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Teorías básicas del sueño
Centros nerviosos, sustancias neuro humorales y mecanismos capaces de causar sueño
Lesiones en los centros que favorecen el sueño pueden ocasionar un estado de vigilia intensa
Otras posibles sustancias trasmisoras relacionadas con el sueño
El sueño esta ocasionado por un proceso inhibidor
El sueño esta ocasionado por un proceso inhibidor activo
Teoría pasiva del sueño
La zona de estimulación para generar sueño natural son los núcleos del rafe en la mitad inferior de la protuberancia y en el bulbo raquídeo.
Las lesiones aisladas en los núcleos del rafe conducen a un grado de vigilia acusado.
los fármacos que imitan la acción de la acetilcolina incrementan la aparición de este sueño.
Péptido de muramilo, un compuesto de bajo peso molecular que se acumula en el líquido. Cuando se inyectan, aparece un sueño casi natural en cuestión de unos pocos minutos.
El sueño de ondas lentas queda interrumpido periódicamente por el sueño REM.
El exceso de actividad observado en ciertas regiones encefálicas durante el sueño REM.
Posible causa del sueño REM
Nonapéptido aislado de la sangre 
los tejidos nerviosos del tronco del encéfalo es posible que la vigilia prolongada desemboque en una acumulación progresiva de un factor hipnótico o varios en el tronco del encéfalo o en el líquido cefalorraquídeo, que acaben produciendo sueño.
Esto sucede con las lesiones bilaterales del área supraquiasmática rostro medial en el hipotálamo anterior. los núcleos reticulares excitadores del mesencéfalo y la parte superior de la protuberancia parecen quedar liberados de su inhibición, lo que origina esta situación de marcada vigilia. 
La estimulación de algunas zonas en el núcleo del tracto solitario puede generar sueño. Esta estructura es una terminación en el bulbo raquídeo y en la protuberancia de las señales sensitivas viscerales que penetran a través de los nervios vago y glosofaríngeo. 
El sueño puede promoverse mediante la estimulación de diversas regiones en el diencéfalo
Esta teoría estaba basada en que las áreas excitadoras del tronco encefálico se iban agotando a lo largo del día, por lo que cuando llegaba el momento de dormir, estaban ya fatigadas y se desactivaban. 
Esto quiere decir que en el cerebro existe una pequeña área que hace que partes de él se desactiven durante el sueño. Algo así como un vigilante que impide a otras áreas cerebrales que hagan su trabajo mientras duermes.