y se rehidrataron con agua destilada por 20 min. El gel se tiñó con una solución de rojo de Rutenio al 0.05% p/v por 30 min con agitación suave, y se lavó con agua destilada para remover el exceso de colorante. MATERIAL Y MÉTODOS| 4 35 4.5 Caracterización 4.5.1 Medición de proteína por el método de Bradford Se preparó una solución stock de albúmina (0.1mg/mL) para hacer una curva estándar La curva se hizo por duplicado empleando las cantidades de la tabla 2 en los pozos de una microplaca de policarbonato: Las muestras a las que se les midió la concentración de proteína se diluyeron, agregando 50 µL de muestra y 50µL de agua en cada pozo. Finalmente, se agregaron 200µL del reactivo de Bradford a todos los pozos de reacción, incluyendo a la curva estándar. Se dejó reaccionar durante 5minutos medidos a partir de agregado el reactivo al último pozo y se leyó a 595nm. Tabla 2.Cantidades a adicionar en una microplaca de policarbonato para construir una curva estándar de albúmina de huevo por el método de Bradford. Punto de la curva estándar Volumen de solución stock (µL) Volumen de Agua (µL)1 0 100 2 5 95 3 10 90 4 15 85 5 20 80 6 25 75 7 30 70 8 40 60 9 50 50 10 60 40 4.5.2 Preferencia de sustrato Se prepararon soluciones con las pectinas disponibles (Tabla 3) con diferentes grados de esterificación y con ácido poligalacturónico al 1% y ajustando su pH a 5 con NaOH. Se midió la actividad de la pectin liasa normalmente empleando cada una de las soluciones preparadas como sustrato. MATERIAL Y MÉTODOS| 4 36 Tabla 3. Pectinas empleadas para determinar la preferencia de sustrato y su grado de esterificación Pectina Grado de esterificación (%) Sigma 46 Citrus fruits 57.6 Cítrica 58.8 Sigma esterificada 90 Sigma altamente esterificada 93 4.5.3 Determinación del pH óptimo Se prepararon buffers 100mM ajustados a diferentes intervalos de pH y adicionados con 10mM de Ca2+, con los cuales midió la actividad de la pectin liasa normalmente. Los buffers usados y los rangos de cobertura de cada uno se presentan en la siguiente tabla: Tabla 4.Buffers usados para la determinación de pH óptimo y el rango de pH para cada uno. Buffer Rango de pH Acetatos 3-6 MOPS 6.5-7.9 Borato-cloruros 8.1-9.5 Tris-acetato 7-9 4.5.4 Determinación de temperatura óptima Se determinó la actividad empleando buffer tris-acetatos (100mM) a pH 9 empleando temperaturas de incubación de 30 a 75ºC. 4.5.5 Determinación del efecto de iones Se prepararon soluciones con buffer tris-acetatos (100mM) a pH 9 adicionadas con los iones Ca2+, Ba2+, Co2+, Zn2+, Mn2+ y Mg2+(10mM) y una más con EDTA (20mM) como agente quelante. Se midió la actividad a 60ºC usando las soluciones preparadas. MATERIAL Y MÉTODOS| 4 37 4.5.6 Estabilidad al pH El concentrado enzimático se diluyó 1:50 veces con buffers a diferentes pH`s entre 3 y 9.5, preparando 3mL con cada pH. Las muestras se dispusieron en tubos de 12x75mm, dividiendo la cantidad de mezcla con cada buffer en dos tubos y tapadas con Parafilm. La mitad de los tubos, conteniendo todo el rango de pH, se incubaron a 4ºC durante 24 horas, mientras que la otra mitad se incubó a 30ºC durante el mismo tiempo. Finalmente, pasado este tiempo se midió la actividad a 60ºC de cada tubo, por ser esta temperatura determinada como la optima para la enzima en cuestión. 4.5.7 Estabilidad a la temperatura El concentrado enzimático se diluyó 1:50 veces con buffer de borato-cloruros (100mM; pH 9) por ser este el buffer en el que se encontró mayor estabilidad de la enzima, preparando 15 mL de disolución para cada temperatura a probar. Se incubó a 30, 40, 50, 60, 70 y 80ºC, tomando una muestra de un mililitro cada cierto rango de tiempo en minutos dependiendo de la temperatura empleada, tomando muestras en un intervalo menor para 80ºC y en uno mayor para 30ºC. Se midió la actividad residual a 60ºC al final del ensayo de cada muestra tomada y de la solución inicial. 4.5.8 Cinética enzimática Se preparó una solución stock de pectin cítrica al 2% ajustando el pH a 5 con NaOH 1M, de la cual se hicieron diluciones para obtener soluciones de 0.1, 0.15, 0.2, 0.25, 0.3, 0.35, 0.4, 0.45, 0.5, 0.6, 0.7, 0.8, 0.9, 1.0, 1.2, 1.4, 1.6, 1.8 y 2. Cada solución se ajustó a pH 5 con NaOH. Se midió la actividad a 60º con cada una de la soluciones. MATERIAL Y MÉTODOS| 4 38 4.6 Esquema general de la producción, purificación y caracterización de pectin liasas de Aspergillus flavus CECT 2687 Purificación Fig. 9 Esquema general de la producción, purificación y caracterización de pectin liasas de Aspergillus flavus CECT 2687 Recuperación, activación y mantenimiento de cepas. Producción de enzimas en medio líquido en matraces agitados. Preparación de concentrados enzimáticos por liofilización y precipitación. Cromatografía de intercambio iónico. Análisis electroforético y zimográfico. Análisis y caracterización de las enzimas Determinación de la estabilidad a la Temperatura y el pH. Determinación de Vmax y Km. Efecto de iones en la actividad. Determinación del pH, temperatura óptimos y Ea. RESULTADOS Y DISCUSIÓN| 5 39 CAPÍTULO 5 RESULTADOS Y DISCUSIÓN 5.1 Efecto de la concentración de la fuente de carbono sobre la producción de pectinasas en fermentaciones en lote La finalidad del estudio en fermentaciones en lote fue evaluar el efecto de la concentración de la fuente de carbono sobre la producción de pectinasas, en este caso se empleó cáscara de limón. En base a los resultados generados a partir de esta primera etapa de trabajo, se determinó la concentración a emplear durante los ensayos posteriores. Durante esta etapa se realizaron fermentaciones en lote empleando dos diferentes concentraciones de cáscara de limón (CL) como sustrato (1 y 2%) y medio basal a un pH inicial alrededor de 7.5, aunque se buscaba obtener un pH de 8 al ser mencionado como el más apropiado para la producción de pectinasas por Aspergillus flavus CECT 2687 en el trabajo realizado por Pradal (2012). La actividad exo-pectinolítica se midió en base a la producción de ácido-D- galacturónico como azúcar reductor, determinando como una unidad de actividad enzimática a la cantidad de enzima necesaria para producir 1 µmol de producto. Cada fermentación y ensayos de medición de actividad de exo-pectinasas se realizaron por duplicado (Fig. 10). RESULTADOS Y DISCUSIÓN| 5 40 Fig 10. Perfil de actividad exo-pectinolítca a través del tiempo en fermentaciones en lote con Aspergillus flavus CECT 2687 empleando dos concentraciones de cáscara de limón, 1 y 2%, como sustrato. El comportamiento de la actividad de las exo-pectinasas durante las primeras 48 horas de fermentación fue el mismo para ambas concentraciones de sustrato empleadas, mientras que en el periodo comprendido entre las 48 y 72 horas de fermentación se observa una diferencia al incrementar la producción de exo-pectinasas para el caso de la concentración de sustrato de 1% con respecto a la de 2%. Durante las primeras 24 horas de fermentación se observa que, en ambas condiciones, hubo un incremento notable en la producción de exo-pectinasas hasta un máximo de alrededor de 6 a 6.5 U/mL, lo que supone, y en coincidencia con los resultados obtenidos previamente sobre el comportamiento del crecimiento de Aspergillus sp en el trabajo de Aguilar & Huitrón (1986), que durante esta etapa de la fermentación se lleva a cabo la fase exponencial de crecimiento, siendo los residuos de ácido galacturónico libres y disueltos en el medio provenientes de la cáscara de limón los inductores de estas enzimas dado que los Aspergilli no son capaces de importar polisacáridos hacia dentro de sus células (De Vries, 2003; Mach 2003). Pasadas las 24 horas es notable RESULTADOS Y DISCUSIÓN| 5 41 una disminución en la actividad de exo-pectinasas, lo que sugiere que se ha llegado a la fase estacionaria de crecimiento, donde se presume una acumulación de productos por efecto de una mayor velocidad de degradación de la pectina en comparación con la utilización de los mismos para el crecimiento del hongo, habiendo así una represión por fuente de carbono. El incremento en la producción de exo-pectinasas en una segunda etapa posterior a una baja en la actividad, correspondiente al periodo entre las 48 y 72 horas, se propone que podría deberse a la inducción de algunas exo-pectinasas debido a la disminución de ácido galácturónico libre en el medio por su utilización para el crecimiento del hongo. Además, este incremento de la actividad exo-pectinolítica se propone que puede ser debida también a la regulación genética por pH, ya que al llegar el medio a un pH mucho más cercano a 8 a partir de las 48 horas (tabla 5) es donde se observa el incremento de la actividad para ambas concentraciones de sustrato,
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