Escisión de nucleótido

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Escisión de nucleótido
 Se va a describir en E.Coli por simplicidad: El complejo enzimático clave es la ABC-Excinucleasa. Está formada por 3 enzimas diferentes: UvrA, Uvrb, Uvrc. Se asocian dos unidades de UvrA con una de Uvrb, escaneando el ADN hasta encontrar el dímero de timina en la cadena afectada. A continuación las dos unidades de UvrA se van de la zona produciendo un cambio conformacional que deja bien ajustada la UvrB a la cadena. Luego se une UvrC realizando dos cortes alrededor del sitio problemático. Uno 5 enlaces fosfodiester del lado 3 prima de la lesión y otro 8 enlaces para el lado 5 prima. El fragmento resultante de 12 o 13 nucleótidos es eliminado por la Helicasa-UvrD. El hueco es re sintetizado por la ADN-Polimerasa I y sellado por la ADN-Ligasa. 
Mismatch
 Los apareamientos incorrectos tras la replicación del ADN se corrigen siempre de acuerdo a la información contenida en la cadena molde. Por eso el sistema tiene que saber distinguir la cadena molde (vieja) de la recién sintetizada. Esto se logra marcando el ADN molde con grupos metilo. 
Regulación de la expresión genética
Switches genéticos
Interacciones proteína – ADN. Los factores de transcripción son proteínas regulatorias con motivos de unión a ADN. Las secuencias regulatorias son secuencias nucleotidas especificas reconocidas por los factores de transcripción.
La unión proteína – ADN se da por complementariedad extensiva entre las características químicas en la interface proteína – ADN.
Regulación en procariontes
Regulada principalmente a nivel transcripcional. Está regulada en respuesta a señales, en su gran mayoría ambientales. Todo el genoma procariota es codificante y los genes se organizan en operones (arreglo adyacente de genes que se transcriben a partir de un único promotor).
El operon sirve de elemento regulador de la expresión de genes involucrados en una misma ruta metabólica. Todos los genes se transcriben juntos en una única molécula de ARNm. Los genes en un operon son expresados en conjunto o no son expresados. 
· Regulación negativa (triptofano): El triptofano se une en la proteína que se une al operador del ARN y no le permite la unión a la ARN polimerasa.
· Regulación negativa y positiva (LAC): Se requiere de una unión con un cap (permite iniciar a la ARN pol) y que el represor esté ausente. 
Regulación en eucariontes
· Control transcripcional: Control de cuanto y cuando se transcribe.
· Control de procesamiento de ARNm: Colocarle o no el capuchón, splicing, cola de poli A.
· Control traduccional: Cual ARNm es exportado y cual no.
· Control postraduccional.
Promotores, enhancers, silencers. A pesar de tener el mismo genoma las proteínas reguladoras varían.
Organización del genoma
Funciones del núcleo
Almacena y protege la información genética contenida en el ADN. Convierte la información del ADN en ARN. En bacterias el ADN es circular mientras que en eucariotas es lineal. Además dirige la actividad celular a través de proteínas.
Cromatina en eucariontes 
Eucromatina: genes en activa transcripción (10%) y genes que no se transcriben. 
Cromatina densa: inactiva.
Cariotipo
Representación gráfica de los cromosomas presentes en una sola célula somática