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Micrografía electrónica de un gen de rRNA eucariótico en proceso de transcripción
Bacterial Yeast
Las RNA pol de eucariotas y procariotas tienen estructuras similares
Los genes de rRNA presentan promotores diferentes a los de mRNA
Iniciación de la 
transcripción 
de genes de 
rRNA
Los genes transcriptos por la Pol III tienen distintos tipos de promotores
En genes de tRNA, 
el primer factor que 
se une es TFIIIC
En los genes de rRNA 5S 
hace falta la unión previa 
de TFIIIA
El elemento más común presente en los promotores de pol II 
es la TATA-box
El CTD de la polimerasa II es mucho más extenso que 
el cuerpo de la polimerasa
La fosforilación del 
CTD le permite a la 
polimerasa II pasar a 
la etapa de 
elongación 
Composición de los factores de transcripción generales de la Pol II
Además de la TATA box, los promotores de genes 
eucariotas están constituidos por un número variable de 
secuencias de ADN
Estas secuencias se hallan esparcidas en grandes 
distancias y son requeridas para la correcta transcripción 
de los genes
Esquema de un gen eucariota típico
Los distintos elementos son unidos por factores de 
transcripción específicos
a N stands for any nucleotide.
Transcription factor Consensus binding site
Specificity protein 1 (Sp1) GGGCGG
CCAAT/Enhancer binding protein (C/EBP) CCAAT
Activator protein 1 (AP1) TGACTCA
Octamer binding proteins ATGCAAAT
(OCT-1 and OCT-2)
E-box binding proteins (E12, E47, E2-2) CANNTGa
Los factores de transcripción reconocen secuencias específicas de ADN
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=cooper.glossary.2886#3390
El reconocimiento se da por interacciones entre aminoácidos y las 
bases del ADN
Muchos factores de transcripción tienen dominios de 
activación de la transcripción
Los dominios de activación interaccionan con la maquinaria de 
transcripción basal
Las proteínas unidas a los enhancers interaccionan a grandes distancias 
debido a curvaturas en el ADN
Algunos factores 
de transcripción 
actúan como 
represores
Se forma un gran complejo transcripcional estabilizado por uniones 
proteína-ADN y proteína-proteína
Las interacciones suelen estar mediadas por un gran complejo 
proteico denominado “mediator” que interacciona con la pol II y los 
factores de transcripción generales
La regulación de la interacción de diversos factores de transcripción 
con sus secuencias de unión permite la regulación de la expresión de 
los genes
La “actividad” de los factores de transcripción puede ser regulada 
de distintas maneras
La fosforilación puede regular la actividad de los factores de transcripción
•CREB can be phosphorylated
 
by Protein
 
kinase
 
A:
•When
 
CREB is
 
phosphorylated, CBP can bind
 
to
 
it
 
and
 
form
 
a bridge
 
to
 
the
 
basal transcription
 
machinery
 
to
 
activate
 
transcription.
La unión de ligandos puede modificar la ubicación del factor de 
transcripción en la célula
Algunos factores 
de transcripción 
son inhibidos por 
proteínas que se 
desunen o 
degradan ante 
determinados 
estímulos
El ADN no está siempre accesible
La accesibilidad puede ser diferente en distintas regiones del genoma
La estructura de la 
cromatina es 
modificada por 
proteínas que 
interactúan con las 
histonas
Las histonas pueden ser modificadas covalentemente
Algunos activadores actúan provocando la acetilación de histonas
Algunos represores actúan provocando la desacetilación de histonas
Las “colas” de las histonas pueden sufrir muchas modificaciones
Metilaciones asociadas con 
cromatina activa e inactiva
Proteínas capaces de reconocer histonas modificadas
La proteína HP1 se une a 
cromatina con H3K9me
Metilación del ADN
-En eucariotas, ocurre en la posición 5 de citosinas, en dinucleótidos CpG
-Ocurre en ambas hebras del ADN
-Está catalizada por DNA metiltransferasas (DNMT)
-Algunas metilasas catalizan la metilación de novo del ADN
-Otras metilasas mantienen el patrón de metilación durante la replicación
Existen modificaciones epigenéticas características de la heterocromatina
En promotores activos existe una menor densidad de nucleosomas
Posicionamiento y características de los nucleosomas 
presentes en un gen transcripto
Durante la 
transcripción, los 
nucleosomas son 
reciclados
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