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QUÍMICA BIOLÓGICA La química biológica es la ciencia que estudia los constituyentes químicos de las células vivas, y las reacciones químicas que experimentan RUTAS METABOLICAS Y RUTAS DE TRANSFERENCIA DE ENERGIA -Metabolismo- El metabolismo comprende la suma de las transformaciones químicas que se produce en una célula o en un organismo, y que son catalizadas enzimáticamente en una secuencia ordenada de pasos, los cuales constituyen las rutas metabólicas. Cada paso de una ruta ocasiona un cambio químico específico, normalmente la eliminación, transferencia o adición de un átomo o grupo funcional. Las rutas metabólicas pueden seguir diferentes secuencias: lineales, ramificadas, y cíclicas Las funciones específicas del metabolismo son: 1. Obtención de energía química de las moléculas combustibles o de la luz solar absorbida. 2. Conversión de los nutrientes exógenos en precursores de los componentes macromoleculares de la célula. 3. Ensamblaje de estos materiales para formar biomoléculas. 4. Metabolizar macromoléculas necesarias para funciones especializadas de las células. El metabolismo pueden dividirse en: 1) rutas catabólicas responsables de la degradación de las moléculas exógenas o de reserva del organismo, lo que va acompañado de la liberación de energía química y de su conversión en forma de ATP y transportadores FUENTES DE NUTRIENTES PARA EL METABOLISMO F. ENERGIA F. CARBONO F. HIDROGENO F. OXIGENO F. NITROGENO F. AZUFRE Y P Energía química asociada a reacciones de óxido-reducción (Quimiotrofos) Energía lumínica (Fototrófos) Compuestos orgánicos (Heterótrofos) CO2 (Autótrofos) Agua, H2, H2S O2 molecular Principalme nte proteínas y Ácidos nucleicos. NH3 H2S, H3PO4 y compuestos fosforilados. electrónicos reducidos (NADH, NADPH, FADH2); 2) rutas anabólicas son por las cuales se efectúa la biosíntesis de los componentes celulares, la cual precisa un consumo de energía química aportada por el ATP y cofactores reducidos generados en la ruta anterior; 3) rutas anfibólicas puede desempeñar ambas funciones. El catabolismo y anabolismo se desarrollan simultáneamente y de modo concurrente en las células, pero son regulados de forma independiente, es decir, cuando una tiene lugar la otra está suprimida. Tal regulación no podría tener lugar si ambas rutas estuviesen catalizadas por el mismo conjunto de enzimas, operando en una dirección para la ruta catabólica y en dirección opuesta para la anabólica, ya que la inhibición de una ruta también inhibiría la otra. No obstante, ambas rutas podrían estar catalizadas por algunas enzimas en común, pero al menos uno de los pasos están catalizados por enzimas diferentes, siendo estos los sitios de regulación específicos. Como una contribución más a la regulación independiente de ambas rutas podemos destacar que: 1. Las reacciones que son específicas de cada dirección deben incluir por lo menos una que sea termodinámicamente favorable (no reversible). 2. Las rutas se dan frecuentemente en compartimientos celulares diferentes. 3. Regulación de enzimas específicas de una ruta metabólica mediante el control del número de moléculas (largo plazo) y la actividad catalítica de la enzima (corto plazo). Cada ruta está constituida por una secuencia de reacciones consecutivas catalizadas enzimáticamente. Estos sistemas multienzimáticos actúan normalmente de modo secuencial, catalizando reacciones consecutivas conectadas por intermediarios comunes, de modo que el producto de la primera enzima es sustrato de la otra y así sucesivamente. En la organización de los sistemas multienzimáticos podemos distinguir tres niveles de complejidad: 1) las enzimas están disueltas en el citoplasma como moléculas independientes, no asociadas unas con otras (Ej. Enzimas de la glucólisis) 2) las enzimas están físicamente asociadas formando complejos multienzimáticos (Ej. Complejo de la ácido graso sintasa) 3) la mayor complejidad son los sistemas que se hallan asociados a grandes estructuras supramoleculares como las membranas o los ribosomas (Ej. Cadena transportadora de electrones). División de Procesos catabólicos: DIGESTIÓN Y ABSORCIÓN (Etapa I): las proteínas son digeridas a aminoácidos (AA), polisacáridos a monosacáridos, lípidos a glicerol y ácidos grasos. Luego cada elemento es absorbido a nivel intestinal. CATABOLISMO (Etapa II): luego entran en la segunda fase, que es la conversión de AA, monosacáridos, ácidos grasos, en Acetil-CoA. CICLO DE KREBS (Etapa III): aquí los átomos de C de Acetil-CoA se transforman en CO2 y los H formarán cofactores reducidos, que ingresan a la cadena respiratoria para formar una gran cantidad de ATP. ATP: LA MONEDA ENERGÉTICA Estructuralmente el ATP (Adenosin trifosfato) es un ribonucleótido que posee tres grupos fosfato unidos mediante enlaces fosfodiester al C5 de la ribosa. A pH 7, tanto el ATP como ADP son aniones muy cargados que se hayan presentes en gran parte como complejos con el Mg2+ debido a la alta afinidad de los aniones pirofosfato por los cationes divalentes y debido a las altas concentraciones intracelulares del catión. Cabe destacar que en la mayor parte de reacciones enzimáticas en las que el ATP participa como dador de fosfato, su forma activa es el complejo MgATP2-. El ATP se genera a partir del ADP mediante reacciones de fosforilación acopladas a expensas de la energía que se libera en la degradación de las moléculas combustibles. Al mismo tiempo, el ATP cede su grupo fosfato terminal a moléculas aceptoras específicas que resultaban activadas energéticamente, siendo capaces de efectuar diversas funciones que precisan de energía en la célula; como por ejemplo, la biosíntesis de las macromoléculas (trabajo químico), el transporte activo (trabajo osmótico) y la contracción muscular (trabajo mecánico). Aunque el sistema del ATP-ADP es el transportador obligatorio de grupos fosfatos en el flujo principal de transferencia de la energía celular, intervienen también en dicha transferencia otros ribonucleósidos y desoxirribonucleósidos, tales como UTP, GTP, dATP, etc. NADH, FADH2 Y NADPH: MEDIADORES DE LAS REACCIONES DE OXIDO-REDUCCIÓN BIOLÓGICAS La transferencia de grupos fosfato es una de las características centrales del metabolismo. De igual importancia es la transferencia de electrones. En los organismos no fotosintéticos, la fuente de electrones son compuestos reducidos (alimentos); en los organismos fotosintéticos, el dador de electrones inicial es una especie química excitada por la absorción de luz. En el metabolismo la ruta de transporte de electrones es compleja. Los electrones pasan desde diversos intermediarios metabólicos a transportadores de electrones especializados (NAD+, FAD+ Y NADP+) en reacciones catalizadas enzimáticamente. A su vez, los transportadores reducidos (NADH, FADH2 Y NADPH), ceden electrones a aceptores con mayor afinidad por ellos, liberando energía. En las oxidaciones biológicas interviene con mucha frecuencia la deshidrogenación.