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•Genes y evolución. Regulación genética y evolución.. Interruptores genético. Evolución de los interruptores . PseudogenesVariabilidad hereditaria. Mutaciones génicas. Tasas de mutación. Carácter de la mutación. Mutaciones silenciosas. Revisión e introducción de conceptos biológicos- genéticos en el marco del pensamiento evolutivo Herencia es la transmisión de rasgos de los padres a la descendencia, información codificada en forma de unidades hereditarias denominadas unidades discretas de información hereditaria secuencias de nucleótidos específicas en el DNA (o en el RNA, en algunos virus) GENES Unidad funcional básica de la herencia (responsable por la expresión de un rasgo en particular) Versiones alternativas de un gen que produce efectos fenotípicos característicos y diferentes. ALELOS Las decenas de miles de genes que heredamos de nuestros padres constituyen nuestro GENOMA. Es la totalidad de la información genética depositada en las moléculas de ADN. En animales y plantas, las células reproductoras llamadas ……… son los vehículos que trasmiten genes de una generación a la siguiente La fecundación produce un nuevo individuo con una composición genética única. Variación GENOMA GENOTIPO: conjunto de alelos de un organismo Es una característica fija del organismo; permanece constante a lo largo de la vida del animal y no es modificado por el medio ambiente. FENOTIPO: rasgos físicos y psicológicos de un organis. (determinados por su constitución genética) Es lo que puede ser observado o medido. Para todos los organismos vivos actualmente conocidos, el material genético consiste casi exclusivamente en ADN, con la excepción de algunos virus y priones (formas infecciosas de proteínas normales). TIPOS DE GENOMAS Genomas nucleares eucariontes Genomas procariontes y de orgánulos Genomas virales Replicación • El genoma completo, tanto en las células procarióticas, como eucarióticas, debe ser replicado con precisión una vez en cada ciclo celular. 1. Los cromosomas circulares de células procarióticas tienen por lo general un solo origen de replicación (1 sólo replicón). 2. Los cromosomas lineares de células eucarióticas deben tener muchos orígenes de replicación separados. 3. La replicación es bidireccional 4. Es semiconservadora . CONSIDERACIONES Nivel de empaquetamiento D os ca denas a ntipa rrale las El material genético se compacta en en la célula formando los cromosomas BASES MOLECULARES DE LA HERENCIA El apareamiento de bases complementarias garantiza que las 2 moléculas hijas sean copias exactas de las moléculas parentales. Se separan y cada una de las cadenas sirve de molde. El ADN es un material genético mejor que el RNA para almacenar información genética La desoxirribosa del DNA es el producto de una molécula mucho menos susceptible a la rotura. Las ADN polimerasas catalizan la unión fosfodiéster entre el grupo OH en el C3`del azúcar de un nucleótido y el grupo fosfato en el C5 del nucleótido recién llegado. ADN polímero lineal con nucleótidos. Formada por dos cadenas de AcNuc con giro a la derecha (componen la doble hélice) Dos cadenas antiparalelas Tiene un hidroxilo en el carbono 2 del azúcar (ribosa): es un agente para la catálisis del enlace fosfodiéster 3′-5′ adyacente que une los nucleótidos del RNA. Su ausencia en el DNA (desoxirribosa) elimina este mecanismo de rotura de la cadena. DNA ADN ARN desoxirribosa El uso de T en el DNA en lugar de U, como en el RNA, supone una protección contra el efecto de la desaminación, una forma común de daño genético. El trabajo de la célula de reconocer las bases dañadas es mucho más sencillo cuando el daño produce una base anormal. La estructura en doble hélice del DNA aporta dos cadenas complementarias, esto permite que se reparar correctamente el daño producido (x que utiliza como referencia la secuencia de la otra. la desaminación de la C producen uracilo. El uso de T permite que cualquier desaminación de C sea detectada inmediatamente. La deaminación de la citosina genera una base natural que el sistema de reparación no podría reconocer con facilidad. El trabajo de la célula de reconocer las bases dañadas es mucho más sencillo cuando el daño produce una base anormal. El uso de T en el DNA en lugar de U, como en el RNA, supone una protección contra el efecto de la desaminación, una forma común de daño genético La aparente conservación de los genes de las histonas durante la evolución reflejaría el papel crucial de estas proteínas en la organización del DNA dentro de las células 8 móleculas de histonas De diámetro (interfase) Dominios en bucles Profase Plegamiento de la profase Se enrolle o pliega Fibra de 10 nm de diámetro nucleosoma : segmento de ADN alrededor de un núcleo proteico:histonas H1, (H2A, H2B, H3, H4) y la no histonas H1 La asociación entre el DNA y las histonas en los nucleosomas permanece intacta a lo largo de todo el ciclo celular. Lo abandonan en la replicación y No en la transcripción Forma de fibra de cromatina metafase Unidad básica de empaquetamiento del ADN Cada cromosoma está formado por una larguísima molécula de ADN asociada a diversas proteínas (histonas y no histonas). Los aa- Cola(extrem./N- terminal)Accesibles a modf químicas Unidad de empaqueta miento Durante la mitosis y meiosis la cromatina se condensa hasta formar estructuras discretas Cromatina Cromosoma con compactación máxima (metafase) Dominios en bucle: se enrollan y se pliegan a sí mismos 700nm adheridos a un armazón cromosómico formado por proteínas No histonas No se transcribe ADN se enrolla sobre sí mismo y varia de acuerdo con el momento del ciclo en que se halla la célula. Bucles de profase • Las histonas desempeñan un papel fundamental en el enrollamiento de la cromatina • Proteínas con alta proporción de lisina y arginina(aa carg+), es decir, de aa cargados positivamente • Esto contribuye a la unión de las histonas con las moléculas de ADN (grupos fosfato dan negatividad) HISTONAS Los cromosomas poseen secuencias de ADN únicas y secuencias de ADN repetidas Por una parte el ADN se halla representado por secuencias singulares (copias únicas) de nucleótidos y/o secuencias pocas veces repetidas (En este sector del ADN se encuentran los genes (13%) El % restante del ADN se halla representado por secuencias de nucleótidos altamente repetidas. Sus funciones se desconocen MOLÉCULA PARENTAL CADA UNA ACTÚA COMO MOLDE AL SEPARARSE Mecanismo de replicación del ADN es SEMICONSERVADOR LA REPLICACIÓN DEL ADN ES UN PROCESO BIDIRECCIONAL El apareamiento de bases complementarias garantiza que las 2 moléculas hijas sean copias exactas de las moléculas parentales. La transmisión de los rasgos hereditarios tiene su base molecular en la replicación exacta del DNA, (dos moléculas de ADN idénticas a la del ADN originario ) produce copias de genes que pueden transmitirse desde los padres a la descendencia. Garantiza copias exactas, al separarse cada una sirve de molde El ADN no se sintetiza globalmente sino a partir de múltiples sectores a lo largo de su molécula Cada unidad abarca al ADN comprendido entre los puntos de origen y de llegada del lazo a su base El apareamiento de bases complementarias garantiza que las 2 moléculas hijas sean copias exactas de las moléculas parentales. Se separan las cadenas y cada una sirve de molde. G1 G2 S C—Citocinesis M—Mitosis Interfase C M G2 S G1 Metafase Profase Anafase Telofase Prometafase C IC L O C E L U L A R ADN se enrolla sobre sí mismo y varia de acuerdo con el momento del ciclo en que se halla la célula. El ADN, antes que las células somáticas se dividan los genes se replican Ciclo de condensación- descondensación de los cromosomasLos lazos de 30nm representan unidades de replicación del ADN El collar de nucleosomas se enrolla sobre sí mismo para formar una fibra de cromatina ( Estructura solenoide) La cromatina se compacta más y la fibra de 300 nm forma en bucle- Profase Compactación máxima de la cromatina ADN se enrolla (nucleosomas) ( condensan), unidad básica de enrollamiento cromatínico interfasefibra Niveles de empaquetamiento de la cromatina 361 Replicación • Las células efectúan y regulan actos individuales de replicación con una unidad de DNA llamada el replicón (secuencia única de nucleótidos). Cada replicón tiene un origen y una terminación. El Genoma Bacteriano y su replicación El cromosoma bacteriano, es una molécula de ADN circular con pocas proteínas asociadas. Los plásmidos son moléculas circulares de DNA más pequeñas que se pueden replicar de forma independiente del cromosoma. Las célula bacterianas se dividen por fisión binaria, que está precedida por la replicación del cromosoma bacteriano Origin of Replication (único) Horquilla de replicación, progresa en ambas direcciones alrededor del cromosoma circular Termination of replication Replicación del cromosoma bacteriano La cadena hija en su totalidad (en gral), la mitad se sintetiza en forma continua (hebra adelantada) y la otra mitad (en el lado opuesto al origen) se sintetiza en fragmentos. Cromosoma circular continuo cerrado y asociado a pocas proteínas 108 bac. en 12hs Fisión binaria (asexual) Burbuja de rep. Las bacterias se diferencian de los eucariotas en los mecanismos utilizados para unir el DNA de dos individuos en un célula. En los eucariotas, los procesos sexuales de la meiosis y de la fertilización combinan el ADN de dos individuos en un solo cigoto La meiosis y la fecundación no se producen en los Procariontes Tres procesos reúnen el DNA bacteriano de individuos diferentes: – Transformación – Transducción – Conjugación EL PROCESO DE LA TRANSFORMACIÓN ES LA ALTERACIÓN DEL GENOTIPO Y FENOTIPO DE UNA CÉLULA BACTERIANA POR LA CAPTACIÓN DE ADN EXTRAÑO Y DESNUDO DEL AMBIENTE CIRCUNDANTE Mecanismos de transferencia de genes y recombinación genética en las bacterias Transposición de elementos genéticos • Segmentos de ADN que pueden insertarse en sitios múltiples en el DNA de una célula (contribuyen a la recombinación genética) Elementos transponibles, no existen nunca en forma independiente. La rapidez de la reproducción, la mutación y la recombinación genética contribuyen a la diversidad genética de las bacterias. VARIACION Parece evolut……que los genomas bacterianos se hubieran reducido a lo esencial: la mayoría de las secuencias de DNA codifica proteínas, una pequeña cantidad se dedica a la regulación de la expresión génica y quedan algunas secuencias no funcionales. En el genoma humano por el contrario únicamente codifican proteína alrededor del 1,5% de las secuencias de DNA, el resto aparentemente sin función. ADN – Replicación – Recombinación – Recombinación transposicional • Está mediada por vectores llamados elementos transponibles o transposones. • Los transposones son secuencias de DNA que se pueden mover de una localización genética a otra Recombinación génica Recombinación gamética Recombinación cromosómica FLUJO DE INFORMACIÓN GENÉTICA El ADN dirige su propia replicación y la transcripción a ARN, el cual a su vez dirige su traducción a proteínas Replicación ADN ARN transcripción traducciòn Proteína FLUJO DE INFORMACIÓN GENÉTICA El genoma es un depósito de información biológica, pero por sí mismo es incapaz de liberar esa información a la célula La información biológica contenida en el genoma requiere la actividad coordinada de enzimas y otras proteínas, que participan en una compleja serie de reacciones bioquímicas Expresión del Genoma GENOMA TRANSCRIPTOMA copias RNA de los genes activos que codifican proteínas transcripción traducción PROTEOMA Repertorio de proteínas de la célula Productos de expresión del genoma: -Variaciones del medio extra o intracelular Necesidades proteicas diferentes. - Morfogénesis: Diferenciación de tejidos, desarrollo embrionario -Ciclo celular: diferentes etapas diferentes necesidades Las condiciones ambientales cambiantes determinan distintas necesidades celulares y en consecuencia la expresión o no de ciertos genes. NECESIDAD DE REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GENÉTICA Mecanismos de Regulación de la Expresión genética • Metilación • Acetilación • Fosforilación • Splicing Alternativo PUNTOS DONDE ES POSIBLE REGULAR LA EXPRESIÓN GENÉTICA transcripción, maduración de ARNm transporte de ARNm, traducción, etc. los mecanismos reguladores pueden intervenir en cualquier paso entre la transcripción y la traducción o sea a nivel de: LA REGULACIÓN A NIVEL DE TRANSCRIPCIÓN • Regulación en procariotas El modelo “operón” en procariotas constituye un buen ejemplo de este mecanismo regulador genes reguladores que codifican para proteínas represoras A partir de esto se dan mecanismo de control positivo (inducible) (Control +) o negativo (reprimible) (Control -) ? al unirse a un gen operador impiden el avance de la RNA-polimerasa. Operón: unidad genética funcional formada por un grupo o complejo de genes capaces de ejercer una regulación de su propia expresión Las bacterias individuales responden a cambios ambientales por medio: de la regulación de su expresión génica A MODO DE EJEMPLO, una célula de E. coli vive en un ambiente cambiante como el colon humano, para su nutrición depende de los hábitos alimenticios de su huésped Si el ambiente carece del aa triptófano (necesario para su vida) la célula responde activando una vía metabólica Regulation of enzyme activity Regulation of enzyme production Enzyme 1 Regulation of gene expression Enzyme 2 Enzyme 3 Enzyme 4 Enzyme 5 Gene 2 Gene 1 Gene 3 Gene 4 Gene 5 Tryptophan Precursor Feedback inhibition Regulación de una vía metabólica Se produce en dos niveles Las células controlan el metabolismo regulando la actividad enzimática o la expresión de genes que codifican enzimas. Inhibición por retroalimentación b) Reprimir la expresión de los genes para todas las enzimas Resp. A más largo plazo En la vía de síntesis del triptófano, la abundancia de este puede: a) inhibir la actividad de la 1º enzima en la vía (inhibición por retroalimentación) Resp. rápida Control a nivel transcripcional En Gral, muchos genes del genoma bacteriano se “encienden” o se “apagan” por cambios en el estado metabólico de la célula Promotor Promotor DNA trpR Gen regulador trpR RNA polymerase mRNA 3 5 Protein Inactive Repressor trp mRNA 5 trpE trpD trpC trpB trpA Operador Start codon Stop codon Operón trp Genes of operon E Polipéptidos que componen las Enzimas para la síntesis del triptófano D C B A El operon trp se enciende por sí mismo La RNA polimerasa se fija al DNA en el promotor y transcribe los genes del operón El operón Trp: síntesis regulada de enzimas reprimibles Triptófano es un aa producido por una vía anabólica catalizada por enzimas reprimibles Reguladora alostérica DNA Protein se sintetiza en forma inactiva Tryptophan (correpressor) Tryptophan present, repressor active, operon off mRNA Active repressor No se sintetiza RNA a medida que se acumula el triptófano, inhibe su propia producción por medio de la activación de la proteína represora El represor se activa cuando está unido a un correpresor, por lo general, el producto final de una vía anabólica Represor trp Proteína reguladora alostérica Triptóf. ausente, represor inact.(elemento control negativo) y operón encendido el operón trp es un operon reprimible Gen regulador trpR Operón: Unidad de función genética que consiste en grupos de genes regulados coordinadamente con funciones relacionadas En lasbacterias, los genes, por lo general, se encuentran agrupados en operones La organización comprimida en bacterias seguramente apareció en respuesta a presiones evolutivas para mantener un genoma compacto. Parece como si los genomas bacterianos se hubieran reducido a lo esencial: • la mayoría de las secuencias de DNA codifican proteínas. • una pequeña cantidad de DNA se dedica a la regulación de la expresión génica • y quedan algunas secuencias no funcionales. Dos tipos de proteínas reguladoras que controlan la expresión génica • activadoras(+) que contribuyen a que la RNApoli se una al ADN y represoras (-) que bloquean esa unión (desactivan los genes) • Algunos activadores actúan por alostería y regulan pasos ulteriores a la unión de la RNA poli • Genomas eucariontes: regulación y evolución La información hereditaria fluye desde el DNA al RNA y de aquí a la proteína. Etapas: Transcripción Traducción Razones evolutivas la presencia del ARN como intermediario permite que se hagan mas copias de una proteína de forma simultánea (muchos transcritos de RNA a partir de un gen) La expresión génica: puede regularse en cualquier etapa, pero la etapa clave es la transcripción Todos los organismos deben regular qué genes se expresan en un momento determinado Tanto los organismos unicelulares como lo multicelulares deben activar y desactivar genes de forma continua en respuesta a los estímulos del medio Durante el desarrollo de un organismos , sus células sufren un proceso de especialización denominado Diferenciación celular Diferenciación celular: resultado es la presencia de células diferenciadas Cuerpo humano más o menos 200 tipos de células diferentes Una célula humana típica probablemente expresa cerca de un 20% de sus genes en un momento dado, una pequeña cantidad de ADN (1,5%) codifica proteína Las más especializadas expresan una fracción menor Hoy se dispone de la secuencia completa del genoma humano. El ADN repetitivo sin relación con transposones se origina por errores que se producen durante la replicación o recombinación. Exons (regions of genes coding for protein, rRNA, or tRNA) (1.5%) Alu elements (10%) DNA de secuencia Simple (3%) Duplicaciones de Segmento largo (5-6%) DNA NO codificante único (15%) Genes mutados No funcionales Intrones y secuencias reguladoas 24% DNA Repetitivo que incluye elementos Transponibles y secuencias relacionadas (44%) DNA repe titivo no Relacionado con elementos transponibles (about 15%) En los seres humanos y otros primates, una gran proporción de elementos transponibles y el ADN relacionado con ellos integra una familia de secuencias similares llamada elementos alu Tipos de secuencias de DNA en el genoma Humano Duplicaciones (accidentes en la división celular), reordenamientos, combinación de exones , mutaciones, elementos transponibles La duplicación de segmentos cromosómicos, que pueden incluir uno o más genes, permite que con el tiempo uno de los dos genes diverja para adquirir una función relacionada pero diferente. Parece que el proceso de duplicación de genes y divergencia ha desempeñado un papel fundamental en la evolución de la complejidad biológica Evolución de genes con funciones relacionadas: (Genes de la hemoglobina humana), son dos familias de genes relacionados entre sí que codifican las globinas, un grupo de proteínas que incluye las subunidades de polipeptídicas alfa y beta Una flía localizada en el cromosoma 16 de los seres humanos, codifica diversas formas de alfa –globina, la otra en el cromosoma 11 codifica formas de beta-globina. Las distintas formas de c/subunidad de globina se expresan en momentos diferentes del desarrollo LE 19-17b Heme Hemoglobin -Globin -Globin -Globin gene family -Globin gene family Chromosome 11Chromosome 16 1 12 A Embryo Embryo Fetus Adult Fetus and adult The human -globin and -globin gene families Subunidades polipeptídicas de alfa-globinas y beta- globinas Familia de genes codifica diversas formas Duplication of ancestral gene Mutation in both copies Transposition to different chromosomes Nuevas duplications and mutations Ancestral globin gene 1 12 A -Globin gene family on chromosome 16 -Globin gene family on chromosome 11 E vo lu ti o n ar y ti m e 400 o 500 Ma Genes parálogos La duplicación de genes puede impulsar la evolución de genes con funciones relacionadas , como los de la flía de la alfa y beta globinas embrión Feto y adulto embrión feto Feto y adulto Por el contrario, en el genoma humano parece que únicamente codifican proteína y RNA estructural alrededor del 1,5% de las secuencias de DNA, de forma que la mayoría del genoma humano está formado por DNA que aparentemente no tiene ninguna función. En los genomas bacterianos la mayoría de las secuencias de DNA codifican proteínas, una pequeña cantidad de DNA se dedica a la regulación de la expresión génica y quedan algunas secuencias no funcionales. Esta organización compacta o comprimida seguramente apareció en respuesta a presiones evolutivas para mantener un genoma compacto Varias tendencias son evidentes cuando comparamos los genomas de los procariotas y los de los eucariontes, incluidos los grupos más complejos, como los mamíferos Los seres humanos tienen de 500 a 1500 veces más pares de bases en su genoma que la mayoría de los procariontes, pero, en promedio, solo de 5 a 15 veces más genes. Los seres humanos tienen10000 veces más ADN no codificante que los procariontes. EVOLUCION DEL GENOMA CONTRIBUCIONES A LA EVOLUCION DEL GENOMA (cambios en el tiempo que van transformando el conjunto completo de genes de los organismos) •Duplicaciones (como accidentes de la división celular) •Los reordenamientos de partes de genes (duplicación y combinación de exones, etc.) •Las mutaciones del DNA •Los elementos transponibles Etapa clave la TRANSCRIPCION para la regulación de la expresión génicas Proceso completo Cada etapa representa un control potencial en el que la expresión génica se puede activar, desactivar, acelerar o retrasar ETAPAS DE LA EXPRESIÓN GÉNICA QUE PUEDEN SER REGULADAS (EUCARIONTE) ADN muy condensado genes que no se expresan (regulación de la expresión génica) • Modificación de las Histonas: Acetilación, Metilación y Fosforilación. • Metilación del DNA Ciertas modificaciones químicas de las histonas y del ADN de la cromatina influyen en la estructura de ésta como en la expresión génica HERENCIA EPIGENÉTICA • La herencia de rasgos transmitidos por mecanismos que no implican directamente a la secuencia de nucleótidos se llama Herencia epigenética Las modificaciones de la cromatina (acetilación, metilación de histonas y de ADN ) no implican un cambio en la secuencia de ADN y aun así pueden pasarse a generaciones futuras de células Herencia EPIGENÉTICA Herencia de rasgos transmitidos por mecanismos que no implican directamente a la secuencia de nucleótidos La herencia de los modelos de expresión génica, cuando no hay ni mutación ni señal de iniciación. Regulación de la estructura de la cromatina Determinadas modificaciones químicas de las Histonas y del DNA, desempeñan un papel importante. Permiten regular la transcripción génica como su estructura Las colas de histonas (extremo N-terminal) se proyectan hacia afuera del nucleosoma. Protruye y forma una cola accesible a diversas enzimas modificadoras que catalizan la adición o eliminación de grupos químicos específicos: acetilo, metilo y fosfato Nucleosomas muy acetilados, cromatina menos compacta, el DNA se hace accesible para la transcripción(favorece el acceso de los factores de transcripción basales al promotor del gen). los grupos acetilo(-COCH3) se adhieren a las (lisinas+) en las colas de histonas (H3 y H4, neutralizan sus cargas + y no se pueden unir a los nucleosomas vecinos). La desacetilación incrementa la carga positiva de las colas de las histonas al desenmascarar las cargas + de las lisinas. El incremento de la carga tiende a estabilizar la estructura de la cromatina, quizás al permitir que las colas interaccionen más fuerte con el ADN. ACETILACIÓN DE LAS HISTONAS Desacetilación: provoca el efecto contrario, ya que incrementa el enrrollamiento de la cromatina. METILACIÓN DEL ADN Adición de grupos metilo a ciertas bases del DNA después de haberse sintetizado. Generalmente (citosina), en plantas y animales provoca el silenciamiento de los genes METILACIÓN DE HISTONAS: el metilo (-CH3). Se adiciona a las histonas, provoca la condensación de la cromatina. El metilo se une a una de las lisinas de la histona H3 aumenta el enrollamiento de la cromatina, (su remoción lo disminuye) En determinadas especies la metilación del ADN es esencial para inactivar a los genes. Se produce durante la diferenciación celular en el embrión y es esencial para la inactivación a largo plazo de ciertos genes Los investigadores descubrieron que cierta proteínas que se unen al DNA metilado reclutan enzimas de desacetilación de histonas LA METILACIÓN DEL ADN INFLUYE SOBRE LA ACTIVIDAD GÉNICA La metilación del ADN se halla restringida a las citosina seguidas por guaninas Existe una estrecha correlación entre el grado de metilación de los genes y su inactividad transcripcional. Silenciamiento de genes diferenciación En sitios del ADN donde ya se encuentra metilada una cadena, las enzimas metilan la cadena hija después de cada ciclo de replicación del ADN. Los patrones de metilación se traspasan de esta manera y las células que integran los tejidos especializados llevan un registro químico de lo que sucede durante el desarrollo embrionario. Un patrón de metilación mantenido de esta manera también es responsable de la IMPRONTA GENÓMICA IMPRONTA GENÓMICA está representada por alrededor de 80 genes agrupados en regiones. La impronta es un tipo de regulación genética del desarrollo caracterizado por silenciación monoalélica, ya sea de los genes heredados por la madre o el padre. En los mamíferos, la metilación regula en forma permanente la expresión de los alelos maternos o paternos de ciertos genes al comienzo del desarrollo La fosforilación y la desfosforilación como modificaciones epigenéticas. Ciertas proteínas capaces de fosforilar varios aminoácidos en residuos de ciertas serinas y treoninas localizadas en la “cola” de las histona2A, se las vinculan con la condensación de la cromatina. Producen efectos opuestos a los de la acetilación y desacetilación respectivamente. LA ACETILACIÓN, LA DEMETILACIÓN Y LA DESFOSFORILACIÓN DE DISTINTAS HISTONAS DISMINUYEN EL ENROLLAMIENTO DE LA CROMATINA Y PROPICIAN LA ACTIVIDAD DE LOS GENES. Regulación de la transcripción La expresión del gen puede ser regulada en varios niveles • La transcripción génica diferencial, regula cuál de los genes nucleares son transcriptos en RNA. • El procesamiento nuclear selectivo de RNA, regula cuáles de los RNAs transcriptos (o qué partes de estos RNA nucleares) entran al citoplasma para convertirse en RNA mensajeros. • La traducción selectiva de RNA mensajero, regula cuáles de los mRNA del citoplasma llega a ser traducido en proteína. • La modificación diferencial de proteínas, regula a cuáles proteínas se les permite permancer o funcionar en la célula. Algunos genes (como los que codifican para las proteínas de la globina de la hemoglobina) están regulados en cada uno de estos niveles. La síntesis de un ARNm se produce cuando el gen respectivo, (promotor y las secuencias reguladoras), se activan por proteínas especiales, llamadas factores de transcripción. Los Factores de Transcripción se clasifican en. basales y específicos. Los factores de transcripción basales interactúan con el promotor del gen Los factores de transcripción específicos interactúan con el regulador, se subdividen en activadores y represores, según interactúen con la secuencia amplificadora o con la inhibidora del regulador a) componentes moleculares de la transcripción: (RNA polimerasa) b) Síntesis de un transcrito de RNA: 1) Los promotores señalan la iniciación de la síntesis de RNA.(secuencia específica del DNA ) 2) Los factores de transcripción actuan como mediadores en la unión de la RNA polimerasa y la inición de la trascripción. Es la síntesis de RNA dirigida por DNA ¿Qué es la transcripción? INCIACIÓN: la RNA polimerasa II se une al promotor (sec del DNA donde se fija la polimerasa) después que los factores de transcripción se unen a él (complejo de iniciación de la transcripción) ELONGACIÓN: la polimerasa se mueve en dirección 3´ desenrolla el DNA y alarga el transcrito de RNA 5´ 3´ TERMINACIÓN: se libera el transcrito de RNA y se despega la polimerasa del DNA GEN EUCARIONTE TÍPICO:Iniciación; corte y empalme Elementos de control casquete ENSAMBLAN Poliadenilación (250nucleótidos de adeninas) 7-metilguanosina Amplificadores o Potenc F.T.Específicos: activadores o represores FACTORES DE TRANSCRIPCION Reg. de la inici Para que un gen se exprese se necesita también de secuencias cuya función es controlar su actividad . A) Promotor: secuencia nucleotídica específica del ADN que se une a la RNA polimerasa y le indica dónde comenzar a transcribir el RNA. B) Reguladoras (determinan cuando el gen debe comenzar a transcribirse y cuántas veces debe hacerlo en un tiempo dado). reguladores: 1) Amplificadores o potenciador: segmento de ADN que contiene múltiples elementos de control que pueden estar localizados muy lejos del gen que regulan. Existen 3 clases de ARN polimerasas (I, II, y III) que sintetizan distintas clases de ARN: ARN polimerasa II participa en la síntesis de los ARNm y en la de los ARNsn; ARN polimerasa I interviene en la de los ARNr (45S), ARN polimerasa III lo hace tanto en la síntesis de los ARNt como la del ARNr (5S) Elementos de control Distal Activadores protein (Fact.de transcrip.Espec.) amplificador DNA TATA box Promoter Gen Factores de transcripción Grals RNA polymerase II RNA polymerase II RNA synthesis Transcription Initiation complejo Un activador es una proteína que se une a un potenciador y estimula la transcripción de un gen Proteína que pliega el ADN (acerca los activadores al promoto)r Modelo para la acción de los amplificadores y los activadores (proteínas) de la transcripción, la interacción entre ambos es importante para controlar la expresión génica Grupo de proteínas mediadoras Complejo de iniciación El pleg del ADN producida por una proteína Algunos factores de transcripción funcionar como represores, inhibiendo la expresión de un gen particular (por ej. bloquear la unión de los activadores o sus elementos control) Algunos activadores y represores actuan indirectamente al influir en la modificación de la estructura de la cromatina. Por ej, algunos activadores reclutan proteínas que acetilan histonas cerca de los promotores de un genes para facilitar o permitir la transcripción Proteínas de regulación génica provocan el pliegue del ADN, es común en eucariotas. En procariota estos ejemplos de sitios de regulación lejanos son pocos, sugieren que la organización comprimida común en bacterias seguramente apareció en respuesta a presiones evolutivas para mantener un genoma compacto. Procesamiento del RNA: corte y empalme del RNA En la elaboración de un transcripto primario a partir de un gen la RNA polimerasa II transcribe tanto intrones como exones del DNA Varias snRNP diferentes se unen con otras proteínas para formar un conjunto aun más grande llamado ESPLICEOSOMA Las partículas llamadas ribonucleoproteínasnucleares pequeñas (snRNP), reconocen estos sitios. El RNA en una partícula snRNP se llama RNA nuclear pequeño (snRNA) Interactúa con ciertos sitios a lo largo de un intrón, liberándolo y uniendo los dos exones que lo flanquean ¿Cómo se lleva a cabo el corte y empalme del pre-mRNA? La señal para el corte y empalme del RNA es una sec. corta de nucleótidos en cada extremo de un intrón están involucrados en: La formación de los espliceosomas El reconocimiento de los sitios de corte y empalme El proceso de catálisis sobre un pre-mRNA que contiene exones e intrones Ensamble de moléculas de RNA y proteínas:snRNP) ribonucleoproteínas nucleares pequeñas (snRNP) y otras proteínas forman un complejo molecular (espliceosoma) Dentro del espliceosoma, las snRNP aparean sus bases con nucleótidos en sitios específicos a lo lago del intrón y empalma los exones Función de las (snRNP) y los espliceosomas, en el corte y empalme del pre-mRNA ARNpn Mecanismo de regulación postranscripcional (procesamiento del mRNA) • Los genes eucariotas tienen intrones intercalados con exones • En el corte y empalme se eliminan los intrones y se unen los exones • El corte y empalme lo realiza los espliceosomas, a veces, el RNA sólo cataliza el proceso. (ribozimas) • La presencia de intrones permite el corte y empalme alternativo del RNA Importancia funcional y evolutiva de los intrones ¿Cuáles son las funciones biológicas de los intrones y del corte y empalme del RNA? Una idea es que los intrones cumplen un papel regulador en la célula; al menos algunos intrones contienen secuencias que de alguna manera controlan la actividad de los genes El proceso de corte y empalme, en sí mismo es necesario para el paso del mRNA desde el núcleo al hasta el citoplasma CORTE Y EMPALME ALTERNATIVO Se producen moléculas diferentes de ARNm a partir del mismo transcripto (pre-mRNA) Los genes pueden dar origen a dos o más proteínas diferentes, Genoma humano: un número de genes relativamente pequeño Dependiendo de qué exones están incluidos en el mRNA y cuáles no. Al dar origen a más de una versión del mRNA, un solo gen puede codificar más de un polipéptido CORTE Y EMPALME ALTERNATIVO del pre-mRNA Regulación a nivel del procesamiento del RNA •Produce moléculas diferentes de RNA a partir del mismo transcripto primario dependiendo de qué segmentos de RNA se trata como exones y cuáles como intrones •Proteínas reguladoras específicas de un tipo de célula controlan las elecciones intrón-exon, uniéndose a secuencias reguladoras dentro del transcripto primario moléculas diferentes a partir de una molécula de pre-mRNA: dependiendo de qué exones están incluidos en el mRNA y cuáles no. Al dar origen a más de una versión del mRNA: un solo gen puede codificar más de un polipéptidos Evolución • La presencia de intrones en un gen puede facilitar la evolución de proteínas nuevas y potencialmente útiles (combinación de exones) • Los intrones aumentan la probabilidad de entrecruzamientos potencialmente beneficiosos entre los exones • La combinación de exones de cualquier clase podría producir nuevas proteínas con combinaciones novedosas de funciones Procesamiento del RNA: adición del casquete 5´(forma modificada del nucleótido de G) y de la coli poliA “Funciones:facilitan la exportación del mRNA del núcleo, evitan que sea degradado por enzimas hidrolíticas y facilitan su fijación a los ribosomas al extremo 5´- Oportunidad para regular la expresión génica (procesamiento del RNA en el núcleo) Traducción Es la síntesis de un polipéptido dirigida por el RNA La regulación se produce con mayor frecuencia en la etapa de iniciación Control de la expresión génica después de la traducción en general los Polipéptidos eucariotas deben procesarse para obtener moléculas proteicas funcionales como escisión, modificaciones químicas, proteínas reguladoras se activan o inactivan por la adicción reversible de grupos fosfatos y las proteínas destinadas a la superficie de la células animales adquieren azúcares. Posteriormente el transporte de la proteína al destino específico mRNA Ribosomes Signal peptide Signal- recognition particle (SRP) SRP receptor protein CYTOSOL ER LUMEN Translocation complex Signal peptide removed ER membrane Protein La síntesis de polipéptidos siempre comienza en el citosol y termina en el citosol a menos que el polipéptido en crecimiento guíe al ribosoma para fijarlo al RE Polipéptidos de las proteínas destinados al Sist. de endomemb. o para la secreción son marcados por un péptido señal que dirige la proteína al RE Un complejo proteína-RNA llamado partícula de reconocimiento de la señal (SRP) reconoce el péptido señal SRP Proteína receptora en la membrana del RE Mecanismo de señalización para dirigir las proteínas al RE La síntesis de polipt. Comienza sobre el ribosoma libre en el citosol Una SRP se une al pept. Señal detiene la síntesis La enzima de escición de la señal corta el péptido señal Proteínas reguladoras que se unen a secuencias o estructuras del ARNm pueden bloquear la iniciación de la traducción, o pueden evitar la fijación al ribosoma Control en la iniciación de la traducción por medio de los factores de iniciación Por otra parte, la traducción de todos los ARNm en una célula puede estar regulado al mismo tiempo tiene un tiempo de vida , determinado en parte por las sec. en las regiones inicial y final. Después de la traducción diversos tipos de procesamiento de las proteínas como escisión y la adicción de grupos químicos están sujetos a control también. Se puede controlar la iniciación de la traducción por medio de la regulación de los factores de iniciación (proteínas reguladoras), o bloqueando la traducción La degradación del mRNA, cada mensajero tiene un tiempo de vida característico, determinado en parte por las secuencias en las regiones inicial y final La interferencia del RNA, por los miRNA de cadena única pueden inducir la degradación de un mRNA o los siRNA bloquear su traducción. Degradación: Cada mRNA tiene un tiempo de vida (determinado por las secuencias inicial y final) La interferencia de RNAm por los micro-RNA de cadena única pueden (A) inducir la degradación de un mRNA o (B) bloquear la traducción La degradación del mRNA Regulación de la expresión génica por los microRNA(miRNA) El precursor del micro(miRNA) (plegamiento) Enzima Dicer La enzima se mueve a lo largo de la cadena y lo secciona Se degrada una cadena, la otra cadena de (miRNA) Se asocia a un compl.de proteinas Complejo de proteínas El miRNA se aparea con el mRNA B A Regulación de la expresión génica por los microRNA (miRNA) El complejo miRNA-proteína evita la expresión génica degradación Bloqueo de la traducción Protoasomas (complejos proteicos): reconocen las moléculas proteicas marcadas ubiquitinas y las degradan Finalmente, la duración de las funciones de cada proteína en la célula se regula de manera estricta por la degradación selectiva Para marcar una proteína destinada a su destrucción, la célula le añade moléculas de una proteína pequeña llamada ubiquitina. Ubiquitinada proteína Protoasoma Proteina entrando en un protoasoma Protein fragments (peptides) Protoasoma y ubiquitina para reciclar Moléculas Ubiquitina (proteína Marcadora) Procesamiento y degradación de las proteínas por un protoasoma Protoasomas son complejos gigantes de proteínas que unen las moléculas de proteínas y las degradan Degradación de una proteína por un protoasoma (enorme complejo proteico) enzimas La proteína marcada con ubiquitina es reconocida por el protoasoma Última oportunidad para controlar la expresión génica (después de la traducción) Proteína para degradar Los componentes enzimáticos del protoasoma cortan a la proteína El RNA desempeña múltiples papelesen la célula Desempeña papeles catalíticos (Ribozima) y estructurales en los ribosomas Ribosomal RNA (rRNA) Sirve como molécula adaptadora en la síntesis de proteínas; traduce los codones del mRNA en aa. Transfer RNA (tRNA) Lleva información que especifica las secuencias de aa de las proteínas desde el DNA hasta los ribosomas (codifica proteínas) Messenger RNA (mRNA) FunctionsType of RNA Pequeño citosólico: se asocia a proteínas y dá lugar al complejo nucleo-proteico (SRP) ARNsc Es un componente de la partícula de reconocimiento señal (SRP), del complejo proteína-RNA que reconoce a los péptidos señal de los polipétidos destinados al RE SRP RNA Desempeña papeles estructurales y catalíticos en los espliceosomas- (cortes y empalmes de los ARNm) (Pequeños nucleolares) (maduración de transcriptos de RNA) Small nuclear RNApn ó (snRNA) Sirve como precursor del mRNA, el rRNA o el tRNA antes de ser procesado por corte y empalme Primary transcript FunctionsType of RNA modificacion de snoRNA y snRNARNAsca Colabora en el procesamiento de los transcritos pre-RNA para la formación de la subunidad del ribosoma en el nucléolo Small nucleolar RNA (snoRNA) Participan en la regulación de la expresión genética Inducen la degradación de un mRNA (miRNA)o bloquean su traducción (siRNA) Small interfering RNA (siRNA) and microRNA (miRNA) FunctionsType of RNA mRNA: codifica proteínas rRNA: componente del ribosoma tRNA: Adaptador en la síntesis de proteínas (traslada aa) siRNA: bloquea la traducción del mRNA seleccionados miRNA: dirige la degradación de mRNA seleccionados snRNA: maduración de transcriptos de RNA snoRNA: modificación y procesamiento del rRNA scaRNA: modificacion de snoRNA y snRNA RNA • La expresión génica puede regularse en cualquier etapa ( la etapa clave es la TRANSCRIPCIÓN) • los cambios en la estructura de la cromatina • la iniciación de la transcripción • el procesamiento del RNA (corte y empalme alternativo) • la degradación del mRNA o bloquear su traducción (miRNA y siRNA) • la traducción (controlar la iniciación) • el procesamiento y la degradación proteica. LA ACETILACIÓN, LA DEMETILACIÓN Y LA DESFOSFORILACIÓN DE DISTINTAS HISTONAS DISMINUYEN EL ENROLLAMIENTO DE LA CROMATINA Y PROPICIAN LA ACTIVIDAD DE LOS GENES. No existen genes diferentes, sino una EXPRESIÓN GÉNICA DIFERENCIAL Expresión de genes distintos por parte de células que contienen el mismo genoma Casi todas las células tienen un genoma idéntico, sin embargo el subgrupo de genes expresados en las células de cada tipo es único La expresión génica diferencial •Cada célula de un eucariota multicelular expresa solo una parte de sus genes. •En cada tipo de célula diferenciada se expresa un único subconjunto de genes. Se creía que en la regulación de los genes de los organismos complejos sólo intervenían proteínas. 100 billones de células con localizaciones y funciones características Patrón de expresión génica transformación Modificación de la cromatina, el corte y empalme alternativo del ARNm y la metilación del ADN Totipotente
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