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I. Las moléculas clase I tienen una cadena pesada de glicoproteína y una cadena ligera de proteína 
pequeña. 
II. Las moléculas clase II tienen dos cadenas de glicoproteína no idénticas. 
 
 Estrucutura de las MHC I 
Dos polipéptidos se ensamblan para formar una molécula de MHC clase I única: una cadena α 
de 45 kilodaltones (kDa) y una molécula de β2-microglobulina de 12 kDa. 
 
La cadena α está organizada hacia tres dominios 
externos (α1, α2 y α3), cada uno de aproximadamente 
90 aminoácidos de largo; un dominio transmembrana 
de alrededor de 25 aminoácidos hidrofóbicos seguidos 
por un tramo corto de aminoácidos cargados 
(hidrofílicos), y un segmento de anclaje citoplasmático 
de 30 aminoácidos. Su acompañante, la β2-
microglobulina, tiene tamaño y organización similares 
al dominio α3. La β2-microglobulina no contiene una 
región transmembrana, y está unida de manera no 
covalente a la cadena α de MHC clase. Datos sobre 
secuencia revelan fuerte homología entre el dominio 
α3 de MHC clase I, la β2-microglobulina y los dominios de región constante que se encuentran 
en inmunoglobulinas. 
 
Los dominios α1 y α2 interactúan para formar una plataforma de ocho cadenas β antiparalelas 
abarcadas por dos regiones α-helicoidales largas. La estructura forma un surco profundo, o 
hendidura, con las hélices α largas como los lados y las cadenas β de la lámina β como el fondo. 
Este surco de unión a péptido está ubicado sobre la superficie superior de la molécula de clase 
I, y es suficientemente grande como para unirse a un péptido de ocho a 10 aminoácidos. 
 
El dominio α3 y la β2-microglobulina están organizados hacia dos láminas con plegamiento β, 
cada una formada por cadenas β de aminoácidos antiparalelas. Esta estructura, conocida como 
el pliegue de inmunoglobulina, es característica de los dominios de inmunoglobulina. Debido a 
esta similitud estructural, que no sorprende dada la considerable similitud de secuencia con 
las regiones constantes de inmunoglobulina, las moléculas de MHC clase I y la β2-
microglobulina se clasifican como miembros de la superfamilia de las inmunoglobulinas. El 
dominio α3 parece estar altamente conservado entre moléculas de mhc clase I, y contiene una 
secuencia que interactúa fuertemente con la molécula de superficie celular CD8 que se 
encuentra en células TC. 
 
 Estructura MHC II 
Las moléculas de MHC clase II contienen dos cadenas polipeptídicas diferentes, una kDa α de 
33 kDa, y una cadena β de 28 kDa, que se asocian por medio de interacciones no covalentes . 
Al igual que las cadenas α clase I, las moléculas de MHC clase II son glicoproteínas unidas a 
membrana que contienen dominios externos, un segmento transmembrana, y un segmento 
 
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de anclaje citoplasmático. Cada cadena en una 
molécula clase II contiene dos dominios externos: 
dominios α1 y α2 en una cadena, y dominios β1 y β2 
en la otra. Los dominios α2 y β2 proximales de 
membrana, como los dominios de α3/β2-
microglobulina proximal de membrana de 
moléculas de mhc clase I, muestran similitud de 
secuencia a la estructura de pliegue de 
inmunoglobulina. 
 
Por esta razón, las moléculas de MHC clase II 
también se clasifican en la familia de la 
inmunoglobulina. Los dominios α1 y β1 forman el surco de unión a péptido para antígeno 
procesado. Aunque similar al surco de unión a péptido de MHC clase I, este surco es formado, 
así, por la asociación de dos cadenas separadas. 
 
o Unión al péptido de las moléculas HLA. 
 Moléculas clase I Moléculas clase II 
Dominio de unión a péptido α1/α2 α1/β1 
Naturaleza del surco de unión al 
péptido 
Cerrado en ambos extremos Abierto en ambos extremos 
Tamaño general de los péptidos 
unidos 
Ocho a 10 aminoácidos 13 a 18 a aminoácidos 
Motivos peptídicos involucrados 
en la unión a molécula de MHC 
Residuos de anclaje en ambos 
extremos del péptido; por lo 
general ancla carboxilo terminal 
hidrofóbica. 
Residuos conservados distribuidos 
a lo largo de la longitud del 
péptido. 
Naturaleza del péptido unido 
Estructura extendida en la cual 
ambos extremos interactúan con 
el surco del MHC pero forma un 
arco que asciende y separa de la 
molécula de MHC. 
Estructura extendida que es 
sostenida a una elevación 
cosntante por arriba del piso del 
surco de MHC 
 
o Herencia del MHC 
El complejo mayor de histocompatibilidad es un conjunto de genes dispuesto dentro de un tramo 
continuo largo de ADN en el cromosoma 6 en seres humanos, y en el cromosoma 17 en ratones. El 
MHC se denomina complejo de antígeno leucocítico humano (HLA) en seres humanos, y complejo H-2 
en ratones, las dos especies en las cuales estas regiones se han estudiado más. Aunque la disposición 
de genes es un poco diferente en las dos especies, en ambos casos los genes que codifican para el MHC 
están organizados en regiones que codifican para tres clases de moléculas: 
 
 Los genes que codifican para el MHC clase I codifican para glicoproteínas expresadas sobre la 
superficie de casi todas las células nucleadas; la principal función de los productos del gen que 
codifica para clase I es la presentación de antígenos peptídicos endógenos a células T CD8+