¿Cuál es el peor caso histórico de endogamia?

Los Habsburgo y muchas otras familias reales. En aquel entonces, los matrimonios se usaban para consolidar los poderes políticos y mantener acuerdos, por lo que era bastante común que los primos se casaran.

Uncle = tio. Cousin + primo. Niece = sobrina.

Eso no funcionó bien para los descendientes, como se podría imaginar, y en el caso de Habsburgo resultó en una deformidad de la mandíbula llamada el prognatismo de los Habsburgo:

Pero eso fue leve en comparación con la discapacidad mental y física real que muchos Habsburgo tuvieron que soportar desde el nacimiento. Algunos de ellos apenas funcionaban como adultos, no eran los mejores candidatos para gobernar una gran potencia europea.

Edicion: 17/10/2019, para agregar la consecuencia de este árbol genealógico particular.

Lo que hizo que este caso de Habsburgo fuera particularmente terrible es lo que sucedió después de la muerte de Carlos II (último en la línea anterior). Era infértil, probablemente debido al nivel extremo de endogamia, y por lo tanto no tuvo heredero. Cuando los reyes no tenían heredero, sus muertes generalmente son seguidas por una lucha de poder, y eso es exactamente lo que sucedió:

Guerra de sucesión española - Wikipedia, la enciclopedia libre

Fue una guerra de múltiples continentes de 13 años que se desencadenó por la disputa de la sucesión de Charles. Con la mayor parte de las principales potencias europeas involucradas, la guerra mató quizás a un millón de personas en Europa y América. Por supuesto, el problema de la sucesión no fue el único factor que motivó la guerra, pero proporcionó la justificación.