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Universidad de Guanajuato División de Ciencias Naturales y Exactas Lic. en Biología Experimental Laboratorio de Microbiología Práctica 11. Pruebas Bioquímicas Samantha Gudiño Vallejo Parte 1. Fundamentos de Pruebas Bioquímicas FERMENTACIÓN DE CARBOHIDRATOS: GLUCOSA, SACAROSA Y MANITOL En esta prueba se usa un medio sin carbohidratos agregados que se utiliza como base para la adición de carbohidratos para determinar las reacciones de fermentación de los microorganismos. Debe ser capaz de soportar el crecimiento de los organismos de prueba. Se determina si la bacteria es capaz de fermentar un carbohidrato particular (producción de ácidos acompañados o no de gases). Se aplica a bacterias con metabolismo fermentador, ensayándose por separado con diferentes carbohidratos. La producción de ácidos se pone de manifiesto con un indicador ácido-base y la de gases con una campanita Durham (tubo cerrado por uno de sus extremos que se coloca invertido en el medio de cultivo). Las bacterias que fermentan un carbohidrato son por lo general anaerobios facultativos. Por medio del proceso de fermentación, un carbohidrato es degradado y descompuesto en dos moléculas de carbono (Triosas) que son nuevamente degradas en un número de compuestos de 1, 2, 3 y 4 carbonos. Los productos finales varían con cada especie bacteriana y depende del sistema enzimático existente de la especie y las condiciones del medio ambiente. FERMENTACIÓN DE CARBOHIDRATOS EN MEDIO KLIGER Esta prueba es utilizada para la diferenciación de enterobacterias en base a la fermentación de lactosa y glucosa, además de la formación de ácido sulfhídrico. El medio se solidifica en forma inclinada permitiendo tener dos cámaras de crecimiento: una aeróbica y la otra anaeróbica, el fondo del tubo. La fermentación de azúcares, como la glucosa, acidifica el medio lo cual se observa con el cambio de color del rojo fenol (indicador ácido-base incorporado) a amarillo, pero solo se observa en el fondo del tubo, mientras que la superficie cambia a rojo debido a que ahí no se presenta fermentación. Una vez consumida la glucosa, el microorganismo comienza a metabolizar aminoácidos liberando amoníaco, lo cual alcaliniza el medio, esto ocurre en la superficie. Si ocurre una fermentación de lactosa, el medio cambia a amarillo dado que su concentración es mayor, la formación de ácido es suficiente para mantener el color amarillo en todo el tubo. FERMENTACIÓN DE CARBOHIDRATOS: PRUEBAS DE ROJO DE METILO Y VOGES PROSKAUER La prueba de Voges-Proskauer determina la capacidad de algunos organismos de producir un producto final neutro, la acetoína a partir de la fermentación de la glucosa. Esta reacción se basa en la deteción de actoína como producto final neutro derivado del metabolismo de la glucosa. Ésta es metabolizada en ácido pirúvico, intermediario clave en la glucólisis. A partir del ácido pirúviso, una bacteria puede seguir muchas más vías. La producción de acetoína (precursos de la producción de 2,3-butanediol) que es uno de los ciclos para la degradación de la glucosa en las bacterias. La formación de acetoína y butilenglicol es una vía alternativa del metabolismo del ácido pirúvico. Las bacterias que utilizan esta vía producen solo pequeñas cantidades de ácidos mixtos que son insuficientes para disminuir el pH del medio de rojo de metilo, lo bastante como para producir un cambio de color. Por este motivo muchas de las especies de Enterobacterias son VP positivas, con pocas excepciones son RM negativas y viceversa. El primer reactivo agregado a una alícuota incubada es el catalizador α-naftol porque éste actúa como intensificador del color, lo que aumenta la sensibilidad de la reacción sin pérdida de su especificidad. El KPH contribuye a la absorción de CO2, y reaccionará con la peptona dando un color rosado salmón y con el agregado posterior deα-naftol no habrá alteración del color. La prueba de rojo metilo se basa en el empleo de un indicador de pH para determinar la concentración de iones hidrógeno presentes cuando un organismo fermenta glucosa. Las bacterias RM positivas producen ácidos estables manteniendo una alta concentración de iones hidrógeno hasta alcanzar cierta concentración y entonces detiene toda actividad. Los organismos RM negativos también producen ácidos pero tienen una menor concentración de iones hidrógeno porque hay una reversión hacia la neutralidad debida a la nueva degradación de los ácidos orgánicos en carbonatos. UTILIZACIÓN DE ÁCIDOS ORGÁNICOS: El caldo malonato es el medio de cultivo líquido empleado para la prueba diagnóstica (prueba del malonato), utilizado para diferenciar algunos géneros de la familia Enterobacteriaceae. La prueba de malonato se basa principalmente en la capacidad que tienen algunos microorganismos de utilizar como única fuente de carbono al malonato de sodio y como fuente de nitrógeno al sulfato de amonio. Suele dar positiva en algunas especies de los géneros Enterobacter, Klebsiella y Citrobacter. En tanto que, la mayoría de las especies de los géneros Escherichia, Salmonella, Shigella, Edwardsiella, Yersinia, Serratia, Morganella, Proteus y Providencia, dan reacción negativa. La mayoría de las enterobacterias que no utilizan el malonato son capaces de crecer en este medio, tomando como nutrientes la dextrosa y el extracto de levadura. En este caso, cualquier intento de alcalinización cuando esta prueba es positiva se dice que el microorganismo utilizó el malonato y al sulfato de amonio como fuentes de carbono y nitrógeno respectivamente, sin hacer uso de los otros componentes. El medio se alcaliniza debido a la liberación del sodio y la consecuente formación de NaOH. En este sentido, el indicador de pH (azul de bromotimol) hace virar el color del medio de verde hacia azul cuando el pH es igual o mayor a 7,6. El azul puede ser claro o intenso (azul de Prusia). Finalmente, el cloruro de sodio mantiene la osmolaridad del medio y el agua es el diluente de todos los componentes por el uso de las peptonas será contrarrestada por la producción de ácidos generados por la fermentación de la dextrosa. Así mismo, los fosfatos dipotásico y monopotásico actúan como tampón manteniendo el pH a 6,7. Es por ello que, cuando la prueba es negativa, el caldo queda del mismo color original (verde). En raras ocasiones el medio podría acidificarse debido a la fermentación de la dextrosa; sin el uso de las peptonas y el indicador de pH haría virar el color del medio hacia amarillo. Para que ello ocurra el pH debe bajar a 6. Para el Agar citrato de Simmons Algunas bacterias tienen la capacidad de sobrevivir en ausencia de fermentación o producción de ácido láctico, necesitando conseguir energía a través de la utilización de otros sustratos. En esta prueba la única fuente de carbono ofrecida es el citrato. Las bacterias que son capaces de sobrevivirbajo estas condiciones metabolizan el citrato de forma rápida por una vía alterna a la tradicional, utilizando el ciclo del ácido tricarboxílico o el ciclo de fermentación del citrato. El catabolismo del citrato por parte de las bacterias comprende un mecanismo enzimático sin la intervención de la coenzima A. Esta enzima se conoce con el nombre de citricasa (citrato oxalacetato-liasa) o citrato desmolasa. La reacción requiere la presencia de un catión bivalente, que en ese caso es suministrado por el magnesio. https://www.lifeder.com/fermentacion/ https://www.lifeder.com/fermentacion/ La reacción genera oxaloacetato y piruvato, que luego dan origen a ácidos orgánicos en medio de un pH alcalino formado por la utilización de la fuente de nitrógeno. Estos ácidos orgánicos son usados como fuente de carbono generando carbonatos y bicarbonatos, alcalinizando aun más el medio. METABOLISMO DE AMINOÁCIDOS: PRODUCCIÓN DE ÁCIDO SULFHÍDRICO E INDOL. Los elementos del medio posibilitan la determinación de tres actividades por las que se pueden diferencias las bacterias entéricas. El tiosulfato sódico y el sulfato ferroso de amonio son indicadores de producción de ácido sulfhídrico. El sulfato ferroso de amonio reacciona con gas de H2S para producir sulfuro ferroso, un precipitado de color negro. La peptona de caseína es rica en triptofano, que determinados microorganismos atacan, lo que da como resultado la producción de indol. El indol se detecta mediante la adición de reactivos químicos, posteriormente al periodo de incubación. La detección de motilidad es posible gracias a la naturaleza semisólida del medio. Un crecimiento que se propague hacia el exterior a partir de la línea central de inserción de la muestra indica que el organismo de prueba es móvil. METABOLISMO DE AMINOÁCIDOS: PRODUCCIÓN DE AMONIACO E INDOL La prueba del indol es una prueba bioquímica realizada en especies bacterianas para determinar la habilidad del organismo de romper el indol del aminoácido triptófano. Esta división molecular es lograda por una serie de enzimas intracelulares diferentes, un sistema que en conjunto se le llama con frecuencia triptofanasa. Se genera el indol por una desaminación reductiva del triptófano via la molécula intermediaria ácido indolpirúvico. Las triptofanasas catalizan la reacción de desaminación, durante el cual se remueve el grupo amino (NH2) de la molécula de triptófano. Los productos finales de la reacción son el indol, ácido pirúvico, amoníaco (NH3) y energía. Como coenzima de la reacción se requiere al fosfato de piridoxal. METABOLISMO DE AMINOÁCIDOS: PRODUCCIÓN DE LISINA-DESCARBOXILASA Mide la capacidad enzimática de un organismo para descarboxilar un aminoácido para formar una amina, con la consiguiente alcalinidad. La descarboxilación es el proceso mediante el cual las bacterias que poseen enzimas descarboxilasas específicas son capaces de atacar a los aminoácidos en su grupo carboxilo, dando una amina o una diamina y anhídrido carbónico. La descomposición de los aminoácidos se produce anaeróbicamente. El proceso de descarboxilación es irreversible, no oxidativo y requiere una coenzima en común, el fosfato de piridoxal. El aminoácido L-lisina sufre la descarboxilación para dar cadaverina y CO2 por acción de la enzima específica lisina descarboxilasa. https://es.wikipedia.org/wiki/Prueba_bioqu%C3%ADmica https://es.wikipedia.org/wiki/Especie https://es.wikipedia.org/wiki/Bacteria https://es.wikipedia.org/wiki/Ser_vivo https://es.wikipedia.org/wiki/Indol https://es.wikipedia.org/wiki/Amino%C3%A1cido https://es.wikipedia.org/wiki/Tript%C3%B3fano https://es.wikipedia.org/wiki/Mol%C3%A9cula https://es.wikipedia.org/wiki/Enzima https://es.wikipedia.org/wiki/Desaminaci%C3%B3n https://es.wikipedia.org/wiki/Amino https://es.wikipedia.org/wiki/%C3%81cido_pir%C3%BAvico https://es.wikipedia.org/wiki/Amon%C3%ADaco https://es.wikipedia.org/wiki/Energ%C3%ADa https://es.wikipedia.org/wiki/Coenzima https://es.wikipedia.org/wiki/Fosfato_de_piridoxal https://es.wikipedia.org/wiki/Fosfato_de_piridoxal RESPIRACIÓN: REDUCCIÓN DE NITRATOS A NITRITOS Esta prueba determina la capacidad de un organismo de reducir el nitrato en nitritos o en nitrógeno libre. La reducción de nitrato en nitrito y en gas nitrógeno tiene lugar generalmente en condiciones anaerobias, en las cuales un organismo obtiene su oxígeno del nitrato. El oxígeno sirve como aceptor de hidrógeno. La reducción de nitrato en nitrito está indicada por la aparición de color cuando el nitrito reacciona con los dos reactivos. La reacción de color resultante se debe a la formación de un compuesto diazoico, p-sulfobenceno-azo-alfa.naftilamina. RESPIRACIÓN: PRUEBAS DE CITOCROMO OXIDASA Y CATALASA. es un método diagnóstico que evidencia la presencia del complejo enzimático denominado citocromo oxidasa c. Este sistema induce la transformación del citocromo reducido a oxidado, ya que capta el oxígeno y este a su vez actúa como último aceptor de electrones (H+) en la cadena respiratoria. En esta prueba utiliza sustancias que actúan como aceptores artificiales de electrones, sustituyendo los naturales dentro de la cadena de transporte de electrones. Principalmente se utilizan colorantes como el parafenilendiamina y el indofenol, que actúan como sustratos receptores y donadores de electrones artificiales. El parafenilendiamina es oxidado por el sistema del citocromo oxidasa c. El colorante en su forma reducida es incolora, pero en su forma oxidada es coloreado. Es así como se pone en evidencia la presencia del sistema citocromo oxidasa c; pues una reacción positiva generará una coloración lavanda o azul –púrpura dependiendo del reactivo utilizado. En cambio, si la última sustancia aceptora de electrones en la cadena respiratoria es diferente al oxígeno, la prueba de oxidasa dará negativa (no hay producción de color); este es el caso de los microorganismos anaerobios. Así mismo, si el citocromo utilizado por el microorganismo es diferente al citocromo oxidasa c, también dará la prueba negativa. Parte 2. Pruebas bioquímicas en Pseudomonas aeruginosa Prueba de fermentación de carbohidratos Cepa aislada Glucosa Ácido - Gas - Durham Sacarosa Ácido - Gas - Manitol Ácido - Gas - Kligler Glucosa - Gas - H2S - Alcalinización + MR (Rojo de Metilo) + VP (Voges Proskauer) + Prueba de utilización de ácidos orgánicos Citrato de Simmons + Malonato ++ Prueba metabolismo de aminoácidos SIM H 2 S - Indol - movilidad + Caldo triptona Amoniaco + Indol - LIA Descarboxilación - + + Desaminación H 2 S Respiración Reducción de nitratos a nitritos + Oxidasa + Catalasa +
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