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ADN mitocondrial Las mitocondrias son organelos, que tienen como función principal la síntesis de la energía celular necesaria para las funciones metabólicas de los organismos. Dentro de la mitocondria acontecen 4 pasos de la respiración celular, para cumplir sus funciones metabólicas. En la mitocondria se consume la glucosa y otras sustancias energéticas en un proceso que requiere oxígeno y en el que se genera energía, se almacena en forma de ATP F u n c i o n e s -Producción de energía -Regulador de temperatura -Control del ciclo celular -Almacenamiento de calcio -Regulación de hormonas sexuales Tiene una estructura circular y se localiza extra nuclear y de doble cadena. Cuando hablamos de los mecanismos de replicación y transcripción de la mitocondria, también hablamos de los mecanismos del genoma nuclear, pero estos últimos son más complejos. La mitocondria tiene muchas copias de ADNmt, y varían durante toda la vida, por esta razón, no está directamente coordinado con el ciclo celular. También disminuye la corrección de errores de la replicación Hay variaciones en la secuencia que pueden ser poliforfismos silentes, eso quiere decir que, no tienen el potencial de un efecto fenotípico o patógeno, pero hay otras que pueden ser consideradas mutaciones patógenas Variaciones en la secuencia del ADNmt Mitocondria como cocina Las mitocondrias son como la cocina de nuestras células y órganos, así que cuando hay un fallo,la consecuencia es inmediata, y se produce la falta de energía Como habíamos dicho, el ADNmt, tiene dos cadenas complementarias, que tienen una proporción C y G muy diferente, ya que su peso molecular es distinto Cadenas complementarias del ADNmt Cadena pesada o H Cadena rica en púricas Cadena ligera o L Cadena rica en pirimidinas La información que está dentro de la mitocondria está compactada, porque no hay intrones Los genes están en la región codificante, y representa el 90%, 28 de los genes están codificados por la cadena H y 9 por la L Hay genes nucleares que se sintetizan en el citoplasma y luego se transportan a la mitocondria en forma de proteínas, son de gran importancia, porque están implicadas en el proceso de la fosforilación oxidativa, que es el proceso en el que se forma ATP desde la transferencia de electrones Estructura y organización Hay 37 genes de los cuales codifican: 22 genes - ARN t 2 genes - ARN r 13 genes - ARN s mensajeros El 10% restante de la molécula es ADN no codificante y se llama región control, que contiene: -promotores de la transcripción de ambas cadenas -origen de replicación de la cadena pesada -lugares de unión de factores de transcripción Región control: Región no codificante Es una región muy polimorfica, que tiene dos regiones hipervariables ¿Qué es el D-Loop? Región hipervariable 1: HVI Región hipervariable 2: HVII El código genético mitocondrial es diferente al universal, porque hay 64 codones pero 4 codones reciben un significado distinto. Sin embargo, el código genético mitocondrial es casi el mismo para todos los organismos, lo que significa que todas las células eucariotas evolucionaron a partir de un antepasado común. Las mitocondrias no se sintetizan de novo, sino que surgen por crecimiento y división de otras ya existentes, porque cada órgano lo duplica su masa y luego se divide por la mitad, así que importan lípidos, nucleótidos y proteínas desde el citosol. Si una célula tiene moléculas ADNmt diferentes, la proporción de moléculas mutantes que van a pasar a sus hijas puede variar mucho en el genotipo Segregación mitótica Heteroplasmía Es el estado en el que un individuo, célula o mitocondria presenta más de un genotipo de ADNmt. En muchos individuos no hay evidencia de heteroplasmía, pero si hay evidencia de que está mutado Las mutaciones de ADN mitocondrial se van a distribuir al azar entre los tejidos y van a tener distintas proporciones de mutación Homoplasmía Es el estado en el que no podemos detectar las mutaciones, en este caso solo existe la presencia de un único tipo de ADN mitocondrial Solo se determina con doble secuenciación, mientras que en la homoplasmía, solo basta con una secuencia Efecto umbral Solo se necesita que la mutación exista al mínimo, para que genere una expresión fenotípica o bioquímica del efecto mitocondrial, los tejidos que dependen más de la energía, que la necesitan más, se verán más afectados, habrá más mutación. Es decir, solo con que esté afectado un poco, va a estar la enfermedad Genes mitocondriales Estas son las funciones de los genes mitocondriales -síntesis de complejos -factores de ensamblaje -portadores de electrones para la fosforilacion oxidativa (OXPHOS) -mantenimiento de ADNmt (homeostasis de nucleósidos) -expresión de ADNmt: afecta la síntesis, procesamiento y modificación de ARN mitocondrial, ya sea el ribosómico, el de transferencia y el mensajero -biogénesis de ribosomas mitocondriales -biogénesis de cofactores enzimáticos -homeostasis y control de calidad mitocondrial: porque sino afectaría a la importación de proteínas, metabolismo de los lípidos, morfología mitocondrial, y a los mecanismos de apotosis -metabolismo energético: sino afectaría el ciclo de krebs El ADN mitocondrial codifica trece proteínas involucradas en la producción de energía celular y procesos de fosforilación oxidativa. Mutaciones El gen mutado más frecuente en niños es: PDHA1 Este gen, afecta el complejo piruvato deshidrogenasa El gen nuclear mutado más frecuente en adultos son: POLG, OPA1 y TWNKL El gen mutado más frecuente en adultos es: TYMP y TK2 Las enfermedades son causadas por mutaciones en el ADN nuclear o en el ADN mitocondrial. Dependiendo del tipo específico de la enfermedad, los síntomas pueden variar, pero usualmente incluyen debilidad muscular, desequilibrio, problemas gastrointestinales, crecimiento deficiente, enfermedad hepática y cardiaca, diabetes, problemas visuales y auditivos, acidosis láctica y retrasos en el desarrollo Enfermedades Síntomas Existen 400 genes que causan estas enfermedades. El diagnóstico requiere un enfoque integral que comprenda la exploración clínica de diferentes órganos y sistemas, imágenes, anatomía patológica, electrofisiología, exámenes bioquímicos y genéticos. El aumento de lactato, privado y alanina son biomarcadlres clásicos para orientar al diagnóstico Diagnóstico a) cuadro clínico reconocido o sugestivo b) neuroimagen sugestiva, exploración oftalmológica, electromiograma c) estudio bioquímico en sangre, orina y LCR (análisis de líquido cefalorraquídeo) d) biopsia muscular e) estudio enzimático en biopsia muscular o tejido afecto: que hace referencia si hay una alteración en el sistema OXPHOS f) estudio genético en diferentes tejidos Hay un aspecto que se debe tener en cuenta para caracterizar a las enfermedades mitocondriales y es que son las únicas causadas por mutaciones en dos sistemas genéticos, los dos sistemas son el nuclear y el mitocondrial. El nuclear por su parte es el causante de la mayoría de enfermedades raras. Característica más importantes de las EM La diferencia entre estos dos ADN El ADN mitocondrial El ADN nuclear ~Se encuentra en el núcleo de las células eucariotas ~Es una molécula mayor, que tiene más de 3’000.000 de nucleótidos ~Tiene miles de genes diferentes, que se encargan de todas las funciones del organismo ~Es de doble cadena, pero es lineal, con extremos abiertos ~Se encuentra dentro del organelo llamado mitocondria ~Es una molécula de pequeño tamaño que tiene entre 16.000 y 17.000 nucleotidos ~Tienen 37 genes diferentes, que se encargan del proceso de la respiración celular ~Es de doble cadena, pero tiene dos hilos enrollados sobre sí mismos, que hacen una molécula circular, con extremos cerrados Síndromes mitocondriales neonatales Se considera neonatal las primeras 4 semanas de vida, es decir, los primeros 28 días. La mutación es originadapor una alteración de la fosforilación oxidativa OXPHOS, estos defectos, alteran el transporte, la interacción de la mitocondria con otros organulos, fusión y fisión, reparación del ADN Por ejemplo: el síndrome de Leigh, es un transtorno progresivo en la infancia,está asociada con más de 75 genes de ADN mitocondrial o nuclear diferentes. Tipo de herencia Tiene un patrón no mendeliano, tiene una herencia estrictamente materna. ¿Por qué no tiene que ver con el padre? Porque las mitocondrias del esperma son selectivamente destruidas en el oocito, así que el ADNmt paterno es marcado mediante la ubiquitinzación durante la espermatogénesis, para su destrucción en el oocito Polimorfismos Son variaciones producidas en un gen que está dentro de la secuencia de ADN, proteína o cromosoma, que no tiene efectos adversos sobre el individuo Existen diferentes tipos de polimorfismos: 1. Polimorfismos de longitud Son producidos por inserciones o deleciones de uno o más nucleótidos 2. Polimorfismos de secuencia o SNP Son producidos por el cambio de uno o más nucleótidos en una secuencia de ADN, puede cambiar un solo nucleótido (transiciones, transversiones) este tipo de mutación aparece en más del 1% de la población, es por eso que es el más frecuente, tanto en la nuclear como en la mitocondrial, se encuentran en regiones donde no alteran la función génica Ragged-Red Fibers Son áreas con acumulaciones de mitocondrias, que aparecen de color púrpura, con el tiempo se conviertieron en un marcador patológico de las miopatías mitocondriales Sistema OXPHOS Es la integración funcionan de dos genomas, es el sistema de fosforilación oxidativa,es la única ruta celular que está bajo control de dos genomas: el nuclear y el mitocondrial, está formado por 5 complejos polipétidicos localizados en dentro de la membrana mitocondrial interna Hay 80 proteínas que conforman estos 5 complejos: 13 son codificadas para el mitocondrial 67 son codificadas para el nuclear Clasificación de las mutaciones que podrían haber Mutaciones que afectan a los genes, los cuales codifican proteínas que están implicadas en la cadena respiratoria, que funcionan para ayudar a la estructura o el ensamblaje Defectos en la señalización intergenómica, que podría afectar a los factores, que realizan funciones importantes para la homeostasis, la replicación y la transcripción del ADNmt Mutaciones que afectan el transporte de proteínas, que son codificadas por el ADN nuclear, desde el citoplasma al interior de la mitocondria Mutaciones que alteran la membrana fosfolipídica de la mitocondria, en la que se encuentra la cadena respiratoria Alteraciones en la división por fisión 1 2 3 4 5 Clasificación por medio de grupos MELAS síndrome de encefalopatía mitocondrial, acidosis láctica y episodios stroke-like MERRF Epilepsia mioclónica asociada a fibras rojas rasgadas NARP (Neuropatía, ataxia, retinitis pigmentosa) MILS (síndrome de Leigh) Afectan a los genes implicados en la síntesis de proteínas, reordenamientos y mutaciones puntuales en los dos genes de ARNe y los 22 genes de ARNt Aquellas que afectan a los genes que codifican alguna de las 13 subunidades de la cadena respiratoria Grupo 1 Grupo 2 Criterios para determinar la patogenicidad de una mutación de ANDmt La patogenicidad es la capacidad que tiene un microorganismo de infectar, para luego producir síntomas -no debe haber mutación en los individuos del mismo gripo étnico -la mutación debe ocurrir en un sitio conservado evolutivo y funcional - la mutación debe ser heteroplásmica - debe haber segregación dentro de la familia: la proporción de genomas mutados debe ser mayor en los tejidos afectados, que en el mismo tejido de miembros de la familia no afectados -la mutación debe segregar dentro del propio individuo -la mutación debe causar deficiencias en la cadena respiratoria de los tejidos afectados, o defectos en la síntesis proteica, que lleguen a afectar la respiración celular
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