Logo Studenta

SARS-CoV-2 variante p1 confirmado por laboratorio en Bogotá, marzo de 2021

¡Este material tiene más páginas!

Vista previa del material en texto

CASO DE SARS-CoV-2 variante p1 confirmado por laboratorio en Bogotá, marzo de 2021 
 
 
RESUMEN 
 
ANTECEDENTES: el SARS-CoV-2, posee múltiples variantes que corresponden a alteraciones 
puntuales a nivel de sus diferentes proteínas virales. Aunque la mayoría de las mutaciones no 
tiene ningún impacto, algunas pueden resultar en que el virus sea más transmisible, o facilitar 
que este escape de la respuesta inmune. El 10 de marzo la Dirección de Investigación del INS 
notificó al Grupo de Gestión del Riesgo y Respuesta Inmediata y Comunicación del Riesgo del 
INS un caso de SARS-CoV-2 positivo linaje P1, de un adulto mayor de 85 años sin aparente 
historial de desplazamiento fuera de la ciudad. 
 
MÉTODOS: estudio de brote en el que se utilizaron las siguientes definiciones de caso: para la 
Búsqueda Activa Institucional (BAI) “Persona con cuadro de infección respiratoria aguda 
procedente del exterior que consultara a la Fundación Cardioinfantil en Bogotá entre 1 de enero 
y el 27 de febrero de 2021; el diagnóstico CIE-10 utilizado fue U071, se revisaron todas las 
historias clínicas identificadas en las cuales se cumplía la definición de caso establecida. 
 
RESULTADOS: se identificaron 6 contactos familiares, tres de ellos positivos para COVID-19, 
dos de los contactos identificados requirieron manejo hospitalario y fueron dados de alta 
posteriormente con adecuada recuperación. Todos los contactos del caso índice se relacionan 
entre sí, no se identifican contactos sociales relacionados, todos negaron desplazamientos 
fuera de Bogotá o contacto con personas procedentes de Leticia u otras ciudades, negaron 
recibir visitas de personas externas a la familia. No se identificó aumento en la ocupación de 
camas de Unidades de Cuidado Intensivo (UCI) ni en hospitalización en sala general. se 
identificaron dos picos correspondientes al comportamiento general que se presentó en el 
distrito de Bogotá y el segundo pico se presentó desde diciembre de 2020 hasta finales de 
enero de 2021; en febrero no se observan comportamientos inusuales. 
 
CONCLUSIONES: Se confirmaron tres casos de COVID-19 en un conglomerado familiar, un 
adulto mayor con condición final muerto que corresponde al caso identificado con linaje P1; se 
considera fuente de infección desconocida, sin antecedente de viajes dentro o fuera del país; 
los indicadores de confirmación, positividad y tasa de mortalidad no presentan incrementos 
inusuales para la localidad de Usaquén o para el distrito capital. 
 
 
 
 
PALABRAS CLAVE: Infecciones por Coronavirus; Vigilancia en salud pública; Enfermedades 
transmisibles. 
 
INFORME FINAL 
 
1. Antecedentes 
 
La pandemia de COVID-19 (conocida popularmente como pandemia de coronavirus) es una 
pandemia derivada de la enfermedad ocasionada por el virus SARS-CoV-2. El primer caso fue 
identificado en diciembre de 2019 en la ciudad de Wuhan, capital de la provincia de Hubei, en la 
República Popular China, los primeros casos detectados tenían relación con trabajadores del 
Mercado mayorista de mariscos de Huanan (1). Posterior a esto la Organización Mundial de la 
Salud (OMS) reconoció el nuevo virus como una pandemia el 11 de marzo de 2020, momento 
en el cual se habían reportado 118 000 casos en 114 países y 4291 defunciones (2). 
 
El virus se transmite generalmente de persona a persona a través de las pequeñas gotas de 
saliva, conocidas como microgotas de Flügge, que se emiten al hablar, estornudar, toser o 
espirar. También está documentada la transmisión por aerosoles (< 5μm). Se difunde 
principalmente cuando las personas están en contacto cercano, pero también se puede difundir 
al tocar una superficie contaminada y luego llevar las manos contaminadas a la cara o las 
mucosas (3). El período de incubación suele ser de cinco días, pero puede variar de dos a 
catorce días. Los síntomas más comunes son fiebre, tos seca y dificultad para respirar y las 
complicaciones pueden incluir neumonía, síndrome respiratorio agudo o sepsis (4). 
 
La edad es un factor de riesgo (> 65 años) así como la presencia de enfermedades crónicas 
como la diabetes, cardiopatías, enfermedades respiratorias, hipertensión arterial o 
inmunodeficiencias tienen un riesgo mucho mayor de contraer la enfermedad y de llegar a tener 
complicaciones graves (5). 
 
Desde la caracterización genómica inicial del SARS-CoV-2, el virus ha evolucionado en 
diferentes grupos genéticos. La ocurrencia de mutaciones es un evento natural y esperado 
dentro del proceso de evolución del virus, algunas mutaciones específicas definen los grupos 
genéticos virales que circulan actualmente en todo el mundo (6). 
 
 
 
El SARS-CoV-2, posee múltiples variantes notables que corresponden a alteraciones puntuales 
a nivel de sus diferentes proteínas virales con aparente importancia particular. Las mutaciones o 
cambios en el ARN viral son detectables a través de la secuenciación genómica completa. 
 
Aunque la mayoría de las mutaciones no tiene ningún impacto, algunas pueden resultar en que 
el virus sea más transmisible, o facilitar que el virus se escape de la respuesta inmune, en la 
comunidad, cuanto más elevado es el nivel de transmisión, mayor es la probabilidad de que 
ocurran mutaciones en el virus. Cuando estas variantes tienen un potencial impacto o riesgo 
para la salud pública, se consideran variantes de preocupación (VOC, del inglés Variant of 
Concern) (7). 
 
A finales de enero o principios de febrero de 2020 apareció una variante del SARS-CoV-2 con 
una sustitución D614G en el gen que codifica su proteína S. En el transcurso de varios meses, 
acabó sustituyendo al virus inicial detectado en China y, en junio de 2020, se convirtió en la 
variante preponderante en todo el mundo. Los estudios realizados en células respiratorias 
humanas y en modelos animales han demostrado que, en comparación con el virus original, el 
que presenta la sustitución D614G es más infeccioso y transmisible, si bien causa síntomas de 
menor gravedad y no merma la eficacia de los medios de diagnóstico en laboratorio, los 
tratamientos, las vacunas o las medidas preventivas de salud pública existentes (8). 
 
El 9 de enero de 2021, Japón notificó a la OMS sobre una nueva variante del SARS-CoV-2, 
B.1.1.28 (inicialmente informada como B.1.1.248), detectada en cuatro viajeros procedentes de 
Brasil. Esta variante, no está relacionada de manera cercana a las variantes SARS-CoV-2 VOC 
202012/01 ni a la variante 501Y.V2. Tiene 17 mutaciones en la proteína Espícula, que incluyen 
tres mutaciones de interés en común con 501Y.V2, es decir, K417N / T, E484K y N501Y, que 
pueden afectar la transmisibilidad y respuesta inmune del huésped (9). 
 
Hasta el momento, algunos hallazgos indican una mayor transmisibilidad; sin embargo, este 
aspecto aún sigue en investigación. No se ha tenido evidencia de que la variante P.1 cause un 
cuadro de gravedad diferente. Sobre la base de investigaciones preliminares realizadas en 
Manaos, donde esta variante se detectó inicialmente, los investigadores han registrado un 
aumento en las hospitalizaciones en esta segunda oleada, lo que ha dado lugar a un colapso 
del sistema de salud en Manaos. Por consiguiente, es difícil determinar la causa de la elevada 
 
 
mortalidad, ya que podría deberse a la variante P.1, al colapso de los sistemas de salud o a 
ambos factores (10). 
 
Hasta el 9 de marzo de 2021, 31 países de la región de las Américas han notificado la detección 
de casos de las VOC. El 30 de enero, el Instituto Nacional de Salud (INS) informó que se 
detectó esta variante por primera vez en territorio nacional en una mujer, de 24 años con doble 
nacionalidad, atendida en un hospital de Leticia. Al siguiente día, la misma entidad dio a 
conocer otros dos casos de una mujer y un hombre, ambos de nacionalidad colombiana, con la 
variante brasileña P1 (11). 
 
El 10 de marzo la Dirección de Investigacióndel INS notificó al Grupo de Gestión del Riesgo y 
Respuesta Inmediata (GGRRI) del INS un caso de COVID-19 positivo, en el cual se identificó el 
linaje P1 de SARS-CoV-2, la muestra fue remitida por la Fundación Cardioinfantil (FCI) en 
Bogotá (FCI). Corresponde a un adulto de 85 años sin aparente historial de desplazamiento 
fuera de la ciudad. 
 
La Secretaría Distrital de Salud (SDS) de Bogotá se desplazó para realizar actividades de IEC 
el 11 de marzo de 2021; adicionalmente se hizo rastreo de las historias clínicas de los 
contactos identificados que asistieron a la FCI; sin embargo, al no identificarse claramente la 
fuente de infección, el viernes 12 de marzo se realizó mesa técnica para revisión del caso 
donde no se puede concluir con la información disponible por el equipo de Bogotá, que el caso 
corresponda a transmisión comunitaria, por tanto el sábado 13 de marzo desde el INS se 
solicitó nueva mesa técnica donde se decidió desplegar un ERI para acompañar a la SDS en 
las actividades adicionales en terreno. 
 
Los objetivos de la investigación fueron definir y caracterizar el caso, hacer seguimiento al 
caso, identificar contactos y posibles nuevos casos e identificar factores de riesgo. 
 
 
2. Métodos usados en terreno. 
 
Se realizó un estudio de brote utilizando la metodología propuesta por los Centros para el 
Control y la Prevención de Enfermedades / Centers for Disease Control and Prevention (CDC) 
siguiendo 13 pasos que permiten verificar la existencia del brote y realizar su caracterización y 
abordaje sistemático. 
 
 
 
Se utilizaron las siguientes definiciones de caso: para la Búsqueda Activa Institucional (BAI) 
“Persona con cuadro de infección respiratoria aguda procedente del exterior que consultara a la 
Fundación Cardioinfantil en Bogotá entre 1 de enero y el 27 de febrero de 2021; el diagnóstico 
CIE-10 utilizado fue U071, se revisaron todas las historias clínicas identificadas en las cuales se 
cumplía la definición de caso establecida. 
 
3. Aspectos éticos 
 
De acuerdo con la resolución N°8430 de 1993 del Ministerio de Salud y Protección Social (12), 
por la cual se establecen las normas científicas, técnicas y administrativas para la investigación 
en salud, se realizó una investigación sin riesgo y se emplearon técnicas y métodos de 
investigación documental, no se realizó ninguna intervención o modificación intencionada de las 
variables biológicas, fisiológicas, psicológicas o sociales de la población en estudio, por lo tanto, 
no se incurrió en ninguna falta bioética al ser humano y no se violó el derecho de privacidad. Se 
garantizó la reserva de la información obtenida en las historias clínicas, de acuerdo con la 
resolución 1995 de 1999 por la cual se establecen normas para el manejo de la historia clínica 
en Colombia (13). 
 
4. Resultados obtenidos en terreno 
 
Se realizó revisión de las historias clínicas correspondientes a la atención prestada al paciente, 
el resumen del caso se presenta a continuación (Ver tabla 1). 
 
Tabla 1. Resumen de caso de SARS-CoV-2 variante P1 confirmado por laboratorio en Bogotá, 
marzo de 2021 
 
Nombre JSPS 
Edad 85 años 
Sexo Masculino 
Fecha de inicio de 
síntomas 
17/01/2021 
Procedencia – 
residencia 
Bogotá 
Fecha de consulta y 
hospitalización 
27/01/2020 
Lugar de hospitalización Fundación Cardioinfantil (Bogotá) 
Fecha de defunción 28/01/2020 
 
 
Antecedentes clínicos 
Hipertensión arterial, EPOC, antecedente de accidente cerebro 
vascular, cáncer de próstata, Diabetes Mellitus tipo II 
insulinorequiriente. 
Síntomas presentados 
Fiebre, tos, dolor torácico, dificultad respiratoria, astenia, 
adinamia. 
Fecha de resultado PCR 28/01/2021 
Fecha remisión de la 
muestra al INS 
02/02/2021 
Fecha resultado 
vigilancia genómica 
10/03/2021 
Periodo probable de 
exposición 
03/01/2021 al 16/01/2021 
Periodo probable de 
transmisibilidad 
15/01/2021 al 24/01/2021 
Observaciones 
Paciente permanecía en el hogar en compañía de su esposa de 
80 años, sin desplazamientos, recibía visitas de los familiares 
más cercanos frecuentemente. 
Investigación de 
contactos 
Se identificaron 4 contactos estrechos (esposa y 3 hijos) 
No se reportan contactos estrechos en trabajadores de salud en 
la FCI todos manifiestan adecuada utilización de EPP durante 
todos los procedimientos. 
Fuente: Equipo de Respuesta Inmediata, INS, SDS 
 
Mediante la IEC se identificaron 4 contactos estrechos familiares, dos de ellos con resultado 
positivo para COVID-19, dos de los contactos identificados requirieron manejo hospitalario y 
fueron dados de alta posteriormente con adecuada recuperación (Ver tabla 2). 
 
Tabla 2. Contactos identificados caso de SARS-CoV-2 variante P1 confirmado por laboratorio 
en Bogotá, marzo de 2021 
 
Contacto Sexo Edad Ocupación 
Fecha de 
inicio de 
síntomas 
Fecha 
hospitalización 
Fecha de 
alta 
Resultado 
PCR 
Contacto 
1 
M 
57 
años 
Prestamista 15/01/2021 20/01/2021 02/02/2021 Positivo 
Contacto 
2 
F 
80 
años 
Hogar 23/01/2021 27/01/2021 05/02/2021 Positivo 
Contacto 
3 
F 
52 
años 
Vendedora Asintomático N/A N/A Negativo 
Contacto 
4 
M 
59 
años 
Prestamista SD N/A N/A N/A 
Fuente: Equipo de Respuesta Inmediata, INS, SDS 
 
Todos los contactos del caso índice se relacionan entre si dado que estuvieron en espacios 
familiares, y no se identifican contactos sociales relacionados en los periodos de tiempo de la 
 
 
infección; del caso confirmado de COVID-19 variante P1 negaron desplazamientos fuera de 
Bogotá o contacto con personas procedentes de Leticia u otras ciudades, negaron recibir visitas 
de personas externas a la familia. Esta información fue validada con los diferentes contactos 
entrevistados. Adicionalmente, se refiere que desde el 5 de enero la localidad de residencia 
entró en cuarentena. Adicionalmente, los contactos 1 y 4 presentaban baja adherencia a las 
medidas de cuidado y protección personal como uso de tapabocas. 
 
Se estableció comunicación con el contacto 3 quien refirió ser cuidadora de sus padres, informa 
que los adultos mayores no salieron de su vivienda los 14 días anteriores a la fecha de inicio de 
síntomas, el 27/01/2021 consultaron al hospital y obtuvieron las muestras por presentar 
expectoración y fiebre 3 días antes. 
 
Manifiestan también que 3 personas llegaban a visitarlos frecuentemente (dos hijos y un yerno) 
uno de los hijos el contacto 1, refieren que el señor vive con sus dos hijos que trabajan en 
teletrabajo con una entidad bancaria de la ciudad, niegan haber salido de Bogotá, manifiesta 
que no han tenido contacto con caso positivo o sintomático respiratorio refiere que su padre se 
moviliza en transporte público para realizar su actividad laboral. 
 
En la línea de tiempo se establece como posible fuente de infección el contacto 1 quien visitó a 
los adultos mayores el día que inició los síntomas; el contacto 1 frecuentaba a sus padres era el 
encargado de asistirlos en las diferentes necesidades como compras medicamentos o citas que 
tuviesen que realizar, al igual que sus hijos (Ver figura 1). 
 
Figura 1. Línea de tiempo caso de SARS-CoV-2 variante P1 confirmado por laboratorio en 
Bogotá, marzo de 2021 
 
Incubacion 
FIS
Visita a los adultos mayores Visita a los adultos mayores Consulta
Fecha de alta
Defunción
Contacto 1 (APP)
Contacto 2 (CEP)
CASO 1 Linaje P1
24 25 26 27 28 29 30 31 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 1 2 3 4 5 6 7 8
Diciembre - 2020
Caso confirmado de Linaje P1 de SARS-CoV-2
Enero - 2021 Febrero - 2021
 
Fuente: Equipo de Respuesta Inmediata, SDS, INS 
 
 
Se realizó investigación epidemiológica en el domicilio del contacto 1 con los siguientes 
hallazgos: 
 
 
 
Reuniones familiares el 24 y 31 de diciembre en casa de sus padres; para el 24 asistieron 12 
personas, para el 31 asistieron 9 personas. El contacto 1reside en su casa con dos hijos 
(contacto 5 y contacto 6); oficios laborales con alto contacto de personas; los primeros 15 días 
de enero estuvo en su casa en confinamiento obligatorio; refiere solo la salida el día que 
reclamó los medicamentos de sus padres en un dispensario de medicamentos y posterior visita 
a casa de sus padres (día de inicio de síntomas). 
 
Refirió no tener contacto con otras personas diferentes a sus hijos, dos semanas antes de inicio 
de síntomas. El mismo día de la toma de muestra y diagnóstico, se realizaron las muestras de 
sus dos hijos; contacto 5 negativo y contacto 6 positivo; el contacto 6 trabaja de manera 
presencial en una entidad bancaria de la ciudad, fue asintomático y se aisló en su casa durante 
14 días (Ver tabla 3). 
 
Tabla 3. Resumen contacto 1 de caso de SARS-CoV-2 variante P1 confirmado por laboratorio 
en Bogotá, marzo de 2021 
 
Nombre APP 
Edad 57 años 
Sexo Masculino 
Fecha de inicio de 
síntomas 
15/01/2021 
Procedencia – 
residencia 
Bogotá 
Fecha de consulta y 
hospitalización 
20/01/2020 
Lugar de hospitalización Fundación Cardioinfantil (Bogotá) 
Antecedentes clínicos HTA, DM II insulinorequiriente 
Síntomas presentados 
Fiebre, tos, dolor torácico, dificultad respiratoria, astenia, 
adinamia, mialgias, artralgias, saturación de oxígeno en 75% al 
ambiente, escalofrío, rinorrea hialina y disnea 
Fecha de resultado PCR 21/01/2020 
Fecha remisión de la 
muestra al INS 
Será enviada el 15/03/2021 
Periodo probable de 
exposición 
01/01/2021 al 14/01/2021 
Periodo probable de 
transmisibilidad 
13/01/2021 al 22/01/2021 
Investigación de 
contactos 
Se identificaron 2 contactos estrechos (2 hijos) 
No se reportan contactos estrechos en trabajadores de salud en 
la FCI todos manifiestan adecuada utilización de EPP durante 
todos los procedimientos. 
Fuente: Equipo de Respuesta Inmediata, SDS, INS 
 
 
 
 
Mediante al IEC se identificaron 2 contactos estrechos familiares, uno de ellos con resultado 
positivo para COVID-19, ninguno de los contactos identificados requirió manejo con adecuada 
recuperación (Ver tabla 4). 
 
 
Tabla 4. Contactos identificados caso de SARS-CoV-2 variante P1 confirmado por laboratorio 
en Bogotá, marzo de 2021 
 
Contacto Sexo Edad Ocupación 
Fecha de 
inicio de 
síntomas 
Fecha 
hospitalización 
Fecha 
de 
alta 
Resultado 
PCR 
Contacto 
5 
M 
28 
años 
Banco 
(teletrabajo) 
N/A N/A N/A Negativo 
Contacto 
6 
M 
29 
años 
Banco Asintomático N/A N/A Positivo 
 
Fuente: Equipo de Respuesta Inmediata, SDS, INS 
 
 
Se indaga al contacto 5 y refiere que no haber presentado síntomas asociados a COVID-19, su 
ocupación es empleado en teletrabajo de una entidad bancaria de la ciudad. Se tomó muestra 
el día 20/01/2021 y el resultado se lo informaron el día 21/01/2021 como negativo, refiere que 
no ha viajado a ningún lugar ni el hermano ni el padre, no han tenido contacto con alguien de 
esta procedencia, no han viajado a ningún destino desde que inició la pandemia. No han tenido 
contacto con alguna persona procedente de ese lugar en los últimos 14 días. 
 
Se logra comunicación con el contacto 6 quien refiere que no presentó síntomas, refiere que el 
04/01/2021 fue la última vez que visitó a su abuelo Caso confirmado P1. Se indaga si en su 
trabajo tuvo contacto con algún caso positivo o sintomático respiratorio, refiere que en su 
trabajo en la entidad bancaria no se han presentado casos positivos cercanos a él, niega 
antecedente de viaje. 
 
 
Actividades de IEC en la FCI 
 
 
 
Se realizó investigación epidemiológica de campo en la Fundación Cardioinfantil el 13/03/2021, 
en el laboratorio de genómica se identificó la obtención, ingreso y procesamiento de las 
muestras encontrando lo siguiente: 
 
• La muestra del adulto de 85 años confirmado para COVID-19 variante P1 fue procesada 
el 28/01/2021 a la 1:00pm, posterior al montaje y procesamiento las muestras fueron 
guardadas en congelación a -70°C. 
• Se realizó búsqueda de la muestra del contacto 1 encontrando muestra viable en el 
laboratorio con un CT menor a 25, se da la indicación de realizar envío de la muestra al 
INS el lunes 15/03/2021 para realizar el experimento de secuenciación. 
• Adicionalmente se solicitó buscar muestra del contacto 6 sin embargo la muestra 
identificada presenta CT mayor al 37 y para el procesamiento tuvo que ser concentrada 
por tal razón no se cuenta con muestra para procesamiento en genómica. 
 
Se realizó revisión de las consultas de ingresos hospitalarios por todas las causas encontrando 
solamente tres pacientes procedentes del exterior: dos de Argentina y uno de Chile, todos 
ingresados a la FCI en marzo del 2021 (ninguno con diagnóstico de infección respiratoria). Se 
verificó con el área de infecciones de la institución evidenciando que no se han presentado 
brotes institucionales en el 2021. El último brote reportado fue en noviembre de 2020 en el área 
de urgencias. 
 
No se identificó aumento en la ocupación de camas de Unidades de Cuidado Intensivo (UCI) ni 
en hospitalización en sala general, se verificó con epidemiología el comportamiento de los 
casos en trabajadores de la salud, no se han presentado comportamientos inusuales, se 
identificaron dos picos correspondientes al comportamiento general que se presentó en el 
distrito de Bogotá y el segundo pico se presentó desde diciembre de 2020 hasta finales de 
enero de 2021; en febrero no se observan comportamientos inusuales (Ver figura 2). 
 
 
 
 
 
Figura 2. Comportamiento de la notificación de casos probables y confirmados de COVID-19, Fundación 
Cardioinfantil, 2020 a semana 10 de 2021 
Fuente: Registro diario casos probables COVID-19, Fundación Cardioinfantil 
 
Se indagó sobre el manejo de los pacientes y la ruta de atención COVID. Se informó que los 
pacientes ingresaron todos por la ruta COVID al presentar al menos un síntoma y fueron 
atendidos por profesionales de la salud con bata, visor y respirador N95 por lo tanto no se 
consideran contactos estrechos. 
 
Se realizó verificación del comportamiento de los indicadores de incidencia, positividad, 
mortalidad y letalidad en el distrito de Bogotá encontrando disminución tanto en los indicadores 
de vigilancia como de laboratorio durante febrero; para este mes todos los indicadores se 
ubican bajo la zona de alerta (Ver figura 3). 
 
Figura 3. Gráfico de control de los indicadores de positividad, incidencia, mortalidad y letalidad, distrito de 
Bogotá, 2020 a semana 10 de 2021 
 
 
Fuente: Base reporte diario nacional, Base SISMUESTRAS nacional 
 
 
 
Adicionalmente se realiza verificación del comportamiento de los indicadores en la Localidad de 
Usaquén teniendo en cuenta que el caso índice y sus contactos viven en esta localidad; de 
acuerdo con la curva de incidencia de los casos con corte al 13 de marzo de 2021 se observa 
un comportamiento de la localidad similar a la presentada para el distrito con una disminución 
para el número de casos (Ver figura 4). 
 
Figura 4. Incidencia casos COVID-19 confirmados, localidad Usaquén, Bogotá, 2020 a semana 
10 de 2021 
 
Fuente: Base casos positivos SDS 
 
En cuanto al comportamiento del número efectivo de reproducción se encuentra que es similar 
al distrital, observando por el contrario una tendencia a la disminución de casos (Ver figura 5). 
 
Figura 5. Número efectivo de Reproducción COVID-19 por localidad, Bogotá, 2020 a semana 10 
de 2021 
 
 
Fuente: Modelos proyectados SDS 
 
 
 
En este sentido no se evidencian cambios ni a la localidad ni a nivel distrital que generen una 
alerta respecto a un comportamiento diferente de los casos en Bogotá. 
 
5. Discusión 
 
Hasta finales de 2020, no se conocían mutaciones asociadas a una evolución más grave de la 
COVID-19 o, al menos, a una modificación del comportamiento epidemiológico de este virus; 
situación que cambió en el 2021.La investigación realizada sobre el SARS-CoV-2, ha dejado en 
evidencia el amplio surgimiento de variantes que parecen transmitirse de forma más eficiente 
(14); es por esta razón que la detección de un caso de SARS-CoV-2 variante P1 en el distrito de 
Bogotá requirió un análisis epidemiológico exhaustivo. Para febrero de 2021 el Instituto 
Nacional de Salud ya había identificado 13 casos con esta variante 2 de ellos en Bogotá con 
antecedente de viaje a Amazonas (15). 
 
En este caso no fue posible la identificación de la fuente de infección; sin embargo, la hipótesis 
plantea que el contacto 6 pudo haber sido el caso primario en este conglomerado; situación que 
podría sustentarse en que las personas jóvenes y de mediana edad suelen ser menos 
propensas a tomar medidas preventivas y precauciones significativas, debido al menor riesgo 
que ellos mismos perciben de desarrollar COVID-19 grave, lo que aumenta su probabilidad de 
exposición e infección (16). 
 
Si bien se dispone de datos clínicos limitados sobre la variante P.1, los datos sobre variantes 
que portan algunas de las mismas mutaciones, como B.1.1.7, se asocian con un aumento de la 
mortalidad; sin embargo, para todas las infecciones respiratorias incluyendo el SARS-CoV-2 la 
edad es un factor de riesgo (> 65 años) así como la presencia de enfermedades crónicas como 
la diabetes, cardiopatías, enfermedades respiratorias, hipertensión arterial o inmunodeficiencias 
tienen un riesgo mucho mayor de contraer la enfermedad y de llegar a tener complicaciones 
graves (17) como lo observado en el caso estudiado. 
 
La variante P1, como otras ya descritas, aumenta la velocidad de transmisión (Rt), provocando 
que la epidemia tenga una tasa de propagación más rápida, llegando a más personas en un 
período más corto; sin embargo, el análisis realizado tanto al Rt y a las diferentes curvas 
epidémicas del distrito de Bogotá no mostraron incrementos significativos en el número 
reproductivo de casos, situación diferente a la reportada en el estado de Manaos en Brasil 
 
 
donde se produjo un aumento brusco del número de ingresos hospitalarios por COVID-19, lo 
que provocó un colapso del sistema de salud local (18). 
 
Si la estrategia PRASS funcionara y el seguimiento de cada caso se realizará adecuadamente 
habría sido posible el establecimiento de la fuente de infección; sin embargo, toda la 
información tuvo que ser reconstruida con más de 15 días de diferencia lo que pudo generar 
sesgos de memoria en los contactos. Países como Japón han implementado estrategias de 
control destinadas a identificar conglomerados mediante el monitoreo de la actividad de los 
casos de manera retrospectiva (rastreo de contactos retrospectivo) lo que podría llevar a 
suprimir la transmisión de COVID -19 (19). 
 
Finalmente la contribución en la transmisión generalizada de este virus en la comunidad, puede 
darse principalmente por la formación de conglomerados, dadas las condiciones de los sitios; 
una porción muy baja de casos en sitios cerrados puede ser responsable de mayor transmisión, 
en comparación con la transmisión de casos individuales en sitios abiertos debido al contacto 
cercano con dicho caso individual, de tal manera que estrategias como el rastreo de contactos 
no solo deben orientarse en una dirección prospectiva sobre el caso identificado, sino que 
también debe haber una entrevista retrospectiva respecto a la relación de dicho caso con 
escenarios frecuentes, especialmente lugares cerrados con ventilación deficiente y/o irregular, 
de mayor importancia que el mismo número de casos confirmados en esos escenarios. 
 
6. Conclusiones 
 
Se confirmaron tres casos de Covid-19 en un conglomerado familiar, un adulto mayor con 
condición final muerto que corresponde al caso identificado con linaje P1; se considera fuente 
de infección desconocida, sin antecedente de viajes dentro o fuera del país; los indicadores de 
confirmación, positividad y tasa de mortalidad no presentan incrementos inusuales para la 
localidad de Usaquén o para el distrito capital. 
 
La vigilancia genómica complementa la vigilancia epidemiológica, por lo que los cambios en el 
comportamiento del virus deben ser analizados teniendo en cuenta estas dos vigilancias. 
 
 
 
 
 
 
7. Recomendaciones 
 
Es importante hacer énfasis en que la alta interacción social sin protección facilita la mutación 
del virus y la aparición de todas sus variantes; por lo que es inevitable que los virus muten, lo 
que debemos lograr es una menor transmisión y esto solo se consigue con las medidas 
individuales y la reducción del contacto social. 
 
Para reducir la transmisión es importante fortalecer los mecanismos de control de 
enfermedades establecidos y probados, como los descritos en el Plan Estratégico de 
Preparación y Respuesta COVID-19, la evidencia ha indicado que la implementación de las 
medidas de prevención y control de infecciones en los establecimientos de salud ha sido eficaz 
en reducir la incidencia de casos de COVID-19, lo que ha llevado a una reducción de las 
hospitalizaciones y muertes entre los pacientes. 
 
Dentro de las medidas más costo efectivas se encuentra el uso de tapabocas, lavado de 
manos, aislamiento de todos los casos y la vacunación. 
 
Adicionalmente es importante fortalecer la vigilancia epidemiologia y genómica mediante un 
enfoque sistemático para proporcionar una representatividad del alcance de la transmisión de 
las variantes del SARS-CoV-2 según el contexto local y así detectar eventos o comportamientos 
inusuales. 
 
8. Agradecimientos. 
 
Agradecemos a la Secretaría de Salud del Distrito de Bogotá, quienes nos acompañaron y 
apoyaron durante toda la investigación; al programa de entrenamiento de epidemiologia de 
campo de INS y sobre todo a mis tutores por el apoyo y dedicación. 
 
9. Nota editorial 
 
En el mundo hay circulando 1.500 linajes del virus SARS-CoV-2 y en Colombia se han 
identificado alrededor de 58 variantes y dentro de estas, dos variantes de preocupación como 
son la variante brasileña y la británica. Además de los linajes de interés mundial, en el país se 
han identificado linajes tradicionales. El más común es el B.1.111 y todavía sigue siendo el más 
 
 
frecuente en Colombia. Con el paso del tiempo, estos linajes que son más transmisibles irán 
predominando en el país. 
 
Lo que hace especial estas variantes de preocupación como la P1, es que tienen mayor 
capacidad de transmisión; son más eficientes porque se requiere menor tiempo de contacto y 
menos inóculo o menos góticas de persona a persona. Por lo tanto, es el momento de reforzar 
las medidas de protección y responsabilidad individual. 
 
10. Bibliografía 
 
1 Organización Mundial de la Salud (OMS). Nuevo Coronavirus en China. 12 de enero de 2020. [Internet]. 
[citado 17 de mayo de 2021]. Disponible en: https://www.who.int/csr/don/12-january-2020-novel-
coronavirus-china/es/ 
 
 
2 Organización Mundial de la Salud (OMS). Alocución de apertura del Director General de la OMS en la 
rueda de prensa sobre la COVID-19 celebrada el 11 de marzo de 2020. [Internet]. [citado 17 de mayo de 
2021]. Disponible en: https://www.who.int/es/director-general/speeches/detail/who-director-general-s-
opening-remarks-at-the-media-briefing-on-covid-19---11-march-2020 
 
 
3 Centers for Disease Control and Prevention. Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) - Transmission. 17 
de marzo de 2020. [Internet]. [citado 17 de mayo de 2021]. Disponible en: 
https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/prevent-getting-sick/how-covid-
spreads.html?CDC_AA_refVal=https%3A%2F%2Fwww.cdc.gov%2Fcoronavirus%2F2019-
ncov%2Fprepare%2Ftransmission.html 
 
 
4 Rothan HA, Byrareddy SN. The epidemiology and pathogenesis of coronavirus disease (COVID-19) 
outbreak. J Autoimmun. 2020 May;109:102433. doi: 10.1016/j.jaut.2020.102433. Epub 2020 Feb 26. 
PMID: 32113704; PMCID: PMC7127067. 
 
5 Organización Mundialde la Salud (OMS). Q&A on coronaviruses. World Health Organization. [Internet]. 
[citado 17 de mayo de 2021]. Disponible en: https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-
coronavirus-2019/question-and-answers-hub/q-a-detail/coronavirus-disease-covid-19. 
6 Centers for Disease Control and Prevention. Acerca de las variantes del virus que causa el COVID-19. 
2 de abril de 2020. [Internet]. [citado 17 de mayo de 2021]. Disponible en: 
https://espanol.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/transmission/variant.html 
 
7 Organización Panamericana de la Salud (OPS) Red Regional de Vigilancia Genómica de COVID-19. 
[Internet]. [citado 17 de mayo de 2021]. Disponible en: https://www.paho.org/es/temas/influenza/red-
regional-vigilancia-genomica-covid-19 
 
 
8 Organización Mundial de la Salud (OMS). Variantes del SARS-CoV-2. [Internet]. [citado 17 de mayo de 
2021]. Disponible en: https://www.who.int/csr/don/31-december-2020-sars-cov2-variants/es/ 
 
 
9 Organización Panamericana de la Salud (OPS). Actualización Epidemiológica: Enfermedad por 
coronavirus (COVID-19) (11 de marzo de 2021). [Internet]. [citado 17 de mayo de 2021]. Disponible en: 
https://iris.paho.org/handle/10665.2/53381 
https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/prevent-getting-sick/how-covid-spreads.html?CDC_AA_refVal=https%3A%2F%2Fwww.cdc.gov%2Fcoronavirus%2F2019-ncov%2Fprepare%2Ftransmission.html
https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/prevent-getting-sick/how-covid-spreads.html?CDC_AA_refVal=https%3A%2F%2Fwww.cdc.gov%2Fcoronavirus%2F2019-ncov%2Fprepare%2Ftransmission.html
https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/prevent-getting-sick/how-covid-spreads.html?CDC_AA_refVal=https%3A%2F%2Fwww.cdc.gov%2Fcoronavirus%2F2019-ncov%2Fprepare%2Ftransmission.html
https://espanol.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/transmission/variant.html
 
 
 
 
 
10 Faria NR, Mellan TA, Whittaker C, Claro IM, Candido DDS, Mishra S, et al. Genomics and 
epidemiology of the P.1 SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil. Science. 2021 Apr 14:eabh2644. doi: 
10.1126/science.abh2644. Epub ahead of print. PMID: 33853970. 
 
11 Instituto Nacional de Salud. Nota de prensa INS Detecta Variante Brasileña en Ciudadana de ese país, 
atendida en Leticia. Internet]. [citado 21 de abril de 2021]. Disponible en: 
https://www.ins.gov.co/Noticias/Paginas/INS-Detecta-Variante-Brasile%C3%B1a-en-Ciudadana-de-ese-
pa%C3%ADs,-atendida-en-Leticia.aspx 
 
 
12 Ministerio de Salud y Protección Social. Resolución número 8430 de 1993 [Internet]. [citado 21 de abril 
de 2021]. Disponible en: 
https://www.minsalud.gov.co/sites/rid/Lists/BibliotecaDigital/RIDE/DE/DIJ/RESOLUCION-8430-DE-
1993.PDF 
 
13 Ministerio de Salud y Protección Social. Resolución 1995 de 1999 [Internet]. [citado 21 de abril de 
2021]. Disponible en: 
https://www.minsalud.gov.co/Normatividad_Nuevo/RESOLUCI%C3%93N%201995%20DE%201999.pdf 
 
14 Pujol FH, Esparza J. COVID-19: VIRUS, VARIANTES Y VACUNAS COVID-19: VIRUS, VARIANTS 
AND VACCINES. 
 
15 Instituto Nacional de Salud. Reporte COVID-19 en Colombia. Internet]. [citado 21 de abril de 2021]. 
Disponible en: https://www.ins.gov.co/Noticias/Paginas/Coronavirus.aspx 
 
16 De Oliveira MH, Lippi G, Henry BM. Sudden rise in COVID-19 case fatality among young and middle-
aged adults in the south of Brazil after identification of the novel B. 1.1. 28.1 (P. 1) SARS-CoV-2 strain: 
analysis of data from the state of Parana. medRxiv. 2021 Jan 1. 
 
17 Organización Mundial de la Salud (OMS). Q&A on coronaviruses. World Health Organization. 
[Internet]. [citado 17 de mayo de 2021]. Disponible en: https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-
coronavirus-2019/question-and-answers-hub/q-a-detail/coronavirus-disease-covid-19. 
 
18 Freitas AR, Beckedorff OA, Cavalcanti LP, Siqueira AM, Castro DB, Costa CF, Lemos DR, Barros EN. 
The emergence of novel SARS-CoV-2 variant P. 1 in Amazonas (Brazil) was temporally associated with a 
change in the age and gender profile of COVID-19 mortality. Available at SSRN 3804788. 2021 Apr 14. 
 
19 Oshitani, H., The Expert Members of The National COVID-19 Cluster Taskforce at The Ministry of 
Health Japan, L. and W., 2020. Enfoque basado en conglomerados para la respuesta a la enfermedad 
por coronavirus 2019 (COVID-19) en Japón, de febrero a abril de 2020. Japanese Journal of Infectious 
Diseases 73, 491–493. https://doi.org/10.7883/yoken.JJID.2020.363 
https://www.ins.gov.co/Noticias/Paginas/Coronavirus.aspx
https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/question-and-answers-hub/q-a-detail/coronavirus-disease-covid-19
https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/question-and-answers-hub/q-a-detail/coronavirus-disease-covid-19

Continuar navegando

Materiales relacionados

12 pag.
REC 1016 - Verónica Bernal

User badge image

Desafío COL y ARG Veintitrés

12 pag.
REC 1010 - Verónica Bernal

User badge image

Desafío COL y ARG Veintitrés

40 pag.