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BIOQUÍMICA BLOQUE I – BIOMOLÉCULAS 1. Concepto y contenido de la Bioquímica. Organización estructural de las células. 2. El agua: su papel biológico. 3. Glúcidos. 4. Lípidos 5. Aminoácidos y péptidos 6. Proteínas 7. Biomembranas 8. Ácidos nucleicos BLOQUE II - FLUJO DE LA INFORMACIÓN GENÉTICA BLOQUE III - BIOENERGÉTICA Y METABOLISMO Bibliografía: Cox, M.M. y Nelson, D.L (2009). (5ª edición). Lehninger. Principios de Bioquímica. Ed.: Omega. Stryer, L., Berg, J.M., Tymoczko, J.L. (2008). (6ª edición). Bioquímica. Ed.: Reverté. Feduchi, E., Blasco, I., Romero, C. y Yañez, E. (2011) Bioquímica Ed. Médica Panamericana. Mckee, T., Mckee, J.R. (2003). Bioquímica. Ed.: McGraw-Hill Interamericana. BIOQUIMICA Tema 1. CONCEPTO Y CONTENIDO DE LA BIOQUÍMICA. • Áreas de estudio • Las raíces de la Bioquímica ORGANIZACIÓN ESTRUCTURAL DE LAS CÉLULAS. •Células: procariótica y eucariótica (tipos y características) •Composición química de los seres vivos: elementos, moléculas y macromoléculas Objetivos de la Bioquímica •¿Cuáles son las estructuras químicas de los componentes de la materia viva? •¿De qué forma interactúan estos componentes para dar origen a estructuras supramoleculares organizadas, células, tejidos, órganos y organismos? • ¿Cómo extrae energía de su entorno la materia viva? • ¿De qué manera almacena y transmite un organismo la información que necesita para crecer y reproducirse? •¿Cómo se controlan las reacciones químicas en el interior de las células vivas? • BIOQUÍMICA ESTRUCTURAL • METABOLISMO • GENÉTICA MOLECULAR Áreas de la Bioquímica ¿Qué es la Bioquímica? La Ciencia que estudia la vida desde el punto de vista molecular Filogenia de los tres dominios de la vida Unicelulares Pluricelulares Unicelulares Unicelulares Características estructurales comunes de las células bacterianas (procariotas) 2 m Estructura de la célula eucariota Célula animal típica Célula vegetal típica 10-100 m 5-30 m Núcleo Mitocondria Cloroplasto Las células se agrupan en tejidos, los tejidos forman órganos y los órganos forman aparatos o sistemas, que forman en conjunto al organismo. Virus Figure 2-6 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008) Los más abundantes en todos los organismos Mucho menos abundantes, pero se encuentran en todos los organismos Metales presentes en pequeñas cantidades en todos los organismos, pero son esenciales para la vida Se encuentran o son necesarios en algunos organismos en cantidades mínimas lípidos BIOQUIMICA Tema 2. EL AGUA: SU PAPEL BIOLÓGICO. • Estructura y propiedades • El agua como disolvente de moléculas hidrófilas, hidrófobas y anfipáticas O H H Hielo Agua líquida Agrupaciones parpadeantes El agua como disolvente de moléculas: HIDRÓFILAS (se disuelven en H2O) -con grupos capaces de formar enlaces de H -compuestos iónicos HIDRÓFOBAS (no se disuelven en H2O) ANFIPÁTICAS (parte de la molécula hidrófila y parte de la molécula hidrófoba) Moléculas polares Proteína Azúcares Moléculas iónicas Hidratación de los iones en disolución NaCl Moléculas hidrófobas Estructura de clatrato que rodea a una molécula hidrófoba Agrupación de moléculas hidrofóbicas en solución acuosa Moléculas anfipáticas Interacciones de las moléculas anfipáticas con el agua monocapa micela bicapa liposoma BLOQUE I – BIOMOLÉCULAS 1. Concepto y contenido de la Bioquímica. Organización estructural de las células. 2. El agua: su papel biológico. 3. Glúcidos. 4. Lípidos 5. Aminoácidos y péptidos 6. Proteínas 7. Biomembranas y transporte 8. Ácidos nucleicos BIOQUIMICA Tema 3. GLÚCIDOS •monosacáridos: aldosas y cetosas derivados de los azúcares •oligosacáridos: disacáridos •polisacáridos de reserva y estructurales •glucoconjugados Funciones de los Carbohidratos -Almacenamiento y generación de energía: almidón, glucógeno ATP -Cofactores enzimáticos derivados de azúcares fosforilados: NAD, FAD -Componentes de los ácidos nucleicos: DNA, RNA -Elementos estructurales y de protección .paredes celulares de vegetales, bacterias y hongos .exoesqueleto de artrópodos .glucosaminoglucanos del tejido conjuntivo -Glucoconjugados: participan en el reconocimiento y la adhesión intercelular. Actúan como señales de localización intracelular o de destino metabólico. TRIOSAS Gliceraldehído (aldosa) Dihidroxiacetona (cetosa) Tautómeros aldosas cetosas Enantiómeros Tautómeros Fórmula en perspectiva Enantiómeros D-aldosas Diastereoisómeros: treosa y eritrosa Epímeros de la glucosa D-cetosas Estereoisómeros ENANTIÓMEROS: imágenes especulares no superponibles DIASTEROISÓMEROS: no especulares EPÍMEROS: diferencia en la configuración alrededor de un C quiral. HemicetalCetona ANILLOS DE PIRANO: anillos de 6 átomos Aldohexosas. Anómeros ANILLOS DE FURANO: anillos de 5 átomos Cetohexosas Proyecciones de Haworth Proyecciones de Fischer Anillos de furano (C2-C5) y de pirano (C2-C6) Fructosa Proyecciones de Haworth -D-glucopiranosa en las conformaciones de silla y de bote -D-ribofuranosa en la conformación de sobre Conformación espacial Azúcares como agentes reductores Terminología que describe la estructura de las moléculas de azúcar DERIVADOS DE LOS MONOSACÁRIDOS -Desoxiazúcares -Derivados fosforilados -Alditoles -Ácidos aldónicos -Ácidos urónicos -Hexosaminas -Ácido siálico -Ácido N-acetil-murámico Desoxiazúcares CH2OH C C C CH2OH H OH H OH H OH D-ribitol COOH C C C C H OH HO H H OH D-gluconic acid D-glucuronic acid CH2OH OHH CHO C C C C H OH HO H H OH COOH OHH Alditoles Ácidos aldónicos Ácidos urónicos H O OH H OH H NH2H OH CH2OH H -D-glucosamine H O OH H OH H NH OH CH2OH H -D-N-acetylglucosamine C CH3 O H Hexosaminas N-Acetylmuramic acid Ácido siálico (ácido N-acetilneuramínico) Ácido N-acetilmurámico Derivados fosforilados de los azúcares Derivados de las hexosas Ácido aldónicoÁcido urónico HemicetalCetona Cetal Formación del disacárido maltosa Extremo reductor Disacáridos Polisacáridos almidón y glucógeno – combustible biológico soporte extracelular celulosa y quitina -- elementos estructurales Gránulos de almidón Gránulos de glucógeno H O OH H OHH OH CH2OH H O H H OHH OH CH2OH H O HH H O O H OHH OH CH2OH H H H O H OHH OH CH2OH H OH HH O O H OHH OH CH2OH H O H 1 6 5 4 3 1 2 amilosa H O OH H OHH OH CH2OH H O H H OHH OH CH2OH H O HH H O O H OHH OH CH2 H H H O H OHH OH CH2OH H OH HH O O H OHH OH CH2OH H O H O 1 4 6 H O H OHH OH CH2OH H H H O H OHH OH CH2OH H H O 1 OH 3 4 5 2 amilopectina 1-4) 1-4) 1-6) almidón H O OH H OHH OH CH2OH H O H H OHH OH CH2OH H O HH H O O H OHH OH CH2 H H H O H OHH OH CH2OH H OH HH O O H OHH OH CH2OH H O H O 1 4 6 H O H OHH OH CH2OH H H H O H OHH OH CH2OH H H O 1 OH 3 4 5 2 1-4) 1-6) glucógeno Estructura de la amilosa Celulosa 10000-15000 unidades Quitina N-acetil-D-glucosamina 1-4) Peptidoglucano de la pared bacteriana Unidades repetidas de algunos de los glucosaminoglucanos más comunes de la matriz extracelular Ácido hialurónico Sulfatos de queratán 4-Sulfato de condroitina Glucoconjugados Estructura del proteoglucano de una proteína integral de membrana Unión de oligosacáridos a glucoproteínas Lipopolisacáridos bacterianos Papel de los oligosacáridos en el reconocimiento y la adhesión a la superficie de la célula