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1 2.1. GENÉTICA DE POBLACIONES Ing. María Elisa Catalina García Salas La Molina, agosto 2020 Universidad Nacional Agraria La Molina Facultad de Zootecnia Departamento de Producción Animal Curso: ZT3007 Mejoramiento Genético del Ganado Contenido 1. Conceptos generales 2. Frecuencia génica y Frecuencia genotípica 3. Ley de Hardy – Weimberg 4. Factores que modifican la frecuencia de los genes 5. Diagrama de las relaciones de la genética de poblaciones 2 Conceptos Generales Población: Grupo de individuos que se reproducen. Genética de Poblaciones: Referencia a la constitución genética de los individuos que la componen, y a la transmisión de genes de una generación a otra. Pool de genes: Genes (y sus alelos) potencialmente contenidos por los individuos en una población mendeliana. Población Mendeliana: Grupo de individuos que contiene genes en común, independientemente de su clasificación y segregación alélica. Variación en Poblaciones Es necesario considerar lo siguiente: ¿Cuanta variación existe en una población? ¿Qué factores puedes mantener o causar los cambios en la estructura genética de la población? ¿Que causa divergencias entre las poblaciones en el espacio y tiempo.? 3 FRECUENCIA GÉNICA y GENOTIPICA El término Frecuencia Génica o Frecuencia Alélica, se refiere a si ese gen A (alelo) es relativamente abundante o escaso, Con referencia al otro gen o genes (alelo o alelos) que pueden ocupar un determinado locus. Los genotipos posibles que se pueden obtener de la combinación de un par de alelos "A" y "a", son tres genotipos: AA, Aa y aa. A estas proporciones llamamos Frecuencias genotípicas (Cardelino y Rovira, 1985; Falconer, 1981). Frecuencias de genes y genotipos. La constitución genética de una población se debe a su genotipo y podemos indicar cuanto de ese genotipo están presente en ella. La frecuencia genotípica y génica (alélica) puede ser solamente definido con respecto a una población en particular. En el sentido general: Población simplemente significa un grupo finito o infinito de individuos de la misma especie. 4 Frecuencias de genes y genotipos. Los procesos de segregación y recombinación, descritos por la ley de Mendel (que tienen como base biológica la meiosis) determinan lo que se herede sean nuevas combinaciones de los genes de ambos padres, Por lo tanto la constitución genética de un grupo, podría ser descrita por la proporción o porcentaje de los individuos que pertenecen a cada genotipo. Una población se puede representar como un proceso continuo, con un estado diploide (individuos) y uno haploide (gametos): INDIVIDUOS FASE DIPLOIDE GAMETOS FASE HAPLOIDE Fertilidad Viabilidad Selección Migración Chance Segregación Recombinación Meiosis Mutación Chance 5 Frecuencias de genes y genotipos. Supongamos dos alelos (A1 y A2), para un mismo locus A, (entendiéndose que se tiene organismos diploides). La frecuencia génica de un locus en particular entre un grupo de individuos puede ser determinado por el conocimiento de las frecuencias del genotipo. Falconer (1981) representa, la estimación de la frecuencia génica de la siguiente manera: Frecuencias de genes y genotipos. La frecuencia del gen A (alelo dominante) será: A = 120 / 200 = 0.60 (p) y la frecuencia del gen a (alelo recesivo) será: a = 80 / 200 = 0.40 (q) 6 Supongamos que en la raza Shorthorn los siguientes pelajes están determinados por un par de alelos R y r GENOTIPO FENOTIPO RR Colorado Rr Rosillo rr Blanco En un rebaño se tienen 150 colorados, 100 rosillos y 50 blancos. ¿Cuál será la frecuencia del gen colorado? Número de individuos: f(R) = frecuencia del gen R = 150 + ½ (100) = 200 = 2 ≈ 0.67 150+100+50 300 3 Número de genes: f(R) = frecuencia del gen R = 2 (150) + 100 = 400 = 2 ≈ 0.67 (2)150+(2)100+(2)50 600 3 De la misma forma se puede calcular la frecuencia del gen blanco: f(r) = frecuencia del gen r = 50 + ½ (100) = 2 (50) + 100 = 1 ≈ 0.33 150+100+50 2(150)+2(100)+2(50) 3 Las frecuencias génicas siempre se pueden calcular si se conocen las frecuencias genotípicas: f(R) = f(RR) + ½ f(Rr) = ½ +(1/2) (1/3) = 2/3 f(r) = f(rr) + ½ f(Rr) = 1/6 +(1/2) (1/3) = 1/3 La frecuencia de un gen es la suma de la frecuencia de los homocigotas que lo llevan, más la mitad de los heterocigotas para ese gen. 7 Para el caso de polimorfismo: es posible que exista para ese mismo locus más de dos alelos, Caso típico es el grupo sanguíneo en humanos, tipo ABO. Independientemente al número de alelos que pueda existir, la suma de las frecuencias, tanto génicas como genotípicas es igual a 1. LEY DE HARDY-WEINBERG “Una población de tamaño grande, sujeta al régimen de apareo al azar, y en ausencia de selección, mutación y migración, las frecuencias génicas y genotípicas permanecen constantes de generación en generación, estando las frecuencias genotípicas determinadas por las frecuencias génicas”. 8 TAMAÑO DE POBLACIÓN: Población grande, para que los fenómenos de muestreo no tengan importancia. APAREOS AL AZAR: Cualquier individuo en la población tiene la misma chance de aparearse con cualquier individuo del sexo opuesto. AUSENCIA DE SELECCIÓN, MUTACIÓN Y MIGRACIÓN: No hay ningún factor que quite, agregue o modifique los genes que posee la población. LEY DE HARDY-WEINBERG Las dos consecuencias más importantes de la ley de Hardy-Weinberg son: En una población en equilibrio, las frecuencias génicas y las frecuencias genotípicas guardan una relación matemática. Cualesquiera sean las frecuencias genotípicas iniciales, una generación de apareamientos al azar es suficiente para establecer el equilibrio. 9 Frecuencia alélica. (p + q = 1) Proporción de un alelo en particular de un gen dentro de una población. Rango de 0.0 a 1.0, y la suma de ellos debe ser igual a 1.0 Frecuencia genotípica: (P + Q +H = 1) Proporción o porcentaje de individuos en una población que exhiben un particular genotipo. Rango de 0.0 a 1.0, y la suma de ellos debe ser igual a 1.0 FRECUENCIA GÉNICA y GENOTIPICA Grafica que relaciona las frecuencias génicas y fenotípicas 10 Tabla 1. Pasos para la deducción de la Ley Hardy - Weinberg, y las condiciones que debe mantenerse. Paso Deducción de: a Condiciones Frecuencia de genes en padres 1a (1) Segregación génica normal (2) Igual fertilidad en padres Frecuencia génica en los gametos 1b (3) Igual fertilidad de los gametos (4) Población grande Frecuencia génica en los gametos formando cigotes 2 (5) Apareamientos al azar (6) Igual frecuencia génica en padres Frecuencia genotípica en cigotes 3 (7) Igual viabilidad 4 Frecuencia genotípica en progenie Frecuencia génica en progenie POBLACIONES EN EQUILIBRIO Genotipo Nº Frecuencia Observada AA Aa aa N1 N2 N3 N1/N=P N2/N=H N3/N=Q Total N 1 1 p = Frecuencia del gen A. q = Frecuencia del gen a. 11 p = P + ½ H q = Q + ½ H (p+q)2 = p2 + 2pq + q2 = P + H + Q = 1 Frecuencia gamética o génica Frecuencia cigótica o genotí pica ♀ ♂ Gen A p Gen a q Gen A p AA p2= P Aa pq=1/2H Gen a q aA qp=1/2H aa q2 = Q EJEMPLO DE APLICACIÓN: El gen colorado es recesivo en el Aberdeen Angus. Supóngase que en un rodeo grande, sin selección por pelaje, bajo el sistema de apareo al azar con respecto a esta característica, nace un ternero colorado por cada 200 nacimientos. Si hacemos q igual a la frecuencia del gen colorado y si asumimos que la población está aproximadamente en equilibrio con respecto a ese locus, entonces: 07.0 200 1 200 12 qq Aberdeen Angus: El gen colorado es recesivo 12 Lo que significa que un 7% de los loci para ese par de alelos está ocupado por el gen colorado y el 93% por el gen negro. Aparentemente, la incidencia del gen colorado no es mucha, pero sin embargo si pensamos en la cantidad de animales negros que son heterocigotas, y por lo tanto portadores delgen indeseable, veremos que no son tan pocos: %1313.007.02 seao0.932pqAa f Aberdeen Angus: El gen colorado es recesivo EJEMPLO En 361 caballos se determinaron algunos genes y se encontró que 305 portaban el gen M, 52 portaban los genes MN y 4 portaban genes N Es claro que la ocurrencia de los tres genotipos no sigue la relación 1:2:1, como sería el caso si se hubiera hecho apareamientos entre individuos MN y MN. La frecuencia del alelo N es mucho más baja que la frecuencia de su alelo M. 13 Genotipos Nº de individuos Número de Genes M Genes N MM MN NN 305 52 4 610 52 0 0 52 8 Totales 361 662 60 082.0 918.0 722 60 NgendelFrecuencia 722 662 MgendelFrecuencia Frecuencia de los genes M y N de los caballos Tabla: Disponibilidad de la prueba de SNP, tipo de prueba usada, número de genotipos hallados en las pruebas de haplotipo y SNP 14 TAMAÑO DE POBLACIÓN: Cuantos más animales tengamos para reproducir, mayores serán las probabilidades de lograr nuevas y mejores combinaciones de genes en los animales que nacen. Además, al tener mayor cantidad de animales, las oportunidades para practicar la selección serán mayores. 4.- FACTORES QUE MODIFICAN LA FRECUENCIA DE LOS GENES 15 MUTACIONES: Supongamos que una población es completamente homocigótica para el gen A, es concebible que la producción de nuevas generaciones de individuos, este gen puede mutar a a. Para que las mutaciones tengan mucho efecto en el cambio de frecuencia de genes, deben producirse frecuentemente y deben tener una ventaja selectiva para el nuevo gen. El punto en que la eliminación de un gen es igual a su reemplazo por mutación se llama equilibrio de mutación. Si suponemos que antes que ocurra la mutación, la frecuencia del gen A es 0.80 y la mutación de A en a ocurre en doble porcentaje que en la dirección opuesta, el equilibrio de mutación será finalmente alcanzado. El cambio en la frecuencia de los genes es hacia a un nivel más alto del alelo a. Si la frecuencia del alelo a se vuelve al doble que la del alelo A, el cual mutaba con doble rapidez, existirá un estado de equilibrio de los alelos en la población. MUTACIONES: 16 MANEJO DE LOS RECESIVOS EN LA POBLACIÓN MacArthur 2012. El genoma humano contiene 100 mutaciones de perdidas de funciones y 20 genes completamente inactivados -> -> -> probablemente es similar en el ganado Figura 2. Número de copias de haplotipos recesivos en lor toros genotipados (barras blancas) y vacas (barras grises) Ningún toro tuvo mas de 5 haplotipos recesivos. Es fácil reducir la frecuencia de un alelo perjudicial en una población bajo selección, pero es extremadamente difícil eliminarlo completamente de la población ( Lush, 1945). Los portadores conocidos pueden ser eliminados de la población, pero en la práctica es más común evitar los apareamientos de portador a portador porque los toros portadores pueden tener un gran mérito genético para los rasgos económicamente importantes. SELECCIÓN La selección significa que a los individuos que poseen ciertos caracteres se les hace reproducirse con mayor rapidez que a otros individuos en la misma población. Esto causa un aumento en la frecuencia de algunos genes y una disminución en la frecuencia de otros. Una de las diferencias principales entre las razas es que difieren en la frecuencia de los genes apara ciertos caracteres. 17 MEZCLA DE POBLACIONES Cuando un grupo de individuos emigra a otra parte del país y se cruza con los nativos de la región, ocurre un cambio en la frecuencia de los genes en la población Si ambos grupos difieren originalmente en la clase de genes que poseen para un carácter particular. DERIVA GENÉTICA Las fluctuaciones en el cambio de genes pueden ser importantes, especialmente en las poblaciones pequeñas. Wright lo ha llamado Deriva Genética al azar. Supongamos que de un gran hato de vacunos, algunos de los cuales poseen cuernos y otros no lo tienen, seleccionamos un toro y 4 vacas para cría. 18 Si no ponemos atención a que sean con cuernos o sin ellos, es enteramente posible que por casualidad seleccionemos animales cornudos. El nuevo hato desarrollado de estos progenitores podría ser muy diferente de la población original en la frecuencia de los genes para cuernos o para el estado mocho. Aun en grandes poblaciones, los genes pueden quedar fijados o perderse enteramente al azar. DERIVA GENÉTICA La extensión de la genética mendeliana dentro de la genética cuantitativa puede ser hecha en dos etapas: a) Introducir nuevos conceptos relacionado con las propiedades genéticas de la población. b) Introducir conceptos relacionado con las medidas de la herencia. Relación de Genética Mendeliana - Cuantitativa 19 Por el lado experimental, la genética cuantitativa tiene tres roles, complementarios a la teoría. a) El estudio experimental de las poblaciones nos permite comprender las propiedades de los genes asociados con la variación cuantitativa. b) La mejora experimental nos permite probar la validez de la teoría. c) Hay algunas consecuencias de los procedimientos de mejora que no puede ser predicho por la teoría, y las preguntas acerca de éstos pueden ser contestadas solamente por la experimentación. Roles de la Genética Cuantitativa 5.-Diagrama de las Relaciones en la Genética de Poblaciones Mutación Migración Deriva Genética Selección Ligamento Sistema de apareamiento Frecuencia Alélica Distribución conjunta (Joint distribution) Genotipo: Orden genotípico Media poblacional Varianza genotípica Ambiente: Varianza ambiental Fenotipo: Media poblacional Varianza Fenotípica
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