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→ Química biológica: Explica en términos químicos las estructuras y funciones de los seres vivos. Es importante para la medicina porque explica todos los procesos que ocurren en las células. Además, casi todas las enfermedades tienen una base bioquímica. → Átomo: Es la unidad fundamental de la materia. Está constituida a su vez por subpartículas; protones, neutrones y electrones. Los átomos se asocian formando moléculas que se comportan como unidades, esta unión se produce a través de enlaces químicos. La formación o ruptura de dichos enlaces causan reacciones químicas. 1. Iónico: Formado entre los átomos de un metal y un no metal. 2. Covalente: Formado entre los átomos de no metales. Los átomos comparten uno o más pares de electrones. A su vez, este puede ser polar o no polar. - Enlace covalente no polar: Los átomos que intervienen en el enlace tienen la misma electronegatividad. Estos se pueden encontrar como; Moléculas formadas por dos átomos iguales (H2, O2) o moléculas formadas por distintos átomos, pero con la misma electronegatividad (molécula de etano) - Enlace covalente polar: Los átomos que intervienen en el enlace tienen diferente electronegatividad. El átomo mas electronegativo atrae los electrones compartidos en el enlace, provocando una distribución asimétrica de cargas y generando un polo positivo y uno negativo, lo cual forma un dipolo (dos cargas de signo opuesto separadas por una distancia determinada) Una molécula compuesta o grupo funcional es polar cuando: ✓ Tiene carga neta o positiva ✓ No tiene carga, pero está formada por átomos de diferentes electronegatividades. Mide la tendencia que tiene un átomo a atraer hacia si los electrones compartidos en una enlace. Cuantos más electrones haya en la última capa, más fácil se completa. Los átomos con más electrones en la última capa son los más electronegativos. Determina la reactividad de cada elemento. Los electrones de la última capa de orbitales (mayor energía) son los que participan en las reacciones químicas. Sirve para comprender la formación de los enlaces químicos. Gases nobles o inertes: Poca tendencia a reaccionar ya que su configuración electrónica se basa en tener completa su ultima capa de electrones (8 electrones, menos el Helio que tiene 2) Metales y no metales: Con menos de 8 electrones en la última capa, tienen reactividad química para adquirir la configuración electrónica similar a la del gas inerte más cercano en la tabla. Los átomos ceden, comparten o ganan electrones para completar su configuración electrónica. 1. Puentes de hidrógeno: Común entre moléculas polares en medio acuoso. Se produce entre un átomo de hidrógeno unido covalentemente a un átomo electronegativo (O y N), que por su densidad de carga positiva es atraído por otro átomo electronegativo presente en otra molécula 2. Enlace Iónico: Interacciones de tipo electrostáticas que se establecen entre cargas opuestas. 3. Fuerzas de Van der Waals: Interacciones de dipolos temporales de tipo carga-carga que dependen de la distancia entre átomos. Se forman continuamente entre moléculas en solución y no es necesario que las moléculas sean pares. 4. Interacciones hidrofóbicas: Se generan entre moléculas y grupos funcionales no polares. La fuerza que mantiene unidas a las moléculas o grupos funcionales apolares o hidrofóbicas se debe a la tendencia de expulsar agua del entorno. Átomo de hidrógeno H: Tiene un electrón en su ultima capa electrónica. Ion de hidrógeno H+: Se genera por la pérdida de ese electrón. (Se pierde el electrón por lo que se vuelve positivo y se convierte en un Ion). Ácido: Sustancia capaz de ceder protones. Base: Sustancia capaz de aceptar protones La acidez es una sustancia que se mide por la concentración de protones. Se utiliza una escala logarítmica denominada escala de pH. Se define: pH = -log (H+) → Definición: Disposición de los elementos químicos en forma de tabla, ordenados por su número atómico, por su configuración de electrones y sus propiedades químicas. En el sentido que van las flechas aumenta la electronegatividad de los elementos en la tabla periódica. → Símbolos de la tabla periódica: - Carbono: C - Hidrógeno: H - Oxígeno: O - Nitrógeno: N - Fósforo: P - Azufre: S → Definición: Biopolímeros constituidos por unidades básicas monoméricas denominadas aminoácidos. Las proteínas son moléculas de gran tamaño, perteneciendo a la categoría de macromoléculas, que mediante el proceso de hidrolisis se reducen a compuestos mas simples llamados aminoácidos. Período grupo - Sodio: Na - Potasio K - Calcio: Ca - Magnesio: Mg - Hierro: Fe - Cloro: Cl Son de fundamental importancia entre las moléculas constituyentes de los seres vivos. Todas contienen H, O y N, casi todas también S. Son biomoléculas esenciales de las estructuras celulares o extracelulares, ya que intervienen en casi todas las modificaciones moleculares del metabolismo celular. 1. Acción catalizadora 2. Transporte y almacenamiento 3. Soporte mecánico 4. Protección inmunitaria 5. Coagulación 6. Control del crecimiento 7. Funciones hormonales 8. Receptores y canales de la membrana La función biológica que cumpla cada proteína dependerá de su estructura → Definición: Moléculas orgánicas con una estructura general común, esenciales en la constitución de las proteínas. → Estructura general común: A un átomo de carbono alfa se unen por enlace covalente un grupo amino, un grupo carboxilo, un átomo de hidrógeno y un resto. R-CH-COOH La cadena lateral es diferente para cada uno de los 20 aminoácidos que constituyen las proteínas. → Familias de aminoácidos L – aminoácidos: Son los que forman parte de nuestras proteínas. Tienen el grupo amino a la izquierda. D – aminoácidos: Tienen el grupo amino a la derecha. → Clasificación según cadena lateral Aminoácidos con grupo R alifáticos de cadena no polar Átomos de hidrógeno Glicina Metilo Alanina Cadena lateral ramificada Valina Leucina Isoleucina Aminoácidos con anillos aromáticos Grupo fenilo Fenilalanina Grupo fenol Tirosina Grupo indolico Triptofano Aminoácidos con grupo R azufrados Grupo tiol Cisteína Metilo Metionina Aminoácidos ácidos y sus amidas Función ácida Derivado Ácido asparatico Aspargina Ácido glutámico Glutamina Aminoácidos básicos Grupo amino con carbono E Lisina Grupo guanidino Arginina Grupo imidazol Histidina Aminoácidos con cadena lateral alifática con grupos hidroxilos Alcohol primario Serina Alcohol secundario Treonina Imino – ácido (le falta el grupo amino) Prolina Hidroxiprolina (subderivado de la prolina) NH2 - → Clasificación de los aminoácidos según polaridad de cadena lateral 1. Apolares 2. Polaridad intermedia 3. Polares → Clasificación de los aminoácidos: Esenciales: No los podemos sintetizar y debemos incorporarlos con la dieta; Valina, leucina, isoleucina, fenilalanina, triptofato, treonina, metionina, lisina. No esenciales: Las sintetizamos, por lo que no es necesario incorporarlo con la dieta. Relativamente esenciales: Arginina e histidina. Enlaces covalentes muy estables por la cual se unen los aminoácidos entre sí, entre el grupo carboxilo del primer aminoácido y el grupo amino del segundo con pérdida de una molécula de agua. Es la estructura en la que se presentan las proteínas. - DIPEPTIDO: Molécula que resulta de la unión de 2 aminoácidos a través de un enlace peptídico. - TRIPEPTIDO: Molécula que resulta de la unión de 3 aminoácidos a través de dos enlaces peptídicos. Depende de: 1. Los restos de los aminoácidos que lo constituyen 2. Grupo amino inicial 3. Grupo carboxilo terminal Todas las proteínas poseen 1.Estructura primaria: Número, tipo y orden del aminoácido 2. Estructura secundaria: orden especial (hélice) 3. Estructura terciaria: Tridimensional No todas las proteínas tienen 4. Estructura cuaternaria: Dos o mas subunidades Existen pequeños polipéptidos que son activos funcionalmente y presentan nada mas que estructura primaria. La mayoría de las proteínas presentes en la naturaleza adquieren estructura secundaria, a veces terciarias y a veces incluso cuaternaria para poder cumplir con sus funciones biológicas. Es la desorganización de la estructura molecular de las proteínas que lleva a la perdida de propiedades y funciones por el sometimiento a la acción de agentes físicos (calor, congelamiento, radiaciones) o químicos (ácidos o álcalis). Es reversible cuando ocurre en todas las estructuras excepto en la primaria, ya que esta es la mas importante. Es irreversible cuando ocurre en la estructura primaria (hidrólisis) 1. Simples: Proteínas cuya hidrólisis total produce aminoácidos y carbohidratos. Ej. Globulinas, histonas, protaminas, etc. 2. Conjugadas: Moléculas en las cuales se asocian una proteína simple y otro tipo de compuesto. Se llama apoproteína a la porción proteica y grupo prostético al otro componente. Ej. Nucleoproteínas, glicoproteínas, fosforoproteinas, etc. • Colágeno: Proteína más abundante en vertebrados. Componente estructural de gran resistencia mecánica, el cual forma fibras de tejido conjuntivo. Estructura: Cadena con una secuencia -glicil-prolil-hidroxiprolil- elevada proporción de restos de glicina y prolina. • Queratina: Existen dos tipos; alfa y beta. Las alfa son las principales proteínas del pelo y las uñas, y son ricas en cisteína Estructura: Predominan las alfa-hélices, en trozos de mas de 300 aa de longitud. Dos de estas hélices suelen enrollarse una sobre otra formando una doble hélice. En el pelo suelo suelen encontrarse fibras muy flexibles, en otros tejidos como las uñas, las fibras son mas duras. • Hemoglobina: Pertenece a las hemoproteínas, las cuales son de gran importancia funcional, es responsable del transporte de oxígeno en sangre. Estructura: Constituidas por una proteína de carácter básico llamada globina, la cual es una molécula tetramérica constituida por la asociación de dos cadenas polipeptídicas de 141 aa cada una, y otras dos cadenas de aminoácidos según el tipo de hemoglobina. • Elastina: Proteína fibrosa que tiene la capacidad de estirarse un 150%. Forma una hélice a. A diferencia del colágeno que presta resistencia, esta produce elasticidad. Cede a la tracción, se deforma y luego recupera su forma original. Además de las sustancias reactivas y productos, en toda reacción química debe considerarse la energía. La termodinámica es la rama de la física que trata la energía y sus transformaciones. 1. Primera ley: La energía total del universo permanece constante. 2. Segunda ley: La entropía del universo va en aumento. La energía es la capacidad de realizar trabajo. En condiciones normales, las reacciones químicas se realizan en un medio de temperatura y presión constantes. Solo una fracción de la energía liberada es disponible para realizar trabajo de algún tipo, esa energía es la llamada energía libre. Existen dos tipos de reacciones químicas Reacciones químicas G ✓ En toda reacción química tenemos un grupo de reactivos y un grupo de productos ✓ Los reactivos y los productos se consumen o se forman a una determinada cantidad por velocidad de tiempo, lo cual es conocido como la velocidad de una reacción ✓ Las reacciones pueden ser reversibles tanto de reactivos a productos como de productos a reactivos. ✓ Cuando las concentraciones ya no cambian mas y la reacción finalizo, es porque se logró el equilibrio químico. Si a un sistema en equilibrio de le modifica la concentración de algún reactivo o producto, la temperatura, presión, etc. El sistema reaccionará de manera de oponerse al cambio. A + B C + D → Definición: Las enzimas son catalizadores biológicos formados principalmente por proteínas. → Definición de catalizador: Estructura química que aumenta la velocidad de una reacción química. Exergónicas Liberan energía Endergónicas Consumen energía Reactivos Productos Lo que se modifica Como reacciona el sistema Lo que significa que una enzima aumenta la velocidad de una reacción química en un organismo vivo. Para lograrlo, disminuye la energía de activación. A + B A…B C+D Para que los reactivos se logren transformar en productos, primero tienen que pasar por un estado activo, para lo cual, deben obtener energía. Esa energía, es la conocida como energía de activación “ea”. Las enzimas hacen que esa energía sea mas pequeña y sea más fácil y rápido el pasaje por el estado activo. Durante este proceso, las enzimas no se consumen, ni cambian la cantidad de energía intercambiada, como tampoco el producto que se obtiene. Las enzimas son específicas ya que catalizan una sola o un grupo muy reducido d reacciones. Esto sucede porque tienen un sitio activo donde solo puede ingresar uno o pocos reactivos. Algunas enzimas necesitan de una coenzima o un grupo prostérico para poder catalizar la reacción. Estas son estructuras químicas que no están formadas por aminoácidos. → Coenzima: Moléculas no proteicas cuya relación con la enzima es débil. → Grupo prostérico: Moléculas no proteicas unidas fuertemente a la enzima mediante uniones covalentes, formando complejos difíciles de separar. → Velocidad máxima: Valor en el que la velocidad no cambia, aunque modifiquemos la concentración del sustrato. Es la medida de la cantidad de enzima presente. → Km: Concentración del sustrato en la cual alcanzo la mitad de la velocidad máxima. Es la medida de la afinidad entre la enzima y el sustrato. A menor km, mayor afinidad. A cada enzima se le asigna un número, por ejemplo; Lactato deshidrogenasa EC. 1.1.1.27 - El primero número nos indica sobre que grupos funcionales o que tipo de actividad química produce. - La seguidilla de números después del primero es la categoría principal. Sustancias que de alguna manera interactúan con las enzimas y modifican su actividad, disminuyendo la concentración de los productos. Se pueden clasificar en: Inhibidores enzimáticos También se puede clasificar dependiendo el mecanismo de acción del inhibidor; 1. Competitivo: Se ubica en el sitio activo y compite con el sustrato. Aumenta el km, pero no modifica la v. máxima. Es reversible. 2. No competitivo: Se ubica en otra parte de la enzima y no compite con el sustrato por el sitio activo. No modifica el km, pero disminuye la V. máxima. Es irreversible. 3. Anticompetitivo: Se unen al complejo enzima-sustrato Tipos de enzimas - Simples: Formadas solo por aminoácidos - Conjugadas: Tienen una parte proteica (apoenzima) y una parte no proteica (coenzima) Reactivos estado activo productos Reversibles Cuando lo retiramos del medio, la enzima vuelve a tomar actividad Irreversibles Produce un deterioro en la actividad enzimática pero una vez retirado la enzima no recobra su actividad Existen las llamadas enzimas alostéricas cuya afinidad puede ser modificada por la unión de sustancias conocidas como reguladores o moduladores alostéricos. Los moduladores alostéricos son sustancias producidas por la misma célula que interactúan con enzimas que se encuentran en la misma célula y modifican su actividad. También, las conocidas como isoenzimas, que son las distintas formas moleculares de una enzima, las cuales poseen igual función y diferentes propiedades físico-químicas.
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