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CATABOLISMO DE LOS HIDRATOS DE CARBONO La mayoría de los microorganismos oxidan hidratos de carbono como fuente principal de energía celular. En consecuencia, el catabolismo de los hidratos de carbono, o la degradación de moléculas de hidratos de carbono para producir energía, es sumamente importante en el metabolismo celular. El hidrato de carbono que las células utilizan con mayor frecuencia como fuente de energía es la glucosa. Los microorganismos también poseen la capacidad de catabolizar diversos lípidos y proteínas para producir energía. Para generar energía a partir de la glucosa los microorganismos recurren a dos procesos generales: la respiración celular y la fermentación. El paso inicial de estos dos procesos por lo general es el mismo (la glucólisis) pero a partir de la glucólisis las vías metabólicas siguen caminos diferentes. la respiración celular de la glucosa consta de tres estadios principales: glucólisis, ciclo de Krebs y cadena transportadora de electrones. La glucólisis es la oxidación de la glucosa para formar ácido pirúvico, con la producción de cierta cantidad de ATP y NADH que contiene energía. El ciclo de Krebs es la oxidación de la acetil CoA (un derivado del ácido pirúvico) para formar dióxido de carbono, con la producción de cierta cantidad de ATP, NADH que contiene energía y otro transportador de electrones reducido denominado FADH2 (la forma reducida de la flavina adenina dinucleótido). La cadena transportadora de electrones es responsable de la oxidación de NADH y FADH2, que transfieren los electrones que transportan desde los sustratos a una “cascada” de reacciones de oxidación y reducción en las que participan otros transportadores de electrones. La energía derivada de estas reacciones se utiliza para generar una cantidad importante de ATP. La mayoría del ATP derivado del proceso de respiración se genera durante el tercer paso. Dado que la respiración requiere una serie numerosa de reacciones de oxidación y reducción, la totalidad del proceso se puede concebir como el flujo de electrones desde una molécula de glucosa con alto contenido de energía hacia moléculas de CO2 y H2O con escasa cantidad de energía. La glucólisis y el ciclo de Krebs generan una pequeña cantidad de ATP y además aportan los electrones que generarán una gran cantidad de ATP durante el estadio de la cadena transportadora de electrones. En general el primer estadio de la fermentación también es la glucólisis . Sin embargo, después de la glucólisis el ácido pirúvico se convierte en uno o más productos distintos, según el tipo de célula. Estos productos comprenden alcohol (etanol) y ácido láctico. A diferencia de la respiración, la fermentación no se asocia con un ciclo de Krebs ni con una cadena transportadora de electrones. En consecuencia, la producción de ATP resultante deriva exclusivamente de la glucólisis y es mucho menor. GLUCÓLISIS La glucólisis es la oxidación de la glucosa para formar ácido pirúvico y en general representa el primer paso del catabolismo de los hidratos de carbono. La mayoría de los microorganismos (en realidad, la mayoría de las células vivas) utilizan esta vía metabólica. La glucólisis también se conoce con el nombre de vía de Embden-Meyerhof. El término glucólisis significa ruptura del azúcar y define el proceso con precisión. Las enzimas que participan en la glucólisis catalizan la escisión de la glucosa, un azúcar de seis carbonos, en dos azúcares de tres carbonos. Luego estos tres azúcares experimentan un proceso de oxidación que libera energía y sus átomos se reordenan para formar dos moléculas de ácido pirúvico. La reducción del NAD+ durante la glucólisis forma NADH, con una producción neta de dos moléculas de ATP por fosforilación a nivel del sustrato. La glucólisis no requiere oxígeno y puede tener lugar en presencia o en ausencia de ese elemento. Esta vía consiste en una secuencia de diez reacciones químicas y cada una de ellas es catalizada por una enzima diferente. En síntesis, la glucólisis consta de dos fases fundamentales, una preparatoria y otra de conservación de energía: 1. En primer lugar, en la fase preparatoria, se utilizan dos moléculas de ATP durante el proceso en el que una molécula de glucosa de seis átomos de carbono experimenta procesos de fosforilación, reestructuración y escisión para formar dos compuestos de tres átomos de carbono cada uno: gliceraldehído-3-fosfato (GP) y dihidroacetona fosfato (DHAP). La DHAP experimenta una conversión rápida en GP (también puede tener lugar la reacción en sentido inverso). La conversión de DHAP en GP significa que a partir de este momento de la glucólisis se aportarán dos moléculas de GP en las reacciones químicas restantes. 2. En la fase de conservación de energía, las dos moléculas de tres átomos de carbono son oxidadas en varios pasos para formar dos moléculas de ácido pirúvico. En estas reacciones dos moléculas de NAD+ experimentan un reducción a NADH y se forman cuatro moléculas de ATP por fosforilación a nivel del sustrato. Dado que para iniciar la glucólisis se necesitaron dos moléculas de ATP y el proceso generó cuatro moléculas de ATP, se produjo una ganancia neta de dos moléculas de ATP por cada molécula de glucosa oxidada. VÍAS DE GLUCÓLISIS ALTERNATIVAS Numerosas bacterias utilizan otras vías además de la glucólisis para oxidar la glucosa. La vía opcional más frecuente es la vía de las pentosas fosfato; otra opción consiste en la vía de Entner-Doudoroff. VIA DE LAS PENTOSAS FOSFATO La vía de las pentosas fosfato (o derivación de la hexosa monofosfato) opera simultáneamente con la glucólisis y permite degradar azúcares de cinco carbonos (pentosas) además de la glucosa . Una característica esencial de esta vía consiste en la producción resultante de pentosas intermedias importantes que se utilizan para la síntesis de: 1) ácidos nucleicos, 2) glucosa a partir de dióxido de carbono en la fotosíntesis y 3) ciertos aminoácidos. Esta vía es importante para producir la coenzima reducida NADPH a partir de NADP+. La vía de las pentosas fosfato arroja una ganancia neta de sólo una molécula de ATP por cada molécula de glucosa oxidada. Las bacterias que utilizan la vía de las pentosas fosfato son Bacillus subtilis, Escherichia coli, Leuconostoc mesenteroides y Enterococcus faecalis. VÍA DE ENTNER-DOUDOROFF Por cada molécula de glucosa la vía de Entner-Doudoroff produce dos moléculas de NADPH y una molécula de ATP para su uso en las reacciones biosintéticas celulares. Las bacterias que poseen las enzimas necesarias en la vía de Entner- Doudoroff pueden metabolizar la glucosa sin necesidad de recurrir a la glucólisis ni a la vía de las pentosas fosfato. La vía de Entner- Doudoroff es utilizada por algunas bacterias gram- negativas, como las de los géneros Rhizobium, Pseudomonas y Agrobacterium; las bacterias grampositivas en general no utilizan esta vía. A veces se usan pruebas para determinar la capacidad de oxidación de la glucosa mediante esta vía para identificar Pseudomonas en el laboratorio. RESPIRACIÓN CELULAR Una vez degradada la glucosa para formar ácido pirúvico este último compuesto puede dirigirse hacia la fermentación o la respiración celular. La respiración celular, o sencillamente la respiración, se define como un proceso generador de ATP en el cual las moléculas experimentan oxidación y el aceptor final de electrones es (casi siempre) una molécula inorgánica. Un rasgo esencial de la respiración es la presencia de una cadena transportadora de electrones. Existen dos tipos de respiración que dependen de si el organismo es aerobio, es decir que utiliza oxígeno, o anaerobio, es decir que no necesita oxígeno y el oxígeno incluso puede destruirlo. En la respiración aerobia el aceptor final de electrones es el O2; en la respiración anaerobia el aceptor final de electrones es una moléculainorgánica no O2 o, raramente, una molécula orgánica. RESPIRACIÓN AEROBIA Ciclo de Krebs. El ciclo de Krebs, también llamado ciclo del ácido tricarboxílico (TCA) o ciclo del ácido cítrico, consiste en una serie de reacciones bioquímicas en las que la gran cantidad de energía química potencial almacenada en la acetilCoA se libera en forma gradual. En este ciclo una secuencia de oxidaciones y reducciones transfieren la energía potencial en la forma de electrones a coenzimas portadoras de electrones, sobre todo NAD+. Los derivados del ácido pirúvico experimentan un proceso de oxidación con reducción simultánea de las coenzimas. El ácido pirúvico producto de la glucólisis no puede ingresar directamente en el ciclo de Krebs sino que antes debe perder una molécula de CO2 y convertirse en un compuesto de dos átomos de carbono. Este proceso se denomina descarboxilación. El compuesto de dos carbonos, llamado un grupo acetilo, se fija a la coenzima A mediante un enlace de alta energía; el complejo resultante se conoce con el nombre de acetil coenzima A (acetil CoA). Durante esta reacción el ácido pirúvico también se oxida y NAD+ se reduce a NADH. Se debe tener presente que la oxidación de una molécula de glucosa produce dos moléculas de ácido pirúvico, de manera que en el estadio preparatorio por cada molécula de glucosa se liberan dos moléculas de CO2, se producen dos moléculas de NADH y se forman dos moléculas de acetil CoA. Después de la descarboxilación del ácido pirúvico y de la unión de su derivado (el grupo acetilo) a la CoA la acetil CoA resultante puede ingresar en el ciclo de Krebs. En el momento en que la acetilCoA ingresa en el ciclo de Krebs la CoA se desprende del grupo acetilo. El grupo acetilo de dos carbonos se combina con un compuesto de cuatro carbonos llamado ácido oxaloacético para formar el compuesto de seis átomos de carbono denominado ácido cítrico. Esta reacción biosintética necesita energía, la que se obtiene mediante la escisión del enlace de alta energía entre el grupo acetilo y la CoA. En consecuencia, la formación de ácido cítrico es el primer paso del ciclo de Krebs. Las reacciones químicas del ciclo de Krebs se clasifican dentro de diversas categorías generales, una de las cuales es descarboxilación. Otra de las categorías generales a las que corresponden las reacciones químicas del ciclo de Krebs es la oxidación y reducción. Si se considera el ciclo de Krebs en su conjunto se puede apreciar que por cada dos moléculas de acetil CoA que ingresan en él se liberan cuatro moléculas de CO2 mediante la descarboxilación, se producen seis moléculas de NADH y dos moléculas de FADH+ mediante reacciones de oxidación y reducción y se generan dos moléculas de ATP mediante la fosforilación a nivel del sustrato. Muchos de los productos intermedios del ciclo de Krebs también participan en otras vías metabólicas, sobre todo en la biosíntesís de aminoácidos. El CO2 que se produce en el ciclo de Krebs finalmente se libera en la atmósfera en la forma de un subproducto gaseoso de la respiración aerobia. (Los seres humanos producen CO2 mediante el ciclo de Krebs en la mayoría de las células corporales y lo eliminan a través de los pulmones durante la espiración.) Las coenzimas reducidas NADH y FADH2 son los productos más importantes del ciclo de Krebs debido a que contienen la mayor parte de la energía almacenada originalmente en la glucosa. Durante la siguiente fase de la respiración una serie de reducciones transfiere indirectamente la energía almacenada en estas coenzimas al ATP. Estas reacciones se conocen globalmente como cadena transportadora de electrones. La cadena transportadora de electrones. Una cadena transportadora de electrones consiste en una secuencia de moléculas transportadoras capaces de provocar reacciones de oxidación y reducción. A medida que los electrones transcurren a lo largo de la cadena se produce una liberación gradual de energía que se utiliza para la generación quimioosmótica de ATP. La reacción de oxidación final es irreversible. En las células eucariontes la cadena transportadora de electrones se encuentra en la membrana interna de las mitocondrias, mientras que en las células procariontes se localiza en la membrana plasmática. En la cadena transportadora de electrones existen tres clases de moléculas transportadoras. La primera clase está representada por las flavoproteínas. La segunda clase de moléculas transportadoras comprende los citocromos. La tercera clase de moléculas transportadoras está representada por la ubiquinona, o coenzima Q. Las cadenas transportadoras de electrones de las bacterias difieren entre sí debido a que las moléculas transportadoras utilizadas por una bacteria y la secuencia en la que operan pueden ser diferentes de las de otras bacterias y de las de los sistemas mitocondriales de las células eucariontes. No obstante, todas las cadenas transportadoras de electrones cumplen el mismo objetivo central, que es la liberación de energía a medida que los electrones pasan de compuestos de alta energía a compuestos con una menor cantidad de energía. La cadena transportadora de electrones genera NAD+ y FAD+ que se pueden utilizar nuevamente en la glucólisis y el ciclo de Krebs. Las distintas transferencias de electrones en la cadena transportadora de electrones generan alrededor de 34 moléculas de ATP a partir de cada molécula de glucosa oxidada; alrededor de tres moléculas de cada una de las diez moléculas de NADH (un total de 30) y alrededor de dos de cada una de las dos moléculas de FADH2 (un total de cuatro). Para llegar al número total de moléculas de ATP generadas a partir de cada molécula de glucosa las 34 moléculas derivadas de la quimioósmosis se agregan a las generadas por oxidación durante la glucólisis y el ciclo de Krebs. En las células procariontes la respiración aerobia puede generar un total de 38 moléculas de ATP a partir de cada molécula de glucosa. RESPIRACIÓN ANAEROBIA En la respiración anaerobia el aceptor final de electrones es otra sustancia inorgánica y no el oxígeno (O2). Algunas bacterias, como Pseudomonas y Bacillus, pueden utilizar el ión nitrato (NO3-) como aceptor final de electrones; el ión nitrato es reducido a ión nitrito (NO2-), óxido nitroso (N2O) o nitrógeno gaseoso (N2). Hay otras bacterias, como Desulfovibrio, que utilizan sulfato (SO4-) como aceptor final de electrones para formar sulfuro de hidrógeno (H2S) y que utilizan carbonato (CO32-) para formar metano (CH4). La respiración anaerobia de las bacterias que utilizan nitrato y sulfato como aceptores finales es un proceso esencial en los ciclos naturales del nitrógeno y el azufre. La cantidad de ATP generada durante la respiración anaerobia varía según el organismo y la vía utilizada. Como en condiciones anaerobias el ciclo de Krebs sólo opera en forma parcial y dado que no todas las moléculas transportadoras de la cadena transportadora de electrones participan en la respiración, la producción de ATP siempre es menor que en la respiración aerobia. En consecuencia, los microorganismos anaerobios se desarrollan más lentamente que los aerobios. FERMENTACION Una vez que la glucosa ha sido degradada para formar ácido pirúvico este compuesto puede experimentar una degradación completa durante la respiración o se puede convertir en un producto orgánico durante la fermentación, en el transcurso de la cual se regeneran NAD+ y NAD+ que pueden ingresar en otro ciclo de glucólisis. La fermentación 1. Libera energía a partir de azúcares u otras moléculas orgánicas, como aminoácidos, ácidos orgánicos, purinas y pirimidinas. 2. No necesita oxígeno (pero a veces tiene lugar en su presencia). 3. No necesita recurrir al ciclo de Krebs ni a una cadena transportadora de electrones. 4. Utiliza una molécula orgánica como aceptor final de electrones. 5. Sólo produce pequeñascantidades de ATP (una o dos moléculas por cada molécula de material inicial) debido a que una gran parte de la energía original almacenada en la glucosa permanece en los enlaces químicos de los productos finales orgánicos, como el ácido láctico o el etanol. Durante la fermentación los electrones se transfieren (junto con los protones) desde coenzimas reducidas (NADH, NADPH) al ácido pirúvico o sus derivados. Los aceptores finales de electrones experimentan una reducción que los convierte en los productos finales. Una de las funciones esenciales del segundo estadio de la fermentación consiste en garantizar una provisión constante de NAD+ y NADP+ para que pueda continuar el proceso de glucólisis. En la fermentación el ATP se produce exclusivamente durante la glucólisis. Los microorganismos poseen la capacidad de fermentar diversos sustratos; los productos finales dependen del tipo de microorganismo, del tipo de sustrato y del tipo de enzimas que se encuentran presentes y en estado de activación. El análisis químico de estos productos finales ayuda a identificar los microorganismos. FERMENTACIÓN DEL ÁCIDO LÁCTICO Durante la glucólisis, que representa la primera fase de la fermentación del ácido láctico, la oxidación de una molécula de glucosa produce dos moléculas de ácido pirúvico. Esta reacción de oxidación genera la energía necesaria para formar las dos moléculas de ATP. Durante el paso siguiente las dos moléculas de ácido pirúvico son reducidas por dos moléculas de NADH para formar dos moléculas de ácido láctico. Dado que el ácido láctico es el producto final de la reacción, este compuesto no experimenta una oxidación ulterior y la mayor parte de la energía producida por la reacción permanece almacenada en el ácido láctico. Por lo tanto, este tipo de fermentación sólo genera una escasa cantidad de energía. Dos importantes géneros de bacterias productoras de ácido láctico son Streptococcus y Lactobacillus. Dado que estos microorganismos producen exclusivamente ácido láctico, se conocen con el nombre de homolácticos (u homofermentadores). La fermentación del ácido láctico puede conducir a la descomposición de los alimentos pero este proceso también permite producir yogur a partir de la leche, chucrut a partir del repollo fresco y pepinillos en salmuera. FERMENTACIÓN DEL ALCOHOL La fermentación del alcohol también comienza con la glucólisis de una molécula de glucosa para formar dos moléculas de ácido pirúvico y dos moléculas de ATP. Durante el paso siguiente las dos moléculas de ácido pirúvico se convierten en dos moléculas de acetaldehído y dos moléculas de CO2. Más tarde las dos moléculas de acetaldehído son reducidas por dos moléculas de NADH para formar dos moléculas de etanol. La fermentación del alcohol también es un proceso que produce una escasa cantidad de energía debido a que la mayor parte de la energía almacenada en la molécula de glucosa inicial permanece en el producto final, es decir el etanol. La fermentación del alcohol se observa en numerosas bacterias y levaduras. El etanol y el dióxido de carbono producidos por la levadura Saccharomyces son productos de desecho para las células de la levadura pero son útiles para el ser humano, El etanol producido por las levaduras es el alcohol presente en las bebidas alcohólicas y el dióxido de carbono elaborado por las levaduras es responsable de que la masa del pan aumente de tamaño (“leve”). Los organismos que además de ácido láctico producen otros ácidos o alcoholes se conocen con el nombre heteroíácticos (o heterofermentadores) y a menudo utilizan la vía de las pentosas fosfato. BIBLIOGRAFÍA Tortora, Gerard J. Introducción a la microbiología / Gerard J. Tortora; Berdell R. Funke; Christine L. Case. - 9a ed. - Buenos Aires: Médica Panamericana, 2007. Capítulo 5.
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