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Enzimas de restricción y escena del crimen. El resultado de cortar y pegar el DNA deseado con precisión es lo que se conoce como tecnología de DNA recombinante. El primer paso en el empalme de un gen, es localizarlo específicamente en un cromosoma. Las enzimas de restricción son usadas para aislar al gen que se requiere del resto del cromosoma. Estas mismas enzimas pueden ser usadas para cortar el DNA en el sitio en el cual el fragmento va a ser insertado. Las enzimas de restricción son biomoléculas que cortan o restringen sitios específicos del DNA. Éstas fueron identificadas y separadas por primera vez de bacterias, donde son usadas como un mecanismo de defensa natural para cortar el DNA de bacteriófagos –virus que infectan bacterias-. Cualquier DNA foráneo que encuentran las enzimas de restricción es cortado o restringido en muchos fragmentos inocuos. Existen muchas enzimas de restricción, y cada una es nombrada de acuerdo al organismo del cual fue aislada Cada enzima de restricción reconoce una secuencia específica de nucleótidos, llamada sitio de restricción (ver figura 17), y corta al enlace fosfodiéster de la molécula de DNA solamente en esa secuencia específica. Muchas enzimas dejan un fragmento corto de nucleótidos sin aparear, el cual es llamado extremo cohesivo, en el sitio donde el DNA fue cortado. En general los sitios de restricción son palindrómicos, lo que significa que pueden ser leídos hacia delante y hacia atrás en las cadenas opuestas y es lo mismo La estructura tridimensional de las enzimas de restricción les permite introducirse perfectamente en la ranura formada por las dos cadenas complementarias de la molécula de DNA. Una vez unida al DNA, la enzima literalmente se desliza a lo largo de la doble hélice hasta reconocer una secuencia específica de pares de bases, donde separa químicamente o corta a la molécula de DNA. Si existe más de un sitio de restricción en la molécula de DNA, se producirán múltiples fragmentos o si una molécula lineal de DNA es cortada con una enzima de restricción cuya secuencia específica de reconocimiento se encuentra en 5 diferentes localizaciones, se producirán 6 fragmentos de longitud variable. Cuando se utilizan estas enzimas de restricción para cortar una molécula circular de DNA como el de pGLO (ver figura 18), se producen fragmentos de varios tamaños que pueden ser analizados por el proceso conocido como electroforesis en geles de agarosa. El plásmido pGLO mide poco más de 5,400 pares de bases y puede ser cortado con enzimas de restricción para generar fragmentos de diferentes tamaños. En este mapa parcial se muestran los sitios en los que cortan algunas enzimas de restricción. Se muestran además, el origen de replicación (ori), la posición del gen que codifica para el regulador del operón de arabinosa, el promotor del operón , el sitio en donde se ha clonado el gen que codifica a la proteína verde-fluorescente, que ha sustituido a los genes estructurales del operón de arabinosa, y el sitio que ocupa el gen que codifica a la βlactamasa (Ampr ), lo que confiere resistencia al antibiótico ampicilina a las bacterias que portan a este plásmido. Dentro de las técnicas de biología molecular se dispone del “Análisis de fragmentos de restricción de longitud polimórfica (RFLPs)” que sirven para conocer la variación en la longitud de un fragmento particular de DNA, entre individuos diferentes, después de que el DNA ha sido cortado con enzimas de restricción. Esta técnica se fundamenta en la longitud de los fragmentos que difieren principalmente porque tenemos cantidades diferentes de DNA “no funcional”, es decir, segmentos de DNA que no codifican para proteínas. Estas secuencias de bases tienden a ser repetidas. El número de veces que cada secuencia se repite varía de persona a persona, por lo tanto, existen fragmentos de DNA con longitudes diferentes. La aplicación que tienen los RFLPs son diversas, por ejemplo: ● Se emplean en las técnicas de mapeo genético para relacionar marcadores genéticos con secuencias del genoma, esto sirve para ubicar al gen responsable de un desorden genético; genes aberrantes que ocasionan enfermedades, por ejemplo: Huntington y fibrosis quística, entre otras. ● También son utilizados en estudios antropológicos y en la biología de la conservación para conocer la identidad de un individuo y determinar las relaciones filogenéticas. ● También sirve para establecer vínculos consanguíneos para las “pruebas de paternidad”, así como también, para la identificación de personas en el área forense. Para llevar a cabo dicho análisis se obtiene DNA de cualquier material humano: células de mucosas, fragmentos de tejidos, fluidos corporales (sangre y semen), folículos del pelo, muestras de tejido seco ancestral o momificado, colillas de cigarros.
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