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Unidad 1: Biosíntesis de Estructuras Superficiales En esta Unidad estudiaremos los aspectos relevantes de la síntesis de estructuras superficiales en los microorganismos atendiendo a su diversidad en los tres dominios de la vida. • Pared celular Bacteriana Biosíntesis de mureína. Biosíntesis de acido teicoicos Biosíntesis del lipopolisacárido (LPS) • Pared celular en Archaeas Composición de los diferentes tipos de pared celular. • Pared celular en Hongos Composición de la pared celular en hongos filamentosos y unicelulares Biosíntesis de Quitina Biosíntesis de Glucanos Parte I. Biosíntesis de estructuras superficiales. Bacterias y Archaeas PM: membrana plasmática Pr: proteína Pl: fosfolípido Gl: glicolípido PG: peptidoglucano; SP: polisacáridos; Pw: proteína adherida no covalentemente aLTA: ácido lipoteicoico acilado; dLTA: ácido lipoteicoico deacilado LTAt ácido lipoteicoico en proceso de secreción; W: restos de pared celular Pg: proteína globular; Pe: proteína; B: flagelo Saliendo del clásico esquema de la Pared celular bacteriana Si sabemos de que está compuesta la pared celular bacteriana, sabremos que requiere para sintetizarla…… Se considera la unidad química de mureína o peptidoglucano (es un disacárido tetrapéptido) Esta unidad se repetirá formando la estructura de la pared bacteriana FEMS Microbiol Rev 32 (2008) 149–167 La unidad de peptidoglucano dentro de la estructura de la pared Dos unidades conectadas a través de sus tetrapéptidos NAG- NAM l T NAG-NAM l T Pero… ¿todas las bacterias tendrán la misma composición de peptidoglucano?? Atención! El tetrapéptido asociado al ácido N-acetil Murámico es variable, sobre todo a nivel del tercer aminoácido ¿Cómo se inicia la construcción de esta pared? 1. Glutamina:fructosa 6P aminotransferasa 2. Glucosamina P transacetilasa 3. N-acetil glucosamina fosfomutasa 4. UDP-Nacetil glucosamina pirofosforilasa 5. Enoil piruvato transferasa 6. UDP-Nacetil enolpiruvoilglucosamin a reductasa Fructosa, molécula precursora Sintetizando cada unidad de peptidoglucano en el citoplasma Para que se enlace a la pared pre-existente por fuera de la membrana plasmática Es llevada hacia el exterior Un lípido de membrana lo hace posible La pared celular creciendo con cada unidad añadida… http://mmbr.asm.org/content/vol63/issue1/images/large/mr0190007003.jpeg Incorporación de la unidad de peptidoglucano a la pared pre- existente El lípido-PP (ej.Bactoprenol) que trae la unidad PG se enlaza a la pared liberando el anterior Lípido-PP para su reciclado Inhibidores de la Síntesis de Peptidoglucano 1. Tunicamicina 2. Mureidomicina 3. Liposidomicina 4. Vancomicina 5. Ramoplanina 6. Risina 7. Ristocetina 8. Moenomicina 9. Mersacidina 10.Nisina 11.Penicilina 12.Beta Lactámicos 13.Bacitracina 1,2,3,4 5,6 4,7,8,9,10 11,12 13 Inhibidor NAM NAG Lip.Memb. Controlamos el crecimiento bacteriano inhibiendo la síntesis de pared Ahora hagamos un ejercicio!! Lista los antibióticos (rojo) que actúan sobre la síntesis de pared celular bacteriana ubicando el paso o la reacción donde actúan FEMS Microbiol Rev. 2008;32(2):149-167. (a) Escherichia coli (enlace directo 3–4 ); (b) S. aureus (enlace 3-4 con puente pentaglicina); (c) Curtobacterium pointsettiae (enlace 2-4 con un puente de D- ornitina); (d) Micrococcus luteus (enlace 3-4 con un puente peptídico ramificado). Enlaces peptídicos cruzados y puentes interpéptido Otra fuente de variación en la pared bacteriana: los enlaces entre unidades de peptidoglucano Otros ejemplos de unión entre tetrapéptidos en el peptidoglucano Las enzimas que posibilitan el enlace de las nuevas unidades de peptidoglucano • El crecimiento o elongación de la pared celular bacteriana ocurre cuando se van añadiendo unidades a la pared pre- existente. • Esta acción de importancia es catalizada por enzimas de acción transglucosidasa, transpeptidasa, endopeptidasa y carboxipeptidasa. • A estas enzimas se les ha dado el nombre de PBPs por sus siglas del inglés Penicillin Binding Protein, o Proteínas de Enlace a la Penicilina. • ………………Por qué llevan ese nombre?? Propiedades de las PBPs de Escherichia coli PBP Nº moléculas/ célula Actividad enzimática conocida Posibles funciones PBP 1A, 1B 1C 100 cada una Transglucosilasa/transpep tidasa Síntesis de PG durante la elongación celular PBP 2 20 Transpeptidasa Crecimiento y determinación de la forma bacilar PBP 3 50 Transglucosidasa/transpe ptidasa Síntesis de PG durante la septación (tabique) PBP 4 110 D-D-endopeptidasa/ D-Dcarboxipeptidasa Hidrólisis de los entrecruzamientos durante la elongación PBP 5 1800 D-D-carboxipeptidasa Destrucción del pentapéptido no entrecruzado ¿Por qué tantas PBPs ? ¿Por qué las acciones similares? ¿Sólo es el caso de E.coli? Observa que son diferentes estados fisiológicos!! La Penicilina G se une covalente e irreversiblemente con la transpeptidasa (PBP) PenicilinaG Pero…………… Por qué se le une si no es su sustrato natural?? Unida a la penicilina, la enzima ya no está activa en su función!! Enzima PBP TRANSPEPTIDASA Y PENICILINA Las proteinas de enlace a la penicilina (PBPs) actúan en los ultimos pasos de la síntesis de pared celular. Ellas reconocen la unidad ‘D-Ala D-Ala terminal para realizar la transpeptidación. La penicilina es estereoquímicamente similar a esa unidad y de allí que es reconocida por la PBP que se enlaza irreversiblemente a ella y se inactiva liberada Penicilina Tres últimos aminoácidos del pentapéptido Transpeptidasa β-lactamasa ¿Cómo explicarías que la Vancomicina con este mecanismo pueda inhibir tanto la transglucosidación como la transpeptidación? Diversidad de la Estructura del peptidoglucano • Existe una alta diversidad en la composición y secuencia de los péptidos del peptidoglucano en diferentes especies. • En varias especies estudiadas la fina estructura del peptidoglucano varía significativamente con las condiciones de crecimiento. • Los métodos analíticos modernos han permitido mostrar que las variaciones en la estructura del peptidoglucano pueden ocurrir en función de la edad, composición del medio, patogénesis o presencia de antibióticos. • Las futuras investigaciones deben dirigirse a determinar la arquitectura molecular del peptidoglucano en bacterias gram positivas y gram negativas. Ejm. Orientación de las cadenas de glucanos y péptidos con respecto al eje celular; patrón de distribución de los enlaces cruzados L-D; la existencia de péptidos diméricos y triméricos; los sitios de unión con otros polímeros; porosidad y elasticidad del sacculus, etc. Los Acidos Teicoicos en las paredes de las Gram positivas ¿Que son los acidos teicoicos ? ¿Cómo están compuestos? Todas las bacterias gram positivas tienen los mismos ácidos teicoicos? ¿Qué comparten? ¿En qué se diferencian? ¿Cómo se unen al peptidoglucano? ¿Cumplen alguna función? Existen ácidos ribitol-teicoicos y glicerol-teicoicos unidos al peptidoglucano y también lipoteicoicos, unidos a la membrana citoplasmática … Unidades que se repiten formando un polímero fosfatado Estructura de los ácidos teicoicos. En los ac. teicoicos de glicerol, R puede ser alanina, glucosa o glucosamina. En los ribitol teicoicos, R1 puede ser glucosa o N.acetilglucosamina, R2 y/o R3 puede ser alanina. Cada unidad siempre ligada a un grupo fosfato. Annu. Rev. Microbiol. 2013.67:313-336. Estructura de los Acidos Teicoicos Glicerol-P Enlace Peptidoglucano Los ac. teicoicos se unen covalentemente a la estructura del Peptidoglucano a través de unidades de enlace frecuentes, aún cuando existe variabilidad en ellas Unidad de enlace frecuente Síntesis de Ac. Teicoicos Los ac. teicoicos se sintetizan en el citoplasmaya con su unidad de enlace , luego se unen a un lípido de membrana (P-C55) para ser llevados al exterior y unirse al Peptidoglucano. Podemos determinar, qué pasos de la síntesis de ácidos teicoicos son comunes a la mayor parte de las bacterias gram positivas y a partir de qué pasos diverge??? Función de los Ac. teicoicos • Regulación de la forma y división celular • Regulación de la actividad de las autolisinas • Regulación de la homeostasis • Reconocimiento celular • Protección contra los mecanismos de defensa del hospedero y antibióticos Pared celular de una Micobacteria Mycobacterium tuberculosis es una micobacteria gram positiva que tiene un tipo de pared muy particular. Ubiquemos esas características particulares y pensemos en las ventajas que pueden brindarle al patógeno. Pared Celular de Micobacterias • Las Micobacterias están clasificadas como bacteria gram positivas, las formas patogénicas como las que causan tuberculosis y lepra son parásitos intracelulares. En esta ubicación inhiben la respuesta de los macrófagos a las infecciones causando apoptosis y la secreción de citoquinas. • Estas actividades dependen de los constituyentes de la pared celular como los lipoarabinomananos (manósidos de fosfatidilinositol ) que además se encuentran unidos covalentemente a los arabinogalactanos que se extienden por fuera de la superficie celular. • Los lípidoarabinomananos están también asociados con otra capa en la pared celular compuesta de ac. micólicos, un tipo de ácido graso. • Las Micobacterias están rodeadas por complejos de ac. micólico- arabinogalactano y peptidoglucano y una cápsula rica en polisacáridos de arabinomananos y mananos. Utilizan proteínas de tipo porinas para el trasnporte de moléculas hidrofílicas Superficie de una bacteria Gram negativa Cuántos distintos componentes tenemos en la membrana externa de las bacterias Gram negativas? Membrana Externa Proteínas de enlace Para amino acidos (ejm. histidina, arginina) Para azúcares (ejm. glucosa, maltosa) Para vitaminas (ejm. tiamina, vitamina B12) Para iones (ejm. fosfato, sulfato) Enzimas de biosíntesis Para ensamblaje de peptidoglucano (ejm. transglicosilasas, carboxipeptidasas, transpeptidasas) Para secreción y ensamblaje de subunidades en las fimbrias (ejm. chaperoninas) Enzimas degradativas fosfatasas proteasas Enzimas detoxificantes Beta-lactamasas (ejm. penicilinasa) Enzimas aminoglicosido-fosforilante Proteínas de periplasma en E. coli. En el Periplasma abundan las proteínas. Y tienen diferentes funciones Proteínas de la Membrana Externa de las bacterias Gram negativas Proteínas canal o porinas, permiten el paso de moléculas hidrofílicas pero con un límite de tamaño (700Da) E. coli E.coli/P. aeruginosa P. aeruginosa Nombre Regulación Presentes en OmpF Reprimidas en condiciones de alta osmolaridad externa. E. coli Salmonella OmpC Expresadas en condiciones de alta osmolaridad externa E. coli Salmonella OmpD Su expression es dependiente del tenor de cAMP Salmonella PhoE Reprimidas en condiciones de alto fosfato externo. E. coli Salmonella Porinas clásicas de E. coli y Salmonella LIPOPROTEINA: En la cisteína del extremo amino terminal de la fracción peptídica se encuentran unidos un ácido graso y un diacilglicérido. En el extremo carboxi terminal el aminoácido lisina se une al péptidoglucano. Kovacs-Simon A et al. Infect. Immun. 2011;79:548-561 Las lipoproteínas no sólo se encuentran en las bacterias gram negativas… y no siempre anclan al peptidoglucano OM: Membrana Externa PG: peptidoglucano CM: membrana citoplasmática AG: arabinogalactano ML: capa de ácido micólico C: material tipo cápsula La síntesis de la Lipoproteína paso a paso. Kovacs-Simon A et al. Infect. Immun. 2011;79:548-561 (A) Preprolipoproteina, con un péptido señal N-terminal el cual posee una secuencia consenso característica llamada lipobox . (B) Durante la maduración de la lipoproteína, el grupo tiol de la cisteína invariable del lipobox es modificada por una molécula de diacilglicérido mediante la lipoproteína diacilgliceril transferasa (Lgt), la cual sirve como un anclaje a membrana. (C) Después de esta lipidación la, lipoproteina señal peptidasa (Lsp) corta el péptido señal, dejando a la cisteína como el nuevo residuo amino terminal que formará la lipoproteina en una bacteria Gram- positiva. (D) En bacterias Gram-negativas y en algunas Gram positivas, la lipoproteína madura tendrá un ácido graso unido por enlace amida al residuo cisteína N-terminal mediante la lipoprotein N-acil transferasa (Lnt). Funciones de la Lipoproteína • Han sido identificados diferentes roles de las lipoproteínas en bacterias patógenas como Mycobacterium tuberculosis, Streptococcus pneumoniae, Borrelia burgdorferi, Haemophilus influenzae y Neisseria meningitidis, ya sea gram negativas o gram positivas. • Tienen un rol fundamental en la adhesión a las células hospederas, modulación de los procesos inflamatorios y en la translocación de factores de virulencia hacia las células del hospedero. • Se les asocia además a una función reguladora de las proteínas PBP en la síntesis de pared. LIPOPOLISACARIDO (LPS) Síntesis del Lípido A Acilación Formación del disacárido y acción kinasa Transferencia de KDO y última acilación Síntesis del Ac. 3-dioxi-D-manooctulosónico (KDO) isomerasa D-Ribulosa-5-P D-Arabinosa-5-P sintetasa D-Arabinosa-5-P + PEP KDO-8-P + Pi fosfatasa KDO-8-P KDO + Pi Estructura del LPS y sus variantes Región altamente variable Región mayormente conservada Región variable entre géneros Difrentes estructuras del Antígeno O Síntesis del Antígeno “O” y ligazón al núcleo polisacárido del LPS en S. typhimurium El antígeno O inicia su síntesis adicionando azúcares a un lípido de membrana Y finalmente se liga a la cadena oligosacárida pre-existente elongándola en una unidad y desplazando al Lipido-PP Diversidad de Estructuras de Pared Celular en Archaeas Pared celular en diversas arqueas. GC, Glicocalix ; GG, Glutaminilglucano; HP, Heteropolisacarido; LP, Lipoglucano; MC, Metanocondroitina; OCM, Membrana externa; PM, Pseudomureina; PS, Envoltura proteica; SL, Capa S. Frontiers in Microbiology. Nov. 2014 | Volume5 | Article 624 . En muchas eubacterias (sobre todo Gram-positivas) y archaeas es una estructura que envuelve a la pared celular. Puede tener capas con simetría oblicua, cuadrada o hexagonal con dimensiones en el rango de 3 a 30 nm por unidad de proteínas o glicoproteínas. Función: En muchas arqueas: – Hace las funciones de la pared celular (da forma y rigidez). En Eubacterias: – Tamiz molecular protector frente a agentes antibacterianos – Protección frente a fluctuaciones iónicas, de pH, etc – En algunas patógenas, protección frente a fagocitosis En Geobacillus stearothermophilus la glucosilación de la proteína ocurre a través de rhamnosiltransferasas… Diferentes sitios de acción de las rhamnosiltransferasas Proteína 100nm Thermoanaerobacter thermohydrosulfuricus CAPA S con clara simetría de estructuras proteicas Deinococcus radiodurans Capa S de Bacteria Capa S de Archaea (Acetogenium kivui) Aeromonas salmonicida Azotobacter vinelandii Bacillus brevis Bacillus polymyxa Bacillus sphaericus Caulobacter crescentus Clostridium aceticum (Clostridium thermohydrosulfuricum) (Clostridium thermosaccharolyticum) (Comamonas acidovorans) Delftia acidovorans = Comamonas acidovorans Deinococcus radiodurans Phormidium uncinatum Sporosarcina ureae Thermoanaerobacter kivui = Acetogenium kivui Thermoanaerobacter thermoydrosulfuricus = Clostridium thermohydrosulfuricum Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum = Clostridium thermosaccharolyticum Acidianus (Sulfolobus) brierleyi Archaeoglobus fulgidus Desulfurococcus mobilisDesulfurolobus ambivalens Halobacterium halobium (salinarum) Halobacterium volcanii Hyperthermus botylicus Methanoplanus limicola Pyrobaculum islandicum Pyrobaculum organotrophum Pyrodictium brockii Pyrodictium occultum Sulfolobus acidocaldarius Sulfolobus shibatae Sulfolobus solfataricus Staphylothermus marinus Thermococcus celer Thermoproteus tenax CAPSULA BACTERIANA COMPOSICION QUIMICA DE CAPSULAS y EXOPOLISACÁRIDOS BACTERIANOS Bacteria Composición Subunidades estructurales Bacteria Gram-positiva Bacillus anthracis polipéptido (ácido poliglutamico) Acido D-glutámico Bacillus megaterium Polipéptido y polisacárido Acido D-glutamic, amino azúcares, azúcares Streptococcus mutans polisacárido (dextrano) glucosa Streptococcus pneumoniae polisacáridos azúcares, amino azúcares, ácidos urónicos Streptococcus pyogenes polisacárido (ácido hialurónico) N-acetil-glucosamina y ácido glucurónico Bacteria Gram- negativa Acetobacter xylinum polisacárido (celulosa) glucosa Escherichia coli polisacárido (ácido colónico) glucosa, galactosa, fucosa, ácido glucurónicp Pseudomonas aeruginosa polisacárido ácido manurónico Azotobacter vinelandii polisacárido ácido glucurónico Agrobacterium tumefaciens polisacárido (glucano) glucosa Azúcares Pentosas: ribosa y arabinosa en especies de Mycobacterium Hexosas: glucosa, manosa, galactosa y fructosa. Desoxiazúcares: fucosa y ramnosa Acidos urónicos: ácido glucurónico y galacturónico Aminoazúcares: glucosamina y galactosamina frecuentemente N-acetiladas. No-azúcares N-acetil, aminoacidos, glicerol, ribitol, ac. láctico, ac. succínico entre otros Componentes generales Streptococcus pneumoniae Bacillus anthracis Streptococcus pyogenes . S. pneumoniae . La cápsula de este patógeno le permite escapar de los fagocitos en el pulmón. B.anthracis , su cápsula es igualmente antifagocítica. S. pyogenes, su cápsula es compuesta de ac. hialurónico, el mismo polímero presente en el tejido conectivo humano, por ello previene el reconocimiento de los fagocitos del sistema inmune. Producción de los polímeros bacterianos Dextranos , Levanos y Mutanos. ¿Qué uso tienen los polímeros de superficie producidos por bacterias? DEXTRANOS.- El primer uso industrial de los dextranos bacterianos fue como sustituto de plasma sanguíneo (ejm.Leuconostoc mesenteroides) . Otra de las aplicaciones es como tamiz molecular para la purificación de proteínas, ac. nucleicos y polisacáridos (ejm. Sephadex). En clínica se utiliza el dextrano hierro, para combatir la deficiencia de hierro en las anemias y el dextrano sulfato, por sus propiedades anticoagulantes similares a la heparina, y como antiviral contra el virus del dengue o el virus de la gripe. En la industria alimentaria se utilizan en cremas, productos de panadería, jarabes de fructosa y helados. Sin embargo, los dextranos no están aprobados explícitamente como aditivos alimentarios ni en Europa ni en Estados Unidos. En los últimos años se observa un aumento en el número de patentes basadas en bacterias productoras de dextrano así como en nuevas aplicaciones de los mismos como prebióticos, agentes bioactivos y/o agentes anticorrosión, en cosmética y en productos horneados. LEVANOS . Los levanos pueden ser usados como alimento o como aditivo alimentario con efectos probióticos y hipocolestererolemicos. Muestran propiedades como proliferadores celulares, humectantes de piel, anti–irritativos en piel como parte de los componentes de los cosméticos. Los derivados de levano sulfatados, fosfatados o acetilados han sido ensayados como agentes anti-SIDA. Adicionalmente son usados como material de cubierta en la formulación de medicamentos. A nivel industrial los levanos tienen variadas aplicaciones como surfactantes o como parte de sistemas de particionamiento de proteínas. MUTANOS. Los mutanos son sintetizados en la película salivaria mediante glucosiltransferasas y promueven la adherencia de las bacterias orales que colonizan la dentadura humana y que juegan un rol esencial en la acumulación de la placa dental. La investigación actual se enfoca en producir mutanasas que puedan hidrolizar este polímero y prevenir las caries