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MOLECULAS ORGANICAS COMPLEJAS MOLÉCULAS ORGÁNICAS PEQUEÑAS PM: 100 – 1000 (no más de 30 átomos de C) Proteínas Ácidos nucleicos Polisacáridos Lípidos Macromoléculas: polímeros de alto peso molecular (PM: 5x103 – 109) Bajo peso molec. (PM: 750 – 1500) Aminoácidos Nucleótidos Azúcares Simples Ácidos Grasos BIOMOLÉCULAS MAS ABUNDANTES Las pequeñas moléculas son los sillares estructurales a partir de los cuales se construyen las moléculas orgánicas complejas y se denominan monómeros cuando la molécula se genera por polimerización de ellos como en el caso de las macromoléculas 4 Grupos 4 Familias Los lípidos incluyen a un grupo heterogéneo de moléculas orgánicas complejas (PM: 750-1500) que presentan como característica común su insolubilidad en agua. “Los ácidos grasos forman parte de algunos lípidos pero no de todos” Según la presencia o ausencia de ácidos grasos en su molécula 01La palabra lípido proviene del término griego lipos, que significa «grasa» contienen ácidos grasos No presentan ácidos grasos se clasifican en: Lípidos Saponificables Por hidrólisis alcalina con NaOH o KOH producen jabones (sales sódicas o potásicas de ácidos grasos) Lípidos Insaponificables LÍPIDOS SAPONIFICABLES Lípidos Polares (anfipáticos) Función: estructural, componentes de membranas biológicas Glicerofosfolípidos Esfingofosfolípidos Esfingoglucolípidos Fosfolípidos Glucolípidos Esfingolípidos G li ce ro l Ácido graso Ácido graso PO4 3- Amino alcohol Ácido graso PO4 3- Ácido graso E sf in go si n a Colina Ácido graso Ácido graso E sf in g o si n a Mono- o Oligosacárido Lípidos Polares (anfipáticos) Función: estructural, componentes de membranas biológicas Glicerofosfolípidos Esfingofosfolípidos Esfingoglucolípidos Fosfolípidos Glucolípidos Esfingolípidos G li ce ro l Ácido graso Ácido graso PO4 3- Amino alcohol Ácido graso PO4 3- Ácido graso E sf in g o si n a Colina Ácido graso Ácido graso E sf in g o si n a Mono- o Oligosacárido Lípidos Neutros (hidrofóbicos) Función: reserva energética y protección Ceras Protección Triacilglicéridos Reserva energética G li ce ro l Ácido graso Ácido graso Ácido graso Ácido grasoAlcohol de Cadena larga Lípidos Neutros (hidrofóbicos) Función: reserva energética y protección Ceras Protección Ceras Protección Triacilglicéridos Reserva energética G li ce ro l Ácido graso Ácido graso Ácido graso Triacilglicéridos Reserva energética Triacilglicéridos Reserva energética G li ce ro l Ácido graso Ácido graso Ácido graso Ácido grasoAlcohol de Cadena larga Los lípidos saponificables se dividen en dos grandes grupos: 02 LÍPIDOS NEUTROS Triacilglicéridos Se forman por la esterificación del glicerol con tres moléculas de ácidos grasos Al perderse los grupos hidroxilo en la esterificación, los triacilglicéridos son moléculas apolares. 03 Pueden contener 2 o 3 ácidos grasos diferentes Triacilglicéridos mixtos Ácido: esteárico linoleico palmítico 04 Grasas y aceites en mamíferos se acumulan en adipocitos. se almacena en semillas en especial de oleaginosas. ¿Por qué? ¿Por qué? 05 Ceras Acido palmítico 1- Triacontanol Tienen elevado punto de fusión. 06 Éster formado por un ácido graso saturado y un alcohol de cadena larga (16-30 C) Ejemplo: Principal función: protección • Previene pérdida de agua en hojas y frutas • Genera película resistente al agua en animales LÍPIDOS POLARES 07Glicerofosfolípidos Son los fosfolípidos más abundantes y principales constituyentes de las membranas biológicas Aminoalcohol o Polialcohol Aminoalcohol o Polialcohol OO Glicerofosfolípido (estructura general) Ácido graso saturado (ej. ác. Palmítico) Grupo sustituyente en cabeza polar Ácido graso insaturado (ej. ác. Oleico) 08 Distintos tipos de glicerofosfolípidos según grupo sustituyente en cabeza polar Inositol Fosfatidilcolina Fosfatidilserina Fosfatidiletanolamina Fosfatidilinositol 09 Esfingolípidos Esfingosina Ácido graso Ácido graso PO4 3- Ácido graso E sf in g o si n a Colina Ácido graso Ácido graso E sf in g o si n a Mono- o Oligosacárido Esfingofosfolípidos Esfingoglucolípidos 10 11 Nombre del esfingolípido Nombre de X Fórmula de X Ceramida --- Esfingomielina Fosfocolina Glicosilcerebrósido Glucosa Lactosilceramida di, tri o tetra sacárido Gangliósido GM2 Oligosacárido complejo 1. Fosfoesfingolípidos 2. Glicoesfingolípidos Gangliósidos Cerebrósidos Globósidos a) Glicolípidos neutros b) Glicolípidos ácidos Esfingosina Ácido graso Esfingosina Ácido graso 12 13 LÍPIDOS INSAPONIFICABLES Los lípidos insaponificables se dividen en tres grupos: Isoprenoides Derivados del isopreno 5C • Ubiquinona • Dolicol • Vitaminas A, E y K Esteroides Derivados del hidrocarburo tetracíclico perhidro- ciclopentanofenantreno � Esteroles: colesterol y fitosteroles � Derivados del colesterol: - Vitaminas D - Hormonas: testosterona, estradiol, aldosterona y cortisol - Sales biliares Eicosanoides Derivados del ácido araquidónico (20:4) • Prostaglandinas • Tromboxanos • Leucotrienos 14 ISOPRENOIDES Derivados del isopreno, un alqueno de 5 carbonos Dolicol: un transportador de azúcares del retículo endoplasmático (n= 9 a 22) Ubiquinona: un transportador de electrones mitocondrial (coenzima Q); (n= 4 a 8) Isopreno 15 Vitamina A1: precursores y derivados Deficiencia:- Piel, ojo, mucosas secas - Retraso desarrollo y crecimiento - Ceguera nocturna 16 Otros isoprenoides o derivados Vitamina K1: Un cofactor de la coagulación sanguínea Vitamina E: Un antioxidante 17 20:4∆∆∆∆5,8,11,1420:4∆∆∆∆5,8,11,14 Químicamente son derivados del ácido araquidónicoQuímicamente son derivados del ácido araquidónico EICOSANOIDES Acido araquidónico Leucotrieno A4 Tromboxano A2 Prostaglandina E1 (PGE1) Este ácido se libera desde los fosfolípidos de membrana por acción de la enzima fosfolipasa A2. NSAID: Fármacos antiinflamatorios no esteroideos (aspirina, ibuprofeno) inhiben la prostaglandina H2 sintasa (COX) 18 ESTEROIDES Derivados del Ciclopentanoperhidrofenantreno o Estrano (3 anillos de ciclohexano y 1 anillo de ciclopentano fusionados) A B C D A B C D 19 A B C D A B C D Componente de las membranas celulares de animales (ausente en vegetales) Precursor a partir del cual se sintetizan Vitamina D Hormonas esteroideas Sales biliares El colesterol corporal se obtiene de la ingesta de carnes, leche y huevo y también es sintetizado en el organismo fundamentalmente en hígado y órganos esteroideogénicos. 20 7-Dehidrocolesterol 1 paso en hígado 1 paso en riñon 2 pasos en piel Colecalciferol (vitamina D3) 1,25-Dihidroxicolecalciferol (1,25-dihidroxivitamina D3) Vitamina D3 Vitamina liposoluble Regula: 1. La captación de Ca2+ en intestino 2. El calcio y los fosfatos en hueso Deficiencia: Raquitismo Forma activa 21 Testosterona Estradiol Cortisol Aldosterona Hormonas sexuales Hormonas corticales Ácidos biliares (Ác. Taurocólico) 22 Cadenas de cientos o miles de monosacáridos unidos por enlaces O-glicosídicos POLISACARIDOS Se clasifican Homopolisacáridos (un único tipo de monosacárido) Lineal Ramificado Homopolisacáridos (un único tipo de monosacárido) Lineal Ramificado Heteropolisacáridos (2 o más tipos de monosacárido) Lineal Ramificado Heteropolisacáridos (2 o más tipos de monosacárido) Lineal Ramificado Según su composición 23 24 Homopolisacáridos de RESERVA Homopolisacáridos ESTRUCTURALES Ambos polímeros de glucosa, pero difieren en el tipo de organismos en el que se encuentran y en su estructura Polímero de glucosa presente en paredes celulares de plantas GlucógenoAlmidón Celulosa Quitina Polímero de N-acetil-D-glucosamina presenteexoesqueleto animal 25 Almidón � Homopolisacárido constituido por monómeros de glucosa Formado por una mezcla de dos polímeros Polímero lineal. Formado por moléculas de αααα-D-glucosas unidas por enlaces glicosídicos αααα (1����4) que adoptan un arrollamiento helicoidal. Polímero ramificado. Formado por moléculas de αααα-D-glucosas unidas por enlaces glicosídicos αααα (1����4) y ramificaciones cada 15 o 30 monómeros con enlaces glicosídicos αααα (1����6). � Función: reserva de energía en vegetales Se acumula en forma de gránulos en el interior de plastos 26 Extremo No reductor Extremo reductor Cadena principal Ramificación Punto de Ramificación (α 1→ 6) Extremos reductores Extremos No reductores Amilosa (15-20%) Amilopectina (80-85%) 27 Glucógeno � Homopolisacárido ramificado constituido por monómeros de glucosa � Función: reserva de energía en animales Se acumula en forma de gránulos en el hígado y músculo esquelético Polímero ramificado. Formado por moléculas de αααα-D-glucosas unidas por enlaces glicosídicos αααα (1����4) y ramificaciones cada 8 o 12 monómeros con enlaces glicosídicos αααα (1����6). Estructura similar a la AMILOPECTINA más ramificada Las ramificaciones permiten obtener glucosa libre más rápido debido a que las enzimas hidrolizan enlaces glicosídicos desde los extremos 28 Triacilglicéridos vs Glucógeno en su rol de almacenadores de energía Ventaja de los triacilglicéridos: almacenan energía mas eficientemente 1- Dado que los átomos de C de los ácidos grasos están mas reducidos que los de la glucosa, por oxidación completa hasta CO2 + H2O de un gramo de TAG se obtiene mas del doble de energía que la obtenida a partir de un gramo de glucógeno (9kcal/g vs 4kcal/g). 2- Dado que los TAG son completamente hidrofóbicos, los organismos que almacenan energía bajo esta forma no deben soportar el peso extra del agua de hidratación que sí está presente en el glucógeno. Ventaja de los polisacáridos: son una fuente energía rápidamente accesible 1- Dado que el glucógeno es muy ramificado y se halla hidratado, las enzimas correspondientes (glucógenofosforilasas) pueden degradarlo rápidamente a glucosa desde todo el volumen del gránulo. En cambio las lipasas que hidrolizan los TAG solo pueden ejercer su efecto desde la superficie de la gota. 2- La glucosa liberada tras la hidrólisis del glucógeno es muy soluble en agua y fácilmente llevada por el torrente sanguíneo hasta los distintos tejidos que lo requieran. Por el contrario los ácidos grasos liberados tras la hidrólisis de los TAG son insolubles en agua y para ser trasladados por sangre a los tejidos deben unirse a un proteína (albúmina). 29Celulosa � Homopolisacárido lineal constituido por moléculas de glucosas unidas entre sí por enlaces O-glicosídicos ββββ (1→→→→ 4) � Función: Estructural en vegetales. Forma las paredes de las células vegetales Es un polisacárido indigerible por los animales Constituye la fibra dietética 30 Mas del 50% de los carbohidratos de la dieta está constituido por almidón (presente en tubérculos y cereales) y sacarosa (azúcar de mesa). En menor proporción se encuentran: glucógeno, glucosa, maltosa, fructosa y otros azúcares. Además hay una elevada proporción de celulosa (constituyente de las fibras no digeribles). Para poder ser absorbidos a nivel intestinal, deben los polisacáridos complejos deben ser digeridos hasta monosacáridos mediante hidrólisis secuencial de los enlaces glicosídicos. La acción es catalizada por una serie de enzimas hidrolíticas que reciben en conjunto en nombre de glicosidasas. Las glicosidasas pueden separarse en dos grupos: 1. α-amilasas: se encuentran en la saliva y en la secreción derivada del páncreas exócrino. Catalizan la hidrólisis de enlaces glicosídicos (α1-4) que no se encuentren próximos a la terminación de una cadena (a 2 residuos de un extremo) o de una ramificación. Transforman al polisacárido en una mezcla de oligosacáridos lineales de 2, 3 y hasta 6 glucosas y oligosacáridos ramificados de 5-9 residuos de glucosa denominados α-dextrinas. 2. Oligosacaridasas: presentes en el borde en cepillo de las células de la mucosa intestinal (preferentemente yeyuno e íleon), actúan sobre oligosacáridos. Dentro de ellas se encuentran: − α-glucosidasa: es una exo-(α1-4)-glucosidasa. Cataliza la hidrólisis de enlaces (α1-4) iniciando su acción desde el extremo no reductor liberando moléculas de glucosa. Ejerce su acción únicamente sobre oligosacáridos lineales. − α-dextrinasa o isomaltasa: cataliza la hidrólisis de enlaces glicosídicos (α1-6) actuando también sobre los (α1-4). Degrada oligosacáridos ramificados hasta glucosa. Esta enzima y la anterior completan la degradación del glucógeno y almidón hasta glucosa. - Lactasa o β-galactosidasa: cataliza la hidrólisis de lactosa generando galactosa y glucosa. - Sacarasa: cataliza la hidrólisis de sacarosa generando glucosa y fructosa 31 ÁCIDOS NUCLEICOS PROTEÍNAS PROTEÍNASÁCIDOS NUCLEICOS MACROMOLÉCULAS INFORMATIVAS Información almacenada en una secuencia de nucleótidos La información almacenada en el ADN se ejecuta a través de las proteínas a través del conjunto de reglas que proporciona el código genético se traduce en la secuencia de aminoácidos de una proteína Información contenida en la secuencia de aminoácidos se traduce en un plegamiento específico estructura tridimensional o conformación única FUNCIÓN de la proteína dando por resultado directamente relacionada 32 PROTEÍNAS Macromoléculas lineales cuyos monómeros constituyentes son los aminoácidos 33 PROTEÍNAS Moléculas de mayor trascendencia en los seres vivos Cuantitativamente representan aprox. el 50% del peso seco de la célula Funcionalmente las moléculas mas versátiles de los seres vivos responsables de capacidad metabólica morfología 34 • Enzimas � ADN polimerasa, Catalasa, Hexoquinasa, Citocromo c • Reserva � Ovoalbúmina, Ferritina, Caseína, Gliadina • Transporte � Hemoglobina, Mioglobina, Seroalbúmina, Transferrina • Contráctiles � Miosina, Actina, Dineína • Defensa � Inmunoglobulinas (anticuerpos), Complemento, Trombina, Fibrinógeno • Hormonal � Insulina, Hormona del crecimiento, Hormona adrenocorticotrópica • Toxinas � Toxina diftérica, Toxina botulínica, Venenos de serpiente, Ricina • Estructurales � Colágeno, Elastina, Queratina, Glucoproteínas Clasificación de las Proteínas Según su Función 35 Tipos y ejemplos Localización o función Enzimas Hexoquinasa Lactato-deshidrogenasa Citocromo c ADN-polimerasa Fosforila glucosa Deshidrogena lactato Transfiere electrones Replica y repara ADN Proteínas de reserva Ovoalbúmina Caseína Ferritina Gliadina Ceína Proteína de la clara de huevo Proteína de la leche Reserva de hierro en el bazo Proteína de la semilla de trigo Proteína de la semilla de maíz Proteínas transportadoras Hemoglobina Hemocianina Mioglobina Seroalbúmina β1-Lipoproteína Globulina que liga hierro Ceruloplasmina Transporta O2 en la sangre de los vertebrados Transporta O2 en la sangre de algunos invertebrados Transporta O2 en el músculo Transporta ácidos grasos en la sangre Transporta lípidos en la sangre Transporta hierro en la sangre Transporta Cu en la sangre Proteínas contráctiles Miosina Actina Dineína Filamentos estacionarios Filamentos móviles en las miofibrillas Cilios y flagelos Proteínas protectoras en la sangre de los vertebrados Anticuerpos Complemento Fibrinógeno Trombina Forman complejos con proteínas extrañas Complejos con algunos sistemas antígeno-anticuerpo Precursor de la fibrina en la coagulación sanguínea Componente del mecanismo de coagulación Toxinas Toxina de Clostridium botulinum Toxina diftérica Venenos de serpiente Ricina Gosipina Origina envenenamiento bacteriano de los alimentos Toxina bacteriana Enzimas que hidrolizan los fosfoglicéridos Proteínatóxica de la semilla del ricino Proteína tóxica de la semilla del algodón Hormonas Insulina Hormona adrenocorticotrópica Hormona del crecimiento Regula el metabolismo de la glucosa Regula la síntesis de corticosteroides Estimula el crecimiento de los huesos Proteínas estructurales Proteínas recubrimiento viral Glucoproteínas α-Queratina Esclerotina Fibroína Colágeno Elastina Mucoproteínas Cubierta alrededor del cromosoma Recubrimientos celulares y paredes Piel, plumas, uñas, pezuñas Exoesqueletos de los insectos Seda de los capullos, telarañas Tejido conectivo fibroso (tendones, hueso, cartílago) Tejido conectivo elástico (ligamentos) Secreciones mucosas, fluido sinovial FUNCIÓN DE UNA PROTEÍNA depende de Estructura tridimensional o conformación Información necesaria para adquirir la Conformación se halla en Secuencia de aminoácidos de la cadena polipeptídica preservada por Unión de los aa a través de enlaces covalentes fuertes 36 ¿Cómo la secuencia de aminoácidos determina la conformación de las proteínas y por lo tanto su función? 37 “Distribución espacial de grupos sustituyentes que tienen libertad de adoptar distintas posiciones en el espacio sin necesidad de romper enlaces covalentes, gracias a la libertad de rotación del enlace que los une” Estado estructural que puede interconvertirse con otros estados estructurales sin romper enlaces covalentes. Esto quiere decir que una simple rotación de dos grupos de átomos a través de un enlace covalente simple ocasiona un cambio conformacional CONFORMACIÓN 38 E n er g ía P o te n ci al ( kJ /m o l) Angulo de torsión (grados) Eclipsada Extendida o alternada H H H - C – C – H H H Etano 39 El esqueleto covalente de una cadena polipeptídica posee muchos enlaces covalentes simple que permiten libre rotación de los átomos que unen, por lo tanto la molécula proteica puede adoptar un número ilimitado de conformaciones posibles. 40 A pH y temperatura normal las cadenas polipeptídicas se pliegan adoptando una sola conformación particular, biológicamente activa, que es la energéticamente mas favorable (menor energía libre G) y por lo tanto la mas estable. Estabilizada fundamentalmente por un gran número de interacciones débiles (no covalentes) intramoleculares y con el agua circundante La conformación energéticamente mas favorable y biológicamente activa se denomina “CONFORMACIÓN NATIVA” 41 Interacciones débiles que estabilizan a la conformación nativa 1) Interacciones electrostáticas (que se dan entre un grupo que presenta carga y otro grupo que posea carga o δ de carga opuesta): ión – ión; ión – dipolo. 2) Fuerzas de van der Waals: interacciones electrostáticas débiles que se dan entre grupos de átomos no unidos entre sí como consecuencia de la existencia de dipolos (permanentes o instantáneos): dipolo-dipolo; dipolo-dipolo inducido; dipolo instantáneo-dipolo inducido. 3) Puentes de hidrógeno: interacción electrostática compleja que se establece entre un átomo de H unido a un elemento muy electronegativo (O, N, F) y un átomo electronegativo que presente densidad negativa de carga. 4) Interacciones hidrofóbicas: fuerzas a través de las cuales los compuestos hidrofóbicos tienden a agruparse en un medio acuoso, no porque exista atracción real entre ellas sino porque son repelidos por las moléculas de agua circundantes. 42 Puente disulfuro (-S-S-) único enlace covalente que puede estabilizar la conformación proteica resultante de la unión de las cadenas laterales de 2 Cys por reacción de oxidación sólo se encuentran en proteínas extracitosólicas dado que el citosol es un ambiente reductor 43 Tipo, número y posición de las interacciones Mayor número de interacciones posibles CONFORMACIÓN NATIVA “La energéticamente más favorable” Más estable aquella que permita el Secuencia de aminoácidos de la proteína determinado por Cada proteína posee composición química definida que determina una conformación nativa y por lo tanto una forma característica 44 Clasificación de las proteínas según: Clase Grupo Prostético Ejemplo Lipoproteínas Glicoproteínas Fosfoproteínas Hemoproteínas Flavoproteínas Metaloproteínas Lípidos Carbohidratos Grupos Fosfato Hemo (Fe-profirina) Flavin Nucleótidos Hierro Cinc Calcio Molibdeno Cobre ββββ1-Lipoproteína de sangre Inmunoglobulina G Caseína de leche Hemoglobina Succinato deshidrogenasa Ferritina Alcohol deshidsrogenasa Calmodulina Dinitrogenasa Plastocianina COMPOSICIÓN QUÍMICA Simples Conjugadas FORMA Globulares Fibrosas 45 Ejemplo Ejemplo Ejemplo Ejemplo LactoglobulinaLactoglobulinaLactoglobulinaLactoglobulina OvoglobulinaOvoglobulinaOvoglobulinaOvoglobulina SeroalbSeroalbSeroalbSeroalbúúúúminaminaminamina GlutelinaGlutelinaGlutelinaGlutelina Participan en constitución de estructuras de sostén Ej. pelos, uñas, cuernos y plumas (α- queratina) fibras del tejido conectivo (colágeno en tendones; elastina en pared de venas y arterias). FORMA Globulares Fibrosas Son solubles en medio acuoso Cadenas polipeptídicas forman ovoide o esferoide Gran actividad funcional Ej: enzimas, anticuerpos, algunas hormonas, la hemoglobina, etc, se pliegan sobre sí mismas se ordenan paralelamente fibras o láminas extendidas Insolubles en medio acuosos en general Clasificación de las proteínas según: NÚMERO DE SUBUNIDADES 46 Estructura Primaria Estructura Secundaria Estructura Terciaria Estructura Cuaternaria Residuos de aminoácidos αααα-hélice Cadena Polipeptídica Subunidades Ensambladas En la conformación de una proteína es posible distinguir niveles jerárquicos de organización crecientes. Clásicamente se describen 4 niveles estructurales: En la actualidad se conocen otros niveles adicionales que están entre la estructura secundaria y la terciaria: estructuras supersecundarias y dominios. 47 Estructura Primaria Resulta de la condensación de aminoácido por unión de tipo amida y define eje central o esqueleto de las proteínas “Secuencia de aminoácido en la cadena polipeptídica, que a su vez está determinada por la secuencia de bases en el gen” Unión Peptídica Unión Peptídica Unión Peptídica Unión Peptídica La secuencia es única para cada proteína Determina la estructura tridimensional de las proteínas y por lo tanto su función La estructura es estabilizada por: Enlaces peptídicos 48 Estructura Secundaria Disposición que adoptan en el espacio los restos de aminoácidos adyacentes de una zona de la cadena polipeptídica Las más importantes son Plegamiento de la estructura primaria a lo largo de un eje o sea Existen varios tipos de estructuras secundarias particularmente estables y ampliamente distribuidos en las proteínas αααα-hélice Conformación ββββ Lámina ββββ 49 αααα-hélice Ejemplo:α-queratinas (constituyentes mayoritarios de pelos, escamas, cuernos y uñas) La estructura es estabilizada por: Puentes de H intracatenarios entre el grupo CO de un aa y el H unido al N de otro aa ubicado 4 restos más arriba Hélice dextrógira 3,6 restos de aa por vuelta de hélice 50 51Lámina ββββ ANTIPARALELA PARALELA Vista de arriba Vista de costado Conformación ββββ Ejemplo: Fibroína de la seda La estructura es estabilizada por: Puentes de H intercatenarios 1 2 3 4 1 2 3 4 Giros o Codos ββββ Conectan tramos sucesivos de hélice α α α α o conformaciones ββββ Integrados por 4 residuos de aa (usualmente Gly y Pro) que forman un giro de 180° La estructura es estabilizada por puentes de H intracatenarios “región de una cadena polipeptídica no posea una estructura regular” Otros tipos de estructura secundaria En ciertas proteínas particulares Colágeno Hélice de colágeno hélice levógira Elastina Hélice de elastina hélice dextrógira ≠ de α-hélice Disposición al azar o Enrollamiento al azar 52 ProteínasFibrosas Único tipo de estructura secundaria Globulares regiones con ≠ tipos de estructura secundaria 53Estructura Terciaria Estructura tridimensional completa que resulta del plegamiento tridimensional de una cadena polipeptídica sobre sí misma (en proteínas globulares) La estructura es estabilizada fundamentalmente por interacciones hidrofóbicas y otras interacciones débiles (no covalentes) como las interacciones electrostáticas, los puentes de H, fuerzas de van der Waals. El único enlace covalente que puede estabilizar esta estructura es l puente disulfuro FUERZAS QUE ESTABILIZAN LA ESTRUCTURA TERCIARIA 54 Estructura Cuaternaria Es la descripción de la disposición espacial que adoptan las subunidades (protómeros) de una proteína oligomérica 55 56 57 58 Nivel estructural que se encuentra entre estructura secundaria y terciaria DOMINIOS ESTRUCTURALES Entidades geométricas definidas que corresponden a regiones de las cadenas polipeptídicas que se pliegan en forma independiente del resto de la cadena: Unidad Básica de Plegamiento. Resultan de la asociación de segmentos en hélice a, lámina b y regiones al azar La asociación de dominios da por resultado la proteína globular completa. DOMINIOS FUNCIONALES Un dominio estructural por sí mismo o en asociación con otros origina un DOMINIO FUNCIONAL, región de la cadena polipeptídica autónoma desde el punto de vista funcional. 59 Agentes Desnaturalizantes Agentes que rompen los enlaces débiles de las proteínas produciendo la desnaturalización proteica: -Altas temperaturas -pH extremos (tanto altos como bajos) -Detergentes (Ej: SDS: dodecilsulfato de sodio) -Soluciones de elevada fuerza iónica (Ej: (NH4)2SO4) -Sustancias que interfieren con la estructura del agua (Ej: urea) -Sustancias que rompen puentes disulfuro (Ej: β-mercaptoetanol) DESNATURALIZACIÓN Pérdida de la conformación nativa por ruptura de los enlaces débiles que la estabilizan. En la desnaturalización se pierden la estructura cuaternaria, terciaria y/o secundaria (que se hallan estabilizadas por enlaces débiles) pero no de la estructura primaria. Consecuencias de la Desnaturalización -Pérdida de la función biológica: ya que la función de una proteína depende de su conformación. -Insolubilización en agua de las proteínas globulares: la pérdida de la estructura terciaria de las proteínas globulares determina que los restos de aa hidrofóbicos, que se hallaban confinados al interior de la esfera, queden expuestos al entorno acuoso tornándose insoluble en agua. 60 En muchos casos (pero no en todos) la desnaturalización es reversible y removiendo el agente desnaturalizante la proteína recupera su conformación nativa. desnaturalizada nativa ÁCIDOS NUCLEICOS Macromoléculas lineales cuyos monómeros constituyentes son los nucleótidos Según tipo de nucleótido constituyente desoxirribonucleótidos ribonucleótidos constituido por Acido desoxirribonucleico ADN Acido ribonucleico ARN 61 -El grupo hidroxilo en 5’ de un nucleósido está unido al grupo hidroxilo 3’ del siguiente nucleósido por un “enlace fosfodiéster” -Unidades alternas de grupos fosfato y residuos de pentosas constituyen el “Esqueleto covalente” de los ac. nucleicos (hidrofílico y cargado negativamente) -Se distingue un extremo donde hay un fosfato libre unidos al C5’ : extremo 5’ y un extremo donde hay un hidroxilo libre unido al C3’: extremo 3’: Se dice que las cadenas tienen “polaridad”. -Las bases púricas y pirimídicas son hidrofóbicas y se disponen en las cadenas perpendiculares al esqueleto covalente apiladas entre sí de modo que los planos de sus anillos se encuentren paralelos. -Por convención la estructura de una hebra o cadena simple de ac. nucleico se escribe siempre con el extremo 5’ a la izquierda y el 3’ a la derecha. La secuencia de nucleótidos puede representarse esquemáticamente: 62 En un tubo de ensayo el ARN se hidroliza rápidamente en condiciones alcalinas dando nucleósido 2’,3’-monofosfato cíclico. Esta hidrólisis en medio alcalino no se observa en el ADN dado que no posee el –OH unido al C2’ a través del cual ejercen su acción los iones hidroxilo del medio. 63 Función: almacenamiento de la información biológica En las moléculas de ADN se encuentran especificadas la secuencia de nucleótidos de todas las moléculas de ARN y la secuencia de aa de todas las proteínas (y por lo tanto la estructura y función de las mismas). “Un segmento de ADN que contiene la información necesaria para la síntesis de un ARN funcional recibe el nombre de GEN” En último término todos los componentes celulares son producto de la información programada en la secuencia de nucleótidos del ADN. 64 ACIDO DESOXIRRIBONUCLEICO ADN Estructura Tridimensional del ADN Modelo de Watson y Crick •Constituido por dos cadenas polinucleotídicas una de ellas dispuesta en dirección 5’→3’ y la otra en dirección 3’→5’: son “ANTIPARALELAS”. •Las dos cadenas o hebras están enrolladas alrededor del mismo eje formando una doble hélice dextrógira: αααα hélice. •Los esqueletos covalentes de ambas cadenas se hallan en el exterior de la doble hélice en contacto con el agua circundante. •Las bases nitrogenadas de ambas cadenas están apiladas en el interior de la doble hélice y en posición perpendicular al eje longitudinal de la hélice. •Cada base de una cadena está apareada con una base de la otra cadena y ambas están situadas en el mismo plano y unidas entre sí por enlaces puente de hidrógeno. •Las bases apiladas en el interior de la doble hélice están separadas por una distancia de 0,34nm y hay 10 residuos de nucleótidos en cada cadena por vuelta completa de la doble hélice. (Se ha comprobado que en realidad el número de residuos es 10,5) •La relación espacial entre las dos cadenas da lugar a la formación de un surco menor y otro surco mayor. 5’ 3’ 5’ 3’ (36 Å) 65 66 Por cuestiones geométricas para mantener constante la distancia entre los esqueletos covalentes se aparean Base púrica de una cadena Base pirimídica de la otraEspecíficamente Adenina (A) Timina (T) Guanina (G) Citosina (C) Patrón de apareamiento según el cual se forman el mayor número posible de enlaces puente de hidrógeno Por cuestiones geométricas para mantener constante la distancia entre los esqueletos covalentes se aparean Base púrica de una cadena Base pirimídica de la otraEspecíficamente Adenina (A) Timina (T) Guanina (G) Citosina (C) Patrón de apareamiento según el cual se forman el mayor número posible de enlaces puente de hidrógeno Reglas de Chargaff: - Nº de residuos de A = Nº de residuos de T (A = T) - Nº de residuos de G = Nº de residuos de C (G = C) - Nº de residuos de purinas = Nº de residuos pirimidinas (A+G = T+C) son COMPLEMENTARIAS entre ellas no son idénticas en secuencia ni en composición de bases Las cadenas antiparalelas Siempre que hay A en una cadena hay T en la otra y si está presente G en una cadena la otra presentará C. ∴∴∴∴ 67 DESNATURALIZACIÓN DEL ADN 68 69 ACIDO RIBONUCLEICO ARN Clases funciones ARNm ARNt ARNr Otros transportan la información desde un gen hasta el ribosoma donde es traducido en secuencia de aa de proteína codificada por el gen moléculas adaptadoras que permiten traducir con fidelidad la información contenida en el ARNm en una secuencia de aa de una proteína componentes estructurales de los ribosomas, complejos de gran tamaño que llevan a cabo la síntesis proteica desempeñan otras funciones específicas que discutiremos oportunamente Estructura del ARN •Independientemente de la clase de ARN que se considere, todos están constituidos por una cadena simple: MONOCATENARIOS O MONOHEBRA. •La naturaleza monohebra de estas moléculas no implica que su estructura sea al azar. •Las monohebras tienden a adoptar una conformación helicoidal con giro a derecha, dirigida por el apilamiento de bases. •Cualquier secuencia autocomplementariadará lugar a estructuras mas complejas y específicas. Las regiones apareadas adoptan por lo general una estructura en hélice dextrógira 70 ARNm La longitud mínima del ARNm viene determinada por la longitud de la cadena polipeptídica que codifica. Para codificar una cadena polipeptídica de n aa se requiere que el ARNm tenga al menos 3 x n nucleótidos. 71 Porción del ARN celular total que traslada la información genética desde el ADN a los ribosomas Actúan como moldes que sirven para especificar la secuencia de aa de las cadenas polipeptídicas Cada aa está codificado por un triplete de nucleótidos presentes en el ARNm denominado “CODON” El proceso de formación de un ARN sobre un molde de ADN se conoce como trascripción (la información pasa de una molécula a otra usando en mismo idioma: nucleótidos) El proceso de formación de una proteína sobre un molde de ARN se denomina traducción (la información pasa de una molécula a otra traduciendo de un idioma de 4 nucleótidos a otro de 20 aa). Capaces de unirse: -Covalentemente a los aa: a través de un enlace éster entre el –OH del extremo 3’ del ARNt y el grupo –COOH del aa) y, - Por apareamiento de bases al codón del ARNm que codifica a dicho aminoácido: a través de un triplete de bases complementario al codón presente en el ARNt denominado ANTICODON. 72ARNt Moléculas adaptadoras 73Tiene una estructura en hoja de trébol en la cual se distinguen regiones doble hebra resultantes del apareamiento de bases de segmentos autocomplementarios. En el extremo de una de las regiones se localiza a los extremos 5’ y 3’ del ARNt. Las otras regiones presentan en sus extremos bucles en horquilla debido a la presencia de segmentos no autocomplementarios. En uno de los bucles se localiza al anticodón: triplete de bases complementario del codón presente en el ARNm. Los otros bucles presentan bases raras. La hoja de trébol se pliega adquiriendo en el espacio una conformación en forma de L 74 Componentes estructurales de los ribosomas ARNr Apliquemos las reglas de Chargaff y conocimientos estructurales del ADN 1) Un gen I contiene 10% de A. a) ¿cuál es el porcentaje de las otras bases? b) Sabiendo que contiene 2000 A, ¿cuál es la longitud del gen expresada en pares de bases (pb) y en nm? 2) El gen II contiene 10% de G y posee tiene idéntica longitud que el gen I a) ¿cuál es el porcentaje de todas las bases presentes? b) Si se dispone de dos tubos, uno contiene una solución 1M del gen I y el otro una solución 1M del gen II. Olvidó rotularlos pero observa que al someterlos al calor las moléculas de ADN presentes en el tubo A se desnaturalizan cuando la temperatura alcanza los 50°C y mientras que las del tubo B lo hacen a los 65°C ¿Cuál de los tubos contiene al gen I? 3) El ARN que resulta de la transcripción del gen A tiene 10% de A, 30% de U y 40% de G a) ¿cuál es el porcentaje de T y de C que posee el mismo? b) ¿cuál es la composición porcentual de bases del gen A?