Vista previa del material en texto
Índice Índice 2 Conceptos fundamentales 9 Introducción 10 Antecedente histórico 10 Complejidad de los componentes químicos 11 Estabilidad 11 Grupos fundamentales 12 Enlaces 13 Iónico 13 Covalente 13 No polar 13 Polar 13 Predecir la polaridad 13 Estructuras y propiedades moleculares: Fuerzas entre dipolos 14 Interacciones moleculares entre moléculas polares: Dipolos permanentes 14 Interacciones entre moléculas apolares: Fuerzas de dispersión de London 14 Puente de Hidrógeno 14 Química del agua y procesos biológicos 15 Atracción dipolo-dipolo 15 Influencia de la estructura 15 Aminoácidos y proteínas 16 Proteínas 16 Monómeros de las proteínas 16 Estructuras y propiedades de los aminoácidos 16 Biosíntesis de los aminoácidos 17 Mamíferos 17 Clasificación de los aminoácidos 19 Aminoácidos alifáticos neutros con cadena no polar 19 Aminoácidos alifáticos neutros con cadena polar no ionizable 19 Aminoácidos neutros aromáticos 19 Aminoácidos con azufre 20 Aminoácidos ácidos 20 Aminoácidos básicos 20 Prolina 20 Comportamiento químico 22 Comportamiento anfótero 22 Punto isoeléctrico 22 El enlace peptídico 24 Péptidos 24 Estructura de las proteínas 25 Estructura primaria 25 Estructura secundaria 25 Estructura terciaria 26 Estructura cuaternaria 27 Propiedades de las proteínas 28 Especificidad 28 Desnaturalización 28 Solubilidad 28 Capacidad amortiguadora 28 Clasificación de las proteínas 29 Químicamente 29 Función 29 Enzimas 31 Catalizadores Biológicos 31 Característica de los catalizadores biológicos 32 Estados de transición 32 ¿Cómo actúa una enzima? 33 Modelos de interacción 33 Factores que influyen en la actividad enzimática 34 Concentración del sustrato 34 Temperatura 34 pH 35 Inhibidores 35 Cinética de las reacciones enzimáticas 36 Cinética de Michaelis-Menten. Complejo ES, enzimas michaelianas 36 Expresión de actividad enzimática 37 Clasificación internacional de enzimas 37 Cofactores 39 Inhibición enzimática 40 Tipos de inhibidores 40 Enzimas alostéricas 41 Tipos de alosterismo 41 Retroalimentación positiva y negativa 41 Lípidos 42 Clasificación de los lípidos 43 Ácidos grasos 43 Triacilglicéridos 46 Fosfolípidos 47 Esfingolípidos 48 Esteroles 50 Terpenos 50 Resumen 51 Funciones de los lípidos 52 Reserva 52 Estructural 52 Como moléculas que transportan energía 52 Regulatorias 53 Defensa 53 Membrana biológica 53 Composición química y modelo del mosaico fluído 56 Lípidos de membrana 56 Distribución de los lípidos de membrana en la estructura de la misma 58 Proteínas de membrana 58 Funciones y propiedades de las membranas 59 Transporte a través de membranas 60 Difusión 60 Transporte 61 Carbohidratos o hidratos de carbono 64 Clasificación 64 Isomería 64 Constitucional de función 65 Espacial - Configuracional - Ópticos - Enantiómeros 65 Espacial - Configuracional - Ópticos - Diastereoisómeros 65 Espacial - Configuracional - Ópticos - Diastereoisómeros - Epímeros 66 Estructura cíclica de los monosacáridos 66 Mutarrotación 67 Azúcares reductores 68 Disacáridos 69 Enlace tipo 𝛽 69 Celobiosa 69 Lactosa 69 Laminaribiosa 70 Calosa 70 Enlace tipo ɑ 70 Maltosa 70 Sacarosa 71 Polisacáridos 71 Aditoles 73 Glicósidos 75 Pared celular 75 Polisacáridos en la pared celular 76 Fibrillas de celulosa 77 Glucanos 79 Xiloglucanos 79 Glucuronoarabinoxilanos 80 Ácidos urónicos y laminilla media 81 Proteínas 81 Glucoproteínas 82 Extensinas 82 Lípidos 82 Lignina 82 Modelo de integración de la pared celular 83 Bioenergética 84 Sistema 84 Materia 84 Energía 84 Transferencia, transformación y necesidad de energía 84 Información 86 Fotosíntesis 86 Luz como fuente de energía, pigmentos fotosintéticos 87 Estructura del aparato fotosintético 90 Fase fotoquímica 90 Transporte cíclico y acíclico (etapa clara o fotoquímica) 92 Fase bioquímica, Asimilación del CO2 y ciclo de Calvin-Benson 94 Fijación del CO2 94 Glucólisis 94 Sistema funcional 94 Ciclo metabólico 96 Fotorrespiración 96 Ciclo C3 y C4 98 Metabolismo Crassulacean Acid Metabolism del carbono 99 Noche 99 Día 100 Destino de los azúcares 100 Catabolismo de carbohidratos 101 Glucólisis 101 Destino del piruvato generado en la glucólisis 103 Fermentación láctica 103 Fermentación alcohólica 104 Presencia de O2 104 Respiración mitocondrial → Decarboxilación del piruvato 107 Proceso 108 Respiración mitocondrial → Ciclo de Krebs 109 Respiración mitocondrial → Cadena respiratoria 111 Componentes de la cadena transportadora de e- mitocondrial o cadena respiratoria 111 Respiración mitocondrial → Balance final 113 Glucólisis 113 Decarboxilación del piruvato 113 Ciclo de Krebs 113 Vías alternativas de oxidación de la glucosa → Ruta de las pentosas - fosfato 114 Tanto glucólisis como ciclo de Krebs no son sólo rutas de obtención de energía → Gluconeogénesis 115 Síntesis de ácidos grasos 118 Primera etapa 118 Segunda etapa 120 Tercer etapa 120 Catabolismo de lípidos 121 𝛽-oxidación de los ácidos grasos 123 Ciclo del glioxilato (glioxisomas) 125 Conexiones entre los ciclos del glioxilato y de Krebs 126 Naturaleza y función de los ácidos nucleicos 128 Núcleo 129 Ácidos nucleicos 129 Base nitrogenada, pentosa y fosfato 130 Función de los nucleótidos 133 Propiedades de los nucleótidos 134 Apareamiento de bases del ADN → Modelo de Watson y Crick 134 Estructura del ADN y el ARN 135 Ácido desoxirribonucleico (ADN) 135 Estructura primaria 136 Estructura secundaria 136 Estructura terciaria 136 Ácido ribonucleico (ARN) 138 Estructura primaria 138 Estructura secundaria 138 Propiedad física del ADN - Desnaturalización y renaturalización del ADN 138 Metabolismo secundario 139 Compuestos 140 Comunes a todas las células vegetales 140 Exclusivos de células de un organismo 140 Transformaciones de la materia 141 Terpenos 141 Cadena prenílica 143 Fenoles 145 Flavonoides 145 Taninos o proantocianas 145 Antocianas 145 Catequinas o monómeros de flavan-3-oles 146 No flavonoides 146 Alcaloides 146 Guías de estudio 148 Aminoácidos, proteínas y enzimas 148 Conceptos fundamentales Introducción Química Orgánica Química Biológica · Estudia propiedades y transformaciones de los compuestos del C (naturales y sintéticos) · C forma: · Enlaces con muchos otros elementos · Simples · Dobles · Triples · Cadenas y anillos con características particulares · Procesos químicos que tienen lugar en los seres vivos · Explica el modo en que los compuestos orgánicos en los seres vivos: · Interaccionan · Se forman Antecedente histórico · Teoría del vitalismo – Berzelius Los productos naturales necesitaban una “fuerza vital” para ser creados por la urea · Wöler (1828) Sintetiza urea por descomposición térmica del isocianato amoníaco Todos los compuestos orgánicos poseen al menos un átomo de carbono, pero no todos los compuestos con carbono en su estructura son orgánicos. · Teoría estructural – Kekulé (1858) Asignar la estructura de los compuestos orgánicos más simples Bases: · Tetravalencia del C · Enlace químico · Isomería (cambia las propiedades físicas y químicas de los compuestos con una misma fórmula molecular) · Bushner (1897) Extractos de levadura fermenta el azúcar · Concepto enlace covalente – Lewis (1916) Base que permitió relacionar las estructuras de las moléculas orgánicas y sus propiedades químicas Complejidad de los componentes químicos · Estructuras moleculares de seres vivos sencillos es igual de complicada que la de los más complejos · Renovación de una estructura ordenada · Capacidad de tomar energía del medio para mantener nuestra estructura en funcionamiento · Reproducción o autorreplicación Estabilidad · Regla del octeto Átomos intentan alcanzar la estructura electrónica del gas noble más próximo · Principio de incertidumbre No puedo conocer la posición o momento exactos de un electrón · Ecuación de Schrödinger Cada orbital tiene una energía característica Grupos fundamentales Enlaces Iónico · Transferencia de e- · Se da entre un metal y un no metal · Diferencia de electronegatividad (Diferencia de Energía) > 1,7 Covalente Compartición de electrones entre dos átomos No polar · Dos átomoscomparten por igual los dos electrones del enlace covalente · Diferencia de energía = 0 Polar · Electrones del enlace son atraídos con mayor intensidad por uno de los dos átomos que forman el enlace · 0 < Dif de energía < 1,7 · µ= log de enlace . magnitud de la dif de carga (momento dipolar) · Flecha · Flecha: Parte más positiva · Extremo opuesto: Parte más negativa Predecir la polaridad · Comparar las electronegatividades de los átomos · Tendencia del átomo a la atracción de electrones hacia sí en un enlace químico · Aumenta hacia arriba y a la derecha Estructuras y propiedades moleculares: Fuerzas entre dipolos Las interacciones moleculares próximas son las responsables de las propiedades físicas de los compuestos orgánicos · Más débil que el covalente · F de atracción molecular (polares o apolares) que actúan entre dipolos permanentes e inducidos · F electrostática Interacciones moleculares entre moléculas polares: Dipolos permanentes · Mayormente momentos dipolares permanentes (extremo negativo y positivo) · Ordenamiento intermolecular más estable · Extremo positivo de una molécula está más cerca del extremo negativo de otra · Mayor polaridad - mayor punto de ebullición (PE) · Estado líquido · Orientación positivo-negativo (F de atracción neta, la rompen para pasar a gaseoso) Compuestos muy polares muestran mayores puntos de ebullición que los componentes menos polares Interacciones entre moléculas apolares: Fuerzas de dispersión de London · Interaccionan entre dipolos inducidos (temporales) · F neta de atracción · Depende del contacto superficial de las moléculas · Proporcional al área molecular Puente de Hidrógeno · La más fuerte de las fuerzas entre dipolos · Ocurre con los enlaces (muy polarizados) de: AGUSTINA BRESSAN INGENIERÍA AGRONÓMICA QUÍMICA ORGÁNICA Y BIOLÓGICA - 2021 FACULTAD DE CIENCIAS AGRARIAS · N-H · O-H · F-H Interacción de puente de hidrógeno entre dos moléculas de H2O Se comunica la parte no enlazada del oxígeno con el hidrógeno Esta interacción causa un efecto importante sobre las propiedades físicas de los compuestos orgánicos. Por ejemplo la diferencia de temperatura entre etanol y dimetiléter Química del agua y procesos biológicos · Tendencia a formar puente de hidrógeno entre sí · Elevado · Punto de fusión (PF) · Calor latente de evaporación · Viscosidad o Tensión superficial · Polaridad · Hidrógeno: átomo pequeño · Oxígeno: átomo pequeño y muy electronegativo · Densidad = líquidos > sólidos Atracción dipolo-dipolo · Como existe un dipolo, atrae a sus moléculas vecinas (fuerzas de atracción) entre cargas de diferente signo · Importante en sustancias al estado líquido y sólido (cercanía molecular grande). Esta interacción se representa mediante una línea punteada · Unión oxígeno-hidrógeno enlace covalente · Unión entre moléculas puente de hidrógeno · Hielo · Moléculas forman una red tridimensional · Los puentes de hidrógeno originan una estructura hexagonal con “canales” Influencia de la estructura Aminoácidos y proteínas Proteínas · Más abundante y de más amplia distribución en la célula · Pertenecen a las macromoléculas · 50% del peso seco · 10.000 clases distintas en la célula humana · Funciones · Estructura · Sostén · Reguladoras · Transporte · Almacenamiento · Enzimas: Proteínas con función de catalizador biológico de las reacciones químicas que ocurren en los seres vivos · Químicamente: Biomoléculas formadas por C, H, O y N. A veces pueden tener S, P, Fe, Mg, Cu entre otros Monómeros de las proteínas Muchos aminoácidos ➜ Proteína Estructura 3D de la proteína superóxido dismutasa · Antioxidante en la mayoría de las células expuestas a radicales libres del oxígeno · Uno de los antioxidantes más potentes Estructuras y propiedades de los aminoácidos Estructura · Básica · Grupo ácido: Grupo carboxilo (-COOH) - más importante · Grupo básico: Grupo amino (-NH2) · Carbono ɑ · A el se unen los grupos carboxilo y amino · Está unido a · H · Cadena R · Diferente para cada uno de los 22 aminoácidos · Quiral porque sus sustituyentes son diferentes · 2 isómeros ópticos (enantiómeros) · Formas D y L (más común, es la configuración S) Biosíntesis de los aminoácidos Mamíferos · Sintetizan 11 mediante reacciones de · Transaminación · Transferencias de grupos de un C · Grupos aminos · Se sintetizan a partir · Intermediarios de la glucólisis · Ciclo de Krebs o ácido cítrico · Ruta de las pentosas-fosfato · La célula degrada las proteínas no funcionales dejando los aminoácidos disponibles para reutilizarse los esqueletos carbonados en · Síntesis de azúcares · Aminoácidos glucogénicos (general piruvato, son intermediarios en el ciclo de Krebs, fuente de energía) · Síntesis de ácidos grasos · Aminoácidos cetogénicos (generan acetil-CoA y acetoacetil-CoA, y como fuente de energía) · Tipos · Aminoácidos no esenciales · Rutas biosintéticas simples · Síntesis con mucho gasto de energía · Aminoácidos esenciales · No se pueden sintetizar · Deben ser incorporados en la dieta Histidina Isoleucina Leucina Lisina Metionina Fenilalamina Treonina Triptófano Valina Argina Lalalal Clasificación de los aminoácidos Dependen de la cadena lateral R ya que todos comparten los grupos -NH2 y -COOH Aminoácidos alifáticos neutros con cadena no polar · Cadena lateral hidrofóbica (excepto G) Regla mnemotécnica → La GAVI Aminoácidos alifáticos neutros con cadena polar no ionizable · Poseen un grupo alcohol en su cadena lateral · Participan en la fosforilación Aminoácidos neutros aromáticos · La cadena lateral es un grupo aromático: benceno en el caso de la F, fenol en el caso de la Y e indol en el caso del W Aminoácidos con azufre · Contiene azufre Aminoácidos ácidos · Cadena lateral contiene grupos ácidos Aminoácidos básicos · La cadena lateral contiene grupos básicos Prolina · Se forma directamente a partir del ácido glutámico y por tanto, no es un aminoácido esencial. · Su estructura química se caracteriza por su cadena lateral cíclica, y está compuesta por 3 unidades de metilo unidos al carbono alfa y al grupo amino Comportamiento químico La figura muestra la fórmula correcta de un aminoácido en comportamiento de la célula (pH fisiológico) Comportamiento anfótero · Los aminoácidos pueden ionizarse dependiendo el pH o liberan protones pasando de -COOH a -COO- actuando como ácido · Los aminoácidos pueden actuar como base cuando los -NH2 captan protones y pasan a -NH3+ · Pueden actuar simultáneamente como ácidos y bases · Aparece una forma dipolar iónica llamada zwitterión · Ionización doble de los aminoácidos · Cuando la suma de los iones totales del aminoácido da como resultado carga neta 0 Punto isoeléctrico Es el valor de pH en el cual se encuentran la máxima concentración de zwitterión · Se calcula como la media de los pKas de las etapas que forman y descomponen el zwitterión · Depende de las características químicas de la cadena lateral R En la figura vemos que cuando el valor de pH es ácido el aminoácido se encuentra cargado positivamente, en el valor de pH que iguala el valor del punto isoeléctrico del aminoácido está doblemente ionizado (zwitterión), y a valor de pH básico el aminoácido ha liberado un H+ y se encuentra cargado negativamente. En la siguiente tabla se ven la mayoría de los aminoácidos (20) que componen las proteínas y sus propiedades El enlace peptídico Péptidos · Formados por la unión de aminoácidos mediante un enlace peptídico · Enlace covalente entre un grupo ɑ-carboxilo de un aminoácido y el grupo ɑ-amino del siguiente · Desprende H2O Podemos ver el enlace peptídico de los aminoácido glicina y alanina: La reacción mantiene un grupo NH3+ en un extremo y un grupo -COO- en el otro sin reaccionar Los aminoácidos se agregan por el extremo -COO- formando agua (condensación) El comportamiento anfótero se da en todas las cadenas de aminoácidos independientemente del número de aminoácidos en la cadena, sino que se da por los extremos Péptido pocos aminoácidos Oligopéptido< 10 aminoácidos Polipéptido > 10 aminoácidos Proteína > 100 aminoácidos Estructura de las proteínas Estructura primaria · Importancia genética y estructural · Determina la función de la proteína · Los nucleótidos (imágen abajo) de ADN decodifican al ARN mensajero y sus nucleótidos (del ARN) determinan la secuencia de aminoácidos con ayuda de los ribosomas · Nos indica qué tipos y en qué orden los aminoácidos componen la cadena polipeptídica, como se enrollan, pliegan, la interacción con otras cadenas (a veces) y definen las próximas estructuras. Estructura secundaria · Es la disposición estable (por puentes de hidrógeno de los átomos implicados en la cadena) de la secuencia de aminoácidos en el espacio · Surge de patrones repetitivos en la estructura · Puente de hidrógeno · -C=O de un aminoácido y el -NH del cuarto aminoácido que le sigue en el espiral · ɑ-hélice se enrolla helicoidalmente sobre sí la estructura primaria · 𝛽-laminar la cadena toma forma de zig-zag (disposición laminar plegada) y los grupos R se proyectan a ambos lados de la lámina alternadamente Estructura terciaria · La estructura secundaria se pliega sobre sí misma · Puede originar una conformación globular · Facilita solubilidad en agua · Funciones de · Transporte, enzimáticas, hormonales, etc · Determinada por la estructura primaria · Estabilidad 1. Enlace covalente entre los radicales de dos aminoácidos que contienen S 2. Atracciones entre radicales de aminoácidos cargados positiva y negativamente 3. Interacciones de los radicales que contienen a. Grupos aminos e hidroxilos con b. Grupos carbonilo y sulfhidrilo 4. Cadenas laterales apolares que se orientan hacia el interior de la molécula evitando interacciones con el disolvente (Fuerzas de dispersión de London) · Conformación nativa: El polipéptido se va a plegar, enrollar y girar para tomar su forma más estable para una determinada secuencia de aminoácidos · Disposición en el espacio: Fibrosa y globular Fibrosa Globular Estructuras secundarias definidas por la secuencia de aminoácidos (ɑ-hélice y 𝛽-laminar) Repetitivas Ordenadas Mayor fracción de proteínas en las células Se pliegan y repliegan formando estructuras compactas Las estructuras ɑ-hélice y 𝛽-laminar están separados por regiones que permiten la formación de lazos y dobleces Estructura cuaternaria · Enlaces débiles no covalentes · Muchas cadenas polipeptídicas con estructuras terciarias para formar un complejo proteico y se torna funcional · Los enlaces y fuerzas que lo mantienen son los mismos que los de las estructuras terciarias · Puede tener de 2 a 7 subunidades Propiedades de las proteínas Especificidad · Función de la proteína (determinada por la estructura primaria) definida a nivel genómico · Cambio de estructura primaria indica la pérdida de esa función · Explica fenómenos biológicos como · Injertos · Compatibilidad o incompatibilidad · Trasplantes de órganos · Sueros sanguíneos · Estudios filogenéticos · Parentesco evolutivo entre especies Desnaturalización · Pérdida de la conformación nativa por romperse las interacciones intermoleculares de la estructura cuaternaria, terciaria o secundaria afectando a la función biológica de la proteína · Factores · Cambio de temperatura · Cambio de presión · Cambio de pH · Alta salinidad · Insoluble en agua formando precipitado · Conformación de proteínas desnaturalizadas · Abierta · Interacción máxima con el disolvente · Puede ser reversible (caso de la proteína de 154 aminoácidos y 4 uniones disulfuro en mercaptoetanol) pero usualmente no lo es Solubilidad · Dada por las características de los radicales R · Usualmente los los aminoácidos apolares estas hacia el interior de la estructura y los polares hacia afuera · Globulares · pH fisiológicos · Solución acuosa · Fibrilares · Insolubles (alargadas con mucha superficie expuesta) Capacidad amortiguadora · Comportamiento anfótero permite que puedan neutralizar las variaciones de pH del medio (ya que actúa como ácido o base) · Punto isoeléctrico: Carga neta de la proteína es nula Clasificación de las proteínas Químicamente · Holoproteínas: Formadas sólo por aminoácidos · Heteroproteínas: Formadas por una fracción proteicas y un grupo prostético (componente no proteico que puede ser azúcar, lípido, ácido nucleico, grupo hemo o ión inorgánico) · Sin el grupo prostético no es funcional y se llama apoproteína Función Función Ejemplo Acción Estructural Glucoproteínas Forma parte de las membranas Histonas Forman parte de los cromosomas Transporte Hemoglobina Transporta oxígeno en animales Defensa Inmunoglobulinas Relacionadas con la patogénesis Hormonales Insulina Enzimáticas - - Reserva Ovoalbúmina En la clara de huevo Gliadina En el grano de trigo Lactoalbúmina En la leche Enzimas En el capítulo de reacciones orgánicas hablamos de la importancia de termodinámica y cinética en las reacciones orgánicas. También leímos que ΔG nos indica si una reacción puede tener lugar lugar pero no si realmente lo tendrá · Todas las reacciones o procesos celulares mediados por enzimas o proteínas catalizadoras significan que la reacción tendrá lugara pesar de que no todos los procesos sean termodinámicamente factibles Enzimas: Proteínas capaces de acelerar las reacciones químicas en una célula, actualmente se conocen hasta 2000 tipos diferentes. Catalizadores Biológicos Enzimas · Acelerar reacciones químicas en los seres vivos · Se recuperan al final de cada reacción para recomenzar de nuevo un ciclo sin alterar su estado inicial · Funcionan indefinidamente Combustión del papel es una reacción espontánea termodinámicamente e irreversible que resulta en CO2 y H2O C6H12O6 + 6O2 → 6CO2 + 6H2O + energía En la oxidación de la glucosa el proceso se da gradual y mediada por enzimas. D-Glucosa + ATP → D-Glucosa-6P + ADP (ΔG°-) *hexoquinasa La D-glucosa es el sustrato sobre el que actúa la hexoquinasa formando D-Glucosa-6P (forma activa de la glucosa) Pero desde un punto de vista termodinámico la reacción no es posible ya que el ΔG° de la misma es positivo o endergónico, pero se termina produciendo a expensas de la hidrólisis del ATP que cede la energía y el ión fosfato para formar glucosa fosforilada Reacción acoplada Reacción donde un sustrato aporta la cantidad de energía suficiente para que el otro lleve a cabo la formación de un producto vital para la supervivencia de los sistemas vivos y es siempre mediada por enzimas Hechos importantes de los catalizadores enzimáticos 1. Participa en el proceso de reacción y vuelve a su estado original para comenzar otro ciclo a. Hexoquinasa: Cataliza y forma D-Glucosa-6P b. Peroxidasa: Destruye la molécula de H2O2 2. Modifica la velocidad de reacción de los procesos pero no afecta la posición del equilibrio de reacción Característica de los catalizadores biológicos · Comparten propiedades y características de las proteínas (lo son) · El reconocimiento de la enzima con el reactivo (sustrato) a procesar es altamente específico · Eficientes (aumenta mucho la velocidad de reacción) · Efectivos en pequeñas cantidades · Sujetos a una gran variedad de controles celulares, genéticos y alostéricos Estados de transición · Energía interna La mínima cantidad de energía que utilizan las moléculas de sustrato para que reaccionen entre sí y den lugar a la formación de productos · Estado de transición Los reactivos al colisionar entre sí alcanzar un mayor estado de energía libre y reaccionan Enzima: ATP-quinasa y reduce la energía de activación y las moléculas reactantes (ATP) llegan al estado de transición Estado de transición: Se forma el complejo enzima-sustrato (es, ATP-ATP-quinasa) EA:Para la mayoría de las reacciones biológicas a temperaturas celulares normales pero la suficiente para que la proporción de las moléculas de reactivos que poseen energía en un momento sea pequeña. Si se transformara todo el sustrato en producto, en una misma unidad de tiempo, el metabolismo celular colapsaríay conduciría a su propia muerte. · Incremento de la velocidad de reacción 1. Une el/los sustrato/s a su/s sitio/s activo/s y/o alostéricos 2. Aumentando el contenido de energía (concentración del complejo o temperatura) de las moléculas de sustrato, incrementando la actividad catalítica 3. Reduce el estado de transición 4. Disminuye la energía de activación ¿Cómo actúa una enzima? Una enzima une a una molécula de sustrato o varios sustratos en una región específica de la enzima llamada sitio activo Sitio activo: Hendidura donde quedan expuestos los aminoácidos que conforman la enzima. Se distorsiona y exige distorsión al sustrato La estructura de las enzimas permite que el sustrato se ajuste mucho, dando lugar a la alta especificidad. Interacciones entre los diferentes aminoácidos que están en el sitio activo como puentes de hidrógeno, fuerzas electrostáticas e hidrofóbicas. Cofactores: Moléculas orgánicas pequeñas o iones metálicos (Fe, Zn, Cu) que están en el sitio activo y son necesarios para que se produzca la catálisis. Modelos de interacción Lugar donde se lleva a cabo la distorsión conformacional de la enzima Modelo de llave-cerradura Especificidad de la enzima-sustrato, la enzima se acomoda al sustrato Modelo del ajuste/acoplamiento inducido Especificidad enzima-sustrato donde la enzima acepta y se adapta al sustrato y se exigen ambos una distorsión para alcanzar el estado de transición para que se produzca la reacción Factores que influyen en la actividad enzimática Concentración del sustrato > eficiencia de reacción → > cantidad de sitios activos ocupados por sustratos El punto de saturación se produce cuando todos los sitios activos estén ocupados por sustratos y aunque añada más sustrato no va a aumentar esta eficiencia o velocidad de reacción Temperatura +10°C → Aumenta la velocidad de reacción de 2 a 4 veces Temperatura óptima: Valor de temperatura máximo al que podemos exponer a esta enzima para que incremente la velocidad de reacción Desnaturalización térmica: Cuando se sobrepasa la temperatura óptima pH Relación directa con el carácter iónico de los grupos amino y carboxilos de la proteína, dado que sus cadenas polipeptídicas contiene grupos que pueden ionizarse de acuerdo al pH presente pH óptimo: Rango de pH dentro del que actúa una enzima, fuera de este se desnaturaliza e inhabilita Inhibidores Disminuyen o impiden la actividad de la enzima Cinética de las reacciones enzimáticas Velocidad de reacción en relación a la concentración de sustrato, productos e inhibidores Cinética de Michaelis-Menten. Complejo ES, enzimas michaelianas A medida que aumenta la [S] se produce un aumento rápido en la velocidad de reacción, pero vemos que en cierto punto esta velocidad comienza a desacelerarse A muy altas [S] la velocidad de reacción tiende a un valor máximo que depende de la concentración enzimática y puede incrementarse añadiendo más enzimas En este punto los sitios activos están saturados Vmax: Valor límite superior al cual tiende la velocidad inicial de la reacción cuando [S] tiende al infinito. Velocidad de concentración saturante del sustrato Las enzimas pueden caracterizarse por la [S] a la cual la velocidad de reacción es la mitad de la velocidad máxima, esta [S] nos da la constante de Michaelis-Menten o Km < Km > afinidad enzima-sustrato Primer orden · Velocidad de reacción es más o menos proporcional a la [S] Orden mixto · Para concentraciones de sustrato intermedias la velocidad del proceso deja de ser lineal. Orden cero · A [S] alto, la velocidad de reacción es independiente a la variación de [S], volviéndose casi constante Expresión de actividad enzimática · Para saber la cantidad de enzimas presentes en un extracto biológico podemos medir la velocidad de reacción de la formación de un producto por una enzima empleando el sustrato específico · Velocidad de reacción: Cantidad de reactivo que se transforma por unidad de tiempo · Unidad internacional · Cantidad de enzima que cataliza la transformación de un mol de sustrato por minuto, bajo condiciones definidas por entre otros: · pH · Temperatura · [S] · Cofactores · Formas de expresarlo · UI cm-3 · Actividad específica - UI mg proteína total (PT)-1 · Cantidad de moles de sustratos transformados or min-1 mg PT-1 · Medida indirecta de la fracción de la proteína total en una preparación que contienen a la enzima Clasificación internacional de enzimas · International Enzyme Comission (IEC]: Sistematizar la nomenclatura y clasificación de las diferentes enzimas conocidas Clase de enzima Reacción Compuestos que actúan Ejemplos Óxido-reductasas Óxido reducción (transferencia de electrones) CH-OH C=O C=CH- CH-NH2 CH-NH- Glucólisis Ciclo de Krebs Hidrolasas Hidrólisis Ésteres Enlaces glucosídicos Amidas (grupos peptídicos) Enlaces C-N Anhídridos de ácido Ciclo glioxilato Transferasas Transferencias de grupos funcionales Aldehídos Cetonas Acilos Glucosilos Fosfato Que contenga azufre Ciclo de pentosas Liasas Adición a los dobles enlaces Síntesis y oxidación de lípidos C=C C=O C=N- Metabolismo de lípidos Isomerasas Transferencias de grupos entre moléculas para producir formas isoméricas Glucólisis Ligasas Reacciones de condensación de aminoácidos Catalizan la formación de enlaces: C-C C-S C-O C-N Aminoácidos Síntesis de proteínas Acopladas al clivaje del ADN Proteínas Cofactores Apoenzima (enzima inactiva) Holoenzima (enzima activa) Cofactor Inhibición enzimática Reguladores negativos que disminuyen o bloquean la actividad de la enzima que son útiles para entender los mecanismos de acción tóxica y farmacológica de algunos compuestos Tipos de inhibidores IRREVERSIBLES REVERSIBLES Enlace covalente Enlace no covalente Enzima con deterioro definitivo de su capacidad catalítica La enzima se regenera COMPETITIVA NO COMPETITIVA Tanto el sustrato como el inhibidor puede unirse a un sitio activo de la enzima El inhibidor se una a la superficie de la enzima en un sitio diferente al sitio activo, donde se une el sustrato, no interfiere en la unión del sustrato pero reduce la actividad catalítica en el sitio activo Enzimas alostéricas Proteínas formadas por varias subunidades de estructura terciaria y que presenta sitios activos y sitios alostéricos presentes en cada enzima · Alosterismo Principales formas de regulación en la célula debido a que puede producir cambios rápidos y fácilmente reversibles en la actividad de las enzimas · Efector alostérico Sustancia reguladora que aumenta o disminuye la actividad enzimática alostérica uniéndose de manera reversible haciendo un cambio conformacional del sitio activo Tipos de alosterismo Alosterismo positivo Alosterismo negativo Unión del efector al sitio alostérico de la enzima favoreciendo la unión del sustrato al sitio activo de la enzima Unión del efector al sitio alostérico de la enzima impide conformacionalmente la unión del sustrato al sitio activo de la enzima Retroalimentación positiva y negativa Esta es una forma astuta en que la célula hace la cantidad justa del producto. Cuando hay poca cantidad del producto, la enzima no se inhibirá y la vía correrá a todo vapor para regenerar sus provisiones. Cuando hay demasiado producto acumulado, la enzima se bloqueará para impedir la producción de producto nuevo hasta que se haya utilizado el existente. Las enzimas alostéricas muestran una dependencia sigmoidal de la velocidad de reacción en función a la concentración de sustrato Lípidos · Estructura química · Son biomoléculas orgánicas formadas básicamente por C, H y O que pueden contener P, N y S · Heterogéneos con características químicas diversas · Propiedades físicas comunes · Son mayoritariamente insolubles en agua · Baja solubilidad de lípidos en agua porque su estructura química es principalmente hidrocarbonada · Gran cantidad de enlaces C-H y C-C · Enlace covalente · Momento dipolar mínimo · Son solubles en disolventes orgánicos como el éter, cloroformo, benceno,acetona y alcoholes · Capaces de formar micelas Clasificación de los lípidos · Solubilidad Son moléculas anfipáticas que presentan · Grupo carboxilo → Parte hidrofílica (polar) · Cadena hidrocarbonada → Parte hidrofóbica (apolar) · Estructuras químicas Seis principales y se detallan a continuación: Ácidos grasos Cn-COOH · Moléculas formadas por una cadena hidrocarbonada más o menos larga de tipo lineal con un número par de C · Nomenclatura y características principales Ácidos saturados (grasas) Ácidos insaturados (aceites) Se nombran por medio de dos números separados por dos puntos 1°→ Cantidad total de C en la cadena 2°→ Números de insaturaciones 12C → 12:0 24C → 24:0 12C con una insaturación entre el C9 y C10 → 12:1△9 24C con una insaturación entre el C9 y C10 y otra entre C12 y C13 → 24:2△9,12 Las más comunes están entre los C: · 9 y 10 · 12 y 13 · 15 y 16 Enlaces simples entre C (hibridación sp3) Enlaces dobles entre C (hibridación sp2) y rara vez triple Configuración cis o trans Punto de fusión mayor (a peso similar) Sólido a temperatura ambiente Punto de fusión menor (a peso similar) Líquido a temperatura ambiente Peso molar > ⇒ Punto de fusión > Mayor punto de fusión que los insaturados ya que poseen cadenas apolares más largas y su proximidad favorece las fuerzas de London Los grupos polares -COOH interaccionan mediante dipolos permanentes y puentes de hidrógeno entre moléculas vecinas adquiriendo un estado compactado Peso molar > ⇒ Punto de fusión < Debido a los quiebres de la cadena al nivel del doble enlace, que no permite que interaccionen. Los trans al ser similares a una conformación zigzag los ácidos grasos saturados de la cadena no se torsionan como el doble enlace cis Fuerzas de Van der Waals (muchas entre cadenas carbonadas) Puente de hidrógeno Fuerzas de London Fuerzas de Van der Waals · Ácidos grasos omega Son ácidos grasos insaturados que se los denomina de esta manera según donde se encuentren los dobles enlaces y son esenciales en la nutrición del ser humano · omega 3 · Doble enlace entre C3 y C4 · omega 6 · Poliinsaturados · omega 9 · Monoinsaturados · Propiedades físicas Detalladas después (lípidos saponificables) · Resumen muy general: Triacilglicéridos · Formados por 3 moléculas de ácidos grasos esterificados y unidos a un tri-alcohol (glicerol) · Funciones de reserva · Pierde una molécula de H2O por cada enlace éster (condensación) · Punto de fusión · Dependen de la insaturación · Líquidos a temperatura ambiente la mayoría · Rancidez · Oxidación de las insaturaciones a aldehídos y ácidos que alteran las propiedades organolépticas de los alimentos y los hacen menos digeribles (dobles enlaces son más fáciles de atacar) · Saponificación · Triacilglicéridos hidrolizados (con calor) por una base (NaOH) resultan en glicerol y sales sódicas de ácidos grasos · Lípidos saponificables · Los enlaces éster se hidrolizan con un álcali y se obtienen las sales de los ácidos grasos correspondientes (jabones) · Químicamente Jabón→ Sal sódica de ácidos grasos, que se dispersa en el H2O formando micelas → Solubilidad de micelas y formación de micelas de los ácidos grasos · Micelas: Asociaciones de 100 a 200 moléculas de jabón que orientan sus cabezas polares en contacto con el agua y sus colas hidrofóbicas hacia adentro → Energéticamente son estables ya que los grupos hidrofílicos están unidos mediante puentes de hidrógeno al agua circundante Grupo carboxilato→ Carga negativa, hidrofílico Cadena carbonada→ Lipofílica: Interactúan con grupos hidrofóbicos y secuestra moléculas de grasas Fosfolípidos · Dos ácidos grasos unidos a dos grupos alcohol glicerol y este unido a una molécula de ácido fosfórico unido a un tercer alcohol (etanolamina, serina o colina), todos mediante enlaces éster · Ácido fosfórico Esterificados con moléculas protonadas como serina, colina o etanolamina Anión fosfato + molécula protonada → fosfoglicéridos (esterifican dos -OH y es muy polar) · Componentes estructurales mayoritarios de las membranas celulares de todos los organismos vivos Esfingolípidos · Lípidos que contienen el aminoalcohol esfingosina, en vez de glicerol · El grupo amino de la esfingosina reacciona con el -COOH del ácido graso y forman un enlace amida conocida como ceramida, la base estructural de todos los esfingolípidos 1. Esfingofosfátidos Unión de la ceramida mediante enlace éster a una molécula de ácido fosfórico y a través de otro enlace éster, a una base nitrogenada polar (etanolamina, serina o colina) 2. Glucoesfingolípidos Unión de una ceramida a un azúcar a través de enlace glucosídico y no por medio de ácido fosfórico como en los esfingofosfátidos que además no contienen azúcar a. Cerebrósidos Un solo monosacárido (D-glucosa o D-galactosa) unido a la molécula b. Gangliósidos Un oligosacárido unido a la esfingosina · Sustituyente polar → Diferente naturaleza y se une a la esfingosina mediante enlace glucosídico · El carbohidrato a los glucolípidos les confiere carácter anfipático (parte hidrofílica e hidrofóbica) formando bicapas lipídicas · Presentes en → membranas celulares (parte externa actuando como sitio de reconocimiento) → tejido nervioso Esteroles · Derivan de un hidrocarburo compuesto de cuatro anillos que se forma a partir de uniones del hidrocarburo escualeno (terpeno) · Poseen un solo grupo OH- en el C3 de la molécula → anfipáticos débil · Se diferencian entre ellos por la posición de sus grupos funcionales, dobles enlaces y cadenas alifáticas lineales o ramificadas añadidas al anillo esterano · Moléculas policíclicas complejas · En todas las células vegetales y animales (colesterol) · No se hidrolizan · Apolares → mayor parte de la molécula constituida por anillos es apolar · Funciones biológicas vitales en las células · Se intercala entre los demás lípidos proporcionando mayor fluidez a las membranas celulares, evitando que se agreguen y "solidifiquen” · Precursores de muchos compuestos con actividad biológica importante → Hormonas sexuales: testosterona (hormona masculina), el estradiol (hormona femenina) → Hormonas adrenocorticales : aldosterona y el cortisol, reguladores del metabolismo celular → Ácidos biliares: componentes de la bilis, emulsionan las grasas en el intestino delgado para facilitar la acción de las lipasas. → Vitamina D, que regula el metabolismo del fósforo y del calcio · No contienen ácidos grasos→ no saponificables, al igual que los terpenos (sus precursores). · En plantas, hongos y levaduras se encuentran mayoritariamente el ergosterol, estigmasterol y sitosterol. Mientras que en las células animales el esteroide más abundante es el colesterol. Terpenos · Moléculas lineales o cíclicas no saponificables · Su unidad estructural, el isopreno, 2-metil-1,3-butadieno, tiene la capacidad de unir más moléculas de isopreno (5C) entre sí dando lugar a una gran diversidad de compuestos · Clasificación → Número de carbonos → Unión entre los isoprenos · Compuestos → Esencias: Mentol, geraniol, limoneno, alcanfor, eucaliptol y vainilla → Vitaminas: A, E y K → Pigmentos: Clorofila, carotenos y xantófilas → Hormonas vegetales: Giberelinas y ácido abscísico Resumen Funciones de los lípidos Reserva FUNCIONES · Reserva energética en los animales y plantas DÓNDE SE ENCUENTRA · Semillas y frutos de especies oleaginosas (triglicéridos) EJEMPLOS · Triglicéridos → Están altamentente reducidos y pueden rendir mucha más energía Estructural FUNCIONES · Conferir consistencia (cera en las plumas de las aves y cutícula en las hojas de las plantas) · Protección mecánica (tejido adiposo en palmas de pies y manos en caso de los animales) DÓNDE SE ENCUENTRA · Bicapas lipídicas de las membranas (de la célula y de las organelas) en las células de todos los seres vivos EJEMPLOS · Fosfolípidos · Glucolípidos · Esteroles (colesterol y sitosterol) Como moléculas que transportan energía FUNCIONES · Absorben energía electromagnética los pigmentos y la → Incorporan como energía química o fotoprotectores → Transferirla a otroscompuestos · Transporte de electrones (plastocianinas y ubiquinonas) EJEMPLOS · Pigmentos (clorofila y carotenos) · Plastocianinas y ubiquinonas Regulatorias EJEMPLOS · Giberelinas · Ácido abscísico · Ácido jasmónico Defensa FUNCIONES · Producción de látex, aceites esenciales, fitoalexinas y resinas Membrana biológica Célula vegetal → Mayor grado de organización y complejidad estructural respecto a bacterias, hongos y animales Definición Función Membrana Núcleo Donde se encuentra el material genético (cromosomas) y a donde la célula dirige su metabolismo (suma de reacciones químicas) Contener el material genético Dirigir el metabolismo Posee dos membranas concéntricas ADN Constituido por cadenas de ácidos nucleicos Contiene la información para la replicación celular y síntesis de proteínas Ayuda al núcleo a dirigir el metabolismo - Citoplasma Contiene las enzimas y solutos de la célula Realiza los procesos fundamentales del metabolismo celular - RER Sistemas membranosos internos, continuos a la membrana nuclear Tiene ribosomas adheridos Síntesis de proteínas Constituido por una pila de membranas REL Continuo al RER pero sin ribosomas Síntesis y metabolismo de lípidos Formación de membranas Ribosomas Complejos formados por proteínas y ácido ribonucleico (ARN) Sintetizar proteínas No posee Aparato de Golgi Sacos aplanados Recibir el material proveniente del RE que se transporta en vesículas a otras partes del sistema de endomembranas Síntesis y secreción de polisacáridos estructurales Si posee Vesículas Estructuras membranosas Almacenar temporalmente Transporte de materiales dentro de la célula y hacia el exterior Si posee Vacuola Tipo de vesícula que puede ocupar de un 30% - 90% del volumen celular Mantener la turgencia celular Almacenar temporalmente los nutrientes o productos de desechos Compartimiento de degradación de sustancias Si posee, se llama tonoplasto Mitocondria - Oxidan los hidratos de carbono para liberar energía química (ATP) contenida en sus enlaces mediante un proceso que consume oxígeno (respiración celular) Si posee Cloroplasto Organelas que se encuentran solo en las células de las plantas Síntesis de compuestos orgánicos (azúcares) a partir del C inorgánico (CO2) en los que almacena energía solar como energía química Posee dos Peroxisoma Tipo de vesícula Oxidación de lípidos Si posee Membrana - Define los límites de la célula y las diferentes organelas y les da funcionalidad Regula el tránsito de sustancias hacia afuera y adentro de la célula - Pared celular Está por fuera de la membrana compuesta por celulosa Da forma a la célula constituyendo el esqueleto del vegetal Participa de las relaciones hídricas de los tejidos - Laminilla media Formada por pectinas y otros polisacáridos Unir a dos células contiguas - Composición química y modelo del mosaico fluído · Membranas compuestas por · Lípidos → Forman una bicapa lipídica (las cabezas hidrofílicas están en contacto con la matriz que forma el agua y las colas se acomodan entre sí para excluir el agua) → Continuo y permanente movimiento → No están unidas por ningun enlace químico electrostático (no forman polímeros sino que se acomodan según su afinidad-repulsión) → > movimiento → + insaturaciones de los ácidos grasos componentes de los lípidos de membrana → Esteroles Efecto amortiguador sobre las temperaturas, le confieren a la membrana propiedades más elásticas si disminuye la temperatura y la hace más rígida si esta aumenta · Proteínas → Alrededor de la mitad de la masa de las membranas · Carbohidratos (menor cantidad) → En glucoproteínas y glucolípidos Lípidos de membrana · Anfipáticos · Ejemplos · Triacilglicerol → Reserva de la célula · Fosfatidilcolina (fosfolípido) → integra las membranas biológicas → Fosfoglicerído · Cabeza polar → Hidrofílico · Enlaces éster de los ácidos grasos con el glicerol · Fosfato unido a la colina · Cola apolar → Hidrofóbico · Residuos hidrocarbonados de los ácidos grasos · Tipos · Que contienen ácidos grasos en su estructura molecular · Fosfolípidos (fosfatidilcolina, fosfatidilserina, fosfatidiletanolamina y fosfatidilinositol) · Glucolípidos · Más abundantes · Galactosil glicerido · Glucocerebrósidos · Esteroides · 4 anillos de 6C y uno de 5C + un grupo alcohol · Estructura casi plana y estructura relativamente rígida · Bipolar → Atemperada porque la parte apolar es mucho mayor que la polar (-OH) · Terpenos · Formados por · Glicerol Para dar lugar a fosfoglicéridos o glucolípidos · Esfingosina Dar lugar a los esfingolípidos Distribución de los lípidos de membrana en la estructura de la misma · Asimetría de membrana Los lípidos se distribuyen de forma desigual entre las dos monocapas de la membrana y pueden desplazarse a través de la membrana · Zona seca Las colas apolares se ponen en contacto entre sí alejándose lo más posible del agua · Insaturaciones de los ácidos grasos Si no hay insaturaciones de los ácidos grasos los lípidos se acercarán entre sí y la membrana se tornará más rígida, mientras que si existen insaturaciones las colas se alejaran una de otra dando a la membrana una condición de mayor fluidez (insaturaciones en posición cis) Proteínas de membrana · Componentes estructurales de las membranas y su estructura está intrínsecamente relacionada con la función que cumplen en las mismas · Transmembrana Atraviesan la bicapa y mantienen interacciones de tipo hidrofóbicas con los lípidos que la rodean · Periféricas o intermembrana Se encuentran asociadas por interacciones electrostáticas y puente de hidrógeno con la parte polar de los lípidos Pueden estar o no unidas con cadenas de azúcares, las cuales participan en la asimetría de la membrana ya que se ubican mayoritariamente en el lado externo de las membranas. · Pueden desplazarse a través de la membrana Funciones y propiedades de las membranas · Funciones · Definir el dentro y afuera de la célula y de las organelas · Regulan el pasaje de sustancias · Imprescindibles en los procesos de transformación de energía en la mitocondria y cloroplasto · Receptores de señales de otras células o del ambiente · Propiedades · Delgadas · Flexibles · Autosellantes (permite procesos de exocitosis y endocitosis) Transporte a través de membranas Difusión · Difusión simple · Sigue las leyes de difusión de gases · La velocidad a la que ocurre el proceso depende de la concentración relativa de un gas · Canal iónico Paso rápido de ciertos solutos (generalmente hidrófilos) sin experimentar cambios conformacionales · Acuaporinas: · Proteínas con la composición de aminoácidos · Apolares en la cara de la proteína en contacto con la parte interna de la capa bilipídica · Polares en el canal interno de la proteína por donde el agua atraviesa dicha membrana · El transporte ocurre sin impedimento pero siempre siguiendo la diferencia de concentración · Difusión facilitada · Permeasas → Puertas proteicas de acceso · La cinética de movimiento seguirá un modelo similar al de cinética enzimática donde la velocidad de pasaje de sustancia varía en forma lineal con la diferencia de concentración a ambos lados de la membrana Transporte Este se da a favor de un gradiente de concentración o gradiente electroquímico · Transporte pasivo · Difusión simple · Canal iónico · Transporte activo Es un movimiento de solutos en contra del gradiente de concentración o electroquímico (en contra del gradiente termodinámico) por lo que necesita energía Procesos termodinámicos desfavorables · Directo o primario La acumulación de moléculas de solutos o iones de un lado de la membrana se acopla directamente a una reacción química exergónica (generalmente hidrólisis de ATP) · Indirecto o secundario Depende del intercambio simultáneo de solutos (uno de ellos a favor de un gradiente permitiendo que el otro lo haga en contra) · Uniporte · Proteína desplaza a través de la membrana a un único soluto · Acoplado · Simporte o contransporte · Dos solutos se mueven enel mismo sentido · Antiparalelo o antitransporte · Dos sustancias se mueven en distinto sentido · Transporte activo indirecto Carbohidratos o hidratos de carbono · Son aldehídos o cetonas polihidroxiladas incluyendo a los compuestos que dan aldehídos o cetonas polihidroxiladas como producto de su hidrólisis · Compuesto más abundante en la naturaleza · Cn(H2O)n → fórmula química · Células de organismos autótrofos → Sintetizan carbohidratos a partir de de C inorgánico y del agua Plantas → Denominan este proceso como fotosíntesis CO2 + H2O + energía química ⇔ O2 + Cn(H2O)n ⇔ glucógeno · Glucógeno → Carbohidrato de reserva de las células animales y la reacción de respiración resulta irreversible Clasificación · Grupo funcional · Aldosas - grupo característico aldehído · Cetosas - grupo característico cetonas · Composición (número de aldosas o cetosas) · Mono- → Los encontrados en la naturaleza van de 3C a 7C, los más comunes son de 3, 5 o 6 · 3C - triosas · 4C - tetrosas · 5C - pentosas · 6C - hexosas · 7C - heptosas · Incoloros, sólidos cristalinos, solubles en agua e insolubles en solventes no polares, sabor dulce · Di- · Poli Isomería Constitucional de función La aldosa puede tener su correspondiente cetosa Espacial - Configuracional - Ópticos - Enantiómeros Uno o más C quirales son isómeros ópticamente activos (excepto la dihidroxiacetona) → Mientras más C quirales tenga, más isómeros presenta de acuerdo a la disposición espacial de los radicales unidos a dichos C n centros quirales = 2n estereoisómeros · Denominación 1. Ubicar el C más alejado del grupo funcional aldehído o cetona 2. Si el/los grupo/s -OH se encuentra a la izquierda se los denomina con L y si se encuentran a la derecha se los denomina con una D Para los monosacáridos solo existen en la forma D Espacial - Configuracional - Ópticos - Diastereoisómeros Monosacáridos que tienen 2 o más centros quirales y al menos uno de ellos con la misma configuración Estructura de los diastereoisómeros D-eritrosa con D-treosa y D-ribulosa con D-xilulosa, tienen en el C3 la misma configuración en ambas moléculas por lo que no pueden ser imágenes especulares Espacial - Configuracional - Ópticos - Diastereoisómeros - Epímeros Difiere la configuración de uno de los átomos de C quirales Estructura cíclica de los monosacáridos El aldehído puede reaccionar con dos alcoholes para dar un acetal, en donde la reacción parcial puede conducir a la síntesis de un hemiacetal En soluciones acuosas los monosacáridos con 5C o más se encuentran formando anillos, como podemos ver en la imagen de abajo correspondiente a la glucosa Las pentosas y hexosas al estado cristalino (sólido) se encuentran como ciclos, en solución acuosa cierta porción están de forma abierta · Aldohexosas que forman anillos de 6 miembros se denominan con ESTRUCTURA PIRANÓSICA · Aldopentosas y cetohexosas que forman anillos de 5 miembros reciben el nombre de ESTRUCTURA FURANÓSICA Mutarrotación Anómeros → Isómeros de los monosacáridos que difieren solo en su configuración hemiacetal Forma cíclica→ El C anomérico (C1 en aldosas y C2 en cetosas) se denomina así porque el C del grupo carbonilo al formar el hemiacetal se transforma en centro quiral Entonces podemos definir que el grupo sustituyente -OH puede tener posición ecuatorial (𝛽) o axial (ɑ) Mutarrotación → Se da cuando en soluciones acuosas de monosacáridos con propiedades ópticas idénticas, los anómeros ɑ y 𝛽 se interconvierten continuamente en una situación de equilibrio y tiene las particularidades de · Rotar la luz polarizada cuando se encuentra en solución acuosa (ɑ-D-glucopiranosa a 112° y el 𝛽 a 19°) y siempre a la derecha, por lo que antes de la D deberíamos poner un (+) · Si se solubiliza en agua la ɑ-(+)-D-glucopiranosa se va transformando en 𝛽-(+)-D-glucopiranosa hasta llegar a un equilibrio, lo mismo ocurre viceversa · De esta manera ayudan a medir con refractómetro la concentración de azúcares Azúcares reductores Se los denomina así por la propiedad de los hemiacetales a oxidarse fácilmente en presencia de un óxido débil como · Agua de Br · Fehling · Tollens Esta reacción no discrimina entre aldosas y cetosas, ya que en medio alcalino las cetosas reaccionan formando un enodiol que luego se oxida a aldehído y de allí se oxida a ácido Si se oxida en las aldosas: · El C1 formará ácidos aldónicos · El alcohol del C6, el C1 y los ácidos dicarboxílicos formará ácidos aldáricos · El C6 por enzimas se forman ácidos urónicos Azúcares no reductores Azúcares que no tienen extremo reductor y no se pueden oxidar, por ejemplo, la sacarosa Disacáridos Es la unión de dos monosacáridos a través de un enlace glucosídicos (enlace covalente) que completa el acetal, generalmente se enlaza por medio del C anomérico de uno con un grupo -OH del otro (C1, C3, C4 o C6) Enlace tipo 𝛽 Celobiosa · Unión de la glucosa con otra molécula de glucosa por medio de enlaces 𝛽1→ 4 · Glucosas quedan alineadas ecuatorialmente · Interacciones puente de hidrógeno · Entre los -OH del C3 con el O del hemiacetal · Entre los -OH de los C2 y C6 de ambas moléculas Lactosa · Unión de una galactosa con una glucosa · Enlace 𝛽1→4 Laminaribiosa · Unión de glucosas · Enlace 𝛽1→3 Calosa · Formada a partir de la laminaribosa · Las células vegetales la utilizan para obturar vasos y lesiones de pared · Enlace 𝛽-1→3 (estructura espiralada y no lineal) Enlace tipo ɑ Maltosa · Dos glucosas unidas por el enlace ɑ1→4 · Los monosacáridos quedan en posición axial Sacarosa · Forma de transporte de la materia orgánica en los vegetales · Unión de los C anoméricos ɑ1→ 𝛽2 de la glucosa y fructosa · Disacárido resultante · No posee extremo reductor · Completa el acetal correspondiente que no puede ser atacado por los oxidante débiles Glucosa Fructosa Polisacáridos Moléculas de gran tamaño y peso, insolubles en agua y carecen de carácter reductor. Si bien siempre queda un monosacárido con un extremo reductor libre, la gran masa del polisacárido lo oculta. · Formados por la unión de monosacáridos a través de repetidas uniones glucosídicas · Funciones · Almacenamiento · Formados por enlaces ɑ-glucosídicos que se hidrolizan a medida que la célula necesite de sus reservas energéticas · Estructura · Formados por enlaces 𝛽-glucosídicos que permiten la formación de estructurales lineales rígidas · Más importantes en células vegetales · Celulosa · Estructural de la pared celular · Compuesta de celobiosa (miles de moléculas de glucosa) · Enlace 𝛽1→4 formando estructura lineales que se asocian lateralmente · Interacciones puente de hidrógeno · Forman microfibrillas · Almidón · Reserva energética · Amilosa · Conformada por un gran número de moléculas de glucosa (maltosa) determinando una estructura espiralada o helicoidal · Glucosa con ángulos teóricos de 109° (6 glucosas es 1 vuelta) · -OH en el exterior y -H en el interior · Hidrosoluble → Estructura helicoidal le permite formar puente de hidrógeno y eso la hace soluble · En el interior se puede ubicar el I2 lo cual permite determinar los almidones de forma experimental · Amilopectina · Fracción ramificada e insoluble del almidón · Formado por maltosa pero con ramificaciones cada 20 o 30 unidades en ɑ1→6 · Glucógeno · Reserva energética de los animales · Estructura similar a la amilopectina pero con ramificaciones cada 8 a 122 moléculas de glucosa · + ramificaciones → > solubilidad Aditoles Polioles alifáticos → Reducción del grupo aldehído a su correspondiente alcohol No forman hemiacetales ni presentan estructuras cíclicas · Manitol: Reducción de la manosa · Sorbitol: Reducción de la glucosa, principalmente es la forma en la que algunas familias (como las Rosáceas) hacen el transporte de C Glicósidos · Éteres o ésteres de azúcar · Aglicona → La unión del C anomérico con los alcoholes o ácidos de otros compuestos no glucídico · Glicona · Compuesta por uno o varios monosacáridos · Reacciones más comunes que ocurren en las células · Plantas almacenan productos químicos importantes en glucósidosinactivos que se activan por enzimas cuando son requeridos · Funciones · Defensa de la planta · Medicina con fines terapeúticos Pared celular · Estructura semirrígida y porosa · Envuelve a las células de bacterias, hongos y plantas (no presente en las animales) · Funciones · Protección física del citoplasma · Hidratación de la célula · Barrera contra ataque de patógenos y permeable a determinadas sustancias de acuerdo al tamaño de las mismas · En organismo pluricelulares → Exoesqueleto que permite la posición erecta de dichos organismos · Forma a la célula y en definitiva a los organismos Polisacáridos en la pared celular · Polímeros de azúcares → (CH2O)n · Estructura furanósica y piranósica · Tipos · Celulosa · Glucanos (polisacáridos formados específicamente por unidades monómeras del monosacárido D-glucosa) · Glucosa y sus epímeros · Ácidos urónicos (oxidación del C6 de los glucanos) · Si los C6 de la galactosa y la manosa se reducen de alcohol a metilo obtenemos · Si se oxida completamente el ácido glucurónico obtenemos ɑ-D-xilosa y su diastereómero 𝛽-D-arabinosa Fibrillas de celulosa · Se forma por uniones 𝛽1→ 4 de glucosa a extremos reductores de celobiosa · Se agregan unidades de glucosa hasta completar cadenas de varios miles de unidades glucosídicas que terminan en un extremo reductor · C anomérico · Se une al grupo -OH del C4 de otra glucosa · Forma puentes de h entre los -OH y -O- de moléculas contiguas · Configuración → lineal con un extremo reductor libre También podemos ver como se agregan las moléculas de glucosa a las fibrillas de la pared celular, las fibrillas son resistentes a fuerzas de tensión La manera en la que se conforman es la siguiente 1. Celulosa → Hasta 20 000 unidades de glucosa 2. Microfibrillas → Paquetes de 30 a 40 cadenas de celulosa (interacciones laterales de puente de hidrógeno entre los -OH y -O- de las glucosas) 3. Macrofibrillas → Fibrillas (microfibrillas) desplazadas longitudinalmente unas de otras con el tipo de entramado que tienen las sogas Glucanos · Polisacáridos no celulósicos flexibles que presentan una cadena principal con ramificaciones cortas · Se combinan en las macrofibrillas de celulosa para formar las macrofibrillas Xiloglucanos · Cadenas de glucosa en uniones 𝛽 1→ 4 pero de menor longitud que la celulosa (< 1000 glucosas por cadena) · Adornadas por xilosas esterificadas al C6 por enlaces ɑ 1→ 6 · Las xilosas pueden estar unidas también a galactosa y luego a fucosa · Se entrecruzan con las fibrillas de celulosa formando un entretejido que da consistencia a la pared celular Carbono 1 de la glucosa Carbono 4 de la glucosa Carbono 6 de la glucosa Carbono 1 de la xilosa Glucuronoarabinoxilanos · Cadenas de xilosa unidas por enlaces 𝛽 1→ 4 · Ramificaciones · Arabinosa enlazadas por uniones ɑ 1→ 3 · Ácido galacturónico ɑ 1→ 2 XILOSA C! C4 ARABINOSA C3 ÁCIDO GALACTURÓNICO C2 Ácidos urónicos y laminilla media · Laminilla media · Capa más externa de las células que cementa las paredes celulares de dos vegetales adyacentes · Formada → Pectinas constituidas por cadenas de ácidos urónicos con enlaces ɑ 1→ 4 entre sí (glucurónico y galacturónico) · Estructura de la pared celular · Ácidos urónicos de la pared celular dejan sus grupos carboxilos expuestos · En la ionización en medio acuoso pueden formar enlaces electrovalentes con cationes (especialmente Ca2+) y forma una manera de cementar la estructura de la pared celular · Elemento importante en la confección de alimentos porque da consistencia (dulces y mermeladas) · Permite la unión de paredes de células vecinas (se unen los ácidos urónico a través del Ca2+) → esto es lo que llamamos laminilla media Proteínas · Son cadenas polipeptídicas · De longitud variable · Ricas en uno o dos aminoácidos · Con secuencias repetidas · Entrecruzan a las fibrillas de celulosa y cadenas de xiloglucanos asegurando el entramado Glucoproteínas Presentan cadenas laterales de carbohidratos unidas a determinados aminoácidos Extensinas · Glucoproteínas ricas en · Hidroxiprolina (HRGP) · Prolina · Glicina · Enzimas · Hidrolasas · Peroxidasas · Celulasas · Pectidasas · Relacionadas con · Producción de nutrientes · Metabolismo de polímeros de la pared · Defensa de la planta Lípidos Lignina Son polímeros complejos (alcoholes unidos a estructuras de resonancia con fuerte carácter ácido) que tienen como base moléculas derivadas de fenilpropanoides (sintetizado a partir de la fenilalanina), como el alcohol coniferílico. Hacen las paredes fuertes, resistentes e impermeables. Las protegen y preservan · Componentes · Flavonoides → quercetina (se acumulan en la estructura secundaria de las paredes) Modelo de integración de la pared celular · Polisacárido de celulosa · Forma fibrillas en su mayoría paralelas enlazadas por una red de polisacáridos ramificados · Glucoproteínas → Extensinas · Proteínas → Enzimas · Lípidos → Ligninas Bioenergética Sistema Estructura física que resulta funcional bajo ciertas condiciones, tanto seres vivos como no vivos pueden ser sistemas siempre y cuando cumplan con los requisitos de materia, energía e información Materia Constituida por compuestos orgánicos (lípidos, glúcidos, proteínas y ácidos nucleicos) que son sintetizados a partir de CO2 y H2O que toma del ambiente en el proceso de fotosíntesis y lo complementa con incorporación de minerales. Funciones · Estructura → Paredes y membranas · Funcional → enzimas y transportadores de membrana Energía Se obtiene a partir de · Luz solar (reacciones fotoquímicas y bioquímicas durante la fotosíntesis) · Metabolismo (sumatoria de reacciones químicas adicionales que ocurren en una célula -y en un organismo compuesto por células-) en donde oxida algunos compuestos que fueron sintetizados Transferencia, transformación y necesidad de energía · 1° ley: La energía no se crea ni se destruye · 2° ley: En toda reacción química la entropía aumenta · La energía disponible para hacer el trabajo (ordenar o hacer funcional el sistema) disminuye en una cierta magnitud, por eso es necesario un aporte externo de energía El ser vivo se opone a el aumento de entropía dentro de su propio sistema mediante el ingreso de energía de una fuente externa · Autotróficos Fotosíntesis → Proceso donde las células toman energía de la radiación electromagnética y se almacena en los carbohidratos (formados a partir de CO2 y H2O) para llevar a cabo las reacciones químicas necesarias para funcionar · Heterótrofos Tomamos la energía junto con la materia que consumimos de los autótrofos, en forma de los distintos compuestos químicos que componen los alimentos · Metabolismo · Endergónicas (anabólicas) Síntesis o reducción donde se necesita energía externa para que se produzcan las reacciones ; siendo menor la energía de los reactivos que la de los productos (como en la fotosíntesis) · Exergónicas (catabólicas) Degradación u oxidación que proporcionan energía · Reacciones acopladas Para que una reacción se lleve a cabo es necesario que otra le proporcione la energía necesaria mediante sustancias ricas en energía (sustancias intermediarias como el trifosfato de adenosina) · Trifosfato de adenosina (nucleótido) · Adenina→ Base nitrogenada, heterociclo de dos anillos insaturados unidos al sustituyente amino. Pirano y furano · Ribosa→ El C anomérico se une al N en posición 9 de la adenina. Pentofuranosa · Fosfatos→ Uno se esterifica al C5 de la ribosa y los otros se unen entre sí mediante enlaces anhídridos (entre dos ácidos) que son los que transmiten la energía a otros compuestos cuando se hidrolizan, activando el reactivo Por ejemplo, en la reacción anterior el glutamato incorpora un NH+3 al carboxilo del C5 · Guanosina trifosfato (GTP) · Fosfoenolpiruvato (PEP) · 1,3-bifosfoglicerato En la siguiente figura están representadas las reacciones de catabolismo, degradación u oxidación de compuestos complejos en otros más simples y de menor contenido energético, en sentido contrario formarán las reacciones de anabolismo, donde a partir de moléculassencillas sintetizan otras más complejas. Como podemos ver en el siguiente ciclo cerrado entre autótrofos (sintetizan) y heterótrofos (oxidan). La energía puesta en juego en todo el ciclo es abastecida por la luz solar durante todo el ciclo . Información Transferida por el ARN para la síntesis de proteínas que actúan después como enzimas y está contenida en el núcleo en el ADN Fotosíntesis La energía electromagnética es captada por pigmentos y es transformada en energía química, a su vez el agua se oxida a H+ y O2 liberándose a la atmósfera. Los electrones que se desprenden son transportados mediante sustancias intermediarias de la membrana tilacoidal que se reducen y oxidan constantemente. Los electrones del agua se reducen al NADP+ a NADPH, y se almacena la energía ahí y en el ATP (mediante un proceso quimio-osmótico), esta energía después se usa para reducir el C inorgánico (CO2 del aire) y al C orgánico (carbohidratos) en las reacciones químicas. Entrada de elementos ↓ Salida de elementos ↓ Luz como fuente de energía, pigmentos fotosintéticos · Luz Ondas electromagnéticas de longitud de onda variable que se desplazan a una velocidad de 300 000 km/s y que nuestra vista puede distinguir · Rango de longitud de onda Lo que nuestros ojos perciben se extiende de de 400 nm - 700 nm y se corresponde con los diferentes colores del arcoiris o los que obtenemos cuando se descompone una luz blanca al pasar por un prisma En el siguiente gráfico se encuentra representada la distribución de las radiaciones, en donde se describen los espectros de absorción de los diferentes pigmentos fotosintéticos. El contenido en energía de las diferentes radiaciones se puede expresar como E= h𝞶 · E (Einstein) → Energía contenida en un mol, fotón o quantum · h → Constante de Planck · 𝞶 → Frecuencia de la luz ondulada, proporcional a la velocidad de la luz · c → Velocidad de la luz (3 . 108 m/s) h𝞶= hc/𝞴 · h → Constante de Planck · 𝞶 → Frecuencia de la luz ondulada, proporcional a la velocidad de la luz · c → Velocidad de la luz (3 . 108 m/s) · 𝞴 → Longitud de onda Y se concluye que a medida que disminuye 𝞴, mayor es E · Pigmentos fotosintéticos Absorben la luz o energía electromagnética gracias a sus estructuras de resonancia determinadas por la presencia de enlaces insaturados (hibridación sp2) de tipo conjugado (alternados) · Clorofilas a y b Estructura de resonancia establecida por anillos tetrapirrólicos nucleados alrededor del Mg2+ → oxida a aldehído → anillo tetrapirrólicos fitol · 𝛽-caroteno → Algunas de las resonancias que presenta CH3 CH3 CH3 CH3 CH3 CH3 CH3 CH3 CH3 CH3 Entonces podemos afirmar que, por ejemplo, en el 𝛽-caroteno la energía es absorbida, se transmite a todos los enlaces de la molécula y ahí pasa a otras moléculas (ya sea de caroteno o clorofila) Estructura del aparato fotosintético Fotosíntesis → Cloroplastos · Cloroplastos · Envueltos en una doble membrana y en su interior tiene una estructura membranosa característica · Discos tilacoides (Thylacoïdes) → Discos cerrados que en su membrana incluyen los pigmentos fotosintéticos, clorofilas y carotenoides anclados a la parte lipídica por las porciones hidrofóbicas · Estroma (stroma) → Porción que no corresponde a los discos o a la estructura membranosa · Pigmentos fotosintéticos de los tilacoides Están agrupados en complejos antena (como la mayoría de los pigmenos), constituidos por unas 200 moléculas de clorofilas además de carotenoides y proteínas, y actúan recolectando la luz en el fotosistema I (PSI) y fotosistema II (PSII) Pico de absorción de radiación del PSI es 700nm y para el PSII es de 680 nm Fase fotoquímica 1. El complejo antena de los PSI o PSII absorbe un fotón de luz 2. Energía electromagnética se transmite a través de las estructuras de resonancia de las moléculas de los pigmentos fotosintéticos 3. Aumenta el contenido de energía de un electrón a un nivel energético superior 4. Vuelve a un nivel energético basal a. Devuelve energía en forma de calor b. Florescencia c. Transmite la energía a otro pigmento d. Reducción (es la etapa fotoquímica del proceso fotosintético) · Etapa fotoquímica Se toma la energía necesaria para hacer que el balance de entropía resulte negativo y que en las células se puedan llevar a cabo todas las reacciones químicas del metabolismo Cl (clorofila) + A (sustancia aceptora de electrones) + h𝞶 (luz) → Cl* + A → Cl- + A+ 1. Cl* → Clorofila en estado oxidado 2. Cl- → Clorofila en estado oxidado A+ → Aceptor reducido Transporte cíclico y acíclico (etapa clara o fotoquímica) La célula obtiene ATP y NADPH que son los compuestos en los que primariamente se almacena la energía de la luz convertida en energía química Fase bioquímica, Asimilación del CO2 y ciclo de Calvin-Benson Fijación del CO2 Glucólisis En un primer paso el 3PG se fosforila por acción de una enzima quinasa (que transfiere P) con gasto de ATP generando bifosfoglicerato (BPG), es decir adquiere un estado energético superior. Posteriormente, la acción de una deshidrogenasa con gasto de NADPH y pérdida de un fosfato, da origen al gliceraldehído-3-fosfato (G3P), que es una triosa fosforilada, es decir se trata del primer azúcar que se forma a partir de la fijación y reducción del CO2 del aire. Parte del G3P, por acción de una isomerasa, se transforma a su isómero de función, la dihidroacetona fosfato (DAP), y la posterior unión de ambos por una aldolasa da origen a fructosa 1,6-bifosfato (FBP). La FBP por acción de una fosfatasa pierde un fosfato formando fructosa-6-fosfato (F6P), que luego es isomerizada por una isomerasa a glucosa6-fosfato (G6P). Finalmente una fosfatasa hidroliza el enlace P dando origen a glucosa. Sistema funcional Es necesario tener · Enzimas → catalizan las reacciones respectivas · Sustratos · ATP (fase fotoquímica) · NADPH (fase fotoquímica) · CO2 (tomado del aire) · Aceptores para · CO2 · RuBP (ribulosa-1, bifosfato) · C fijado (de cada 6) · 1 se utiliza para la síntesis de glucosa · 5 son destinados a la reposición del aceptor · Las triosas P dan origen a diversos monosacáridos (tetrosas y heptosas) que dan lugar a la regeneración del aceptor con gasto de ATP, ya que el aceptor debe estar activado por medio de bifosforilación Ciclo metabólico RuBP (Rubisco) → La cadena de reacciones comienza y termina con ese compuesto · Ingresa → CO2 y energía (ATP y NADPH) · Obtención → Glucosa · Aspecto a notar→ La cantidad de ATP que se necesita por cada vuelta del ciclo es mayor que la de NADPH (relación 3:2) ya que el ATP extra se usa para regenerar el aceptor Toda esta fase bioquímica o ciclo oscuro, se ve representado en el ciclo de Calvin-Benson y podemos en resumen diferenciar las siguientes partes · Fijación del carbono → Formación del 3PG · Reducción del C → Formación del G3P que luego deriva en glucosa · Regeneración del aceptor del C → RuBP La fotosíntesis da como resultado para la biósfera · Construcción de la materia orgánica del sistema · Captura de la energía del sol para asegurar el funcionamiento de dicho sistema · Mantenimiento del balance de gases O2/CO2 a nivel atmosférico para permitir la vida de los animales Fotorrespiración Rubisco → Si bien tiene una alta afinidad hacia el CO2, cuando las concentraciones de CO2 bajan demasiado comienza a trabajar como oxigenasa y deja de trabajar como carboxilada Reacciones de la fotorrespiración (ocurre en presencia de luz, se oxida el aceptor y constituye una vía oxidativa de escape de materia y energía) · No forma dos moléculas de 3PG, no fija al CO2 · El aceptor RuBP oxida a una molécula de 3PG y otra de 2PG (fosfoglicolato) · 2PG se oxida y se termina liberando CO2 o sintetizando otros compuestos como aminoácidos Ciclo C3 y C4 Investigadores no encontraban el Ciclo de Calvin, encontraban: · Oxaloacetato → Primer producto estable del proceso fotosintético un compuesto de 4 átomos de C (por eso su nombre C4) · Modo alternativo de fijar el CO2 dependiendo las especies vegetales (vid, trigo, duraznero tienen el ciclo deCalvin-Benson, pero el maíz, sorgo y cañas de azúcar son plantas C4) 1. Oxaloacetato a. Aceptor del fosfoenolpiruvato (PEP) b. Enzima → PEP carboxilasa 2. Malato a. Producido en los cloroplastos de las células del mesófilo b. Transportado a las células de la vaina que rodean a los haces conductores c. Se decarboxilan liberando CO2 que ingresa el ciclo de Calvin.Benson d. Producen piruvato 3. Piruvato a. Vuelve a las células del mesófilo para regenerar al aceptor (PEP) El oxaloacetato sintetizado primeramente actúa como transportador de CO2 hacia las células de la vaina, manteniendo una concentración adecuada del mismo para que el RUBISCO trabaje como carboxilasa y no como oxigenasa Por cada mol de CO2 que se fija, se consume una cantidad adicional de NADPH y ATP a los que se gastan en el ciclo de Calvin-Benson (suplidos también por la fase fotoquímica de la fotosíntesis) No ocurre fotorrespiración Metabolismo Crassulacean Acid Metabolism del carbono Es una alternativa del metabolismo C4 propio de plantas de ambientes secos (Crasuláceas por ejemplo). Es similar al de las plantas C4 pero las fases en vez de estar separadas por las fases carboxilativas en el espacio, lo están en el tiempo. Los estomas están abiertos durante la noche (ingresa el CO2) y cerrados durante el día (no pierden agua) Noche 1. PEP carboxilasa a. Asimila el CO2 dando malato en el citosol b. Malato es transportado a la vacuola donde será almacenado 2. Almidón a. Se degrada para regenerar el aceptor de CO2 que es el PEP Día 1. Malato a. Transportado al cloroplasto donde es decarboxilado para dar piruvato y CO2 2. CO2 a. Fijado por el Rubisco en el Ciclo de Calvin-Benson b. Rubisco no actúa como oxigenasa por gran concentración de CO2 3. Piruvato a. Convertido a triosa fosfato y luego a almidón o sacarosa Destino de los azúcares Catabolismo de carbohidratos · Glucosa · Sustrato utilizado como punto de partida de las reacciones químicas que ocurren en la célula · Sintetizada en el proceso fotosintético en el caso de las células de las plantas y muchas bacterias o incorporada como tal en células de organismos heterótrofos · Constituye el combustible primario a partir del cual la célula toma la energía y materia esencial para el desarrollo de sus variadas funciones · Otros monosacáridos · Dan energía a la célula pero previa conversión a glucosa o ingresando como intermediarios en el proceso de la glucólisis (fructosa y gliceraldehído) · Oxidación de la glucosa · Se obtiene energía metabólica que satisface las necesidades del resto de las reacciones endergónicas del metabolismo celular que la necesitan · Serie de reacciones → No siguen un único camino metabólico, sino que transitan vías alternativas que dependen de las condiciones del medio y de las características particulares de las células y/u organismos Glucólisis Es el proceso de oxidación de la glucosa implicando la ruptura de la misma en dos moléculas de ácido orgánico de 3 átomos de C llamada piruvato o ácido pirúvico y ocurre en el citosol siendo catalizado por enzimas solubles (no asociadas a la membrana). Este proceso se divide en dos etapas según sus características termodinámicas, que podemos ver a continuación: · En la primera etapa la célula debe gastar ATP (energía metabólica) para activar y dividir a la molécula de glucosa generando dos G3P mediante una serie de reacciones endergónicas Para iniciar la secuencia glucolítica es necesaria la energía de los enlaces fosfatos de 2 moles de ATP por cada mol de glucosa · En la segunda etapa de la glucólisis se oxida el G3P a piruvato se genera por cada G3P · 2 moles de NADH · 4 moles de ATP Comparando la fase preparatoria con el balance final. vemos que en un principio se gastan 2 moles de ATP por cada mol de glucosa y al final en la oxidación parcial obtenemos 2 moles de piruvato, 2 moles de NADH y 2 moles de ATP Entonces podemos decir que una molécula de glucosa se convierte en dos moléculas de piruvato y parte de la energía originalmente contenida en una molécula de glucosa queda conservada en los enlaces fosfatos de dos moléculas de ATP y en los electrones de alto potencial redox de dos moléculas de NADH glucosa + 2ADP + 2Pi + 2NAD+ → 2 piruvato + 2ATP + 2NADH + 2H+ + 2H2O Destino del piruvato generado en la glucólisis El piruvato generado por la glucólisis puede tener tres destinos posible o alternativos que van a depender de · Condiciones del ambiente celular · Capacidad intrínseca de dicha célula El principal condicionante es la ausencia (anoxia) o presencia de O2 Fermentación láctica La carencia de O2 impide que continúe la oxidación del piruvato en el proceso respiratorio, mientras que se incrementa la demanda de ATP Para suplir esa necesidad la célula utiliza el poder reductor del NADH producido en la glucólisis, para reducir el piruvato a ácido láctico y liberar NAD+ que alimenta la fase oxidativa de la glucólisis y de esta manera sigue el proceso de glucólisis para obtener ATP Este mecanismo fermentativo · Es de emergencia en células de mamíferos · Habitual en algunos microorganismos · Células de mamíferos · Acumúlación de ácido láctico es limitada (se catbolia durante el reposo produciendo CO2 y H2O · Algunos microorganismos · Las condiciones del medio celular generado por el proceso de fermentación láctica tiene un efecto regulador · Al concentrarse el ácido láctico aumenta la concentración de protones (baja el pH) y esta condición inhibe a la enzima lactato deshidrogenasa (responsable de reducir el piruvato a lactato) Fermentación alcohólica La misma condición de bajo pH activa a su vez al piruvato decarboxilasa que ante la concentración de piruvato genera acetaldehído Presencia de O2 · Piruvato toma la ruta oxidativa ingresando a la mitocondria · Se oxida al CO2 quedando energía liberada y almacenada en los enlaces fosfatos ATP (respiración mitocondrial · Procesos fermentativos · Puede ser más complejo · Depende de las células de microorganismos como bacterias y levaduras que los llevan a cabo · Alcoholes que se pueden obtener · Metanol · Etanol · Isopropanol · Butanol · Butanodiol · Glicerol · Es posible obtener acetona por oxidación del piruvato en vez de aldehído · Ácidos generados en fermentaciones producidas por bacterias · Ácido fórmico · Ácido acético · Ácido propiónico · Ácido butírico · Ácido succínico · Procesos de regulación · Muchas células irán variando la producción de productos fermentativos según varíen a su vez las condiciones del medio celular (pH fundamentalmente) · Con propósitos industriale se puede guiar estos procesos o activar diferentes microorganismos, al regular dichas condiciones del medio Respiración mitocondrial → Decarboxilación del piruvato En la liberación del CO2 → El carboxilo del piruvato se oxida totalmente · Residuo Proceso Respiración mitocondrial → Ciclo de Krebs · Por cada vuelta del ciclo ingresa un mol de acetil-CoA (molécula de acetato activado) · Reacciones exergónicas → Acetato (del ácido tricarboxílico) se oxida y libera CO2 · Energía del acetato se transfiere como electrones y protones a coenzimas oxidadas (NAD+ y FAD) que se reducen (NADH y FADH2) constituyendo la ganancia neta del ciclo · Se obtiene una molécula de GTP que se transfiere a ATP y su poder reductor servirá para formar ATP luego en la cadena de transporte de electrones · Se necesitan dos vueltas de ciclo para completar la oxidación de una molécula de glucosa Respiración mitocondrial → Cadena respiratoria Componentes de la cadena transportadora de e- mitocondrial o cadena respiratoria · Cuando un compuesto se reduce toma protones de la matriz mitocondrial y cuando se oxida los cede a la solución del espacio intermembrana · Más H+ en intermembrana, generando una diferencia de pH 5 contra 7 de la matriz → Fuerza protón motriz · Motoriza la actividad de los complejos ATP sintasa (ATPasa) que generan ATP a partir de ADP y Pi Respiración mitocondrial → Balance final · Esta no es una sola reacción, sino que son muchas encadenadas · Reacciones de naturaleza termodinámica