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Aminoácidos Compuestos orgánicos formados por un grupo amino primario (NH2) y un grupo carboxilo (COOH), unidos a un mismo átomo de carbono. Algunos aminoácidos se encuentran libres como neurotransmisores, otros se unen entre sí formando péptidos como hormonas, o formando proteínas con múltiples funciones. 2 Estructura General C COO¯ R H H3N + α 3 Predomina a pH fisiológico Formas de los Aminoácidos C COO¯ R H H3N + C COOH R H H2N zwitterión Ión híbrido 4 C COO¯ CH3 H H3N + Isomerismo de los Aminoácidos (excepto la glicina) C COO¯ CH3 H + NH3 L- Alanina D- Alanina Imágenes quirales (no superponibles) Carbono asimétrico Enantiómeros o isómeros especulares Poseen actividad óptica: rotan el plano de la luz polarizada hacia la derecha (dextrógiros) o hacia la izquierda (levógiros). 5 1) Componentes o no de las proteínas Clasificación de los aminoácidos Aminoácidos proteicos: glicina, alanina, valina, leucina, isoleucina, prolina, serina, treonina, cisteína, metionina, tirosina, triptófano, fenilalanina, glutamato, glutamina, aspartato, asparagina, histidina, lisina, y arginina. Aminoácidos no proteicos: ornitina, citrulina, ácido gamma-aminobutírico (GABA), etc. 6 2) Según su capacidad de interaccionar con el agua: Apolares Polares Ácidos: Básicos: glicina, alanina, valina, leucina, isoleucina metionina y prolina. Alifáticos: Aromáticos: Fenilalanina y triptófano. serina, treonina, cisteína, glutamina, tirosina y asparagina histidina, lisina y arginina. glutamato, aspartato. Neutros: 7 Glicina, Gly, G Valina, Val, V Alanina, Ala, A Leucina, Leu, L Metionina, Met, M Isoleucina, Ile, I Aminoácidos Apolares Alifáticos: Prolina, Pro, P 8 Aminoácidos Apolares Aromáticos: Fenilalanina, Phe, F Triptofano, Trp, W 9 Aminoácidos Polares Neutros: Serina, Ser, S Treonina, Thr, T Cisteína, Cys, C Asparagina, Asn, N Glutamina, Gln, Q Tirosina, Tyr, Y 10 Aspartato, Asp, D Glutamato, Glu, E Aminoácidos Polares Ácidos: 11 Aminoácidos Polares Básicos: Lisina, Lys, K Arginina, Arg, R Histidina, His, H 12 13 Selenocisteina, Sec, U Pirrolisina, Pyl, O Aminoácidos proteicos nuevos 3) Esencialidad nutricional Nutricionalmente esenciales: no sintetizados por el organismo (valina, leucina, isoleucina, treonina, metionina, lisina, fenilalanina y triptófano). b) Se sintetizan en cantidades adecuadas para el estado adulto pero no para el estado de crecimiento o la preñez (arginina e histidina). a) Sintetizados a partir de aminoácidos esenciales (cisteína, a partir de metionina y tirosina, a partir de fenilalanina). Nutricionalmente semiesenciales: pueden ser sintetizados por el organismo (glicina, alanina, prolina, serina, glutamato, glutamina, aspartato, asparagina). Nutricionalmente no esenciales: 14 Comportamiento Ácido – Base R-COOH R-COO¯ + H+ R-NH3+ R-NH2 + H+ Ácido Base conjugada Los aminoácidos son moléculas anfóteras ya que pueden actuar como ácidos o como bases Ácido= Sustancia capaz de ceder protones Base= Sustancia capaz de aceptar protones 15 Las fuerzas relativas de los ácidos débiles se expresan en términos de la constante de disociación del ácido (KA) o de su pKA pKA = - log KA pH= - log H+ pKA = Valor del pH en el cual el aminoácido se encuentra 50% disociado y 50% no disociado. Presenta máximo poder amortiguador 16 Formas iónicas de los Aminoácidos en disolución Debido a que los aminoácidos poseen al menos dos grupos ionizables en su estructura (el – COOH y el –+NH3) , la forma iónica predominante de estas moléculas en disolución depende del pH. C COOH CH3 H H3N + C COO¯ CH3 H H3N + C COO¯ CH3 H H2N Medio ácido pH bajo Medio neutro pH fisiológico Medio básico pH alto Carga neta = +1 Carga neta = 0 Carga neta = -1 17 Estados de disociación de los grupos ionizables del L- -aminoácido Histidina pKA -COOH pKA Imidazol pKA -+NH3 Carga neta= +2 Carga neta= +1 Carga neta= 0 Carga neta= –1 pH Ácido pH Básico pI= pKA Imidazol + pKA -+NH3 2 18 Curva de valoración de la histidina pKA -COOH pKA Imidazol pKA -+NH3 Equivalentes de ¯OH 19 pI Propiedades químicas de los aminoácidos 1. Formación de sales sal + agua Ácido + base 2. Formación de ésteres Ácido + alcohol éster + agua péptido + agua 3. Formación de enlace peptídico Amino + carboxilo 20 21 C CH2 H H3 + N CH2 COOH H Ácido -aminobutírico (GABA) Aminoácidos precursores de compuestos especializados Neurotransmisor, considerado un mediador de la sinapsis de tipo inhibidor C CH2 H H3 + N C – N C – N H CH H H Histamina Mediador local potente en las reacciones alérgicas, interviene en el control de la secreción de HCl por el estómago 22 C CH2 H H3 + N COO¯ HO OH L-Dopa Dopamina Derivado de L-Tirosina es un neurotransmisor relacionado con las funciones motrices, emociones y sentimientos de placer C CH2 H H3 + N H HO OH Derivado de L-Tirosina es precursor de la dopamina 23 C H – C – OH H H3 + N H HO OH C H – C – OH H CH3- NH H HO OH Adrenalina o epinefrina Noradrenalina o norepinefrina Derivado de L-Tirosina es una hormona que actúa sobre diversos órganos facilitando la transmisión del impulso nervioso, incrementa el ritmo cardíaco, disminuye el flujo sanguíneo en los intestinos y lo aumenta en los músculos esqueléticos, aumenta la glicemia y es broncodilatador Derivado de L-Tirosina, interviene en la relajación intestinal, vasoconstricción y dilatación de las pupilas, incrementa la frecuencia y contractilidad cardíaca, la vasodilatación, la broncodilatación y la lipólisis 24 Tiroxina (T4) Derivado de L-Tirosina es una prohormona que estimula el metabolismo basal. C CH2 H H3 + N COO¯ I O OH I I I C CH2 H H3 + N COO¯ I O OH I I Triyodotironina (T3) Derivado de L-Tirosina es una hormona tiroidea que estimula el metabolismo basal, su efecto es 80% superior al de la T4. 25 Producto de la condensación de L-Glicina y Succinil~CoA, hasta formar un anillo tetra- pirrolico, dentro del cual se encuentra un átomo metálico. Porfirinas Serotonina Derivado del Triptófano, regula el apetito, deseo sexual, temperatura corporal, las actividades motoras y las funciones perceptivas y cognitivas, provoca la contracción del músculo liso Melanina Es un pigmento de color negro a pardo negruzco derivado de la Tirosina, el cual se encuentra en la piel, cabello y recubrimiento de la retina de los vertebrados, medula adrenal, zona reticular de la glándula adrenal, oído interno, sustancia negra del cerebro, locus coeroleus. Péptidos Compuestos nitrogenados formados por 2 ó más residuos de aminoácidos, unidos por uno ó más enlaces peptídicos. Enlace peptídico: Es un enlace amida que se forma cuando el par de e¯ sin compartir del grupo -amino de un aminoácido ataca al carbono -carboxilo de otro aminoácido. 27 Formación de un enlace peptídico + + Glicina Alanina Glicilalanina, Gli-Ala, GA Agua Enlace peptídico α α α α 28 C COOH H H H2N + C COOH CH3 H H2N HOH C COOH CH3 H N C C H H H2N O H Formación de un dipéptido Glicina, Gly Alanina, Ala Glicil-alanina, Gly-Ala 29 30 Características del enlace peptídico La unidad peptídica es rígida y plana • Presenta un carácter parcial de doble enlace. • Es un híbrido de resonancia con electrones deslocalizados a lo largo de los enlaces (C – N) y (C – O). • Los átomos involucrados en el enlace peptídico son coplanares. • Trans: El hidrógeno del grupo amino sustituido, está casi siempre ubicado opuesto al oxígenodel grupo carbonilo. Nomenclatura de los péptidos Ala-Ser-(Cis-Lis-Fen)-His-Tre AS(CKF)HT Los péptidos se nombran comenzando por el extremo N y se les da el sufijo “il” a los aminoácidos excepto al último, es decir, se nombran como derivados del aminoácido del extremo carboxilo Alanil-seril-cisteil-lisil-fenilalanil-histidil-treonina Abreviaturas o símbolos separados por guiones, y colocando entre paréntesis los aminoácidos dudosos: Por ejemplo: 31 Representación de los péptidos 1. En zig-zag, con extremo amino a la izquierda. 2. Abreviaturas separadas por guiones, colocando entre paréntesis los aminoácidos dudosos: AS(CKF)HT 3. Derivados del aminoácido del extremo carboxilo. Alanil-seril-(cisteil-lisil-fenilalanil)-histidil-treonina Ala-Ser-(Cis-Lis-Fen)-His-Tre 32 H3N + C O C N C C N C C H H O O O¯ H H H CH2 OH CH2 COO¯ CH2 OH Representación de un tripéptido Aspartil-tirosil-serina Amino terminal Carboxilo terminal Asp-Tir-Ser DYS 33 Clasificación de los péptidos 1. Según el número de los residuos de aminoácidos (1 sola cadena): •Dipéptido (2 residuos de aminoácidos), •Tripéptido (3 residuos de aminoácidos) •Oligopéptido (4 a 10 residuos de aminoácidos) •Polipéptido (mas de 10 residuos de aminoácidos). 2. Según el número de cadenas: •Monómero (1 cadena): Glucagon •Dímero (2 cadenas): insulina 34 Funciones: Descomposición del H2O2. Metabolismo de sustancias tóxicas. Antioxidante intracelular. Transporte de aminoácidos Glutatión: Tripéptido (gamma glutamil-cisteil-glicina). H3N + C O C N C C N C C H H O O O¯ CH2 COO¯ H H CH2 SH H CH2 H Péptidos de importancia fisiológica 35 Hormonas pancreáticas Conformada por 2 cadenas, con un total de 51 aminoácidos, responsable de la entrada de glucosa en las células del tejido muscular y adiposo. Es una cadena de 29 aminoácidos, aumenta los niveles de glucosa en sangre, y la movilización de ácidos grasos del tejido adiposo. Glucagón: Insulina: 36 Hormonas hipotalámicas Hormona liberadora de tirotropina (tripéptido). Hormona liberadora de gonadotropina (decapéptido). Estimula la secreción de LH y FSH. La LH estimula el desarrollo celular y la síntesis de hormonas sexuales en ovarios y testículos. La FSH promueve la ovulación y la síntesis estrógenos en ovarios y desarrollo de espermatozoides en los testículos. Estimula la secreción de TSH y Prolactina. La TSH estimula la síntesis de las hormonas tiroideas, y la Prolactina estimula la producción de leche en las glándulas mamarias de las hembras y participa en la regulación del sistema reproductor del macho 37 38 Hormonas hipotalámicas Hormona liberadora de corticotropina (41 amino-ácidos). Hormona liberadora de la hormona de crecimiento (44 aminoácidos). Estimula la secreción de ACTH, la cual estimula la síntesis de esteroides en la corteza suprarrenal Estimula la secreción GH, la cual promueve efectos anabólicos generales en muchos tejidos. Hormonas hipofisiarias Vasopresina ADH : nonapéptido, promueve la resorción de agua desde los túbulos renales distales para el mantenimiento del equilibrio hídrico del organismo. Regula la presión sanguínea nonapéptido, promueve la expulsión de leche de las glándulas mamarias y la contracción del músculo liso uterino. Oxitocina: 39 Proteínas Cadenas polipeptídicas de mas de 100 aminoácidos, con estructuras primaria, secundaria y terciaria por lo menos (algunas también cuaternaria). Compuesto orgánico nitrogenado formado por aminoácidos, que cumple múltiples funciones en los seres vivos. 40 Funciones de las Proteínas Catálisis enzimática Transporte y almacenamiento Protección inmune Generación y transmisión del impulso nervioso Control del crecimiento y diferenciación Movimiento coordinado y soporte mecánico 41 42 Proteínas: diversas formas y tamaños Clasificación de las proteínas 1)Según su forma a) Globulares: Relación longitud/ancho < 10 Solubles en soluciones salinas acuosas. Ejemplos: Enzimas, mioglobina, hemoglobina b) Fibrosas: Relación longitud/ancho > 10 Insolubles en soluciones salinas acuosas. Ejemplos: Colágeno, queratina. 43 2) Según su función a) Catalítica (enzimas) b) Transportadoras (hemoglobina, lipoproteínas) c) Almacenadoras (mioglobina, ferritina) d) Protectoras (inmunoglobulinas) e) Estructurales (colágeno) f) Reguladoras (hormonas, proteínas unidas a ADN) g) Contráctiles o de movimiento (actina, miosina) 44 3) Según su composición a) Simples: formadas solamente por residuos de aminoácidos. b) Complejas: Contienen residuos de aminoácidos y otro(s) componente(s) fosfoproteína (PO4H3) Ejemplos: Grupo prostético: parte no proteica Apoproteína: parte proteica Ejemplo: Albúmina glucoproteína (glúcido) lipoproteína (lípido) metaloproteína (metal) 45 4) Según el número de cadenas a) Monoméricas: 1 sola cadena polipeptídica. b) Oligomérica: más de 1 cadena polipeptídica Hemoglobina (tetramérica) Ejemplo: Mioglobina Ejemplo: 46 5) Según su solubilidad a) Solubles en soluciones salinas acuosas: Proteínas globulares (albúmina, globulinas) b) Insolubles en soluciones salinas acuosas: Proteínas fibrosas (colágeno, queratina) 47 Niveles estructurales: Estructura Primaria: Estructura Secundaria: Estructura Terciaria: Secuencia de aminoácidos unidos por enlaces peptídicos Ordenamiento espacial de los residuos de aminoácidos cercanos entre sí Se refiere a la conformación tridimensional resultante del plegamiento de una cadena polipeptídica Estructura Cuaternaria: Asociación de dos o más cadenas polipeptídicas (varias subunidades o monómeros) 48 Lys Lys Gly Gly Leu Val Ala His Estructura primaria Estructura secundaria Estructura terciaria Estructura cuaternaria Niveles estructurales: 49 Fuerzas que estabilizan los niveles estructurales de las proteínas 1) Enlaces covalentes (fuertes) compartición de electrones: a. Enlace peptídico: entre el grupo alfa NH2 de un aminoácido y el grupo carboxilo de otro aminoácido b. Enlace disulfuro: entre 2 cisteínas, inter o intra-cadena 2) Enlaces débiles (transferencia de electrones): a. Puentes de hidrógeno: entre el N (NH2) y el O (COOH o del H2O), un átomo de hidrógeno es compartido por dos átomos diferentes b. Electrostáticos o salinos: entre grupos con cargas opuestas (+NH3) y (COO¯) c. Hidrófobos: Fuerzas de repulsión entre cadenas laterales no polares y el H2O, interaccionando grupos hidrófobos entre sí. d. Van der Waals: Fuerzas de atracción o de repulsión dipolar a distancias cortas 50 Entre el grupo hidroxilo de un alcohol y el agua Entre el grupo carbonilo de una cetona y el agua Entre los enlaces peptídicos de polipéptidos Entre bases complementarias del ADN Adenina Timina Puentes de hidrógenos 51 Estructura Primaria Enlaces que la conforman: Enlace peptídico Puente disulfuro (si lo hubiera). Es la secuencia lineal de los residuos de aminoácidos Esta secuencia es la que determina la estructura tridimensional y la función de la proteína Está especificada por la información genética Las alteraciones en la estructura primaria provocan enfermedades moleculares 52 Estructura secundaria Plegado local, el la conformación que se repite de modo regular en la cadena polipetídica. Los tipos de estructura secundaria que se observan con más frecuencia son la α- Hélice y la lámina β -plegada. Ambas conformaciones se encuentran estabilizadas por puentes de hidrógenos entre los grupos carbonilo (C = O) y el amino (N –H) del esqueleto polipeptídico y por interacciones de Van der Waals. 53 Alfa-hélice (α-hélice) 54 Hélice derecha Estabilizadas por Puentes de hidrógeno y Fuerzas de Van der Waals Longitud: entre 4 y 50 residuos (12) Poseen 3,6 residuos por vuelta Se repite cada 18 residuos Grupos R dirigidos hacia afuera 55 Los puentes de hidrógeno se forman dentro de una única cadena polipeptídica, entre los oxígenos carbonilos y el hidrógeno amida cuatro reciduos delante en el polipeptido Hélice 310 Hélice Hélice Tipos de Hélices o espirales 56 Lámina plegada beta 57 58 Cadenas plegadas en abanico. Esqueleto peptídico extendido casi por completo. Implican tramos de 5 a 10 aminoácidos. Puentes de hidrógeno, Fuerzas de Van der Waals. Las tiras pueden ser paralelas (igual dirección) o antiparalelas (direcciones opuestas). Los Grupos R alternan hacia arriba o hacia debajo de la cadena principal. Los puentes de hidrógeno son perpendiculares al esqueleto del polipéptido Láminas -plegadas a) Paralelas b) Antiparalelas Las láminas -antiparalelas son más estables debido a que se forman puentes de hidrógenos colineales 59 Láminas plegadas beta antiparalelas 60 Estructuras supersecundarias Son combinaciones de estructuras secundarias de hélices alfa y láminas beta Unidades : Unidades : Meandros: Barril : Llave Griega: Están constituidas por dos láminas -plegadas paralelas interconectadas por un segmento de -hélice Están constituidas por dos -hélices sucesivas separadas por un segmento no helicoidal. Están constituidos por láminas -plegadas anti-paralelas interconectadas por segmentos de aminoácidos polares y glicina que producen un cambio brusco de la dirección de la cadena polipeptídica Se produce cuando varias configuraciones de láminas - plegadas se repliegan sobre ellas mismas. Se producen cuando una lámina -plegada anti-paralela se dobla sobre sí misma. 61 Estructuras supersecundarias Unidades : Unidades : Meandros: Barril : Llave Griega: 62 Estructura terciaria Es la configuración tridimensional única que asume una proteína globular al plegarse sobre sí misma. Características: 1. Aproximación de las cadenas laterales de aminoácidos distantes en la estructura primaria. 2. Empaquetamiento compacto de la cadena polipeptídica. 3. Presencia de segmentos estructuralmente independientes con funciones específicas. Estabilizada por: 1. Interacciones hidrófobas 2. Interacciones electrostáticas o puentes salinos 3. Puentes de hidrógenos 4. Enlaces covalentes (Puentes disulfuro) 63 Puente salino Puente de hidrógeno Puente disulfuro Interacciones hidrofóbicas Interacciones que mantienen la estructura terciaria 64 Estructuras tipo de las proteínas globulares Predominio Hélices Predominio Láminas Mezcla de Hélices y Láminas 65 Estructura Cuaternaria Es el ensamble de dos o más cadenas polipeptídicas separadas que se unen por medio de interacciones no covalentes y por entrecruzamientos covalentes. Fuerzas que la estabilizan: 1. Interacciones hidrófobas 2. Interacciones electrostáticas o puentes salinos 3. Puentes de hidrógenos 4. Enlaces covalentes (Puentes disulfuro, entrecruzamientos de desmosina y de lisinonorleucina) 66 Estructuras Cuaternarias Hemoglobina Inmunoglobulina 67 Lys Lys Gly Gly Leu Val Ala His Estructura primaria Estructura secundaria Estructura terciaria Estructura cuaternaria Niveles estructurales de la hemoglobina 68 Desnaturalización de las proteínas Pérdida de la estructura tridimensional de la proteína (estructuras secundaria, terciaria y cuaternaria) por exposición a agentes físicos y/o químicos. Dependiendo del grado de desnaturalización, la molécula puede perder parcial o totalmente su actividad biológica. Configuración nativa Proteína desnaturalizada 69 Principales condiciones desnaturalizantes: 1. Ácidos y bases fuertes: 2. Solventes orgánicos (como el etanol): 3. Detergentes: 4. Agentes Caotrópicos: 5. Concentración salina: 6. Iones metálicos pesados (como el Pb2+ y el Hg2+) 7. Cambios de temperatura: 8. Agresión mecánica: Alteran los patrones de los puentes de hidrógeno e interacciones electrostáticas Rompen interacciones hidrófobas Afectan las interacciones electrostáticas Rompen todas las interacciones débiles Rompen las interacciones hidrófobas -mercaptoetanol, reduce puentes disulfuros. Urea, rompe puentes de hidrógenos e interacciones hidrófobas. Afectan las interacciones electrostáticas Rompen todas las interacciones débiles 70 Proteínas Fibrosas 71 Proteínas alargadas, de varias cadenas estrechamente entrelazadas. Contienen proporciones elevadas de estructuras secundarias regulares como hélices y laminas -plegadas. Tienen funciones estructurales. Ejemplos: Queratinas Colágeno Elastina Fibroína Queratinas 72 proteína fibrosa estructural. Ubicación: pelo, lana, piel, cuernos y uñas. Estructura primaria: abundante en alanina, leucina y cisteína (puentes disulfuro). Estructura secundaria: alfa-hélice derecha estabilizada por enlaces de hidrógeno, puentes disulfuro y fuerzas de Van der Waals. Estructura terciaria: dímero (2 cadenas enrrolladas). 2 dímeros enrrollados helicoidalmente de forma antiparalela forman un protofilamento superenrollado (4 cadenas). 8 protofilamentos enrrollados a derecha forman un filamento o microfibrilla (16 dímeros o 32 cadenas). Cientos de filamentos forman una macrofibrilla. α-QUERATINA: β-QUERATINA: Láminas beta. Se encuentran en plumas, escamas (aves y reptiles). α-Queratina Hélice α Protofilamento superenrollado: Dímero enrollado 73 Colágeno 74 Función: Glucoproteína fibrosa estructural del tejido conjuntivo. Estructura terciaria: Triple hélice (tropocolágeno), estabilizada por enlaces de hidrógeno (hidroxilisina). Enlaces cruzados entre varias moléculas de tropocolágeno formando la fibra de colágeno, mediante unión de 2 moléculas de alisina, aumentando la dureza y disminuyendo la elasticidad. Aumentan con la edad. Estructura secundaria: hélices 310 izquierdas, estabilizadas por puentes de hidrógeno. Estructura primaria: Principalmente glicina (cada 3 residuos), prolina, hidroxiprolina e hidroxilisina (glicosilada y no glicosilada). Ubicación: piel, tendones, huesos, dientes, córnea y vasos sanguíneos. S ín te s is d e C o lá g e n o 75 Láminas plegadas beta antiparalelas Interacciones de Van der Waals Abundante en glicina, (uno de cada dos residuos es glicina) 76 Fibroína (seda de gusanos, arañas) Proteínas Globulares 77 1. Forma esférica 2. Interior hidrófobo y exterior hidrófilo 3. Solubles en agua (polares) 4. Múltiples funciones (catálisis, transporte, regulación, protección), excepto la función estructural Mioglobina Hemoglobina (multimérica) (monomérica) 78 Mioglobina 79 Hemoproteína globular monomérica Función: Almacena oxígeno en las mitocondrias del músculo esquelético y cardíaco. Estructura primaria: 153 aminoácidos Estructura secundaria: el 75% corresponde a α-hélices (A,B,C,D,E,F,G,H). Estructura terciaria: Superficie polar e interior no polar, excepto las 2 histidinas cercanas al Hemo. Un grupo hemo en el centro de la molécula. Estructura de la Mioglobina Carboxilo terminal Amino terminal Grupo hemo 80 Hemoglobina 81 Hemoproteína polimérica de los eritrocitos Función: Transporte del oxígeno desde los pulmones hacia los tejidos y del CO2 y protones desde los tejidos hacia los pulmones para ser excretados. Ubicación: Eritrocitos. Estructura primaria: rica en todos los aminoácidosEstructura secundaria: 8 alfa hélices (75%). Estructura terciaria: globular, superficie polar e interior no polar, excepto las 2 histidinas cercanas al grupo hemo. Un grupo hemo en el centro de cada monómero. Estructura cuaternaria: tetrámero, 2 cadenas alfa (141 aa) y dos cadenas beta (146 aa) Fija 4 moléculas de oxígeno (una por cada Hemo). Efecto cooperativo: La oxigenación de 1 cadena altera la conformación de la segunda cadena favoreciendo su oxigenación y así sucesivamente. Consta de un anillo de porfirina, formado por cuatro pirroles, con un átomo de Fe+2 en el centro. Estructura del grupo hemo 82 Coordinación octaédrica del átomo de hierro Imagen ampliada del bolsillo del grupo hemo 83 Proteínas Plasmáticas 85 Patrón de electroforesis de las proteínas plasmáticas Fibrinógeno Albúmina Globulinas (alfa, beta y gamma) Fibrinógeno Albúmina 86 Proteína simple globular monomérica de 585 aa. Ubicación: plasma sanguíneo (la más abundante, 4 mg/dL). Lugar de síntesis: hígado. Funciones: a) Ayuda a mantener la presión osmótica de la sangre. b) Transporta ácidos grasos libres, algunas hormonas esteroideas por la sangre, bilirrubina y una porción del triptófano plasmático y una gran variedad de fármacos (aspirina, penicilina G, sulfonamidas, etc). c) Fija el calcio (50%) en la sangre y alrededor del 10% de cobre. Globulinas 87 Proteínas plasmáticas globulares complejas. Lugar de síntesis: hígado. Clasificación: • Alfa-1: lipoproteína de alta densidad (HDL: transporta colesterol) • Alfa-2: Haptoglobulina, ceruloplasmina (transporte plasmático de cobre). • Gamma: anticuerpos • Beta-1: Transferrina (transporte plasmático de hierro), lipoproteína de baja densidad (LDL: transporte de colesterol). • Pre-beta: lipoproteína de muy baja densidad (VLDL: transporte de triglicéridos). Inmunoglobulinas plasmáticas (gamma globulinas) 88 Glucoproteínas de por lo menos 4 cadenas. por 2 cadenas ligeras y 2 pesadas (L2P2) unidas por enlaces disulfuro. Estructura terciaria: Estructura secundaria: predominantemente láminas beta antiparalelas. Función: anticuerpos (protección contra agentes extraños). Lugar de síntesis: linfocitos B. Ubicación: plasma sanguíneo. Dominio constante Dominio variable Fracción amino terminal Fracción amino terminal 89 Tipos de Inmunoglobulinas 90 El tipo de cadena H determina la clase de la inmunoglobulina. IgG: 1 tetrámero (anticuerpos plasmáticos mas abundantes) IgA: 2 tetrámeros (secreciones corporales) IgM: 5 tetrámeros (respuesta inicial al microorganismo invasor) IgD: 1 tetrámero IgE: 1 tetrámeros (respuestas alérgicas) Tipos de Inmunoglobulinas 91 Monómeros IgD, IgE, IgG Dímero IgA Pentámero IgM Inmunoglobulina G 2 cadenas ligeras y 2 cadenas pesadas 92 Inmunoglobulina M (pentamérica) 93 Fibrinógeno 94 Glucoproteína alargada plasmática, soluble en agua. Lugar de síntesis: hígado Composición: por 6 cadenas (tres pares), unidas por puentes disulfuro. (A)2; (B)2; (Gamma)2 Función: al transformarse en fibrina, se polimeriza formando un coágulo insoluble y evitando la hemorragia. A 66 KD B 52 KD 46 KD Fibrinopéptido A Fibrinopéptido B Puente disulfuro Lugar de corte de la Trombina Cadena polipeptídica Estructura del Fibrinógeno 95 Actina 96 Polímero de doble hélice (actina F) de una proteína globular (actina G) Ubicación: tejido muscular, forma parte de los filamentos delgados de la miofibrilla. Sitios de unión: 1. Con el ATP por un monómero de actina G, conduciendo a la polimerización, hidrolizándose el ATP. 2. Con la miosina en cada subunidad. Función: contracción muscular. Estructura del monómero de Actina G Modelo del Filamento de Actina F Los monómeros de Actina G se indican en colores diferentes Los residuos verdes son los puntos de unión con la miosina 97 Miosina 98 Proteína muscular, conforma el filamento grueso de la miofibrilla muscular. Composición: Formada por 6 cadenas polipeptídicas (2 pesadas y 4 livianas). Estructura terciaria: 2 grandes subunidades: 1 cabeza globular y 1 cola fibrosa. El complejo actina-miosina (actomiosina) aumenta la actividad intrínseca de ATPasa. Función: contracción muscular. 6 cadenas polipeptídicas (2 pesadas y 4 ligeras, unidas por interacciones debiles) Molécula de Miosina Cabeza globular Cola fibrosa 2 grandes subunidades 99 Nucleótidos 101 Cumplen funciones importantes en la transferencia de energía, en la regulación metabólica y/o como sillares estructurales de los ácidos nucleicos. Compuestos nitrogenados orgánicos, formados por una base heterocíclica aromática, un monosacárido y por lo menos un ácido fosfórico. Estructura de un nucleótido (Base aromática nitrogenada) Adenina Ribosa (Azúcar C5) Grupos fosfatos 102 C N C N C C N N C 1 2 5 43 6 7 8 9 C N C C N C N C C N N C 1 2 5 43 6 7 8 9 Purina Pirimidina N C 12 3 4 5 6 N C C C N C 12 3 4 5 6 N C C C N C C C Anillos de Purina y pirimidina 103 Uracilo Citosina Timina C N C N HC C N N H CH NH2 C N C HN C C N N H CH H2N O Bases Nitrogenadas O O N C C N C C HN C CH N CH C O O NH 2 O N C C N C C N C C N CH C NH 2 O • Pirimidínicas: Adenina • Púricas: Guanina 104 CH 3 O O C C N C C HN C CH N C C O O CH 3 C N C N C C N N CH O O CH3 CH3 H3C C N C HN C C N N CH O O CH3 CH3 Cafeína (1, 3, 7- trimetil-xantina) Teofilina (1, 3- dimetil-xantina) Teobromina (3, 7- dimetil-xantina) Café Té Cacao Bases nitrogenadas 105 C N C N C C N N H CH O O CH3 H3C NH 2 O N C C N C C N C C N H C C NH 2 O CH3 CH2OH NH 2 O N C C N C C N C C N H C C NH 2 O C N C N HC C N N H CH N CH3 H3C C N C HN C C N N CH H2N O CH3 5-metil-citosina 7-metil-guanina Dimeti-Adenina 5-hidroximetil-citosina Bases nitrogenadas poco comunes 106 syn-Adenosina anti-Adenosina Conformaciones syn y anti 107 C N C N HC C N N H CH NH2 C N C N HC C N N H CH NH2 C N C N HC C N N H CH C N C N HC C N N H CH NH2 C N C HN C C N N H CH H2N O C N C HN C C N N H CH H2N O C N C HN C C N N H CH C N C HN C C N N H CH H2N O O O N C C N C C HN C CH N CH C O O O O N C C N C C HN C CH N CH C O O NH2 O N C C N C C N C C N CH C NH2 O NH2 O N C C N C C N C C N CH C NH2 O NH2 O N C C N C C N C C N CH C NH2 O CH3 O O C C N C C HN C CH N C C O O CH3CH3 O O C C N C C HN C CH N C C O O CH3CH3 O O C C N C C HN C CH N C C O O CH3 Fórmula de la Base nitrogenada Adenina Nombre de la Base nitrogenada Nombre del nucleósido Nombre del nucleótido Guanina Uracilo Citosina Timina Adenosina Guanosina Uridina Citidina Timidina Adenosina 5’ monofosfato AMP Guanosina 5’ monofosfato GMP Uridina 5’ monofosfato UMP Citidina 5’ monofosfato CMP Timidina 5’ monofosfato TMP 108 1.Nucleósidos: 2.Nucleótidos: Adenosina Guanosina Adenosina 5’ monofosfato AMP Guanosina 5’ monofosfato GMP 109 Adenosina Adenosina 5’ monofosfato AMP Adenosina 5’ trifosfato ATP Funciones: • Principal transductor energético. • Precursor de coenzimas. • El AMP es componente de los ácidos nucleicos. 110 111 Hidrólisis del ATP para producir energía Principal transductor de energía Producto y Sustrato en la fosforilación oxidativa 112 Derivados del AMP Coenzima RR’ R” n S-Adonosil- metionina Metionina* H H H H H Adenilatos de aminoácidos Aminoácido Sulfato activo 3’ 5’ AMPcíclico NAD+ NADP+ FAD+ CoA~SH SO3 -2 0 1 PO3 -2 1 H H PO3 -2 PO3 -2 PO3 -2 H H H H H H 2 2 2 2 * Reemplaza al grupo fosfato R es un derivado de la vitamina B 113 Guanosina 5’ Trifosfato GTP Funciones: • Succinil CoA Succinato (ciclo Krebs) • Regulador y fuente de energía para la síntesis de proteínas. • El GMP es componente de los ácidos nucleicos. Guanosina Guanosina 5’ monofosfato GMP Segundos mensajeros 114 GMPc AMPc 115 Funciones: • Interviene en la síntesis de fosfoglicéridos. • El CMP es componente de los ácidos nucleicos. Citidina 5’ Trifosfato CTP 116 Funciones: • Intervienen en el metabolismo de los glúcidos. • Interviene en reacciones de conjugación del ácido glucurónico. • El UMP es componente del ARN. Uridina 5’ Trifosfato UTP Función: • El TMP es componente del ADN. Timidina Timidina 5’ Trifosfato TTP 117 ACIDOS NUCLEICOS 118 ADN Ácido desoxirribonucleico ARN Ácido ribonucleico ribosa Desoxirribosa Polímeros de nucleótidos monofosfatos púricos y pirimidínicos, unidos por enlaces fosfodiester. Puentes de hidrógeno Extremo 3’ Extremo 5’ Extremo 5’ Extremo 3’ 1 2 3 4 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 5 Enlace fosfodiéster Cada cadena polinucleotídica posee “individualidad” determinada por la secuencia de sus bases, es decir, la secuencia de nucleótidos. Cada cadena polinucleotídica posee un “sentido” o direccionalidad”: Un extremo lleva un fosfato 5’ sin reaccionar y el otro extremo lleva un grupo hidroxilo 3’ sin reaccionar. Dos cadenas de polinucleótidos giran alrededor de un eje común formando un plegado regular conocido como “doble hélice dextrógira”. Características estructurales del ADN Las bases de purinas y pirimidinas están ubicadas en el interior de la hélice, mientras que las unidades de fosfato y de desoxirribosa lo están en el exterior La doble hélice se estabiliza mediante puentes de hidrógeno entre las bases de las hebras: Adenina --- Timina Guanina --- Citosina Las dos hebras de la molécula son antiparalelas, es decir, una corre en dirección 5’ a 3’ y la otra tiene dirección 3’ a 5’ Características estructurales del ADN En algunos organismos, como bacterias y virus, las moléculas de ADN en forma natural son “circulares” No tienen extremos libres 5’ ó 3’ ADN circular: FUNCIONES DEL ADN: La información genética almacenada en la secuencia de nucleótidos del ADN tiene dos funciones: Provee la información heredada por las células hijas o la progenie (replicación) Como fuente de información para la síntesis de todas las moléculas de proteínas en la célula (transcripción) Es un polímero de ribonucleótidos púricos y pirimidínicos enlazados por puentes 3’-5’ fosfodiéster Características estructurales del ARN Existen diferentes tipos de ARN: ARN mensajero (ARNm) ARN ribosómico (ARNr) ARN de transferencia. (ARNt) El ARN mensajero (ARNm) Se sintetiza en el núcleo a partir de una hebra molde de ADN. Transporta la información de un gen a la maquinaria que sintetiza las proteínas. El ARNm es el molde sobre el cual es polimerizada una molécula de proteínas específica. La secuencia de nucleótidos del ARNm consiste en una serie de codones que corresponden a cada aminoácido. El ARN de transferencia Se sintetiza en el núcleo. Actúa como adaptador para la traducción de la información contenida en la secuencia de nucleótidos del ARNm. ARN ribosómico (ARNr): Se sintetiza en el nucléolo. Está contenido en los ribosomas, cataliza la síntesis de proteínas. Son estructuras ribonucleo- proteícas complejas y altamente organizadas que permiten la interacción del ARNm con los ARNt Están compuestos por dos subunidades que se mantienen juntas mediante uniones NO covalentes Comparación entre el ADN y el ARN 128
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