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Tema 17: PROCESAMIENTO POST-TRANSCRIPCIONAL � Tipos de ARN: ARNm, ARNr, ARNt, ARNhn, ARNsn, ARNsc � Procesamiento en procariotas � Procesamiento en eucariotas ARNm: Adición de caperuza y poli(A) Edición Splicing y Splicing alternativo ARNr ARNt ARN funcionales (no se traducen a proteínas) - ARN ribosómico (rRNA). - ARN de transferencia (tRNA). - ARN pequeño nuclear (snRNA) - ARN citoplasmático pequeño (scRNA) Tipos de ARN ARN informativos (se traducen a proteínas) - ARN mensajero (mRNA). - ARN heterogéneo nuclear (hnRNA). ARN heterogéneo nuclear (hnRNA) Molécula precursora del ARNm en eucariotas. Es la molécula transcrita directamente del ADN. Incluye secuencias codificantes (exones) y no codificantes (intrones). Este ARN será procesado. ARN mensajero (mRNA) Eucariotas: molécula resultante del procesamiento del hnRNA. Procariotas: molécula transcrita directamente del ADN. Codifican para una o varias proteínas. Su secuencia de nucleótidos es traducida en una secuencia de aminoácidos en el proceso de la traducción. Incluye formas muy heterogéneas tanto en tamaño como en secuencia. Existe, en general, una molécula de mRNA para cada gen o grupo de genes que codifique una proteína Es el menos abundante de todos los ARNs celulares. En E. coli. Representa entre el 2 y el 5 % del total del ARN celular ÁÁcido Ribonucleicocido Ribonucleico Mensajero de vida muy corta entre el núcleo y el citoplasma * Polinucleótido. * Composición reflejo de la del ADN que lo especifica. * Heterogéneo en tamaño. * Asociado transitoriamente con los ribosomas. * De síntesis y degradación rápida. Concepto de mRNA introducido por François Jacob y Jacques Monod en 1961. ARN mensajero ADN: núcleo Síntesis protéica: citoplasma * Es el molde para la síntesis de proteínas Tipos de ARNs en la célula eucariótica Eucariotas Procariotas ARN ribosómico (rRNA) Componente de los ribosomas. Función estructural Es el más abundante en la célula (75%). Función catalítica en la síntesis de proteínas (Ribozimas). Diferentes tipos en función de sus coeficientes de sedimentación. 16S + 21 polipèptidos (subunidad ribosómica pequeña: 30S) 23S + 34 polipéptidos (subunidad ribosómica grande: 50S). 5S (subunidad ribosómica grande: 50S). 18S + 30 polipéptidos (subunidad ribosómica pequeña: 40S). 28S (subunidad ribosómica grande: 60S). 5,8S + 49 polipéptidos (subunidad ribosómica grande: 60S). 5S (subunidad ribosómica grande: 60S). Tipos de ARNs en la célula eucariótica ARN de transferencia (tRNA) ARN pequeño con unos 75 nucleótidos de media. Transporte de aminoácidos activados hasta el ribosoma. Proceso de traducción del mRNA. Al menos un tipo de tRNA para cada uno de los 20 aminoácidos. Todos los tRNAs presentan en su extremo 3´ la secuencia de nucleótidos CCA. Algunos aminoácidos tienen varios tRNAs: Leu y Arg (6 cada uno) 5´ Extremo aceptor del aminoácido. Tipos de ARNs en la célula eucariótica ARN pequeño nuclear (snRNA) ARN citoplasmático pequeño (scRNA) Participan en el proceso de eliminación de intrones y unión de exones (ARNm). Son secuencias pequeñas de unos 150 nucleótidos de media. ARN de unos 300 nucleótidos 7SL RNA que forma parte del SRP (Signal Recognition Particle). Se asocian con proteínas específicas formando los “Snurps” Partician en el envío de proteínas a su destinos finales Tipos de ARNs en la célula eucariótica Forman parte de los Espliceosomas: Complejos dinámicos grandes formados por Snurps, proteínas denominadas factores de empalme, y los pre-mRNA que se van a procesar. . Procesamiento en procariotas Procesamiento en eucariotas * RNA ribosómico * Metilación * Rotura nucleolítica * RNA mensajero * No modificado * RNA transferente * Rotura en 5’- y 3’- * Adición de CCA * Modificación de bases * RNA ribosómico (RNA polimerasa I) * Metilación * Rotura nucleolítica * RNA mensajero (RNA polimerasa II) * Caperuza 5’ * Poliadenilación 3’ * Eliminación de intrones (maduración o splicing nuclear) * Edición del ARN * RNA transferente (RNA polimerasa III) * Rotura en 5’- y 3’- * Adición de CCA * Modificación de bases * tRNA splicing Procesamiento de RNA Procesamiento en procariotas ARNm Prácticamente no experimentan ningún tipo de maduración en procariotas. ARNt y ARNr: Se originan por escisión de un mismo transcrito primario. Endonucleasas 1-RNAasa III 2-RNAasa P 3-RNAasa E Exonucleasas Modificación de bases Escisión en 5´ Escisión en 3´ Adición de CCA RNasa P RNasa D Procesamiento en procariotas ARNt Esquema de un RNA mensajero maduro Procesamiento en eucariotas Procesamiento en eucariotas En los extremos del transcrito pre-mRNA se sitúa una cofia en 5´ y una cola de poli(A) en 3´ pre-mRNA Modificación del extremo 5´de la cadena de ARNm durante la transcripción por adicción de una cofia. Hidrólisis del extremo 5´trifosfato (RNA-trifosfatasa) Formación de un enlace 5´-5´-trifosfato entre extremo 5´-difosfato y el fosfato-αααα de un GTP. (guanililtransferasa) Metilación del N7 de la guanina terminal guanina-7-metil transferasa (S-adenosilmetionina). Cofia 0 2´-O-metil transferasa Cofia 1 Cofia 2 ARNm Procesamiento en eucariotas Funciones de la cofia en 5’: � Marca el extremo 5’ para el procesamiento del primer exón � Esencial para el transporte del mRNA entre el nucleo y el citosol. Interacción con proteínas nucleares. � Aumenta la eficiencia de la traducción. Interviene en la formación del complejo de pre-iniciación (cytoplasmic cap-binding proteins) � Protege de la actividad de exonucleasas 5’→3’ ARNm Procesamiento en eucariotas Poliadenilación en el extremo 3´ 1. Una endonucleasa específica reconoce la secuencia AAUAAA en el pre mRNA 2. Una poli(A) polimerasa añade unos 250 residuos al extremo 3´. El ATP sirve de donador •Confiere estabilidad a frente a la acción de nucleasas. •Facilita y aumenta la efectividad de la traducción del ARNm •Relación inversa entre velocidad de degradación de la cola de poli A y vida media de una molécula de ARNm. Procesamiento en eucariotas La poliadenilación ocurre antes de que el transcrito se disocie de la ARN polimerasa II ARNm ¿ Cuál es el papel fisiológico de la cola de poli A ? Modificación post-transcripcional o corrección del ARN mensajero (RNA editing) Modificación a posteriori de la secuencia del transcrito. Puede afectar a uno o a varios nucleótidos. La modificación del nucleótido puede acarrear un cambio de aminoácido y que éste afecte a la estructura o la función de la proteína. Ej: Apo B-100 ,Apo B-48. Se sintetiza en hígado. Participa en el transporte de lípidos celulares No puede unirse al receptor de la LDL de la superficie celular -Desaminación de citidina, generando uridina - cambio del codón: CAA (Gln) � UAA(stop) Procesamiento en eucariotas Se sintetiza en intestino delgado Transporte de grasa de la dieta Eliminación de los intrones: splicing Procesamiento en eucariotas • El pre-ARN mensajero está formado por secuencias codificantes denominadas exones separados por secuencias no codificantes denominadas intrones. •El proceso de eliminación de los intrones se realiza en el núcleo, mediante un mecanismo muy complejo denominado splicing. Secuencia variable en longitud (50 a 10.000 pb). Todos comienza con GU y termina con AG. En vertebrados la secuencia consenso es: Extremo 5´: AGGUAAGU Extremo 3´: 10 pirimidinas (U o C), N, C y la secuencia AG. GU-AG Procesamiento en eucariotas Estructura de los intrones Todos los intrones poseen una secuencia interna importante que se denomina centro de ramificación. Esta secuencia se situá entre 20 y 50 nucleótidos secuencia arriba del sitio de empalme 3´. Los puntos de corte y empalme se especifican mediante las secuencias situadas en los extremos de los intrones ¿ Cómo se unen los exones ? Precursor Ataque nucleofílico (2´-5´-fosfodiéster) Lazo intermedio Producto Formación enlace fosfodiester 5´-3´ Ataque nucleofílico al 5´delsegundo exón Extremo 3´OH libre del exón 1 Generación de un grupo 3´-OH libre en el extremo 3´en el exón 1 Unión del grupo 3´-OH con el grupo fosfato 5´del exón 2 Implica la rotura y formación de nuevos enlaces fosfodiesteres Dos reacciones de transesterificación Procesamiento en eucariotas Espliceosoma: Complejos dinámicos grandes (60S) que se forman durante la maduración del mRNA Reconocen sitios de unión 5´y 3´de los exones así como los puntos de ramificación. Unión de U1-snRNP al sitio 5´de splicing 5´ Unión de U2-snRNP al centro de ramificación Procesamiento en eucariotas ¿ Cómo se unen los exones ? Formados por: - snRNPs o snurps: asociaciones de snRNAs y proteínas - Cientos de proteínas factores de empalme - los pre-mRNA que están madurando snRNAs: U1, U2, U4, U5, U6 Los RNAs nucleares pequeños (snRNAs) de los espliceosomas catalizan el empalme de los precursores de mRNA Asociación del complejo U4/U6 U5, previamente formado al complejo U1-U2 (espliceosoma inactiva ). U5 interacciona con el exon en 3’ . U6 se disocia de U4. U6 se reordena e interacciona con U2 y el extremo 5’ del intrón Separación de U1 (spliceosoma activo) Interacción de U5 con la secuencia del exón en el centro de corte y unión 5´. U5 alinea el exón libre en 5’ con el situado en 3’ Ataque nuclefílico grupo 3´-OH del exón 1 al centro de emplame del exón 2. Procesamiento en eucariotas Se forma el lazo U2-U6: centro catalítico Primera reacción de transesterificación Ataque nuclefílico del –OH 2’ del adenilato Liberación de U2,U5,U6-intrón (lazo) Células de mamífero Procesamiento en eucariotas La maduración está catalizada principalmente por moléculas RNA (Ribozimas), con las proteínas desempeñando un papel secundario Splicing alternativo 1. Mecanismo que crea diversos ARN maduros a partir de un mismo gen, mediante corte y empalme de distintas combinaciones de exones. 2. La selección que controla qué centros de cortes y empalmes son elegidos, viene determinada por la unión de factores de maduración. 3. Se generan distintas formas de una proteína según el tejido, estado de desarrollo, vía de señalización… Procesamiento en eucariotas Mecanismo que genera diversidad proteica En el genoma humano, la mayor parte de los pre-mRNA experimentan splicing alternativo Splicing alternativo Proteína relacionada con el gen de la calcitonina Procesamiento en eucariotas Gen de la Calcitonina ARNr Las moléculas de ARN ribosómico se forman por rotura de transcritos primarios Procesamiento en eucariotas RNA polimerasa I (nucleolo) RNA polimerasa III (nucleoplasma) snoRNPs ARNt Sufren una escisión de una secuencia guía 5. Eliminación de un intrón de 14 nucleótidos. Sustitución del extremo terminal 3´UU por CCA. Modificaciones químicas de bases y ribosa. Procesamiento en eucariotas RNA polimerasa III endonucleasa ligasa RNasa P
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