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Genética III Unidad Académica Ciclo Lectivo 2020 Seminario N°: 1 EL GENOMA HUMANO Genoma nuclear y mitocondrial El tamaño de los genomas se mide en pares de bases (pb) 1 pb Unidades derivadas: 1Kb= 1.103 pb 1Mb=1.106 pb 1Gb=1.109pb Genoma nuclear Es diploide Es decir, existen ‘2 juegos’ completos de información genética en cada célula Características: Uno es de origen materno... ovocito ...y el otro es de origen paterno espermatozoide Genoma nuclear Características: Se compone de 44 cromosomas somáticos y dos cromosomas sexuales Hay 22 pares de cromosomas somáticos y 1 par de cromosomas sexuales Secuencias Génicas y Secuencias Relacionadas con los Genes.20 % Secuencias repetitivas en tándem Satélites. Minisatélites. Microsatélites. Secuencias Extragénicas. 3 x 109 pares de bases por genoma haploide. Copia única ADN repetitivo 20% 80% Promotor Enhancers Intrones Exones Secuencias repetitivas intercaladas SINEs LINEs Organización del genoma humano Genes y secuencias relacionadas ¿Qué es un gen? Es la unidad funcional de la herencia, que transporta la información de una característica hereditaria de una generación a la próxima En términos genéticos clásicos… Genes y secuencias relacionadas ¿Qué es un gen? Es toda secuencia de ADN que contiende la información para la producción de una molécula de ARN funcional que incluye exones, intrones y regiones regulatorias no codificantes (Lodish, 4ªed.). En términos moleculares… Genes - Variantes ¿Qué son los alelos? Son las variantes de un gen Ocupan una posición específica en un cromosoma específico (locus) Para cada gen, un individuo posee 2 alelos, ubicados cada uno en un miembro del par homólogo, en el mismo locus Difieren unos de otros en su secuencia nucleotídica Par de cromosomas homólogos alelos del gen A alelos del gen B Número de genes anotados 26.383 Número de genes codificantes de proteinas 21.700 Promedio de tamaño de los genes humanos 27 kb Total de ADN en desiertos génicos 605 Mb Total de ADN ocupado por exones 1,1% Total de ADN ocupado por intrones 24,4% Total de ADN intergénico 74,5% Datos generales de la secuencia del ADN genómico Surgen por eventos de duplicación Estos eventos se generan por errores en la meiosis o rearreglos cromosómicos Familias génicas La diferencia de afinidad se debe a una diferente composición de globinas α2β2 α2γ2 Hemoglobina del Adulto Hemoglobina Fetal Familia de Genes de la Globina Familias génicas Las globinas α, β y γ están codificadas por genes diferentes. Sin embargo, esos genes presentan muchas similitudes en sus secuencias. ¿Cómo se explica la existencia de genes similares en el genoma? Familias génicas Cr.11 Cr.16 Familia génica de las globinas ARNr de 47 S (45S) Ejemplo clásico. (Estudiado en Biología Celular) Genes redundantes La célula posee 200 copias del gen del ARNr 47S situadas en la porción fibrilar del nucléolo Familias génicas Pseudogenes Son copias no funcionales de genes Son vestigios evolutivos Pseudogenes Pseudogenes procesados Según su origen, pueden clasificarse en: Genes y secuencias relacionadas Genes y secuencias relacionadas Los genes duplicados pueden sufrir cambios en su secuencia PARÁLOGOS: genes originidos por duplicación. ORTÓLOGOS: genes presentes en especies distintas que provienen de un ancestro común. Secuencias Génicas y Secuencias Relacionadas con los Genes.20 % Secuencias Extragénicas. 3 x 109 pares de bases por genoma haploide. Copia única ADN repetitivo 20% 80% Promotor Enhancers Intrones Exones Organización del genoma humano Tipo de secuencia Ejemplos Codificante De elementos propios ARNt, ARNr, ARNm, ARN pequeños y largos no - codificantes De elementos accesorios Retroposones Transposones No codificante De función estructural ADN centromérico y telomérico De función regulatoria Promotor, enhancer De función desconocida ADN intergénico Clasificación funcional de las secuencias de ADN Clasificación de las Secuencias del ADN Genómico Humano Secuencias Extragénicas ADN Repetitivo Satélites. Minisatélites. Microsatélites. Elementos transponibles En Tandem Intercaladas Tipo Denominación Ejemplos De alta repetición ADN satélite Alphoide De moderada repetición ADN minisatélte Telómeros ADN microsatélite En regiones codificantes y no codificantes Familias génicas ARNr, ARNt Transposones L1Hs Retroposones LINEs, SINEs Tipos de secuencias del genoma humano según el grado de repetición Tipo Denominación Ejemplos De secuencia única Genes de proteinas Copia única ADN intergénico no repetido Función desconocida Clasificación de las Secuencias del ADN Genómico Humano Secuencias Extragénicas ADN Repetitivo Satélites. Minisatélites. Microsatélites. Elementos transponibles En Tandem Intercaladas ADN repetitivo en tándem Porcentaje del genoma (%) Longitud Satélite 8-10 Varios 106 de pb Minisatélite 3 14-500 pb (se extiende por miles de pb) Microsatélite 1-13 pb (extensión menor) ADN repetitivo en tándem ADN Satélite ADN satélite Se llamó a las bandas ‘satélite’ a las que se obtenían en un gradiente de densidad y se apartaban de la banda principal Ultracentrifugación de ADN humano en gradiente de densidad Banda principal Bandas satélite Esas bandas contienen ADN repetitivo de cientos de kb de largo Ejemplos de ADN satélite. Repeticiones en tandem ADN satélite Un ejemplo es el “DNA alphoid”, que constituye las secuencias centroméricas. Cada repetición consta de 171 pb y se extiende a lo largo de varias Mb. Técnica de FISH marcando la posición del DNA alphoid Minisatélite - Telómeros Telómeros Telómeros TTAGGG Repeticiones en tandem ADN microsatélite Suelen tener una longitud menor a las 150 pb, con unidades de repetición de hasta 13 pb. Un ejemplo de microsatélite: Repeticiones en tandem La variación en el número de repeticiones de los distintos mini y microsatélites es un polimorfismo muy frecuente. Estos polimorfismos se generan por errores durante la replicación Dado que las repeticiones se encuentran en forma diploide: Cada uno de nosotros posee dos variantes para una repetición determinada. Clasificación de las Secuencias del ADN Genómico Humano Secuencias Extragénicas ADN Repetitivo Satélites. Minisatélites. Microsatélites. En TandemIntercaladas Elementos Transponibles (TE) El descubrimiento de los elementos transponibles Barbara McClintock Elementos Transponibles (TE) Clase I Clase II Clase I Clase II Intermediario de ARN ADN durante todo el proceso de transposición Retroposones Transposones Tipos de elementos transponibles Elementos transponible Longitud % de Genoma Retroposon SINEs 100-300 pb 13 LINEs 1 kB (4-6 kb) 21 Elementos semejante a retrovirus 2-10 kb 8 Transposon L1Hs 80-3000 pb 3 Elementos transponibles Clasificación de las Secuencias del ADN Genómico Humano Secuencias Extragénicas ADN Repetitivo Satélites. Minisatélites. Microsatélites. En TandemIntercaladas Transposones Retroposones Elemento transponible (TE) Figura 5-69 Biología molecular de la célula, quinta edición (© Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010) Corte e integración de un elemento transponible Los transposones de DNA pueden flanquear un exón e incluirlo en la molécula de ADN intermediario, para finalmente insertar el nuevo exón en otro gen Transposición Dominios DDE DDE DDE Contacto proteina-proteina CatalíticoUnión al ADN Transposasa de MuA Transposasa de Tn5 Integrasa del RSV Dominios de las enzimas transposasas e integrasas Clasificación de las Secuencias del ADN Extragenómico Secuencias Extragénicas ADN Repetitivo Satélites. Minisatélites. Microsatélites. En TandemIntercaladas Transposones Retroposones SINEs (Familia Alu) LINEs (L1Hs) RetroposónLTR No-LTR SINES LINES Tipos de Retrotransposones Retrotransposones en el genoma humano. Retrotransposón LTR Retrotransposón No-LTR LINE – L1 SINE – Familia Alu (Tienen aún mobilidad) Las secuencias LINE, ubicadas en un intrón, codifican para un ARNm con señal para PoliA. Mediante la transcripción reversa de este ARNm (ORF2 codificada por LINE) se forma un DNA intermediario que se inserta en el gen 2, llevando consigo el exón del gen 1. Las Secuencias Dispersas Repetidas Largas (LINES) Secuencias L1Hs Las Secuencias Dispersas Repetidas Cortas (SINES) Pueden mezclar exones al recombinarse Sitios 5´-AGCT- 3´ Ingeniería Genética Es la tecnología de la manipulación y transferencia de ADN de un organismo a otro, que posibilita la creación de nuevas especies, la corrección de defectos genéticos y la fabricación de numerosos compuestos. Diversas finalidades. Plantas Animales Humanos: Terapia génica También se obtienen sustancias útiles para el hombre producidas por bacterias que se utilizan como fábricas de producción, una vez introducidos en ellas determinados genes. Así se han obtenido la insulina, la hormona de crecimiento, el interferón y el factor VIII de la coagulación sanguínea, algunos tipos de vacunas. Figura 8-31 Biología molecular de la célula, quinta edición (© Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010) Enzimas de restricción (endonucleasas) Figura 8-32 Biología molecular de la célula, quinta edición (© Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010) Ligasas Figure 8-39 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008) Clonado Figure 8-40 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008) Transformación bacteriana y amplificación del ADN Geles de Agarosa Geles de Agarosa Geles de Agarosa Geles de Agarosa Geles de Agarosa Geles de Agarosa Geles de Agarosa GENOMA MITOCONDRIAL GENOMA MITOCONDRIAL Contiene varias copias de ADN circular. REPLICACIÓN TRANSCRIPCIÓN TRADUCCIÓN Organela Semiautónoma ADN MITOCONDRIAL MORFOLOGÍA: ES SIMILAR AL BACTERIANO (CIRCULAR, ETC.) CONTENIDO: El ADN codifica para 13 tipos de ARNm 2 tipos de ARNr 22 tipos de ARNt Región no codificante Complejo I Complejo III Complejo IV Complejo V ARN ribosomales ARN de transferencia C o d if ic an te Cadena Pesada H (Círculo externo) Cadena Liviana L (Círculo interno) HSP – Promotor de cadena H LSP – Promotor de cadena L CSB1-2-3: regiones conservadas OriH: orígen de replicación de la cadena H TAS: secuencias asociadas a la terminación D-Loop: la cadena naciente queda transitoriamente Unida a la cadena templado, creando u desplazamiento. Mapa del ADN mitocondrial El código genético mitocondrial presenta algunas diferencias respecto del código genético nuclear
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