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Tema Nº6 Regulación de la función genética y actividad bioquímica de las células. Biotecnología 1 Tema Nº6 Regulación de la actividad enzimática A) Control de la transcripción por represión e inducción • Modelo propuesto por JACOB y MONOD basado en observaciones de funcionamiento del operón lactosa de Escherichia coli, en 1961. • En 1967, corroborado por MÜLLER y HILL. E1; E2; E3: enzimas inductibles o adaptativas. o: gen operón. i: gen regulador que codifica la síntesis de una proteína, el represor ✓ El represor tiene afinidad por el operón. Represión en ausencia de S. Inducción en presencia de S. Figura Nº2: Inducción en presencia de substrato Figura Nº1: Represión en ausencia de substrato Tema Nº6 Regulación de la función genética y actividad bioquímica de las células. Biotecnología 2 B) Enzimas alostéricas (“allos”, griego: de otra forma) • A menudo, la enzima que cataliza la primera reacción de una secuencia metabólica es una enzima alostérica. • Una enzima alostérica, además de los sitios activos para fijar al substrato posee lo que se denominan sitios alostéricos. • Los sitios alostéricos pueden fijar substancias que actúan ya como activadores, ya como inhibidores. • El que un activador o inhibidor se fije sobre una enzima alostérica produce una deformación reversible que es la responsable de la activación o inhibición. Figura Nº3: los dibujos superiores muestran a un inhibidor alostérico impidiendo el ingreso del substrato, los inferiores muestran los activadores alostéricos que favorecen la unión de la enzima con el substrato. ENZIMAS ALOSTÉRICAS Enzima (producto final) Microorganismo Activador Inhibidor Treonina desanimasa (L-isoleucina) Escherichia coli Salmonella typhimurium Saccharomyces cerevisiae L-valina L-isoleucina Acetolactato sintetasa (L-valina) Escherichia coli Salmonella typhimurium --------------------- L-valina Fosfofructosa kinasa (glicólisis) Saccharomyces cerevisiae AMP Citrato, exceso de ATP NAD-isocitrato-deshidrogenasa (Ciclo de KREBS) Saccharomyces cerevisiae Citrato Α-cetoglutarato Succinil homoserina sintetasa Escherichia coli --------------------- L-metionina • La retroinhibición consiste en la inhibición de la primera enzima de una vía metabólica por el producto final de la misma secuencia. Tema Nº6 Regulación de la función genética y actividad bioquímica de las células. Biotecnología 3 • La activación de E1 puede ser hecha por una activador, un precursor del substrato o bien por el mismo substrato. • Si A y B son necesarios para sintetizar C, para producir coordinadamente A y B, B puede ser activador de la síntesis de A. • Podría ocurrir que C fuera inhibidor de la síntesis de A (o de B). Producción de metabolitos • Los metabolitos son los productos del metabolismo. • En un proceso discontinuo, el crecimiento microbiano sigue una ley: Figura Nº4: fases del crecimiento microbiano ✓ A la fase de crecimiento o fase exponencial se la denomina TROFOFASE. Durante esta fase se producen los METABOLITOS PRIMARIOS. (aminoácidos, vitaminas, nucleótidos, proteínas). La biomasa celular es un metabolito primario. ✓ A la fase estacionaria se la llama IDIOFASE y es la que sigue a la exponencial o de crecimiento. En esta fase se producen los METABOLITOS SECUNDARIOS (antibióticos, alcaloides, solventes, etc.). Los metabolitos secundarios son producidos sólo por algunos microorganismos. Los metabolitos secundarios no parecen ser esenciales ni al crecimiento ni a la reproducción. • La formación de metabolitos primarios es extremadamente dependiente de las condiciones ambientales. • La regulación de la biosíntesis de metabolitos primarios es significativamente distinta a la de los metabolitos secundarios. Tema Nº6 Regulación de la función genética y actividad bioquímica de las células. Biotecnología 4 Regulación de producción de metabolitos primarios Un mayor conocimiento de la bioquímica y genética de los microorganismos ha permitido mejorar la producción de metabolitos primarios, fundamentalmente, eliminando la retroinhibición: 1. Se elimina la retroinhibición por producto final utilizando mutantes auxótrofos que no pueden producir el producto final de una secuencia metabólica. El producto final se agrega en pequeñas cantidades, sólo para permitir el crecimiento y de forma que no haya retroinhibición. De esta manera se produce la secreción del producto intermediario deseado. La técnica es válida para secuencias lineales o ramificadas. Figura Nº5: Producción de metabolitos primarios 2. Un segundo método es la selección de mutantes resistentes a antimetabolitos. Los antimetabolitos son análogos estructurales de los metabolitos finales de una secuencia de reacciones. Pueden causar retroinhibición pero no pueden sustituir en sus funciones a los metabolitos normales. Los antimetabolitos ocasionan la muerte de las células normales. Los mutantes resistentes a los antimetabolitos pueden formar un exceso de metabolitos. Por ejemplo: ANTIMETABOLITOS FRECUENTEMENTE UTILIZADOS Metabolito normal Antimetabolito Tiamina Piritiamina Piridoxina Isoniazida Metionina α-metil-metionina norleucina Triptófano 5 ó 6 metil-triptófano Fenilalanina p-fluorofenilalanina Arginina Caravanina Ácido para – amilobenzoico Sulfonamida Ácido nicotínico 3-acetil-piridina Tema Nº6 Regulación de la función genética y actividad bioquímica de las células. Biotecnología 5 Regulación y superproducción de metabolitos secundarios 1. Por empleo de mutantes resistentes a la retroinhibición. Por ejemplo: Microorganismo Antibiótico Característica Penicillium chrysogenum Penicilina Sensibilidad reducida a retroinhibición por valina Streptomyces griseus Candicidina Resistencia a antimetabolitos de triptófano 2. Una mutación auxotrófica en la biosíntesis de metabolitos primarios puede conducir a un aumento en la biosíntesis de metabolitos secundarios. Por ejemplo: Inducción Los metabolitos secundarios se producen en la idiofase porque las enzimas responsables de su síntesis están reprimidas durante la trofofase. Sin embargo, una adecuada composición del medio de cultivo puede hacer que una fracción importante de un substrato lentamente aprovechable (para que las condiciones de crecimiento del organismo no sean óptimas) conduzca a una formación paralela del metabolito secundario. Sólo se conocen algunos ejemplos de substancias que agregadas al medio de cultivo favorezcan la biosíntesis de metabolitos secundarios: • El triptófano es un regulador e inductor de la biosíntesis de alcaloides del ergot (obtenidos del hongo del parásito del centeno Claviceps purpurea y basados en clavina y ácido lisérgico). • La metionina favorece la producción de cefalosporina, etc. Regulación por producto final Se sabe que los antibióticos inhiben su propia biosíntesis, por ejemplo: penicilina, cloramfenicol, puromicina, etc. El mecanismo de retroregulación ha sido explicado para muy pocos casos. Por ejemplo: el cloranfenicol inhibe la arilsintetasa que es la primera enzima de la vía biosintética que desde los ácidos aminados aromáticos conduce al cloranfenicol. Un aumento de la productividad requiere la búsqueda de mutantes menos sensibles a la inhibición por producto final. Tema Nº6 Regulación de la función genética y actividad bioquímica de las células. Biotecnología 6 Figura Nº6: cloranfenicol o cloromicetina Regulación catabólica La regulación catabólica es un mecanismo de regulación por el cual una enzima clave implicada en una vía catabólica está reprimida, inhibida o inactivada cuando se añade un substrato que se utiliza normalmente. Los substratos que producen regulacióncatabólica incluyen fuentes de carbono y de nitrógeno. 1- Fuentes de carbono: El cuadro muestra distintas fuentes de carbono que causan regulación catabólica y fuentes de carbono que no inhiben la formación del producto. El mecanismo de esta regulación depende del organismo y del metabolito. Es conocida la REPRESIÓN CATABÓLICA (levaduras, hongos y algunas bacterias). La represión catabólica consiste en la inhibición del ARN-m por la glucosa. La síntesis del ARN-m necesita la presencia de PAC (proteína activadora catabólica) que debe unirse al sitio promotor de transcripción del operón. Esto sólo se consigue en presencia de AMP-c (adenosín-mono-fosfato- cíclico). Figura Nº7: AMP-c: nucleótido universal de gran importancia biológica que controla como activador alostérico de varias enzimas celulares. Para unirse al sitio promotor la PAC debe estar previamente unida al AMP-c. ¿Cómo pueden utilizarse entonces estas fuentes de carbono a menudo baratas y fácilmente utilizables? Para minimizar la represión catabólica se las añade por recargas a bajas velocidades. ANTIBIÓTICO Fuente de carbono Inhibitoria No inhibitoria Penicilina Glucosa • Lactosa • Alimentación con glucosa. Cefamicina Glicerol • Asparagina Bacitracina Glucosa • Citrato Cloranfenicol Glucosa • Glicerol Neomicina Glucosa • Maltosa Novobiocina Citrato • Glucosa Puromicina Glucosa • Glicerina Estreptomicina Glucosa • Manano (polisacárido soluble extraído de levadura y coníferas) • L-ramnosa Tema Nº6 Regulación de la función genética y actividad bioquímica de las células. Biotecnología 7 Figura Nº7: Esquema de la represión catabólica 2- Fuentes de nitrógeno: en la producción de antibióticos se ha observado también que el AMONIO y otras fuentes de nitrógeno rápidamente utilizable actúan como inhibidores. Regulación por fosfato Los medios de cultivo requieren fosfato inorgánico Pi dentro de un rango de 0,3 a 30 mM (1 M = 98g/l) para el crecimiento tanto de procariotas como de eucariotas. La concentración de Pi para la producción de metabolitos secundarios varía dentro de un rango amplio comprendido entre 0,01 mM y 50 mM tal como se muestra para algunos antibióticos en el cuadro de la página siguiente. El consumo de Pi influye tanto en la trofofase como en la idiofase y se han propuesto varios mecanismos posibles de regulación. Conclusión Sobre la base de conocimientos biológicos y bioquímicos profundos, el diseño de medios de cultivo para la producción de metabolitos secundarios debe hacerse a partir de una seria experimentación estadística. ANTIBIÓTICOS CUYA FORMACIÓN ES INHIBIDA POR LA PRESENCIA DE Pi ANTIBIÓTICO ORGANISMO PRODUCTOR Rango de Pi (mM) que permite la formación del antibiótico Estreptomicina Streptomyces griseus 1,5 – 15 Bacitracina Bacillus licheniformis 0,1 – 1 Clorotetraciclina Streptomyces aureofaciens 1 – 5 Tetraciclina Streptomyces aureofaciens 0,14 – 0,2
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