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UNIDAD III Bioenergética BIOENERGÉTICA La vida depende del flujo de energía constante procedente de las reacciones termonucleares que tienen lugar en el núcleo solar. Una pequeña fracción (menos del 1%) de la energía solar que llega a la Tierra se transforma, por medio de procesos que ocurren en plantas y otros organismos fotosintéticos, en la energía que impulsa todos los procesos vitales. Los sistemas vivos transforman la energía radiante del Sol en distintos tipos de energía, entre ellos, química y mecánica, que a su vez, son utilizados por todo ser vivo. En los organismos vivos, las funciones vitales se llevan a cabo a través de numerosos mecanismos que involucran millones de reacciones químicas. A estos mecanismos, en su conjunto, se los denomina “metabolismo”. METABOLISMO Como mencionamos anteriormente, en los organismos vivos, las funciones vitales se llevan a cabo a través de numerosos mecanismos que involucran millones de reacciones químicas. A estos mecanismos, en su conjunto, se los denomina “metabolismo”. A través del mismo, la célula se construye a sí misma. El total de reacciones químicas involucradas en la biosíntesis de sus partes estructurales y funcionales, recibe el nombre de anabolismo. Decimos entonces, que el anabolismo está formado por todas las reacciones de síntesis que consumen energía. Para que las células puedan construir y ejecutar funciones especificas y de mantenimiento, es necesario que degraden moléculas de las cuales obtienen energía y los materiales necesarios para impulsar las reacciones anabólicas. A esta actividad química, se la conoce como catabolismo. Decimos entonces, que el catabolismo está formado por todas las reacciones de degradación que liberan energía y materia prima. Las células, como maquinarias transformadoras de energía, son el lugar en donde se llevan a cabo miles de procesos. En sus estructuras se realizan de manera coordinada, miles de reacciones químicas diferentes, muchas de las cuales ocurren de manera simultánea. Al conjunto de reacciones, agrupadas en una serie ordenada de pasos, se las conoce como”vías metabólicas”. Cada vía, puede estar formada por una docena o más de reacciones secuencial y cumple una función determinada en la vida de la célula o del organismo. Muchas de ellas incluso, convergen en algún punto. Estas reacciones secuenciales, pueden llevarse a cabo más fácilmente y más rápido, gracias a la acción de ciertas proteínas, denominadas “enzimas” ENZIMAS Para que dos moléculas reaccionen deben poseer una energía adecuada, denominada energía de activación, a fin de chocar con suficiente fuerza para superar su repulsión mutua y debilitar los enlaces químicos existentes. Las enzimas son catalizadores biológicos, encargadas de modificar la velocidad de una reacción química, disminuyendo la energía de activación, sin sufrir un cambio permanente en su proceso. La mayoría de las enzimas son proteínas globulares de gran tamaño formadas por una o más cadenas polipeptidicas, las cuales se encuentran plegadas de forma tal que dejan lugar a un surco o bolsillo, denominado “sitio activo”, en el cual se unen las moléculas de sustrato específicas y ocurren las reacciones químicas. Es importante aclarar, que diferentes enzimas catalizan diferentes reacciones químicas. La selectividad con que se producen las interacciones entre la enzima y su sustrato depende de un reconocimiento estereoespecifico, es decir, reconocimiento de formas entre el sitio activo y el/los sustratos. La relación del sustrato con el sitio activo es similar a la unión de la llave con su cerradura. Sin embargo, estudios posteriores revelaron que el sustrato puede alterar la conformación de la enzima, induciendo un ajuste entre el sitio activo y el sustrato. Este ajuste inducido crea tensión entre las moléculas, facilitando el curso de la reacción. REGULACION DE LA ACTIVIDAD ENZIMATICA Interacciones Alostericas: ocurren en aquellas enzimas que poseen 2 sitios de unión: el sitio activo y el sitio de regulación, al cual se une una segunda molécula conocida como efector alosterico. La unión del mismo, altera la conformación de la enzima, modificando su sitio activo y así, activando o inactivando a la misma. Inhibidor competitivo: algunos compuestos inhiben la actividad enzimática, ocupando temporalmente el sitio activo de la enzima; esta forma de regulación se conoce como inhibición competitiva, dado que el compuesto regulador y el sustrato compiten para unirse al sitio activo. Esta inhibición es totalmente reversible. Inhibidores no competitivos: en ésta, el compuesto inhibitorio se une a la enzima en un sitio de la molécula distinto del sitio activo, cambiando la conformación de la misma. Inhibidores irreversibles: en este caso, algunas sustancias se unen de manera irreversible y permanente al sitio activo de la enzima Efectos del pH y la temperatura sobre la actividad enzimática Efecto de la temperatura: Cada enzima posee una temperatura óptima para actuar. Cambios en la misma, inducen modificaciones en la estructura de la enzima, alterando su funcionamiento Efecto del pH: Cada enzima posee un pH óptimo para actuar. Cambios en el misma, inducen modificaciones en la estructura de la enzima, alterando su funcionamiento Cofactores y Coenzimas La actividad de algunas enzimas no depende de manera exclusiva de las interacciones entre el sitio activo y el sustrato. Muchas enzimas, requieren de sustancias adicionales para que puedan funcionar, las cuales se conocen como Cofactores. Entre ellos, podemos nombrar a algunos iones, por ejemplo: el ion Mg++ es indispensable en aquellas enzimas responsables de catalizar reacciones de fosforilacion. Ciertas moléculas orgánicas no proteicas, denominadas coenzimas, también funcionan como Cofactores en reacciones enzimáticas. Estas moléculas, se unen temporaria o permanentemente a la enzima, bastante cerca del sitio activo. Algunas funcionan como aceptores de electrones en reacciones REDOX, acompañados de un ion hidrogeno, el cual luego es transferido a otra molécula. Entre las coenzimas más abundantes, encontramos el NAD (nicotinamida adenina dinucleotido), fundamental en la glucolisis y respiración celular. El NAD+ (nicotinamida adenina dinucleótido) es un derivado de la vitamina niacina que actúa siempre como coenzima de deshidrogenasas, transportando un átomo de H más un electrón (dos e- en total) y liberando un H+. ATP: LA MONEDA ENERGETICA DE LA CELULA En las vías metabólicas, se acoplan reacciones que liberan energía (exergónicas) y que absorben energía (endergónicas). Las primeras, aportan la energía libre necesaria para que ocurran las endergónicas. Una gran proporción de esta energía proviene de una sola molécula: ADENOSIN TRIFOSFATO ó ATP. Esta molécula está formada por una base nitrogenada (adenina), un azúcar pentosa (ribosa) y tres grupos fosfato, unidos por enlaces de alta energía (covalentes). Estos enlaces pueden romperse con facilidad, liberando una cantidad adecuada de energía. Cuando un grupo fosfato es hidrolizado, la molécula de ATP da lugar a una nueva molécula: ADP (adenosin difosfato) más un grupo fosfato Organismos Heterótrofos y Autótrofos La energía que produjeron las primeras moléculas orgánicas, provino de una variedad de fuentes existentes en la tierra primitiva y en su atmosfera: calor, radiaciones UV y perturbaciones eléctricas. Cuando aparecieron las primeras células primitivas, o estructuras semejantes a células, requirieron un aporte continuo de energía para mantenerse, crecer y reproducirse. Los organismos modernos y las células de las cuales están compuestos pueden satisfacer sus requerimientos energéticos en una de las dos formas. Los organismos heterótrofos son aquellosque dependen de fuentes externas de moléculas orgánicas para obtener su energía y sus moléculas estructurales. En esta categoría se encuentran los animales y los hongos, así como muchos organismos unicelulares. Los organismos autótrofos, por contraste, son aquellos que se “autoalimentan”; es decir, no requieren moléculas orgánicas procedentes de fuentes externas para obtener su energía o para utilizarlas como pequeñas moléculas de tipo estructural. Estos organismos son capaces de sintetizar sus propias moléculas orgánicas ricas en energía a partir de sustancias inorgánicas simples. La mayoría de los autótrofos incluyendo las plantas y varios tipos diferentes de organismos unicelulares, realizan fotosíntesis, lo que significa que la fuente de energía para sus reacciones de síntesis es la energía solar. Ciertos grupos de bacterias, sin embargo, son quimiosinteticas; estos organismos capturan la energía liberada por reacciones inorgánicas específicas para impulsar sus procesos vitales y la síntesis de las moléculas orgánicas necesarias. Todos los heterótrofos como los autótrofos parecen estar representados entre los microfósiles más antiguos. Se ha postulado durante largo tiempo, que la primera célula viva fue un heterótrofo extremo. Sin embargo, descubrimientos recientes han planteado la posibilidad de que las primeras células hayan sido autótrofas, quimiosinteticas o fotosintéticas antes que heterótrofas. Se han descubierto varios grupos diferentes de bacterias quimiosinteticas que hubieran sido muy adecuadas para las condiciones que prevalecían en la tierra primitiva. GLUCOLISIS Y RESPIRACION CELULAR Para comprender el metabolismo de los carbohidratos que es principal proceso de obtención de energía de los seres vivos, es importante comprender primero, el mecanismo de oxidación de la glucosa. Durante el proceso de oxidación de la glucosa los enlaces C-C, C-H y O-O se rompen y se forman los enlaces C-O y O-H, liberando en consecuencia, energía. Glucosa + Oxígeno => Dióxido de Carbono + Agua + Energía C6H12O6 + 6O2=> 6CO2 + 6H2O + energía (868 Kcal/mol) Alrededor del 40% de la energía libre desprendida por la oxidación de la glucosa, se conserva en la conversión de ADP en ATP. En los sistemas vivos aeróbicos, la oxidación de la glucosa se desarrolla en 2 etapas: la primera se conoce como glucolisis (que es realizada en el citoplasma celular) y la segunda, respiración (en células eucariotas, se realiza en las mitocondrias), que a su vez se divide en: ciclo de Krebs y transporte de electrones. GLUCOLISIS La glucólisis o glicolisis (del griego glycos: azúcar y lysis: ruptura), es la vía metabólica encargada de oxidar o fermentar la glucosa y así obtener energía para la célula. Ésta consiste de diez reacciones enzimáticas que convierten a la glucosa en dos moléculas de piruvato, la cual es capaz de seguir otras vías metabólicas y así continuar entregando energía al organismo. Es la vía inicial del catabolismo (degradación) de carbohidratos , y tiene tres funciones principales: http://www.profesorenlinea.cl/Ciencias/Glucosa.html 1.- La generación de moléculas de alta energía ( ATP y NADH ) como fuente de energía celular en procesos de respiración aeróbica (presencia de oxígeno) y anaeróbica (ausencia de oxígeno). 2.- La generación de piruvato que pasará al Ciclo de Krebs , como parte de la respiración aeróbica. 3.- La producción de intermediarios de 6 y 3 carbonos que pueden ser ocupados por otros procesos celulares. Etapas de la glucolisis: 1. El grupo fosfato terminal se transfiere desde el ATP al C en posición 6 de la molécula de glucosa, formando glucosa-6-fosfato. 2. Formación de fructosa, dando lugar a fructosa-6-fosfato 3. La frucvtosa-6-fosfato gana un segundo fosfato que proviene de otro ATP, produciendo la fructosa-1,6-bifosfato 4. La fructosa 1,6 difosfato se rompe dando lugar a dos moléculas de 3 carbonos: dihidroxiacetona fosfato y gliceraldehido fosfato. A partir de aquí, consideramos que son 2 las moléculas de gliceraldehido fosfato participantes, ya que la dihidroxiacetona fosfato, se convierte en gliceraldehido fosfato por acción de una enzima isomerasa. 5. Cada molécula de gliceraldehido se oxida (pierden átomos de H con sus electrones) y NAD+ se reducen a NADH + H+. Un ion fosfato se une a la posición 1 de cada molécula de gliceraldehido. 6. El fosfato se libera de cada molécula de bifosfoglicerato, reaccionando con una molécula de ADP y dando como resultado ATP 7. El grupo fosfato remanente se transfiere de una posición 3 a una posición 2 8. Se elimina una molécula de H2O (por cada molécula de gliceraldehido), dando origen al fosfoenol piruvico 9. El fosfato se transfiere a una molécula de ADP, formando otra de ATP, originando el acido piruvico o piruvato En síntesis: Glucosa + 2ATP + 4ADP + 2Pi + 2NAD+ 2 Ácido pirúvico + 2ADP + 4ATP + 2NADH + 2H+ + 2H2O Las dos moléculas de acido piruvico, pueden seguir 2 caminos: en presencia de oxigeno, seguirá una vía aerobia o en ausencia del mismo, seguirá una vía anaerobia. EN PRESENCIA DE OXIGENO: Cuando hay O2 disponible, la siguiente etapa de la degradación de la glucosa implica la oxidación progresiva del acido piruvico a CO2 y H2O, proceso conocido como respiración RESPIRACION Como indicamos anteriormente, la respiración celular tiene dos etapas: ciclo de Krebs y transporte de electrones. Ambas reacciones se desarrollan dentro de la mitocondria, y durante las mismas se genera el 95% del ATP producido por las células. Luego de la generación de acido piruvico, cada molécula es transportada desde el citoplasma celular hacia la matriz mitocondrial. Allí, cada molécula de acido piruvico producido durante la glucolisis es oxidado, generando una molécula de CO2, un grupo acetilo y NADH. Cada grupo acetilo es unido momentáneamente a la Coenzima A, formando acetil-CoA. Este compuesto, es el nexo entre la glucolisis y el ciclo de Krebs. Por lo tanto, cada molécula de glucosa original, se ha oxidado a dos moléculas de CO2, 2 grupos acetilo y 2 moléculas de NADH (sólo en la oxidación de piruvato) Piruvato + NAD+ + Coa Acetil Coa + NADH + H+ + CO2 CICLO DE KREBS Al entrar en el ciclo de Krebs, el grupo acetilo de 2 carbonos (liberado de la Coenzima A) se combina con el acido oxalacetico de 4 carbonos, produciendo un compuesto de 6 carbonos, el acido cítrico. En el curso de este ciclo, 2 de los 6 carbonos del acido cítrico se oxidan a CO2. Parte de la energía liberada durante el ciclo. E sutilizada en la conversión de ADP a ATP (una molécula por ciclo), y otra parte es usada para la producción de NADH + H+ a partir de NAD+ (tres moléculas por ciclo). Otra parte de la energía es utilizada en la reducción de otro transportador de electrones, la molécula de FAD (Flavina adenina dinucleotido), generando cada ciclo 1 moléculas de FADH2 a partir de FAD. Es importante destacar que el ciclo de Krebs no requiere de la participación del O2, ya que los electrones y protones eliminados durante la oxidación son aceptados por el NAD+ y el FAD. El rendimiento energético provisto entonces, por el Ciclo de Krebs, por cada molécula de glucosa (que rinde 2 de acido piruvico) es: 2 ATP, 6 NADH + H+ y 2 FADH2 Es importante destacar, que el ciclo de Krebs es un importante centro integrador de vías de síntesis y degradación. Además de glucosa, otros carbohidratos, los lípidos y las proteínas cuando son degradados dan lugar a intermediarios que directamente pueden ingresar al ciclo para producir energía. Así mismo muchos de los intermediarios de la glucólisis y del ciclo de Krebs pueden servir para sintetizar glúcidos, proteínas, lípidos y ácidos nucleídos. TRANSPORTE DE ELECTRONES La molécula de glucosa original ya esta oxidada completamente,parte de su energía se uso en la conversión de ADP a ATP. Sin embargo, la mayor parte de la energía almacenada permanece en los electrones aceptados por NAD+ y FAD, que se redujeron a NADH y FADH2. Estos electrones se encuentran en un nivel energético alto y son conducidos a un nivel energético inferior a través de reacciones de oxidorreduccion, que constituyen la cadena transportadora de electrones, ubicada en las crestas mitocondriales. Esta cadena, está compuesta por complejos enzimáticos unidos a moléculas de citocromos, gracias a las cuales, las enzimas pueden catalizar las reacciones de oxidorreduccion. Cada citocromo posee estructura diferente, lo que le permite captar electrones con diferentes niveles energéticos. Estos electrones son aceptados por un átomo de hierro, presente en cada citocromo. A medida que los electrones son cedidos, el transportador se oxida y a la vez se reduce el aceptor siguiente. Los electrones del NADH son cedidos a FMN ya que tienen un nivel energético superior y los electrones de FADH2 son cedidos a CoQ, dado que está en un nivel energético inferior. Por último, los electrones son aceptados por el O2 que entonces se combina con protones (H+) presentes en el medio, produciendo H2O. Cuando los electrones se mueven por la cadena, saltando a niveles energéticos inferiores, se libera energía, la cual es utilizada por la mitocondria para producir ATP a partir de ADP + Pi, en un proceso llamado fosforilacion oxidativa. Este proceso es favorecido, gracias a un gradiente de H + establecido en la membrana interna mitocondrial. Los componentes de la cadena de electrones están dispuestos sobre la membrana interna de la mitocondria, la mayoría de los cuales, están en intima asociación con proteínas integrales de membrana. En tres puntos de la cadena, la energía liberada durante el pasaje de electrones, se utiliza para bombear H+ desde la matriz hacia el espacio entre las membranas internas y externas. Este transporte, genera una diferencia de concentración de H+ (es mayor en el espacio intermembranoso) y una diferencia de cargas eléctricas, quedando la matriz más negativa y el espacio intermembranoso mas positivo. Ambos efectos, generan un gradiente electroquímico, llamado fuerza protón-motriz, que impulsa a los protones de nuevo al interior de la matriz a través de un complejo proteico especifico, la ATPsintetasa, ubicado en las crestas mitocondriales y encargado de acoplar el movimiento de H+ a la síntesis de ATP EN AUSENCIA DE OXIGENO Si no hay O2 en el medio, el ácido piruvico puede convertirse en etanol o en ácido láctico. Esta vía, en la que el aceptor final de la oxidación de la glucosa es un compuesto diferente al O2, se denomina vía anaeróbica. La formación de etanol a partir de la glucosa, se denomina fermentación alcohólica, mientras que la formación de ácido láctico a partir de glucosa, se denomina fermentación láctica. Ésta última, ocurre en varios microorganismos y células animales, donde la presencia de O2 es escasa. Por ejemplo, ocurre en las células musculares durante ejercicios intensos. Si bien la frecuencia respiratoria es aumentada y por consiguiente, la entrada de O2, ésta no es suficiente para satisfacer todos los requerimientos del organismo. Sin embargo, las células musculares continúan trabajando, la glucolisis continua, pero el acido piruvico resultante no ingresa en el ciclo de Krebs. En su lugar, se convierte a acido láctico el cual disminuye el pH del medio, de modo que las fibras musculares no pueden trabajar y produce fatiga muscular. REGULACION DE LA GLUCOLISIS Y LA RESPIRACION CELULAR Este proceso se lleva a cabo mediante el control de la actividad de las enzimas que participan en puntos clave de ambos procesos. • Fosfofructoquinasa: esta enzima, presente en la glucolisis, es inhibida por altas concentraciones de ATP • Citrato sintasa: enzima presente en ciclo de Krebs y es inhibida alostericamente por el ATP En el caso de la fosforilacion oxidativa, depende de la disposición de ADP. Si las células tienen poca demanda de ATP, ya no habrá ADP disponible y por lo tanto el flujo electrónico disminuirá.
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