Es una labor de campo específica de la producción de semillas. Consiste en eliminar plantas fuera de tipo, de otras variedades o portadoras de enfermedades transmisibles por semillas. En producción de híbridos con androesterilidad es de gran importancia para detectar individuos que producen polen entre las plantas madres. Las personas que realicen la depuración tienen que conocer muy bien el cultivar para seleccionar. La depuración se realiza recorriendo el cultivo surco por surco. En especies alógamas es muy importante eliminar las plantas fuera de tipo lo antes posible para evitar que disperse su polen. Para esto último se deben determinar los caracteres fenotípicos que se expresen tempranamente, lo que no es siempre posible. Tanto la interacción genotipo ambiente como la limitada cantidad de caracteres que se evalúan influyen negativamente sobre la eficiencia de esta labor.