Los cromosomas sexuales (X e Y) a menudo son de tamaño desigual, la forma y / o cualidades de tinción. La hecho de que se emparejan durante la meiosis es indicación de que contienen al menos algunos segmentos homólogos. Los genes en los segmentos homólogos se dice que son de forma incompleta ligada al sexo o parcialmente ligado al sexo y pueden recombinarse por cruzar en ambos sexos al igual que hacer el loci de genes en autosomas homólogos.