Vista previa del material en texto
CINÉTICA ENZIMÁTICA ¿Cómo logran las enzimas (E) disminuir la Ea? S# E-S# Ea no catalizada Ea catalizada G de la Reacción Progreso de la reacción → E n e rg ía L ib re → Interaccionan con los reactivos (denominados sustratos en las reacciones catalizadas enzimáticamente) para dar un complejo E-S que tiene menor Ea que el sustrato libre. El lugar específico donde se une el sustrato recibe el nombre de SITIO ACTIVO. Está constituido por cadenas laterales de aminoácidos con características complementarias a la estructura del sustrato [Ej; si sustrato tiene carga positiva (S+) en el sitio activo predominarán aminoácidos ácidos]. Determina la especificidad de la enzima. - Aumenta la concentración efectiva de los sustratos (aumenta la probabilidad de choque) - Modifica las propiedades químicas del sustrato unido a su centro activo, debilitando los enlaces existentes y facilitando la formación de otros nuevos. 25 ¿De qué manera interaccionan enzima y sustrato? - Modelo del encaje recíproco de Fisher (1894): homologaba la interacción E-S con el encaje recíproco de la llave y la cerradura. Este modelo permite explicar la gran especificidad de las enzimas por el sustrato. NO permite explicar el hecho que la misma enzima catalice la reacción directa e inversa, lo cual implicaría que interacciona tanto con el reactivo como con el producto que son químicamente diferentes. - Modelo del ajuste inducido de Koshland (1963): presenta a las enzimas como estructuras dotadas de plasticidad y flexibilidad. La unión del sustrato al sitio activo induce a un cambio en la conformación de la proteína que hace que se ajuste a la estructura del sustrato 26 Modelo estático Modelo dinámico ➢ Modelo del encaje recíproco o de llave – cerradura de Fisher (1894): ➢ Modelo del encaje inducido de Koshland (1958): - Modelo del encaje recíproco de Fisher (1894): homologaba la interacción E-S con el encaje recíproco de la llave y la cerradura. Este modelo permite explicar la gran especificidad de las enzimas por el sustrato. NO permite explicar el hecho que la misma enzima catalice la reacción directa e inversa, lo cual implicaría que interacciona tanto con el reactivo como con el producto que son químicamente diferentes. - Modelo del ajuste inducido de Koshland (1963): presenta a las enzimas como estructuras dotadas de plasticidad y flexibilidad. La unión del sustrato al sitio activo induce a un cambio en la conformación de la proteína que hace que se ajuste a la estructura del sustrato 1. Concentración de sustrato 2. Concentración de enzima 3. Temperatura 4. pH 5. Inhibidores ¿De qué depende la velocidad de una reacción catalizada enzimáticamente? 27 VARIABLES QUE INFLUYEN EN LA VELOCIDAD DE UNA REACCIÓN CATALIZADA ENZIMÁTICAMENTE 27 1- Concentración de sustrato Vmax: velocidad máxima. Se registra cuando todos los sitios activos están ocupados. KM: constante de Michaelis-Menten. Concentración de sustrato a la cual se alcanza la mitad de la Vmax la mitad de los sitios activos están ocupados. 1. Concentración de sustrato Leonor Michaelis y Maud Menten Cuanto mayor sea la afinidad de la enzima por el sustrato menor será la concentración de sustrato requerida para ocupar la mitad de los sitios activos y a mayor afinidad menor KM. 28 Misma enzima distinto sustrato Distinta enzima mismo sustrato Vmax Km “Cuanto mayor sea la afinidad de la enzima por el sustrato menor será la concentración requerida para ocupar la mitad de los sitios activos” “A mayor afinidad menor Km” depende de la cantidad de enzima presente depende de la afinidad de la enzima por el sustrato Hexoquinasa Glucoquinasa [E] en hígado Baja Alta Km para Glucosa < 0,1 mM 10 mM Sustrato Varias hexosas Glucosa La [Glucosa] en sangre es aprox. 5 mM, valor que es regulado por el hígado. Distinta enzima mismo sustrato 29 2. Concentración de enzima Variación de la velocidad de reacción enzimática (V0) en función de la [S] para dos concentraciones de enzima (E y 3E). Al modificar la concentración de enzima [E] se modifica la Vmáx pero no en Km. 303. pH Cada enzima es activa en un intervalo de pH determinado y dentro de ese intervalo habrá uno donde la actividad enzimática será máxima (máxima capacidad catalítica): pH óptimo 3- pH pH óptimo: pH al cual la enzima presenta su máxima capacidad catalítica V m a x o A ct . C a ta lí ti ca pH óptimo pH Actividad enzimáticaEstado de ionización influye Grupos funcionales de los aa Sustrato modifica 31 Desnaturalización En el pH óptimo el estado de ionización del sustrato y de los restos de aminoácido presentes en el sitio activo es aquel que permite la máxima interacción ES. SH S - S - EH + E EH + En el pH óptimo el estado de ionización del sustrato y de los restos de aa presentes en el sitio activo de la enzima es aquel que permite la máxima interacción ES. El pH óptimo para las enzimas humanas varía notablemente, alcanzando incluso valores extremos (por ejemplo: pHopt = 2 para pepsina, una enzima gástrica. Desnaturalización En el pH óptimo el estado de ionización del sustrato y de los restos de aminoácido presentes en el sitio activo es aquel que permite la máxima interacción ES. SH S - S - EH + E EH + 3- pH pH óptimo: pH al cual la enzima presenta su máxima capacidad catalítica V m a x o A ct . C a ta lí ti ca Los pHs extremos pueden inactivar a la enzima por desnaturalización 324. Temperatura Aumento gradual de la velocidad de la reacción con el aumento de la temperatura hasta alcanzar una temperatura en la cual la actividad enzimática es máxima, que se conoce como Temperatura óptima. Disminución progresiva de la velocidad de reacción debido a la inactivación de la enzima por desnaturalización térmica de la proteína. La T óptima para a mayoría de las enzimas humanas está en el rango entre 35 y 40 °C, estas comienzan a desnaturalizarse por encima de los 40°C. 4- Temperatura Aumenta la velocidad porque aumenta la temperatura aumenta la Ecinética Disminuye la velocidad porque se desnaturaliza la enzima V m ax o A ct . c at al ít ic a 4- Temperatura Aumenta la velocidad porque aumenta la temperatura aumenta la Ecinética Disminuye la velocidad porque se desnaturaliza la enzima V m ax o A ct . c at al ít ic a 4- Temperatura Aumenta la velocidad porque aumenta la temperatura aumenta la Ecinética Disminuye la velocidad porque se desnaturaliza la enzima V m ax o A ct . c at al ít ic a Esto se debe a que al aumentar la T aumenta el movimiento de las moléculas y por lo tanto aumenta probabilidad de encuentro entre E y S. 5. Inhibidores Sustancias que disminuyen o anulan la actividad de las enzimas sin ser transformados por ellas. 33 La inhibición enzimática puede ser: Irreversible Reversible A- Inhibidores Irreversibles o Venenos Se combinan de modo permanente con la enzima uniéndose covalentemente a algún grupo funcional esencial para la catálisis con lo cual la enzima queda inactivada irreversiblemente. 33 a) Competitivos: son estructuralmente similares al sustrato y compiten con él por el sitio activo. Modifican KM pero no la Vmax. a) Competitivos: son estructuralmente similares al sustrato y compiten con él por el sitio activo. Modifican KM pero no la Vmax. B- Inhibidores Reversibles La unión de la enzima y el inhibidor es temporal. Impide el normal funcionamiento de la enzima sólo mientras dura la unión. Pueden ser de tres tipo:competitivos, no competitivos y acompetitivos. B1- Inhibidores Reversibles COMPETITIVOS b) No competitivos: se unen a la enzima en un sitio diferente al sitio activo y la inactivan. Modifican Vmax pero no el KM. 34 b) No competitivos: se unen a la enzima en un sitio diferente al sitio activo y la inactivan. Modifican Vmax pero no el KM. B2- Inhibidores Reversibles NO COMPETITIVOS Inhibidores como medicamentos ❑ ATBs beta-lactámicos (Ej: Penicilina y sus derivados) Son inhibidores irreversibles de las transpeptidasas (TP) bacterianas. Amoxicilina La combinación de amoxicilina y ácido clavulánico Ciertas bacterias tienen una enzima llamada betalactamasa que puede abrir el anillo lactámico, lo que vuelve al compuesto inocuo para la bacteria. Como alternativa para disminuir la resistencia bacteriana Ketorolaco Acido araquidónico Tromboxano A2 Prostaglandina E1 (PGE1) AINEs Esta inhibición puede ocurrir por distintos mecanismos: • Inhibición irreversible, como en el caso de la aspirina. • Inhibición competitiva, como en el caso del ibuprofeno. • Inhibición no competitiva, como el paracetamol. Aspirina Ibuprofeno DiclofenacoNaproxen Paracetamol ❑ Los antiinflamatorios no esteroideos (abreviados AINEs) A partir del año 2012 en los consensos internacionales el paracetamol se excluye de los AINEs, por su poca/nula acción antiinflamatoria. Todos son inhibidores de la ciclooxigenasa https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Aspirin-skeletal.svg ❑ Antivirales ANÁLOGOS DE GUANOSINA (Ej: Aciclovir, Ganciclovir, etc.) inhiben la síntesis de ADN viral HVS: virus del herpes simple Son inhibidores de ADN polimerasa viral ❑ ESTATINAS (Lovastatina, Simvastatina, Rosuvastatina, etc.) inhiben la síntesis de colesterol Son inhibidores competitivos de HMG-CoA reductasa celular. METABOLISMO INTERMEDIARIO A B C D Lineal X P Q W R Z Y Ramificada A B C D E F Cíclica 35 A B C D Lineal X P Q W R Z Y Ramificada A B C D E F Cíclica A B C D Lineal X P Q W R Z Y Ramificada A B C D E F Cíclica “Conjunto de todas las reacciones que ocurren en la célula” Algunas de estas reacciones son secuenciales (en las cuales el producto de una es reactivo de la siguiente) Cada conjunto de reacciones secuenciales se denomina RUTA O VÍA METABÓLICA Pueden ser lineales, ramificadas o cíclicas Aquellas rutas metabólicas que poseen un G global < 0 (G de las reacciones) se dice que son cuesta abajo porque liberan energía y se denominan catabólicas. Las que poseen un G global > 0 se dice que son cuesta arriba porque requieren del aporte de energía y se denominan anabólicas. “Todas y cada una de las reacciones del metabolismo intermediario están catalizadas enzimáticamente” 36 En condiciones celulares: PARA QUE UN PROCESO METABÓLICO Debe tener un GGLOBAL ACOPLADO < 0 Debe estar catalizado enzimáticamente De modo que: “Todos los proceso metabólicos pueden controlarse regulando la actividad de las enzimas que lo catalizan” Pueda realizarse Ocurra en tiempos que permitan satisfacer las necesidades celulares ¿De qué manera se puede regular la actividad de las enzimas in vivo? La actividad de las enzimas in vivo puede regularse por múltiples mecanismos, que pueden tener un efecto positivo o negativo, según las necesidades celulares. ❑ Regulación de la expresión (síntesis de la enzima) a nivel transcripcional Principales mecanismos reguladores: ❑ Degradación de la enzima ❑ Clivaje proteolítico → Algunas enzimas se sintetizan como precursores inactivos (proenzimas o zimógenos), que se activan luego por el corte de uno o más segmentos de la cadena polipetídica. Ej: todas las proteasas digestivas se secretan en forma de zimógenos. ❑ Alosterismo ❑ Modulación covalente ENZIMAS REGULADORAS Enzimas capaces de cambiar de conformación por la unión de ligandos y modificar su capacidad catalítica. 37ENZIMAS REGULADAS POR MODIFICACIÓN COVALENTE El cambio conformacional se da por la unión covalente de ligandos (los más frecuentes grupos fosfato o acetilos) a restos específicos de aminoácidos. Esta unión puede tener un efecto positivo o negativo, según la enzima. La modificación covalente más común es la unión de grupos fosfato (fosforilación) a restos de Ser, Thr o Tyr: • El grupo fosfato es aportado por un nucleótido trifosfato (ATP, GTP) • La llevan a cabo las enzimas conocidas como quinasas • La reacción inversa (eliminación del grupo fosfato) tiene efecto contrario en la enzima y es llevada a cabo por las enzimas conocidas como fosfatasas. http://web.usal.es/~evillar/images/fosforilacion.jpg 38ENZIMAS ALOSTÉRICAS Poseen, además del sitio activo, otro sitio denominado alostérico donde se unen por interacciones débiles ligandos endógenos denominados moduladores alostéricos. La unión del modulador al sitio alostérico ocasiona un cambio conformacional que puede disminuir o aumentar la actividad de la enzima. Las enzimas reguladoras se ubican en lugares estratégicos de las vías metabólicas: al principio o en los puntos de ramificación: A B C D X P Q W R Z Y 39 Las enzimas reguladoras se encuentra ubicadas en puntos estratégicos en las vías metabólicas Retroalimentación negativa, retroinhibición o inhibición feedback El producto final de la vía metabólica es modulador alostérico negativo de una enzima ubicada al principio de la vía o en los puntos de ramificación [A] mM V0 (M/min) 0 0 20 15 40 30 80 45 160 80 320 85 640 90 1280 90 La reacción A → B está catalizada por la E1. Se determinó la velocidad de la reacción utilizando una [E1] = 4nM y concentraciones crecientes de sustrato. Las incubaciones se realizaron en condiciones de pH y temperatura óptimas. Los resultados se presentan en la siguiente tabla: a) ¿Cuál es el valor de Vmax y de Km para esta enzima? b) ¿Qué valor de Vmax espera encontrar si repite las incubaciones utilizando una concentración de enzima de 8nM? c) ¿Cuáles de los siguientes pares de valores para Vmax y Km esperaría encontrar si repite el experimento inicial pero en presencia de un inhibidor competitivo? 90 M/min; 80 mM 100 M/min; 80 mM 80 M/min; 80 mM 90 M/min; 40 mM 90 M/min; 100 mM 80 M/min; 100 mM d) Idem ítem c) pero con un inhibidor no competitivo 90 M/min; 80 mM 100 M/min; 80 mM 80 M/min; 80 mM 90 M/min; 40 mM 90 M/min; 100 mM 80 M/min; 100 mM 180 M/min