úcleos situados en el rombencéfalo (protuberancia anular y bulbo raquídeo) que se interrelacionan entre ellos y reciben información periférica de los pares craneales IX y X, así como información de origen central de los centros corticales, elaborando un programa de deglución. Este programa puede ser desencadenado de forma refleja contando con la información periférica (deglución involuntaria) o puede ser puesto en marcha de forma voluntaria gracias a los centros corticales (deglución voluntaria).

a) Deglución refleja: Hay numerosos estímulos que desencadenan la deglución. A nivel orofaríngeo los estímulos mecánicos son los más eficaces, siendo los pilares amigdalinos anteriores la parte más reflexógena. De todas formas, estímulos que desencadenan la deglución en función de su intensidad pueden desencadenar otros reflejos como el tusígeno o el nauseoso. A la altura del vestíbulo laríngeo y del plano glótico el agua parece ser más eficaz, estimulando los receptores situados sobre la mucosa aritenoidea. En el esófago los receptores están situados en la capa muscular y se estimulan por la distensión.
b) Deglución voluntaria: Su control se encuentra en la parte inferior de la corteza frontal ascendente con proyección de fibras a las interneuronas del bulbo raquídeo. Además este área es sensitiva además de motora, recibiendo información del área orofaríngea y laríngea. Permite la rehabilitación de la deglución al poder compensar voluntariamente diversos déficits sensitivos o motores. Las alteraciones de los centros corticales afectan la fase oral pero no eliminan el reflejo de la deglución, aunque suele retrasarse su aparición. Además los impulsos subcorticales procedentes de la amígdala y del hipotálamo contribuyen como facilitadores del desencadenamiento del reflejo de la deglución, así se explican las aspiraciones observadas en pacientes con enfermedad de Parkinson.