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721 Abacavir K65R, L74V, Y115F, M184V Didanosina K65R, L74V Emtricitabina K65R, M184V/I Lamivudina K65R, M184V/I Stavudina M41L, E44D, K65R, D67N, K70R, V118I, L210W, T215Y/F, K219Q/E Tenofovir K65R Zidovudina M41L, E44D, D67N, K70R, T215Y/F, K219Q/E Delavirdina K103N, V106M, Y181C, Y188L, P236L Efavirenz L100I, K103N, V106M, V108I, Y181C/I, Y188L, G190S/A Nevirapina L100I, K103N, V106A/M, V108I, Y181C/I, Y188C/L/H, G190A Enfurvitida (gp41) G36V, I37V, V38A, Q39R, N42D/T, N43D, L44M, L45M Atazanavir L10I/F/V, G16E, K20R/M/I, L24I, V32I, L33I/ F/V, M36I/L/V, M46I/L, G48V, I50L, I54L/V/ M/T, D60E, I62V, A71V/I/T/L, G73C/S/T/A, V82A/T, I84V, I85V, N88S, L90M, I93L Indinavir L10I/R/V, K20M/R, L24I, V32I, M36I, M46I/L, I54V, A71V/T, G73S/A, V77I, V82A/F/T, I84V, L90M Lopinavir/ r L10F/I/R/V, K20M/R, L24I, V32I, L33F, M46I/L, I47V/A, I50V, F53L, I54V/L/A/M/T/S, L63P, A71V/T, G73S, V82A/F/T/S, I84V, L90M L10F/I, D30N, M36I, M46I/L, A71V/T, V77I, V82A/F/T/S, I84V, N88D/S, L90M Fosamprenavir L10F/I/R/V, V32I, M46I/L, I47V, I50V, I54L/V/M, G73S,V82A/F/T/S, I84V, L90M Ritonavir L10F/I/R/V, K20M/R, V32I, L33F, M36I, M46I/L, I50V, I54V/L, A71V/T, V77I, V82A/F/T/S, I84V, L90M Saquinavir L10I/R/V, G48V, I54V/L, A71V/T, G73S, V77I, V82A, I84V, L90M Raltegravir Maraviroc (*) Enfurvitida N42T, N43DKS, L44 M, L45M Bevirimat (**) Tabla 50.2. Mutaciones asociadas a resistencia a drogas utilizadas para el tratamiento de la infección por HIV-1. Las - mación completa sobre 5.2 ENSAYOS GENOTÍPICOS Se basan fundamentalmente en dos principios distintos: la determi- nación de mutaciones puntuales y la determinación de la secuencia completa de la región de interés. En ambos casos se pueden usar diversos tipos de muestra, siendo los empleados con mayor frecuen- - men, etc. A continuación se detallan algunos ensayos genotípicos: Ensayos de secuenciación de DNA: estos ensayos proveen infor- mación de todos los nucleótidos en la región genómica secuen- ciada. Se basan en la reacción de terminación de cadena mediante breve tiempo. En nuestro país, se utilizan protocolos desarrollados en los propios laboratorios o basados en información publicada por otros encuentran HIV Genotyping System TRU- GENE® HIV-1 Genotyping Assay . Ensayos de mutaciones puntuales: estos ensayos sólo dan infor- mación sobre la naturaleza de un número limitado de codones en pero demostró tener poca utilidad a partir de la implementación de clínica. la detección de mutaciones puntuales, el ensayo de sondas alineadas Line Probe Assay o hibrida- diversas mutaciones. El secuenciación - LiPA sólo da información sobre la presencia de determinados residuos aminoacídicos en los codones analizados, y no permite conocer el estado de otras posiciones de clínica. 5.3 PROBLEMAS INHERENTES A LOS SISTEMAS DE GENOTIPIFICACIÓN 5.3.1 Diversidad genética del HIV-1 hibridación, ya sea para - frentar la alta variabilidad que se asocia al como las sondas de - América del Norte y Europa occidental, pertenecientes al subtipo B. Sin embargo, es muy poco lo que se conoce hasta el momento sobre la funcionalidad de los ensayos genotípicos en regiones donde otros subtipos y/o formas recombinantes entre subtipos son muy frecuentes. 5.3.2 Interpretación del genotipo Antes de que pueda ser transferida al médico, la información ge- notípica cruda debe ser procesada. Es importante notar que esta de las distintas mutaciones detectadas. Para que los sistemas de clínica han sido diseñados diversos algoritmos de interpretación de genotipo e inferencia de fenotipo. Algunos de ellos se basan en reglas pro- Capítulo 50 / Introducción al tratamiento antirretroviral y resistencia... VIROLOGÍA MÉDICA PARTE 5 CAPÍTULO 50 5. ENSAYOS DE RESISTENCIA DEL HIV-1 A DROGAS ANTIRRETROVIRALES 5.2 ENSAYOS GENOTÍPICOS 5.3 PROBLEMAS INHERENTES A LOS SISTEMAS DE GENOTIPIFICACIÓN
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