entrecruzamientos y ligamientos

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Citogenética: ciencia en que se creó tras la fusión de la genética y la biología molecular. De importancia ya que aquí es donde se están refugiando la información que existen en los cromosomas.
La Teoría cromosómica de la herencia establece que los genes se encuentran en los cromosomas, por lo tanto, es importante su estudio ya que cuando el cromosoma migra o se va desplazando durante el proceso de duplicación tanto en la mitosis como en la meiosis, el movimiento del cromosoma va en paralelo con el movimiento de los genes y aquí es donde radica la importancia hacia ellos. 
Mendel estudio genes que se encontraban ubicados en cromosomas diferentes. El estudio entre 7 a 11 características diferentes. Se estableció que el color de la semilla estaba en un cromosoma mientras que la textura en otro cromosoma. Los cromosomas que tienen la información para el color son los mas grandes mientras que los cromosomas más pequeños son los que portan la información para la textura.
Lamina 4:
Llama la atención que algunos de estos cromosomas son de color rojo y otros de color azul (cosa que obviamente no ocurre así en la vida), pero esto esta dado ya que algunos son de origen materno (rojos) y otros de origen paterno (azules) todo esto para que podamos entender que los dos alelos que están dando información para el color de la semilla y los dos alelos que están dando la información para la textura vienen tanto de origen materno como paterno.
Mendel estudio genes que se encontraban ubicados en cromosomas diferentes. Recordando que los cromosomas son como “vehículos de carga”, esto significa que cada gen que se encuentre en un cromosoma no se va a ver afectado por el fallo de otro cromosoma.
Pero ¿Qué sucede si estudiamos la herencia de genes que están ubicados en el mismo cromosoma?
Puede que los genes que se encuentran en un mismo cromosoma estén ligados y de eso se hablara más adelante.
Cuando dos genes están ubicados físicamente en el mismo cromosoma, esos genes se encuentran en el mismo Grupo de Ligamiento.
Lmaina 9
ENTRECRUZAMIENTO: Fenómeno de intercambio de material genético que ocurre entre las cromátidas de cromosomas homólogos (cromosoma materno y cromosoma paterno), cuando ellos se enfrentan durante la sinapsis resulta que se pueden sobrecruzarcromátidas hermanas, estas cromátidas pueden reunir e intercambiar fragmentos cromosómicos. Este proceso es muy parecido a una mutación de tipo translocación, sin embargo no es una. La diferencia es que en este caso es entre cromosomas homólogos o equivalentes, mientras que las translocaciones son entre cromosomas diferentes.
Por lo tanto, cuando ocurre el intercambio de material genética entre cromosomas homólogos es considerado un entrecruzamiento y cuando es entre cromosomas diferentes se considera una mutación de tipo translocación. Ver imagen de la lamina 9.
Lamina 10 
QUIASMA: es el punto de unión o recombinación entre las cromátidas. Son los puntos donde dejo de estar secuenciado la información que tenía originalmente una cromátida y fue sustituida por la que tenía la cromátida hermana. 
Viene del griego x o disposición cruzada.
Lamina 11
Consecuencias de que ocurra o no el entrecruzamiento:
Si tenemos los dos cromosomas homólogos (lleva información para un mismo gen). El gen A y el gen B (color de semilla y textura de la semilla), esos dos mismos genes se encuentran en un mismo cromosoma, si no ocurriera el entrecruzamiento posteriormente el gen A migra para un lado y el gen B hacia otro, posteriormente los centrómeros se fracturan, dando como producto final las 4 gametas que es el producto meiótico. Las dos que son de origen materno son iguales entre sí, mientras que las dos que son de origen paterno son iguales entre sí (dos gametas iguales y dos gametas iguales).
Cuando hay entrecruzamiento el quiasma se rompe y se intercambian fragmentos, teniendo nuevas combinaciones que no existían denominadas gametas recombinantes. Este otro mecanismo contribuye al mecanismo de variabilidad, ya que con esta recombinación se tendrá una mayor diversidad de gametas.
Lamina 12
Vamos a tener las gametas parentales: que son aquellas que tienen la misma combinación de alelos que los padres y sus Gametos NO producidos por recombinación entre los loci en estudio.
Las gametas recombinantes son justamente aquellas que tendrán diferentes combinaciones de alelos que los padres debido al entrecruzamiento y gametos producidos por recombinación (entrecruzamiento).
Existen varias opciones para el entrecruzamiento. A lo largo del cromosoma se pueden entrecruzar varias veces (2,3, 4veces) y a medida que ocurren mas entrecruzamientos hay mas puntos de ruptura y mas puntos de mezclar la información genética de la madre y padre, por lo tanto, cada vez va incrementando más y más la variabilidad.
Esto es de importancia ya que al comprender la variabilidad de las gametas se entenderá porqué hay variabilidad en la población.
Lamina 14:
A mayor distancia entre los genes dentro de un mismo cromosoma hay mayor probabilidad de que ocurra entrecruzamiento entre ellos. Cuando dos genes están muy cerca es poco probable que las hembras se sobremonten en ese trayecto tan corto, si la distancia entre esos dos genes es más larga habrá mayor probabilidad de que ocurra el entrecruzamiento.
Esto dado ya que la probabilidad de entrecruzamiento entre dos genes es proporcional a la distancia que los separa. Mayor distancia mayor probabilidad, menor distancia menor probabilidad de que ocurra el entrecruzamiento; en consecuencia se heredan y se transmiten juntos. Genes muy pegados se heredan en bloque.
Lamina 17:
En la imagen podemos observar dos entrecruzamientos. Tanto A como B se espera que se puedan heredar juntos. A esto llamamos genes ligados y cumplen unas ciertas características.
*Ubicados en el mismo cromosoma, a una distancia (<50 cM= equivale al porcentaje de recombinación) que permite que se transmitan juntos con mayor frecuencia.
GENES INDEPENDIENTES: Están ubicados en distintos cromosomas, como también en el mismo cromosoma, pero separados por una distancia tal que su comportamiento se asemeja a genes que están en cromosomas diferentes (mayor a 50 cM).
Lamina 18:
Aquí tenemos dos genes (gen A y gen B), ambos en condición de heterocigoto. 
Aquí se quiere estudiar son los genes en un mismo cromosoma. Completar porque no entendí nada de la explicación.
Lamina 19:
Genes independientes. En este caso tenemos 4 gametas, dos producto del entrecruzamiento y dos parentales, como las 4 están muy separadas las 4 están en igual proporción, ya que siempre hay chance de que el entrecruzamiento ocurra y por lo tan van a existir siempre recombinantes en igual proporción que parentales.
Si la distancia es mayor o igual a 50 cM se cumple que =25% AB, 25% Ab, 25% aB, 25% ab todas estas con igual proporción.
Lamina 20:
Genes ligados. Los genes están en un mismo cromosoma pero separados a una distancia no mayor a 50 Cm. Si A y B están muy pegados no se tiene una plena oportunidad de entrecruzamiento, aquí por azar puede que ocurra el entrecruzamiento, como también que no ocurra.
>25% AB, >25% ab, <25% Ab, <25% aB 
2 Gametos parentales 2 Gametos recombinantes (entrecruzamiento)
Esto es igual a lo que se vio antes, el cambio está en que no todas van a ocurrir en la misma frecuencia o en la misma proporción. Si la distancia entre las gametas es menor a 50 cM, la distancia será tan corta que siempre se heredan juntos. Aquí la probabilidad de que ocurra el entrecruzamiento es mínima, por lo tanto, tendremos gametas solamente parentales.
Cuando la distancia es muy corta entre los genes la probabilidad de que se entrecrucen A y B se encuentra muy reducida, por lo tanto las combinaciones maternas y paternas son las predominantes y las combinaciones producto del entrecruzamiento recombinantes son muy pocas o escasas.
Lamina 21:
Genes completamente ligados (no es lo mismo que genes ligados al sexo). Esto es más teórico, poca probabilidad de que ocurra.
La distancia entre el gen A y el B es cero, estosse encuentran sobremontados. Esto sería el caso de tener dos genes en un mismo pedazo de cromosoma (en bases nitrogenadas o proteínas).
No hay entrecruzamiento, No hay gametas recombinantes. Las gametas que se producen son iguales a las del papa o a la de la mama. 
Tendríamos solo dos gametas, y ambas en igual proporción 50% AB y 50%ab. 
Lamina 22:
*Independiente: genes en cromosomas distintos. 
Genes en dos cromosomas distintos. Tenemos las 4 gametas en igual proporción 25% cada una.
*Genes completamente ligados: genes en un mismo locus, sobremontados. Aquí no ocurre entrecruzamiento, por lo tanto es cero las recombinantes, solo existen las parentales. Mitad de la madre mitad del padre. No contribuye a la variabilidad.
*Genes ligados: genes en un mismo cromosoma, pero la cantidad de recombinantes será menor al 25% y la cantidad de parentales mayor al 25%. Esto aumenta o disminuye dependiendo de si están más cerca o menos cerca los genes (más cerca disminuye el entrecruzamiento y las gametas recombinantes, pero hay un aumento de más del 25% de las parentales).
Lamina 23:
Hasta el momento hemos dicho que Ab y Ab son las parentales y ab y AB son las recombinantes, pero esto no es tan así.
Si la disposición de los alelos en un dihibrido es que en un cromosoma están (paternos o maternos) los dos alelos dominantes y en otro los dos alelos recesivos, estamos en una fase de ligamiento.
Los dos alelos dominantes en un cromosoma (AB) y los dos alelos recesivos en otro (ab), proceso llamado acoplamiento.
También puede ocurrir la fase de repulsión. Esta implica que existe un dominante y un recesivo en cada cromosoma, es decir Ab en un cromosoma y aB en otro cromosoma. Esto no es lo mismo que lo anterior ojo.
Los dos son dihibrido, los dos son heterocigoto para los dos genes, pero que pasa con las gametas parentales y recombinantes, en el caso de la fase de acoplamiento las parentales los genes que están ligados van a ser más comunes o frecuentes y las recombinantes más escasas. Ocurre todo lo contrario en el caso de la repulsión.
*LIGAMIENTOS Y SUS CARACTERISTICAS
-La distancia entre los genes en un cromosoma se mide en centimorgan o en porcentaje de recombinación (1 cM = 1 %).
-Los genes deben estar ubicados a menos de 50 centimorgan para ser considerados como ligados.
-Si la distancia es mayor o igual a 50 centimorgan su comportamiento desde el punto de vista de la segregación es idéntico a los genes ubicados en diferentes cromosomas (independientes).
-El hecho de que los genes estén ligados provoca que se transmitan juntos con mayor frecuencia, por lo que se genera un cambio en las proporciones esperadas de un cruzamiento.
MAPAS CROMOSOMICOS: no va para la prueba
Dos mapas:
*mapas físicos: dicen cuántos pares de bases conforman cada gen dentro del cromosoma.
*mapas genéticos: dice en función a los grupos de ligamientos. Esto es porque ya sabemos que cuando la distancia entre dos genes es mayor hay mayor probabilidad de entrecruzamiento y habrá mayor cantidad de recombinancia. Conociendo esto se puede calcular la fracción de recombinación.
 21+33= 54, al ser 54 mayor que 50 implica que estos genes no se encuentran ligados.
12+34.2= 46.2, al ser menor de 50 se encuentran ligados (mas no estrechamente ligados), menos recombiantes que parentales.
Mapas cromosómicos
*Indican la relación entre el brazo corto y el largo, en función al centrómero.
*Ilustran los patrones de bandas específicos. Cada banda se numera para ayudar a indicar la ubicación de genes y en la descripción de reorganizaciones cromosómicas.
*Muestran las distancias calculadas entre los diferentes genes ubicados en el cromosoma.