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SI SE TIENE ADN BICATENARIO → se le aplica calor → a medida que aumente la energía calórica se irá desnaturalizando ya que se desestabilizan las uniones PdH que mantienen a las dos hebras complementarias unidas. En la medida que se van separando las dos cadenas que forman la molécula de ADN → se van exponiendo las bases, que absorben luz a 260nm. A medida que aumenta la temperatura → las moléculas de ADN se van separando, se van exponiendo las bases, comienzan a absorber a 260nm → y llega un momento, a temperaturas muy altos, donde las dos hebras se separan y la absorbancia aumenta rápidamente. Cuando se llega a los 85-90 grados → se tiene a las dos hebras completamente separadas y la máxima absorción. SI LUEGO SE DISMINUYE LA TEMPERATURA → las dos cadenas de ADN monocatenario pueden volver a interaccionar por complementariedad de bases → y formar el ADN renaturalizado. SI SE TIENE ADN BICATENARIO NATIVO Y SE LO DESNATURALIZA → y luego se pone en contacto con este ADN monocatenario desnaturalizado, pequeñas moléculas formadas por desoxirribonucleótidos con secuencias complementarias a secuencias presentes en el ADN → cuando se baje la temperatura, esas pequeñas secuencias de ADN complementarias podrían interaccionar por complementariedad con secuencias del ADN desnaturalizado → esta interacción se denomina HIBRIDACIÓN. Si a esa pequeña molécula de ADN se le hubiese agregado alguna molécula marcadora → podría ser una forma de detectar una secuencia en un ADN desconocido. 18° T E O R I C O ADN RECOMBINANTE El ADN recombinante ES CUALQUIER MOLÉCULA DE ADN QUE FUE OBTENIDA IN VITRO POR LA COMBINACIÓN DE FRAGMENTOS DE ADN QUE TIENE DISTINTO ORIGEN → un ADN que proviene de un organismo y un ADN que proviene de otro organismo o de síntesis. Lo que permite unir el ADN de distintos orígenes serán los ENLACES COVALENTES. La molécula resultante de la unión de los dos ADN es lo que se llama ADN recombinante. Para obtener estos fragmentos de ADN de distintos orígenes → se necesita extraer estos fragmentos de alguna fuente → generalmente es el genoma del algún organismo → a través de enzimas de restricción. ENZIMAS DE RESTRICCIÓN (ENDONUCLEASAS) Las enzimas de restricción son enzimas capaces de cortar el ADN en el interior de la molécula → no comienzan cortando al ADN por sus extremos, sino que es escindido en el interior de la molécula → por eso se las denomina ENDONUCLEASAS. Las enzimas de restricción son de ORIGEN BACTERIANO → las bacterias poseen estas enzimas ya que permiten degradar el ADN de aquellos virus capaces de infectar a las bacterias (BACTERIÓFAGOS) → van a degradar el ADN viral que esté tratando de infectar a las bacterias. Debido a esto se las llama enzimas de restricción → restringen el ingreso del ADN viral al citosol de la bacteria. ¿Cómo hace la bacteria para evitar que estas enzimas degraden su propio ADN? Esta enzima, además puede modificar el ADN introduciendo un metilo dentro de los propios sitios de corte en su ADN → al metilar los sitios de corte de la enzima en su propio ADN → evita que la enzima lo corte → ya que la enzima reconocerá la presencia del metilo y esto evitará que actúe. Estas enzimas se caracterizan por reconocer secuencias específicas que contienen entre 4 y 8 pares de bases y se denominan SECUENCIAS PALINDRÓMICAS → quiere decir que las secuencias son idénticas cuando se as lee en dirección 5’ → 3’. SITIO DE RESTRICCIÓN → es una secuencia palindrómica a donde cortará la enzima de restricción → cada enzima de restricción reconoce un sitio de restricción específico. Estas enzimas van a cortar en sitios de restricción → los cuales son secuencias palindrómicas que se leen de misma manera si se las lee de 5’ → 3’. Por ejemplo → se le GGCC en 5’ → 3’ en la hebra superior; y también se lee GGCG en dirección 5’ → 3’ en la hebra inferior. CADA ENCIMA DE RESTRICCIÓN VA A RECONOCER UNA SECUENCIA ESPECÍFICA → esto es coincidente con la propiedad de especificidad que tienen las enzimas, en particular en base a la forma de su sitio activo → la primer secuencia palindrómica será reconocida por una enzima llamada HAE III → cortará las dos hebras de manera lineal entre las uniones que unen a G con C → este tipo de corte se denomina CORTE LINEAL y se generan dos extremos denominados ROMOS → que no tienen ningún tipo de saliencia. Pero puede ocurrir que la enzima no corte de forma lineal a la molécula de ADN → sino que realice un CORTE ESCALONADO. Como consecuencia de la acción de esta enzima que es la EcoRl en la molécula de arriba y la Hind III en la inferior → se obtienen fragmentos de ADN que tendrán extremos escalonados o extremos cohesivos (ya que si se los pusiera juntos interaccionarían por complementariedad de bases). Para obtener ADN recombinante → se necesita ADN de distintos orígenes → ADN 1 y ADN2 en el esquema. El ADN 1 fue obtenido con la enzima de restricción uno y el ADN2 mediante la E1, E2 y E3. La condición para unir el fragmento de ADN1 con el ADN2 es que tengan los MISMOS EXTREMOS COHESIVOS → por lo tanto, si se quiere unir dos ADN de distintos organismos, se debe tratar de cortarlos con la misma enzima de restricción → en el ejemplo, se debe unir el ADN1 con el fragmento de ADN2 obtenido con la E1 que genera el mismo extremo cohesivo. Entonces → el ADN1 interaccionará con el ADN2 (a) → las bases complementarias interaccionaran a través de los extremos cohesivos por complementariedad de bases; sin embargo → A PESAR DE QUE LAS BASES INTERACCIONEN, SI NO SE FORMA LA UNIÓN COVALENTE, NO SE TENDRÁ EL FRAGMENTO DE ADN RECOMBINANTE. Para que se forme la unión covalente entre el OH de una base y el fosfato de la otra → se necesita una enzima llamada ADN T4 LIGASA → generará la condensación, la liberación de agua, y la unión covalente entre las bases que se forman después de la interacción de los extremos cohesivos. SI TENGO LA UNIÓN DENTRO DE UN TUBO DE ENSAYO → se tendrá el ADN1 y los distintos fragmentos del ADN2 (el ADN1 solo interaccionará con el fragmento a del ADN2) y el fragmento recombinado → todo mezclado. Pero únicamente se quiere obtener el ADN recombinante que contiene a los fragmentos unidos covalentemente → se lo debe separar del resto de las moléculas que se tiene en la fracción → SE REALIZA UNA ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA → la agarosa es un polímero que deja un determinado tamaño de poro → SE SIEMBRA EN UN POCILLO LA MEZCLA DEL TUBO Y SE APLICA UN CAMPO ELÉCTRICO → en este caso, no se necesita el agregado de SDS ya que las MOLÉCULAS ESTÁN CARGADAS NEGATIVAMENTE YA QUE PROVIENEN DE ÁCIDOS NUCLEICOS → se van a separar de acuerdo a su tamaño y al tamaño del poro → cuando se agrega el campo eléctrico, las moléculas más pequeñas van a correr más rápidamente hacia el polo positivo; mientras que las moléculas más grandes van a correr más lentamente y quedarán más cercanas del polo negativo. El ADN no tiene color → se debe realizar una técnica para visualizar las bandas en el gel de agarosa → se utiliza alguna sustancia capaz de intercalarse en las moléculas de ADN → una delas más conocidas es el BROMURO DE ETIDIO → ya que tiene la particularidad de que cuando se lo irradia con luz UV es fluorescente → en la parte del gel donde no hay ADN, y por lo tanto el bromuro de etidio no se intercaló → el gel no va a fluorescer; mientras que en la parte del gel donde hay ADN con bromuro de etidio intercalado → se observará fluorescencia. Sin embargo → simplemente visualizando las bandas no se puede saber cuáles corresponden al ADN1 y cuales al ADN2 → podría ser cualquiera de ellas → se debe tratar de identificar la secuencia de interés sobre el gel → para ello, hay dos posibilidades: A TRAVÉS DE LA HIBRIDACIÓN A TRAVÉS DE LA SECUENCIACIÓN HIBRIDACIÓN La hibridación significa que se tieneun fragmento pequeño de desoxirribonucleótidos (al cual se denomina SONDA o “PROBE”) → este pequeño fragmento debe tener una secuencia complementaria al ADN que se desea encontrar. Esta secuencia SONDA ES ALTAMENTE ESPECÍFICA → solamente interaccionará cuando todos sus nucleótidos reconozcan a sus nucleótidos complementarios en el ADN o ARN desnaturalizado. Entonces → se tiene el tubo que contiene el ADN1, los distintos fragmentos del ADN2 y el ADN recombinado → se desea separar al ADN recombinante e identificarlo. Se aplica el gel de agarosa, se aplica el campo eléctrico, se desarrolla la electroforesis → y luego, al gel se lo pone en contacto con una membrana para que los fragmentos de ADN pasen del gel a la membrana → se debe poner un peso en medio alcalino → y el ADN es rápidamente transferido del gel de agarosa a la membrana. Una vez que se tiene la membrana → todas las bandas de ADN que se tenía en la electroforesis ahora están en la membrana → sobre la membrana se puede realizar una REACCIÓN DE DETERMINACIÓN ESPECÍFICA PARA EVALUAR LA PRESENCIA DEL ARN O DEL ADN EN ESTUDIO. SE PONE A LA MEMBRANA EN CONTACTO CON UNA SOLUCIÓN QUE CONTENGA LA SONDA O PROBE → si en la membrana está presente el ADN que se busca, la sonda interaccionará con él y se podrá identificar la banda. Si en la membrana no está presente el ADN que se busca → la sonda o probe no reconocerá ni se unirá a nada y no se obtendrá ninguna banda. En el ejemplo → se tiene una membrana con 3 bandas → se pone una sonda de ADN que debería hibridar con la banda del medio → que es lo que se observa cuando se revela la interacción. PARA PODER VISUALIZAR LA BANDA SE DEBE INTRODUCIR A LA SONDA UN FOSFATO RADIOACTIVO, ALGUNO DE LOS NUCLEÓTIDOS CON UN FLUOROCROMO. POR ESTA METODOLOGÍA SE PUEDEN SEPARAR TANTO MEZCLAS DE ARN COMO DE ADN. Cuando la mezcla de ADN es revelada con las sondas correspondientes → el resultado del ensayo se denomina SOUTHERN BLOT. Cuando la mezcla de ARN es revelada con las sondas correspondientes → el resultado del ensayo se denomina NORTHERN BLOT. Así se observaría un Southern blot revelado con sondas que estaban marcadas con fosforo radioactivo. En esta corrida electroforética en gel de agarosa se separaron los genomas de 3 parásitos; siendo este genoma cortado por 3 enzimas de restricción diferentes. En las perneras 3 calles tengo los 3 genomas cortados por la misma enzima y lo mismo en las calles siguientes → cortado con las diferentes enzimas. Se observan solo aquellas bandas que hibridan perfectamente con las sondas que se puso en el medio de reacción. El southern blot permite ver que los genomas pueden ser cortados de manera diferente con cada una de las enzimas de restricción → y generan fragmentos diferentes con cada una de ellas. OTRO EJEMPLO → la secuencia de ADN que se desea identificar no se encuentra en un tubo Ependdorf → se desea reconocer un ADN dentro de la célula → se desea reconocer una secuencia de un gen dentro del núcleo. Derecha → hay un portaobjetos y sobre él está fijado la muestra con el ÁCIDO NUCLEICO A ANALIZAR → el ADN dentro de la muestra estará en estado nativo → se somete a la muestra a calor para desnaturalizar el ADN y separar las hebras. Por otro lado se tiene a la SONDA (en rojo) → son pequeños fragmentos de ADN que pueden tener unidas un fluorocromo o una pequeña molécula que se pueda revelar posteriormente. Se debe desnaturalizar a la sonda para obtenerlas en forma monocatenaria y luego → se pone en contacto la sonda desnaturalizada con el ADN desnaturalizado → si el ADN que se busca y para el cual se diseñó la sonda, se encuentra presente en la muestra → SE OBTIENE A TRAVÉS DE HIBRIDACIÓN LA INTERACCIÓN DE LA SONDA CON EL ADN BUSCADO → Y SI LA SONDA TENIA UN FLUORESCENTE PODRÉ DETECTARLA CON EL MICROSCOPIO DE FLUORESCENCIA. Este tipo de ensayo muy utilizado en la clínica se denomina FISH → permite diagnosticar la presencia de estructuras anormales dentro de los genomas u obtener un cariotipo y ordenarlo de acuerdo a los colores de las sondas que se diseñó para cada par de cromosoma (se diseña una sonda específica para cada par de cromosomas, unidos a fluorocromos de distintos colores con el fin de luego poder separarlos y agruparlos). Por esta técnica también se puede detectar el ARN. Utilizando una sonda de ADN dirigida contra una determinada secuencia → se puede detectar si en un núcleo celular se transcribió un determinado gen → si un determinado gen se transcribió, se obtiene el producto de expresión inmaduro y maduro que será el ARN → molécula complementaria del ADN → se debe diseñar una sonda marcada que posea la secuencia complementaria a ese ARN. Entonces → en la hibridación se utiliza un probe o sonda de una corta secuencia de nucleótidos → nucleótidos que se sepa que están presentes en la secuencia a evidenciar para con esa sonda marcada poder detectar la secuencia de ADN o ARN buscada mediante fluorescencia o radioactividad → ya sea en una corrida electroforética o en un preparado sobre un portaobjetos. SECUENCIACIÓN Es la otra manera de realizar la identificación → se utiliza para corroborar, por ejemplo, una secuencia de 1000 pares de bases es la que se busca → ya que no serviría de nada utilizar una sonda, que posee como mucho 50 pares de bases → con ella solo podría identificar un pedazo de secuencia, y seria ineficiente para una cadena tan larga ya que podría contener anomalías o mutaciones en los nucleótidos no reconocidos por las sonda y por lo tanto, no las detectaría. En estos casos → SE DEBE TOMAR TODA LA SECUENCIA Y SECUENCIARLA → o sea, saber exactamente cuál es la secuencia de nucleótidos que hay en esa cadena de mil pares de bases. Existen varios métodos para obtener la secuencia de ADN: Métodos básicos de secuenciación → métodos de Sanger. Métodos avanzados de secuenciación. NEXT generation sequencing (NGS) → illumina. MÉTODO DE SANGER Es también conocido como método de determinación de la cadena o método de la didesoxirribosa. Sanger diseñó un NUCLEÓTIDO CARACTERIZADO POR SER DIDESOXI → es decir, que no tenía un OH en la posición 3’ → sin el OH en esta posición, la cadena no podrá seguir sintetizándose → con lo cual, la SÍNTESIS SE CORTA EN DONDE ENTRA EL NUCLEÓTIDO DIDESOXI. Y si además → se puede visualizar al nucleótido defectuoso de alguna manera → se puede saber en esa posición de la cadena molde, que nucleótido entró y se podrá comenzar con la secuencia. Se tiene 4 TUBOS EPENDDORF → en los 4 tubos se pone la misma mezcla → ADN desnaturalizado, un cebador, la ADNpol y los 4 nucleótidos. Sin embargo → en un tubo pongo DIDESOXI ATP (el rojo); en el amarillo DIDESOXI TTP; en el violeta DIDESOXI CTP y en el verde DIDESOXI GTP. Cuando se comiencen a sintetizar las cadenas complementarias y a la síntesis entre cada uno de los nucleótidos defectuosos → se detendrá la síntesis. Como el nucleótido defectuoso podrá ser visualizado de alguna manera → luego de separar la mezcla de reacción en gel de agarosa se podrá identificar el tamaño de la cadena sintetizada en cada uno de los tubos → y en base al tamaño de la cadena sintetizada se podrá deducir la secuencia del fragmento de ADN que se tenía. En el tubo rojo → se tiene ddATP, si el ATP entra en la primera base que tiene que sintetizar se corta la síntesis → y cuando se intente separar esa mezcla de reacción en el gel de agarosa → ese fragmento con la primera adenina alterada correrá al frente del gel de agarosa, luego correrá el segundo fragmento y luego el tercero. Lo mismo ocurrirá con las mezclas que tienen CTP, TTP y GTP → Y SE PODRÁ IR DEDUCIENDO EN BASE A QUIEN CORRIÓ MÁS CERCA DEL FRENTE DE CORRIDA CUAL ES LA SECUENCIA DE LA MUESTRA. EL DIDESOXINUCLEÓTIDO TIENE UNIDO UN FLUOROCROMO → el cual será detectado porun detector y se podrá obtener una imagen donde la maquina indica la secuencia de la muestra que se introdujo. CLONACIÓN La clonación es obtener muchas COPIAS IDÉNTICAS DE SECUENCIAS DE ADN (por ejemplo) → se obtienen in vitro a través de ciertas técnicas. Se puede querer clonar ADN para obtener grandes cantidades de esa misma secuencia → para, por ejemplo, hacer un análisis de secuencia para hacer un diagnóstico; o para estudiar la función de un gen; para obtener proteínas recombinantes o para obtener los organismos genéticamente modificados. CLONACIÓN DE ADN El ADN en general se puede clonar de dos maneras: PCR → a partir de la reacción en cadena de la polimerasa. A partir de la TECNOLOGÍA DE ADN RECOMBINANTE. PCR DESNATURALIZACIÓN. Se tiene a la doble cadena de ADN → lo primero que se debe hacer es desnaturalizarlo. En esta técnica se desnaturaliza al ADN a altas temperaturas (mayores a 90°C). HIBRIDACIÓN. Luego, se pone cebadores o primers que necesita la ADNpol para extender la cadena; pero para que los cebadores hibriden en el lugar correcto, se debe bajar la temperatura. ELONGACIÓN. Cuando ya se tiene los primers ubicados en la posición correcta para que actúe la polimerasa → se agrega la ADNpol y la mezcla de desoxiribonucleótidos → para que la ADN pol, a partir del primer adecuado, elonge la cadena → y obtenga la cadena hija. La ADN pol elonga a 72°C → como nuestra temperatura constante es de 37°C → por lo tanto la ADN pol obtenida de mamíferos no podría resistir estas temperaturas y no podría realizar la elongación → entonces, se utiliza la ADNpol de una bacteria denominada thermus aquiaticus → TAQ POLIMERASA. Estos 3 pasos constituyen un primer CICLO DE REACCIÓN → se lleva a cabo en un TERMOCICLADOR. Con un ciclo se logra, como mucho, que se copie una única vez cada una de las hebras → se debe repetir el ciclo → cada uno de los dúplex que se formaron se van a separar, se van a ubicar los cebadores y la ADNpol elongara cada molécula separada. Al final del segundo ciclo de reacción → obtengo 4 hebras hijas → sin embargo, 2 ciclos tampoco es suficiente. Se suele programar al termociclador para más de 20 ciclos de reacción. EJEMPLO → se tiene al hígado y se logra extraer todo el ADN de él → y se desea clonar el GEN MAPK (proteína quinasa que participa en una vía de señalización que activa la división celular). Se debe diseñar los primers que flanqueen los extremos del gen → una vez diseñados, se debe obtener el ADN a partir del hígado → una vez obtenido el ADN, se lo pone en un tubo de ensayo, se pone la mezcla de nucleótidos y la Taq polimerasa y los cebadores o primers diseñados. Lo primero que debe ocurrir es la DESNATURALIZACIÓN del ADN → cuando el ADN se desnaturaliza se separan las dos hebras y en ese momento los primers interaccionarán con su secuencia complementaria en ese ADN desnaturalizado → cuando los primers hibridaron con su secuencia complementaria el ADN (gracias a que se disminuyó la temperatura) → comienza actuar la taq polimerasa (temperaturas elevadas) y permite la copia del gen que se busca. Esto se obtiene dentro del tubo de ensayo → si se desea separar el gen clonado de toda la mezcla de reacción → se realiza un GEL DE AGAROSA en donde se correrá la muestra → y luego si se desea identificar nucleótido a nucleótido se debe MANDAR A SECUENCIAR y si no se lo debe HIBRIDAR CON UNA SONDA ESPECÍFICA para la secuencia a través de un southern blot. Si de una muestra biológica no puedo obtener ADN, sino que obtengo ARN → ESTE NO PUEDE SER CLONADO. En estos casos se puede hacer una estrategia que permita transformar el ARN en su complementario ADN → y luego amplificar el ADN por PCR. Esto se conoce como . RT PCR Se tiene la muestra de ARNm → para aislarlo se utiliza como estrategia → utilizar como primer cebador, un CEBADOR FORMADO SOLO POR TIMINAS (ya que el ARNm tiene la cola poliA) → se denomina a este CEBADOR POLI T. Esto se denomina oligodeoxitimidina. Se pone la muestra de ARNm purificado en presencia de los oligoDT → además, se pone en el tubo de ensayo, una enzima llamada TRANSCRIPTASA REVERSA → esta, a partir de la molécula de ARN copia la molécula de ADN complementaria (roja en imagen). RETROTRANSCRIPCIÓN → luego de que actúa la transcriptasa reversa se tiene un heterodúplex → una molécula bicatenaria formada por una molécula de ARN y una de ADN (cDNA). Luego → la molécula de ARN se degrada con la misma transcriptasa reversa, ya que posee actividad de nucleasa → y luego la misma enzima copia la molécula complementaria a la del ADN para obtener un ADN de doble cadena. AHORA PODRÍA REALIZARSE LA REACCIÓN DE PCR A PARTIR DEL CDNA → el cDNA representa el producto de expresión de un gen. A partir de órganos, células, una muestra de sangre o de un hisopado → se puede hacer una purificación de ADN o una purificación de ARN → a partir del ADN purificado y utilizando primers adecuados → se puede tener la amplificación de una secuencia de ADN y se obtienen clones de ADN genómicos. Si se purifica ARN (total o mensajero) → primero se hace una retrotranscripción para obtener el ADN complementario → a partir de este, se pueden obtener copias del ADN complementario → el cual representa al ARN. LA CLONACIÓN DE ADN TAMBIÉN ES MUY UTILIZADA PARA EL DIAGNÓSTICO. Es una técnica no cuantitativa → lo único que permite decir la técnica es si hay o no hay respecto de algo que tiene comparando ADN o ARN. PCR CUANTITATIVA (Q) RT-qPCR → se refiere a haber hecho primero una retrotranscripción y luego una PCR que permite cuantificar. CRISPR-CAS El sistema CRISPR-CAS → es un sistema detectado en bacterias → corresponde al sistema de defensa de las bacterias. No responde al sistema de defensa inmediato sino que habla de memoria genómica para el sistema de defensa de las bacterias. REPETICIONES PALINDRÓMICAS → palindrómicas son las secuencias que se leen de la misma manera en dirección 3’ → 5’ y 5’ → 3’. Se detectaron bacterias que tenían muchas repeticiones palindrómicas pero entre ellas se vieron secuencias de ADN a las cuales se llamó → ESPACIADORES DE LAS SECUENCIAS PALINDRÓMICAS → estas secuencias que separan a las secuencias palindrómicas tienen secuencias parecidas a las secuencias de los virus de ADN. Se determinó que las secuencias palindrómicas se encuentran separadas por distintos espaciadores → y cada espaciador corresponde a secuencias de ADN de diferentes virus. Secuencias palindrómicas representadas en gris; en colores se representan diferentes espaciadores. Existe una secuencia “líder” que tiene todos los elementos de regulación para que se exprese esa secuencia espaciadora → corriente arriba de la secuencia líder estarán codificadas en el genoma de la bacteria, diferentes proteínas denominadas PROTEÍNAS ASOCIADAS A LAS SECUENCIAS CRISPR → son enzimas denominadas CASP. CRISPR → es la secuencia que corresponde a las secuencias espaciadoras que separan las secuencias palindrómicas en el genoma de la bacteria. CASP → proteínas asociadas a las secuencias CRISPR. EN UNA PRIMERA INSTANCIA → una bacteria es infectada por un virus. Las enzimas de restricción que posee la bacteria degradarán al genoma viral de ADN → el cual se inserta en el genoma bacteriano separando las secuencias palindrómicas repetidas. CUANDO EL GENOMA DE LA BACTERIA ES LUEGO TRANSCRIPTO → se transcriben las secuencias de las proteínas asociadas a la secuencia CRISPR y también se transcriben las secuencias que tienen secuencias palindrómicas y secuencias espaciadoras. CUANDO EL VIRUS VUELVE A INFECTAR A LA BACTERIA → el ADN viral será desnaturalizado, la secuencia espaciadora complementaria al ADN del genoma del virus → se unirá al ADN desnaturalizado del virus y una vez que la secuencia ARN espaciadora interacciona con el ADN del virusque está infectando nuevamente la célula → se activa la proteína CASP → la cual degrada el ARN → de esta manera, LA BACTERIA SE DESHACE DE TODO EL GENOMA DEL VIRUS. En una primera infección → la bacteria degradaba el genoma del virus y lo insertaba en su genoma → y al estar inserto en el genoma, genera un SISTEMA DE MEMORIA → que cuando vuelva a ingresar el virus ya no tiene que insertarlo en el genoma, sino que debe degradarlo completamente. Este es el mecanismo por el cual, las proteínas CASP pueden específicamente unirse a un determinado genoma y cortarlo en una secuencia específica dirigida por la secuencia de ADN que se introduzca. En general → el sistema que permite la modificación o la edición del genoma → es el sistema CRISPR-CASP 9 → o sea, la enzima que se utiliza para cortar ADN y editarlo y modificarlo es la CASP 9. CASP13 → no solo es capaz de degradar ADN sino que también puede degradar ARN. Si se pone una muestra de ARN en presencia de CASP13 y de una secuencia que reconozca específicamente a ese ARN, y esta secuencia hibrida completamente con el ARN → la CASP 13 se activará y degradará todo el complejo ARN-secuencia específica.
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