El siguiente avance fue el método de terminación de la cadena, también llamado método de Sanger en honor a su inventor, Frederick Sanger. Este procedimiento también crea fragmentos de varias longitudes que son, de modo similar, esparcidos en un gel para ponerlos en orden. El paso ingenioso es dar un tinte fluorescente a las etiquetas moleculares (verde para A, azul para C, amarillo para G, rojo para T) y leer estas automáticamente usando métodos de óptica.