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ADN RECOMBINANTE → cualquier molécula de ADN obtenida in vitro por la combinación de fragmentos de ADN de distintos orígenes. VECTOR DE CLONACIÓN (amarillo en esquema) → es una molécula de ADN de doble cadena con capacidad de albergar un fragmento de ADN exógeno (o sea, de otro origen). El fragmento de ADN rojo será incorporado a un vector de clonación → será unido a través de una ADN ligasa. Existen distintos vectores de clonación → en general se trabaja con VECTORES PLASMÍDICOS → son vectores cuya estructura deriva de los plásmidos bacterianos → que son ADN circular de ADN cadena extracromosómicos. Tienen la capacidad de replicarse en forma independiente al cromosoma, pueden ser transferidos de una célula a otra y permiten clonar fragmentos de ADN de hasta 30mil pares de bases. Un VECTOR DE CLONACIÓN PLASMÍDICO tiene que tener, en su estructura, 3 secuencias principales: UN ORI → permite que el vector se replique dentro de la bacteria que lo contiene en forma independiente al ADN cromosómico. UNA SECUENCIA DENOMINADA POLILIGADOR, PLICONECTOR O POLILINKER → es una sucesión de sitios de restricción para diferentes tipos de enzima; permiten seleccionar con que enzima se cortará el vector y el ADN a clonar → para generar, en ambos fragmentos, extremos cohesivos. UNA SECUENCIA DE SELECCIÓN → la cual codifica la expresión de una enzima que sea capaz de degradar el antibiótico que se encuentra en el medio de incubación. 19° T E O R I C O TECNOLOGÍA DE ADN RECOMBINANTE SE NECESITAN ENZIMAS QUE PERMITAN CORTAR AL SITIO POLILIGADOR Y AL ADN QUE SE DESEA CLONAR. Se tiene al vector con las enzimas y se generan cortes en el vector, en el sitio poliligador, y se generan cortes en el fragmento de ADN que se quiere clonar de manera tal de generar extremos cohesivos tanto en el vector de clonación como en el fragmento de ADN a clonar. Luego se incuba la mezcla con la enzima ADN ligasa que generará las uniones covalentes entre los extremos que se aparean por complementariedad molecular. UNA VEZ OBTENIDO EL ADN RECOMBINANTE (cuando ya se hizo la ligación entre el fragmento de ADN a clonar y el vector plasmídico) → el producto que se obtiene se llama PLÁSMIDO RECOMBINANTE o ADN RECOMBINANTE → se lo debe introducir dentro de bacterias, para que cuando estas se dupliquen, dupliquen a su vez al plásmido que se introdujo en ellas. El proceso de introducción del plásmido recombinante dentro de la célula bacteriana → se lo denomina TRANSFORMACIÓN BACTERIANA (paso 3). Se debe incubar a la bacteria en presencia de un agente que induzca competencia (que las bacterias sean competentes quiere decir que están en condiciones de captar al plásmido con el cual se las incuba); se debe agregar al medio de reacción los plásmidos recombinantes y una vez que la bacteria captó al plásmido → se las incuba en el medio de cultivo bacteriano (que tiene sales, aminoácidos y cofactores enzimáticos). LAS BACTERIAS CRECEN EN EL MEDIO DE CULTIVO → Y CADA VEZ QUE LAS BACTERIAS SE DIVIDAN, SE DIVIDIRÁN TAMBIÉN LOS PLÁSMIDOS QUE CONTIENEN → y a su vez, estos plásmidos pueden dividirse dentro de la bacteria en forma independiente a la división del cromosoma bacteriano. El medio de cultivo que se utiliza para cultivar bacterias se denomina LURIA BERTANI → medio líquido de color ámbar → al medio, además de adicionar las bacterias transformadas se les adiciona ampicilina. Las bacterias transformadas dentro de ese medio de cultivo se dividirán → cada vez que la bacteria se divida, se divide el plásmido (AUNQUE LA DIVISIÓN DEL PLÁSMIDO PUEDE SER INDEPENDIENTE A LA MULTIPLICACIÓN DE LA BACTERIA) → luego de una determinada cantidad de tiempo, la multiplicación bacteriana será grande → por lo tanto, a partir de una sola bacteria se obtienen un gran número de bacterias que contienen en su interior por lo menos un plásmido replicado. DE ESTA MANERA SE LOGRA AMPLIFICAR, A PARITR DE UNA BACTERIA MUCHAS VECES EL ADN RECOMBINANTE QUE SE INTRODUJO EN LA MISMA. SE AGREGA AMPICILINA EN EL MEDIO DE CULTIVO PARA SELECCIONAR QUE SOLAMENTE CREZCAN AQUELLAS BACTERIAS QUE CAPTARON EL PLÁSMIDO → O SEA, QUE HAN SIDO TRANSFORMADAS. SI LAS BACTERIAS FUERON TRANSFORMADAS → estas expresarán la enzima que degrada el antibiótico (la ampicilina del medio); y las bacterias van a poder crecer sin ser muertas. Una vez que termina la incubación → se toma una alícuota y se siembra una placa con Agar + Ampicilina → en esta placa se obtiene una COLONIA DE BACTERIA TRANSFORMADAS (aquellas que incorporaron el plásmido). A partir de las bacterias transformadas se hace una extracción del plásmido recombinante → se extrae el plásmido recombinante para poder utilizar el ADN que se clonó exitosamente dentro de las bacterias. Aquellas bacterias que no incorporaron el plásmido → no van a expresar la enzima que degrada el antibiótico y no van a sobrevivir. EXTRACCIÓN DEL PLÁSMIDO RECOMBINANTE Entonces → se puede tener ADN genómico y este puede ser cortado por enzimas de restricción; a partir del genoma de un organismo se pueden obtener muchísimos fragmentos de restricción (fragmentos que han sido cortados por las enzimas de restricción) → y cada uno de estos fragmentos de restricción puede ser incorporado dentro de un vector plasmídico para obtener plásmidos recombinantes. Si lo que se incuba con los vectores plasmídicos son los fragmentos que provienen de todo el genoma de un organismo → se obtiene fragmentos de ADN que contienen toda la información que estaba presente en el genoma del organismo. Por otro lado → se puede obtener todo el ARN de una muestra y se podría hacer una retrotranscripción obteniendo los ADN que corresponden a todos los ARN expresados en esa muestra (células, tejidos u órganos). Los cADN pueden ser también incorporados dentro de vectores plasmídicos → obteniendo un conjunto de vectores plasmídicos que contendrían toda la información que se expresaba en ese tejido al momento de la extracción del ARN. Ya sean los plásmidos recombinantes que provengan de la obtención del cADN como los plásmidos que se obtienen por recombinación de ADN d un organismo entero y los vectores plasmídicos → se puede transformar bacterias en ambos casos: si las bacterias en las placas de colonias contienen plásmidos recombinantes, que en su conjunto contendrán a todo el genoma del organismo → en este caso se obtiene una biblioteca de ADN genómico. si lo que contienen las bacterias transformadas son plásmidos recombinantes que incorporaron los cADN que provienen de la retrotranscripción de todo el ARN que se expresa en una muestra → se obtiene una biblioteca de cADN. Entonces → se podrá guardar, dentro de placas que contengan un medio selectivo con ampicilina, bacterias que tendrán en su interior a los plásmidos que brinden información sobre todo un organismo en cuanto a su genoma; o la información de toda la expresión del genoma de un organismo (en el caso de hacer una retrotranscripción y una obtención de cADN a partir de todo el ARN que contenga el organismo). Para la producción de proteínas se necesita: 1. la secuencia de la proteína que se quiere producir. 2. un vector que albergue la secuencia de la proteína que se quiere expresar. 3. un sistema de expresión. La secuencia de ADN de la proteína que se quiere expresar puede provenir de un gen obtenido por PCR o de un cADN obtenido por rt-PCR a partir de un ARNm. En general, lo más utilizado es un cADN. VECTOR → molécula de ADN de doble cadena capaz de albergar un fragmento de ADN exógeno (de otro origen). En este caso, el vector que se necesita no es un vector de clonación (plasmídico) → SINO QUE SE NECESITA UN VECTOR DE EXPRESIÓN → tiene los mismos fragmentos que tiene un ADN de clonación: tiene un ORI. tiene una secuencia queexpresará una proteína que degrade antibiótico. tiene un poliligador → sucesión de sitios de restricción que permiten elegir las enzimas de restricción con las cuales se cortaran los fragmentos de ADN y el vector para introducir el fragmento allí. sin embargo, a diferencia del vector de clonación → el vector de expresión debe tener un PROMOTOR → para favorecer la interacción con el ADN de la ARNpol. SI NO SE TIENE AL PROMOTOR, NO SE PODRÁ EXPRESAR EL ADN UBICADO DENTRO DEL VECTOR. Además de tener al VECTOR DE EXPRESIÓN, se necesita un SISTEMA DE EXPRESIÓN → será un sistema celular, y puede ser: UN SISTEMA CELULAR PROCARIONTE → generalmente se utilizan bacterias. UN SISTEMA CELULAR EUCARIONTE → generalmente se utilizan células de levadura, de mamíferos, insectos o gusanos. Si se tiene la SECUENCIA DE LA PROTEÍNA A EXPRESAR y el VECTOR adecuado que albergue la secuencia de la proteína a expresar y que contenga la secuencia promotora para que se pueda transcribir correctamente el ADN de la proteína; y se tiene un SISTEMA DE EXPRESIÓN → el fragmento de ADN que contenga la secuencia de la proteína será incorporado dentro del vector en la dirección correcta (para que se pueda copiar en dirección 5’ → 3’); y una vez que ocurra la ligazón → la ARNpol interaccionará con el promotor y se activará la transcripción del ADN que se introdujo en el vector de expresión. SI SE TIENE UNA TRANSCRIPCIÓN CONTINUA SE PODRÁ OBTENER UNA GRAN CANTIDAD DE ARN CORRESPONDIENTE A LA PROTEÍNA → el ARN sobreexpresado será traducido a proteína y se obtendrá una gran cantidad de la proteína que se deseaba expresar. SISTEMA DE EXPRESIÓN Cuando se utiliza como SISTEMAS DE EXPRESIÓN (3) a las bacterias → se puede favorecer la expresión de la proteína utilizando como estrategia al OPERÓN LACTOSA → el cual contiene una región reguladora que tiene un promotor seguida de una región operadora; esta región promotora y operadora tendrá unida a una proteína represora cuando la bacteria se encuentre en un medio de cultivo en el cual dispone de glucosa; si la bacteria no contiene glucosa en el medio, sino lactosa → la lactosa se unirá a la proteína represora cambiándole la conformación, y así la proteína represora abandonará su unión a la región promotora/operadora → y una vez liberada la proteína, SE PODRÁ UNIR LA ARNPOL Y PODRÁ COPIAR LOS GENES DEL OPERÓN LACTOSA. La estrategia fue realizar una construcción que tuviese el promotor del operón lac y se reemplazó la zona de los genes lac z (los 3 genes que constituyen el operón lac) por el ADN de la proteína que se desea expresar. A TRAVÉS DE TÉCNICAS DE ADN RECOMBINANTE SE ELIMINA LA ZONA DE LOS GENES LAC Z Y SE INTRODUCE EL ADN DE LA PROTEÍNA A EXPRESAR. Una vez realizada la construcción e introducido el cADN → se incuban las bacterias en presencia de lactosa o en presencia de IPTG (análogo de la lactosa → solo que no se degrada en galactosa+glucosa); el IPTG siempre estará presente en el medio y siempre se unirá al represor liberándose la zona del operador/promotor, con lo cual se unirá la ARNpol y se copiara con alta eficiencia al cADN que se introdujo a continuación de la región reguladora lac z. DE ESTA MANERA SE PUEDEN OBTENER, POR TECNOLOGIA DE ADN RECOMBINANTE, GRANDES CANTIDADES DE LAS PROTEÍNAS A EXPRESAR. No se puede producir una glucoproteína dentro de una bacteria ya que la bacteria no contiene el sistema de endomembranas que permite la síntesis y glicosilación y secreción de las glucoproteínas → con lo que se debe cambiar el sistema de expresión y comenzar a utilizar células eucariontes. SE UTILIZAN CÉLULAS EUCARIONTES PARA PRODUCIR GLUCOPROTEÍNAS EN GRAN CANTIDAD. Se necesita el vector de expresión → el cual debe tener su ORI, un gen de selección y un promotor a continuación del cual se introduce el cADN por técnicas de ADN recombinante. El vector recombinante será introducido dentro de células eucariontes, se cultivan y se deberá generar PERTURBACIONES TRANSITORIAS EN LAS MEMBRANAS PLASMÁTICAS DE LAS CÉLULAS EN CULTIVO para lograr que el plásmido recombinante ingrese a la célula → una vez que ingresa, el plásmido recombinante debe ingresar al núcleo celular, una vez allí, el promotor del plásmido será susceptible de ser reconocido por una ARNpol que transcribirá y luego ese ARN será transportado al citoplasma donde se traducirá la proteína de interés. NO TODAS LAS CÉLULAS INCORPORAN EL PLÁSMIDO RECOMBINANTE → por lo tanto la eficiencia no es muy alta. Y el hecho de que el plásmido recombinante no se incorpore al genoma hace que luego de un determinado periodo de tiempo, la célula se deshaga de ese ADN extraño degradándolo → con lo cual, se debería volver a transfectar las células constantemente durante distintos periodos de tiempo. EL PROCESO DE INCORPORACIÓN DE UN PLASMIDO RECOMBINANTE A UNA CELULA EUCARIONTE SE DENOMINA TRANSFECCIÓN → LA TRANSFECCIÓN ES TRANSITORIA. Como este sistema no es muy eficiente; se desarrolló otro (lado derecho) en el cual se tiene los mismos elementos dentro del vector de expresión (promotor, cADN, ORI) pero se introduce un nuevo elemento de selección → EL ANTIBIÓTICO NEOMICINA → si la célula no lo degrada, se muere ya que es altamente tóxico para las células eucariontes. Se toma al cultivo de células, se introduce el plásmido recombinante dentro del cultivo celular y LUEGO SE CULTIVA A LAS CÉLULAS EN PRESENCIA DEL ANTIBIÓTICO NEOMICINA. AQUELLAS El plásmido recombinante ingresa al núcleo pero no se incorpora al genoma. CÉLULAS QUE HAYAN INCORPORADO EL PLÁSMIDO SOBREVIVIRÁN A LA NEOMICINA; Y LAS QUE NO LO HAYAN INCORPORADO SE MORIRÁN. El ADN correspondiente al vector se va a incorporar al genoma → esta será la condición para que se exprese la enzima que degrade al antibiótico. ENTONCES SOLO AQUELLAS CÉLULAS QUE INCORPORARON EL VECTOR DE EXPRESIÓN Y ESTE SE INCORPORÓ AL GENOMA → PODRÁN EXPRESAR LA ENZIMA QUE DEGRADA NEOMICINA Y PODRÁN SOBREVIVIR EN EL CULTIVO. SE TENDRA EL GEN QUE SE DESEA EXPRESAR INCORPORADO EN EL GENOMA Y PODRÁ SER EXPRESADO POR LA CÉLULA DE MANERA CONSTANTE → TRANSFECCIÓN ESTABLE → la célula no expulsará al plásmido luego de determinado momento, la inserción es permanente y heredable → cada vez que la célula se divida va a heredar la transformación en su genoma a las células hijas. También se denomina transformación celular ya que la célula incorpora un nuevo gen que antes no tenía en su genoma. ENTONCES → en el sisrema de expresión eucarionte hay 2 tipos de transfección: TRANSFECCIÓN TRANSITORIA → dura un corto periodo de tiempo; el plásmido recombinante de expresión no se integra al genoma y es expulsado de la célula. TRANSFECCIÓN ESTABLE O TRANSFORMACIÓN → el plásmido se integra al genoma y se podrá obtener de manera heredable y de forma constante la expresión de las proteínas deseadas. VECTOR A veces e busca clonar un ADN a través de una transformación bacteriana para obtener gran cantidad de ADN dentro de las bacterias que se replicaron; y luego se querrá expresar ese ADN → CON LO CUAL UN VECTOR DE CLONACIÓN NO SIRVE YA QUE FALTA EL PROMOTOR → habitualmente se saca el cADN del vector de clonación y se lo inserta en un vector de expresión. Para evitar este paso → se utiliza un VECTOR LANZADERA O SHUTTLE → vector que puede ser utilizado para evitar el uso de dos tipos de vectores. Este vector contiene un GEN DE SELECCIÓN PARA TRANSFORMACIÓN BACTERIANA, un POLILIGADOR, un ORI, un PROMOTOR y un GEN MARCADOR DE SELECCIÓN PARA NEOMICINA. Este vector tiene la capacidad de funcionar como vector de clonación si se lo introduce dentro de bacterias; y luego se lo puede extraer la gran cantidad de este vector clonado dentro de las bacterias y se puede transfectar células en un sistema de expresión eucarionte; SE PUEDE A PARTIR DE ESTE VECTOR, SINTENER QUE CAMBIAR DE VECTOR → EXPRESAR LA PROTEÍNA DE INTERÉS. GENES REPORTEROS Un gen reportero es un GEN CUYO PRODUCTO SERÁ FÁCILMENTE DETECTABLE EN UNA CÉLULA y por lo tanto puede usarse como: indicador de alguna función (ya sea de una actividad celular o una localización). indicador de una proteína celular. indicador de si la transfección fue exitosa. PROTEÍNA FLUORESCENTE VERDE (gfp) La proteína fluorescente verde permite estudiar la actividad, la localización de una proteína celular. Si se quisiera seguir los movimientos o la ubicación de una proteína dentro de la célula luego de que esta fue estimulada para dividirse → si se lo quiere observar en una célula viva, no se podrán utilizar las técnicas de microscopia clásica que implican la fijación celular → entonces se desarrolló una estrategia que es la generación de una PROTEÍNA DE FUSIÓN → dos proteínas se transcriben y se traducen unidas de manera tal que forman un solo polipéptido; PARA LOGRAR ESTO SE DEBE FUSIONAR EL ADN QUE CODIFICA UNA DE LAS PROTEÍNAS CON EL ADN QUE CODIFICA LA OTRA. Por ejemplo → si se quisiese estudiar la ubicación de la proteína MAPquinasa → el ADN de la proteína MAPquinasa denominado ERK se debería fusionar con la proteína fluorescente verde GFP → PROTEÍNA DE FUSIÓN GFP-ERK. SE DEBE TENER LOS DOS CADN → EL CADN DE LA PROTEÍNA ERK Y EL DE LA PROTEÍNA GFP → Y LOGRAR CONSTRUIR UN CADN QUE CONTENGA A AMBOS UNO A CONTINUACIÓN DEL OTRO → cuando este cADN se transcriba se obtendrá una proteína que tendrá dos dominios → el dominio de la proteína de interés (ERK) y un dominio que estará formado por la proteína fluorescente verde (que será la que se podrá seguir en el microscopio). Una vez que se tiene el cADN que contiene los dos cADN (proteína ERK y GFP) → SE LO INSERTA EN UN VECTOR DE EXPRESIÓN DONDE ESTÉ BAJO CONTROL DE UN PROMOTOR ADECUADO; luego se transfecta a las células y se tratará de generar una transfeccion estable a través de un marcador de selección usando neomicina → induciendo que el plásmido se incorpore al genoma de la célula → luego, una vez que las células incorporaron esto en su genoma celular, podrán expresar la ERK que contiene unida a la proteína fluorescente verde. ESTA TÉCNICA QUE UTILIZA LA PROTEÍNA FLUORESCENTE VERDE ES MUY ÚTIL PARA ESTUDIAR PROCESOS EN CÉLULAS VIVAS. El GFP un gen reportero → ya que reporta donde se encuentra la proteína ERK en una célula control o en una célula que fue tratada con un mitógeno. En la célula control se observa como la fluorescencia correspondiente a la proteína de fusión con la ERK se encuentra en el citoplasma; cuando las células son tratadas con mitógenos, la fluorescencia rápidamente transloca al núcleo (donde la proteína fosforilará factores de transcripción para activar el proceso de división celular). PROTEÍNA FLUORESCENTE roja (Rfp) De la misma manera que se creó un cADN fusionando el cADN de la ERK y el de la proteína fluorescente GFP → se lo puede hacer para cualquier otra proteína con cualquier otro cADN de proteína fluorescente. SE PODRÍA FUSIONAR EL CADN DE RFP CON LA ACTINA → y se podría visualizar como se disponen los filamentos de actina en una célula que fue transfectada en forma estable con este plásmido de expresión; se podría visualizar la localización celular de la actina si es que se tiene a la actina unida a la proteína fluorescente roja. LA PROTEÍNA FLUORESCENTE ROJA ES UN GEN REPORTERO ya que reporta como se distribuye la actina en células que fueron transformadas en forma estable con esta construcción. LUCIFERASA La luciferasa es una ENZIMA; cuando se transfecte células con esta construcción → si se expresa la luciferasa, será capaz de convertir un sustrato incoloro en un sustrato con fluorescencia → y se podrá medir la transformación en un fluorómetro o en un luminómetro. LA ACTIVIDAD DE LA ENZIMA LUCIFERASA REPORTA ALGUNA ACTIVIDAD QUE SE BUSQUE ESTUDIAR. Se tiene una construcción con: la LUCIFERASA. corriente arriba está el PROMOTOR para que se pueda expresar la luciferasa. corriente arriba del promotor hay una SECUENCIA ER → es el ELEMENTO DE RESPUESTA de una región reguladora → es una secuencia de ADN a donde se unirán factores de transcripción. ESTE GEN REPORTERO SIRVE EN PARTICULAR PARA ESTUDIAR LA ACTIVIDAD DE FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN; si el factor de transcripción está activo y se une al elemento de respuesta → esto induce a que la ARNpol se una al promotor y transcriba la luciferesa → una vez transcripta y traducida podrá convertir un sustrato incoloro en un sustrato con luminiscencia y se lo podrá detectar. Por lo tanto → si se detecta luminiscencia quiere decir que se tiene luciferasa y que esta se transcribió debido a que el factor de transcripción en estudio fue capaz de unirse al elemento de respuesta que se encontraba en el vector. ESTE VECTOR DE EXPRESIÓN ES UTILIZADO PARA ESTUDIAR FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN. La luciferasa estará reportando la activación del factor de transcripción. Una vez unido al elemento de respuesta favorecerá la unión de la ARNpol en la región promotora y favorecerá la transcripción de la luciferasa → que luego será traducida en el citoplasma y podrá convertir un sustrato incoloro en un sustrato que emita luz. Ligando azul es capaz de unirse a la molécula verde (factor de transcripción) → una vez unidos, se activa el factor de transcripción, transloca al núcleo y es capaz de unirse al elemento de respuesta. OGM = ORGANISMOS GENÉTICAMENTE MODIFICADOS; PUEDEN SER PLURICELULARES O UNICELULARES. Un organismo transgénico o genéticamente modificado es aquella célula, planta o animal que incorporo en forma estable uno o más genes de otro organismo → ya sea por inserción, deleción o reemplazo de genes y que puede ser heredado en las generaciones sucesivas. Las transfecciones estables para la producción de proteínas son ORGANISMOS UNICELULARES GENÉTICAMENTE MODIFICADAS ya que incorporaron el cADN de la proteína que se quiere expresar y ese ADN que expresa la proteína será heredado a sus células hijas. TRANSGEN → gen modificado que se agrega cuando se crea un organismo genéticamente modificado. SE PUEDE ADICIONAR UN GEN DENTRO DEL GENOMA DE UN ORGANISMO DE DOS MANERAS: se puede ADICIONAR DE MANERA HOMÓLOGA y en este caso el gen que se quiera introducir en el organismo deberá hacer una recombinación homóloga en un gen previamente existente en ese genoma. Si se desea introducir un “gen C” por recombinación homóloga en un organismo que contiene el gen A y B → se deberá reemplazar, por ejemplo, el gen B por el gen C que es el que se desea introducir; en este caso no se estará adicionando un gen sino reemplazando uno por otro. la otra forma de incorporación de un transgen al genoma de un organismo es por RECOMBINACIÓN NO HOMÓLOGA → en este caso, el gen que se busca incorporar al organismo no reemplazará ningún gen previamente existente en el genoma; sino que será insertado en una región del ADN donde no perturbe a ningún otro gen del genoma → probablemente se incluya dentro de una región no codificante. ADICIÓN DE UN GEN SE TENDRÁ EL GEN QUE SE DESEA ADICIONAR AL ORGANISMO INCORPORADO DENTRO DE UN VECTOR → este vector será luego introducido en una célula (ya sea por transfección, electroporación por una infección viral o inyectando ese vector dentro del núcleo de la célula). ESTE GEN DEBE INCORPORARSE AL GENOMA DEL ORGANISMO POR RECOMBINACIÓN NO HOMÓLOGA. En general cuando se introduce un gen a un organismo y este irá por recombinación no homóloga → se deberá incorporarlo con un promotor ya que no se sabe en qué zona del genoma se incorporará el gen; y si no tiene un promotor el gen no podrá expresarse. Entonces → como debe adicionarse tanto el promotor como el gen → la estrategia utilizada es incorporarun PROMOTOR REGULABLE → o sea que se lo pueda hacer expresar cuando se quiera → que permita que a través de un estímulo el promotor se active y desencadene la expresión del gen de interés. ANIMAL TRANSGÉNICO Obtención de un animal transgénico → se debe inyectar la construcción que contiene el gen y el promotor regulable dentro de un ovocito que ha sido fecundado. En general se inyecta ese plásmido de expresión dentro de uno de los núcleos del ovocito fecundado → ese ovocito comenzará a segmentarse y el embrión que surja de ese ovocito será implantado en una rata (por ejemplo) que haya sido previamente hormonizada → se hormoniza al animal para que el organismo sienta que esta embarazado y se pueda implantar el ovocito fecundado que se le va a transferir. De todos los ovocitos que se pueden haber transfectado in vitro y que luego se implanten en el útero de la rata → solamente entre un 10% y un 30% de las ratas que se vayan a desarrollar serán transgénicas e incorporarán el ADN incorporado en todos los tejidos y las células germinales. De aquellas ratas que incorporaron el ADN foráneo, se trata luego de obtener una descendencia de manera tal de poder conservar los animales transgénicos en las generaciones sucesivas. La obtención de animales genéticamente modificados en general es utilizada para la investigación y no para la industria alimenticia. PLANTAS TRANSGÉNICAS La bacteria que se observa → es resistente a los insectos; un gen que posee esta bacteria codifica una proteína que la hará resistente a los insectos. Lo que se hace es clonar ese gen, ya sea por PCR o por tecnología de ADN recombinante, se obtienen grandes cantidades del vector de clonación que tendrá es gen que codificará la proteína que será resistente hacia los insectos → y con esa gran cantidad de vectores que contienen el ADN de interés → se recubrirán perlas o partículas de oro con esos vectores recombinantes → luego estas partículas de oro recubiertas por el vector recombinante se empaquetaran dentro de balas de teflón que cargaran una pistola con la cual se dispararán células embrionarias de la planta de interés que interesa transfectar y que estará en cultivo. LAS PLANTAS SON MUY FÁCILMENTE TRANSFORMABLES Y TRANSFECTABLES → adquieren rápidamente el plásmido y lo expresan. Una vez que el plásmido llegó al genoma de la planta, en general se hace crecer a las plantas en un medio de selección, se selecciona a aquellas plantas que han sido transformadas → y luego esos plantines que crecen en medio de cultivo se transfieren a la tierra para que se desarrollen las plantas genéticamente modificadas → y esas plantas genéticamente modificadas transferirán a su descendencia el gen adicionado → SE PODRÁ OBTENER A PARTIR DE ELLA, SEMILLAS QUE TENDRÁN EL GEN YA ADICIONADO A SU GENOMA. ESTE TIPO DE TECNOLOGÍA SE UTILIZA EN LA TERAPIA GÉNICA deleción o silenciamiento de un gen Los organismos genéticamente modificados, cuando se dileciona o se silencia un gen → PERMITEN ESTUDIAR FUNDAMENTALMENTE CUAL ERA LA FUNCIÓN DE ESE GEN. O sea → si se tiene un gen de hormona de crecimiento y se lo silencia (no se deja expresar) se verá lo que le pasa al organismo → nunca crecerá y terminara muriendo pequeño. Entonces → si se quiere estudiar para qué sirve un gen → debe hacerse una deleción del mismo. Para estudiar la función del gen se puede: NOQUEAR EL ADN → para lo cual se debe obtener un organismo transgénico genéticamente modificado en el cual, en lugar de introducir un gen, lo que se hará es interrumpir la expresión del gen. NOQUEAR EL ARNM → de esta manera se induce la degradación del ARNm en las células de manera que se impida que se exprese la proteína → se observa que le pasa a la célula cuando esa proteína no está. INHIBIR LA FUNCIÓN DE LA PROTEÍNA MEDIANTE INHIBIDORES FARMACOLÓGICOS. En los organismos genéticamente modificados se realiza una construcción que se introduce en el genoma por recombinación homóloga → se reemplazará el gen que se quiere silenciar por una construcción que no contenga el gen → y por lo tanto el organismo no expresará el gen y se podrá ver que le ocurre al organismo en ausencia del mismo. En general, la construcción con la que se reemplazará al gen que se quiere estudiar → será un ADN que contenga la secuencia de una enzima que degrade antibiótico. Si se quiere reemplazar el gen A en el genoma → se debe obtener un cADN que codifique para una enzima que degrade antibiótico → pero este cADN tendrá que tener secuencias en ambos extremos del gen para que se pueda intercambiar el gen A por el gen que contiene la enzima que contiene a la enzima que degrada antibiótico por RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA. SE DEBE OBTENER POR TÉCNICAS DE ADN RECOMBINANTE → una construcción interruptora que contendrá la secuencia de la enzima que degrada antibiótico; y en los extremos de esta secuencia tendrá secuencias que se encuentran en los extremos del gen que se quiere reemplazar. En general el antibiótico de elección es NEOMICINA. EL GEN DEBE CONTENER: la secuencia de la enzima que degrade al antibiótico. las secuencias que flanquean a la secuencia iguales a las del gen. secuencia de la tirosina quinasa del virus de estomatitis humana. PROTEÍNA TIMIDINACINASA → va a añadir un fosfato a un compuesto que se llama ganciclovir → este adquirirá un fosfato, luego trifosfato y se transformara en un análogo de timidina trifosfato.Por lo tanto, cuando se este replicando el ADN para que la célula se divida → en lugar de introducir timidina trifosfato, introducirá ganciclovir trifosfato → y cuando esto ocurra se detendrá la síntesis de ADN → YA QUE ES UN ANALOGO DE BASE QUE BLOQUEALA SINTESIS DE ADN → y cuando esto ocurra, se dejarán de dividir las células y morirán. Entonces → se tiene la construcción que estará en un vector de expresión que contendrá el cADN que tiene la secuencia de la enzima que degrada antibiótico flanqueada por los extremos del gen que se quiere reemplazar; y a su vez se tiene la secuencia de la enzima timidinaquinasa del virus de la estomatitis humana. Con la construcción se transforman células madre embrionarias de ratón (ejemplo) → dentro de esas células madre embrionarias pueden ocurrir dos cosas: que ocurra una RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA DE LA CONSTRUCCIÓN QUE SE INTRODUJO CON EL GEN X QUE SE DESEA REEMPLAZAR. Si se inserta en el lugar que se quiere que el gen se inserte → se reemplazará el gen x por el gen que tiene la enzima que degrada antibiótico → y por lo tanto, si se la cultiva en un medio que tiene neomicina → las células sobrevivirán. Aquellas células que han incorporado en forma de recombinación homóloga a la construcción introducida → no habrán incorporado la secuencia de la timidinaquinasa y serán resistentes al antibiótico ganciclovir ya que este no se transformara en gaciclovir trifosfato y no podrá impedir la síntesis de ADN. que ocurra una RECOMBINACIÓN NO HOMÓLOGA → o sea que la construcción se inserte en cualquier lugar del genoma excepto en aquel lugar en donde se lo busca reemplazar. Si el gen se inserta de manera no homóloga también se expresará la enzima que degrada a la neomicina → pero además de esta, expresa a la enzima que transforma al ganciclovir en un ganciclovir trifosfato y que impedirá que las células sigan proliferando → con lo cual se van a morir. DE ESTA MANERA SE PUEDE SELECCIONAR TANTO CON NEOMICINA COMO GANCICLOVIR CUÁLES SON LAS CÉLULAS QUE HAN SIDO TRANSFORMADAS POR RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA DE MANERA EXITOSA. Una vez que se pudo seleccionar cuales son las células (marrones en esquema) → esas células, que ya se sabe que fueron transformadas en forma exitosa con la construcción, son inoculadas en un embrión temprano de ratón → el embrión temprano será introducido en el útero de una rata previamentehormonizado. Dentro de la cría del ratón habrá ratones que van a tener dos tipos de células → las que provienen de las células transformadas y las que provienen de las que no estaban transformadas → a este tipo de individuos se los denomina QUIMERA O MOSAICOS ya que se tienen células que provienen de un origen distinto al de otras células. LA CONSTRUCCIÓN CON LA QUE SE TRANSFECTÓ A LAS CÉLULAS PARA GENERAR A ESTOS RATONES → además de reemplazar el gen que se quiere mutar con la enzima que degrada antibiótico; tendrá algún gen que indique algún color en el pelaje de manera que ese color se pueda expresar en los descendientes de la rata. Se podrá detectar a partir de la aparición de cambios en el pelaje cuales son los ratones que han incorporado algunas de las células a su organismo y cuáles no. Y luego se procede a hacer cría entre los ratones que tienen cambios en el pelaje y liego de muchas generaciones se obtiene un ratón donde todas sus células provienen de las células donde el gen ha sido sustituido por el gen diana → se observa ya que el ratón cambia completamente el color del pelaje; sin embargo a todas las descendencias de estos ratones se les debe hacer un análisis genético para ver si el gen se expresa o no. SE ESTARÁ EN PRESENCIA DE UN RATÓN TRANSGÉNICO KNOCK OUT CUANDO EN LOS DOS ALELOS DEL GENOMA SE HAYA PODIDO DELETAR EL GEN → EN GENERAL EL MUTANTE ES HOMOCIGOTA PARA ESA DELECIÓN, CON LO CUAL NO SE EXPRESARÁ EN EL ORGANISMO. SILENCIAMIENTO DE GEN A TRAVÉS DE MICROARN Además de deletar el gen → SE PUEDE SILENCIAR EL ARN → existen ARN codificados por genes denominados microARN → éstos, una vez que son procesados por enzimas dentro y fuera del núcleo, se convierten en una hebra → primero son dúplex de ARN complementarios y luego serán separados en una sola hebra de ARN molde que tendrá la capacidad de aparearse con un ARN citoplasmático → si este ARN molde se aparea con un ARN citoplasmático, éste último será completamente degradado y por lo tanto, ese gen que se expresó en el ARN es silenciado → ya que ese producto de expresión ya no puede formar parte de un ribosoma o ser traducido a una proteína.
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