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Micrografía electrónica de un gen de rRNA eucariótico en proceso de transcripción Bacterial Yeast Las RNA pol de eucariotas y procariotas tienen estructuras similares Los genes de rRNA presentan promotores diferentes a los de mRNA Iniciación de la transcripción de genes de rRNA Los genes transcriptos por la Pol III tienen distintos tipos de promotores En genes de tRNA, el primer factor que se une es TFIIIC En los genes de rRNA 5S hace falta la unión previa de TFIIIA El elemento más común presente en los promotores de pol II es la TATA-box El CTD de la polimerasa II es mucho más extenso que el cuerpo de la polimerasa La fosforilación del CTD le permite a la polimerasa II pasar a la etapa de elongación Composición de los factores de transcripción generales de la Pol II Además de la TATA box, los promotores de genes eucariotas están constituidos por un número variable de secuencias de ADN Estas secuencias se hallan esparcidas en grandes distancias y son requeridas para la correcta transcripción de los genes Esquema de un gen eucariota típico Los distintos elementos son unidos por factores de transcripción específicos a N stands for any nucleotide. Transcription factor Consensus binding site Specificity protein 1 (Sp1) GGGCGG CCAAT/Enhancer binding protein (C/EBP) CCAAT Activator protein 1 (AP1) TGACTCA Octamer binding proteins ATGCAAAT (OCT-1 and OCT-2) E-box binding proteins (E12, E47, E2-2) CANNTGa Los factores de transcripción reconocen secuencias específicas de ADN http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=cooper.glossary.2886#3390 El reconocimiento se da por interacciones entre aminoácidos y las bases del ADN Muchos factores de transcripción tienen dominios de activación de la transcripción Los dominios de activación interaccionan con la maquinaria de transcripción basal Las proteínas unidas a los enhancers interaccionan a grandes distancias debido a curvaturas en el ADN Algunos factores de transcripción actúan como represores Se forma un gran complejo transcripcional estabilizado por uniones proteína-ADN y proteína-proteína Las interacciones suelen estar mediadas por un gran complejo proteico denominado “mediator” que interacciona con la pol II y los factores de transcripción generales La regulación de la interacción de diversos factores de transcripción con sus secuencias de unión permite la regulación de la expresión de los genes La “actividad” de los factores de transcripción puede ser regulada de distintas maneras La fosforilación puede regular la actividad de los factores de transcripción •CREB can be phosphorylated by Protein kinase A: •When CREB is phosphorylated, CBP can bind to it and form a bridge to the basal transcription machinery to activate transcription. La unión de ligandos puede modificar la ubicación del factor de transcripción en la célula Algunos factores de transcripción son inhibidos por proteínas que se desunen o degradan ante determinados estímulos El ADN no está siempre accesible La accesibilidad puede ser diferente en distintas regiones del genoma La estructura de la cromatina es modificada por proteínas que interactúan con las histonas Las histonas pueden ser modificadas covalentemente Algunos activadores actúan provocando la acetilación de histonas Algunos represores actúan provocando la desacetilación de histonas Las “colas” de las histonas pueden sufrir muchas modificaciones Metilaciones asociadas con cromatina activa e inactiva Proteínas capaces de reconocer histonas modificadas La proteína HP1 se une a cromatina con H3K9me Metilación del ADN -En eucariotas, ocurre en la posición 5 de citosinas, en dinucleótidos CpG -Ocurre en ambas hebras del ADN -Está catalizada por DNA metiltransferasas (DNMT) -Algunas metilasas catalizan la metilación de novo del ADN -Otras metilasas mantienen el patrón de metilación durante la replicación Existen modificaciones epigenéticas características de la heterocromatina En promotores activos existe una menor densidad de nucleosomas Posicionamiento y características de los nucleosomas presentes en un gen transcripto Durante la transcripción, los nucleosomas son reciclados Slide Number 1 Slide Number 2 Slide Number 3 Slide Number 4 Slide Number 5 Slide Number 6 Slide Number 7 Slide Number 8 Slide Number 9 Slide Number 10 Slide Number 11 Slide Number 12 Slide Number 13 Slide Number 14 Slide Number 15 Slide Number 16 Slide Number 17 Slide Number 18 Slide Number 19 Slide Number 20 Slide Number 21 Slide Number 22 Slide Number 23 Slide Number 24 Slide Number 25 Slide Number 26 Slide Number 27 Slide Number 28 Slide Number 29 Slide Number 30 Slide Number 31 Slide Number 32 Slide Number 33 Slide Number 34 Slide Number 35 Slide Number 36 Slide Number 37 Slide Number 38 Slide Number 39 Slide Number 40 Slide Number 41 Slide Number 42 Slide Number 43 Slide Number 44 Slide Number 45 Slide Number 46 Slide Number 47 Slide Number 48 Slide Number 49 Slide Number 50 Slide Number 51 Slide Number 52 Slide Number 53 Slide Number 54 Slide Number 55 Slide Number 56 Slide Number 57 Slide Number 58 Slide Number 59 Slide Number 60 Slide Number 61 Slide Number 62 Slide Number 63 Slide Number 64