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StuDocu no está patrocinado ni avalado por ningún colegio o universidad. PROBLEMAS CINÉTICA ENZIMÁTICA Biocatalisis (Universidad Autónoma de Yucatán) StuDocu no está patrocinado ni avalado por ningún colegio o universidad. PROBLEMAS CINÉTICA ENZIMÁTICA Biocatalisis (Universidad Autónoma de Yucatán) Descargado por Meli Chiamba (melaniachiamba@gmail.com) lOMoARcPSD|7239382 https://www.studocu.com/es-mx?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=problemas-cinetica-enzimatica https://www.studocu.com/es-mx/document/universidad-autonoma-de-yucatan/biocatalisis/ejercicios-obligatorios/problemas-cinetica-enzimatica/2988366/view?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=problemas-cinetica-enzimatica https://www.studocu.com/es-mx/course/universidad-autonoma-de-yucatan/biocatalisis/3222295?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=problemas-cinetica-enzimatica https://www.studocu.com/es-mx?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=problemas-cinetica-enzimatica https://www.studocu.com/es-mx/document/universidad-autonoma-de-yucatan/biocatalisis/ejercicios-obligatorios/problemas-cinetica-enzimatica/2988366/view?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=problemas-cinetica-enzimatica https://www.studocu.com/es-mx/course/universidad-autonoma-de-yucatan/biocatalisis/3222295?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=problemas-cinetica-enzimatica UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE YUCATÁN FACULTAD DE INGENIERÍA QUÍMICA LICENCIATURA EN INGENIERÍA EN BIOTECNOLOGÍA SEXTO SEMESTRE BIOCATÁLISIS PROBLEMAS CINÉTICA ENZIMÁTICA Descargado por Meli Chiamba (melaniachiamba@gmail.com) lOMoARcPSD|7239382 https://www.studocu.com/es-mx?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=problemas-cinetica-enzimatica 24 DE ENERO DE 2018 Problemas cinética enzimática 1. Las velocidades iniciales a varias concentraciones de sustrato para una reacción catalizada por un enzima hipotético son: a) ¿Cuál es la velocidad máxima para esta reacción? Haciendo el cálculo mediante el método de Lineweaver-Burke, además de que la velocidad permanece constante a concentraciones de sustrato mayor 5x10-4 M, la velocidad máxima es 0.25 μM/min b) ¿Por qué la velocidad inicial permanece constante a una [S] mayor de 5x10-4 M ¿Cuál es la concentración de enzima libre para una [S] de 5x10-4 M? Esto podría deberse a que el producto es un inhibidor de la enzima o a que el producto se esté reconvirtiendo a sustrato. No hay enzima libre debido a que a esa concentración de sustrato se llega a la velocidad máxima. c) ¿Cuál es la Km de la enzima? Haciendo el cálculo mediante el método de Lineweaver-Burke, la Km es 1.25x10-5 mol/l d) Calcular la velocidad inicial para [S]=1x10-6 y [S]=1x10-1 V 0 = Vm [S ] Km+ [S ] = 0.25 (1 x10−6 ) 1.25x 10 −5+1x 10−6 =0.0185 μmol/min V 0 = 0.25 (1x 10−1) 1.25 x10 −5+1 x10−1 =0.25μmol /min e) Calcular la concentración de producto formado en los cinco primeros minutos de reacción utilizando 10 ml de una disolución de sustrato 2x10-3 M Descargado por Meli Chiamba (melaniachiamba@gmail.com) lOMoARcPSD|7239382 Como a concentraciones de sustrato mayores a 5x10-4 M la velocidad máxima es de 0.25 μmol/min, a 2x10-3 M tenemos dicha velocidad. En 5 min tenemos 1.25 μmol. A 10 ml o a 0.01 l tendríamos una concentración de 125 μmol/ l. 2. Para una enzima con cinética de Michaelis-Menten, determinar la velocidad de reacción, V (como porcentaje de Vmáx), observada a a) [S]=Km; b) [S]=0.5 Km; c) [S]=0.1 Km; d) [S]=2 Km; e) [S]=10 Km V= Vm [S ] Km+ [S ] → V Vm = [S ] Km+ [S ] a) V Vm = Km Km+Km = 1 2 =0.5 b) V Vm = 0.5Km Km+0.5Km = 0.5 1.5 = 1 3 =0.333 c) V Vm = 0.1Km Km+0.1Km = 0.1 1.1 = 1 11 =0.09 d) V Vm = 2Km Km+2Km = 2 3 =0.667 e) V Vm = 10Km Km+10Km = 10 11 =0.9 3. Determine los valores de Km y Vmáx para la descarboxilación de un - cetoácido utilizando los siguientes datos: Concentración de sustrato (M) Velocidad (mM min-1) 2.5 0.588 1 0.500 0.714 0.417 0.526 0.370 0.250 0.256 Eddie Hofstee x (v/[s]) y (v) 0.2352 0.588 0.5 0.5 0.5840336 0.417 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 1 1.1 0 0.2 0.4 0.6 0.8 f(x) = − 0.43 x + 0.69 R² = 0.98 Eddie Hofstee V V /[ S] Descargado por Meli Chiamba (melaniachiamba@gmail.com) lOMoARcPSD|7239382 https://www.studocu.com/es-mx?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=problemas-cinetica-enzimatica 0.7034221 0.37 1.024 0.256 Km 0.4327 M Vm 0.6898 mM Lineweaver-Burke X (1/[S]) Y (1/V) 0.4 1.70068027 1 2 1.4005602 2.39808153 1.9011407 2.7027027 4 3.90625 Km 0.42 Vm 0.68 4. Efecto de la concentración de enzima. En el siguiente experimento con la enzima fosfatasa ácida de semillas de trigo germinadas, se varió la concentración de la enzima a dos concentraciones de sustrato y se obtuvieron los resultados siguientes: 0 0.5 1 1.5 2 2.5 3 3.5 4 4.5 0 1 2 3 4 5 f(x) = 0.62 x + 1.47 R² = 0.99 Lineweaver-Burke 1/V 1 /[ S] 5 10 15 20 25 30 0 5 10 15 20 25 30 35 40 f(x) = 1.93 x + 0.07 f(x) = 6.34 x + 0.24 Efecto de la [enzima] [FP] 0.1 mM Linear ([FP] 0.1 mM) [FP] 10 mM[enz] (microl) V el ( n m o l/ m in ) Descargado por Meli Chiamba (melaniachiamba@gmail.com) lOMoARcPSD|7239382 a) ¿Cómo varia la velocidad de la reacción en función de la cantidad de enzima añadida? De acuerdo con la gráfica, aumenta linealmente con la concentración de enzima. b) ¿Qué pasa si dividimos la velocidad registrada por la cantidad de enzima añadida al ensayo? 5 10 15 20 25 30 0 0.5 1 1.5 Vel vs vel/[enz] [FP] 0.1 mM [FP] 10 mM Vel/[enz] V el ( n m o l/ m in ) Como se puede observar en la gráfica, se obtiene una velocidad constante. c) Utilizando la ecuación de Michaelis-Menten explique sus respuestas a las preguntas anteriores. [enz] ( l) [FP] 0.1 mM [FP] 10 mM Vel (nmol/min) Vel (nmol/min) 5 1.920 6.307 10 4.059 13.169 15 5.956 19.145 20 7.766 25.694 25 9.479 32.282 30 11.844 37.882 Descargado por Meli Chiamba (melaniachiamba@gmail.com) lOMoARcPSD|7239382 https://www.studocu.com/es-mx?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=problemas-cinetica-enzimatica La ecuación de Michaelis-Menten es V= Vm [S ] Km+ [S ] en la cual la velocidad máxima es V m=K cat[EnzT ] y como se observa, la velocidad es proporcional a la velocidad máxima y a su vez, la velocidad máxima es proporcional a la concentración total de enzima añadida, por lo que explica el inciso a). En las dos determinaciones la concentración de sustrato se mantuvo constante, por lo que el resultado en la ecuación obtenida de la división V [Enz ] = K cat [S ] Km+ [S ] es constante y se mantendrá de esta forma mientras la concentración del sustrato no sea modificada. 5. Cinética de una enzima. La actividad de la Acetil-CoA carboxilasa, medida con tres diferentes concentraciones de enzima y a diferentes concentraciones de sustrato fué la siguiente: [Enz] ( g de proteína) 0.1 0.2 0.5 [AcetilCoA] (M) Vel ( mol / min) 0.05 0.275 0.546 1.373 0.14 0.482 1.001 2.502 0.23 0.580 1.185 2.891 0.32 0.642 1.385 3.463 0.50 0.755 1.494 3.656 0.59 0.766 1.497 3.810 a) Calcular para cada experimento el valor de Km y el valor de Vmax. Descargado por Meli Chiamba (melaniachiamba@gmail.com) lOMoARcPSD|7239382 La Vm es proporcional a la cantidad de enz agregada. b) ¿Son los valores de Km y Vmax iguales o diferentes? Los valores de Km son casi iguales y los de Vmax son bastante diferentes. c) Explique si lo que observó es lo que esperaba obtener. Si, se observó lo esperado. Los valores de Km nodeberían diferir debido a que la cantidad de sustrato requerida para ocupar el 50% de los sitios activos sólo depende de la afinidad entre la enzima y el sustrato, lo cual no cambia con la concentración total de enzima. Los valores diferentes de la velocidad máxima son explicados por el aumento de enzima que a su vez aumenta los sitios activos disponibles para el sustrato, lo cual aumenta la velocidad máxima. d) Sabiendo que la enzima pesa 220 000 grs/mol, haga una gráfica de Vmax vs mol de enzima. Enz (μmol) Vmax ( mol/min Eddie-Hofstee 0.1 0.2 0.5 x (v/[s]) y (v) x (v/[s]) y (v) x (v/[s]) y (v) 5.5 0.275 10.92 0.546 27.46 1.373 3.442857143 0.482 7.15 1.001 17.8714286 2.502 2.52173913 0.58 5.15217391 1.185 12.5695652 2.891 2.00625 0.642 4.328125 1.385 10.821875 3.463 1.51 0.755 2.988 1.494 7.312 3.656 1.298305085 0.766 2.53728814 1.497 6.45762712 3.81 Km 0.1171 Km 0.117 1 Km 0.1154 Vm (mM/min) 0.9012 Vm (mM/min) 1.830 4 Vm (mM/min) 4.5355 5 10 15 20 25 30 0 2 4 6 f(x) = − 0.12 x + 4.54 0.5 v/[S] v 5 10 15 20 25 30 0 2 4 6 f(x) = − 0.12 x + 4.54 0.5 v/[S] v 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 0 1 2 f(x) = − 0.12 x + 1.83 0.2 v/[S] v 1 1.5 2 2.5 3 3.5 4 4.5 5 5.5 6 0 0.5 1 f(x) = − 0.12 x + 0.9 0.1 v/[S] v 4.55E-07 9.09E-07 2.27E-06 0 5 Vmax vs enz V max En z (m ic ro m o l) Descargado por Meli Chiamba (melaniachiamba@gmail.com) lOMoARcPSD|7239382 https://www.studocu.com/es-mx?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=problemas-cinetica-enzimatica ) 4.55E-07 0.9012 9.09E-07 1.8304 2.27E-06 4.5355 Microgramos de enzima/ peso molecular de enzima e) ¿Qué representa la pendiente de esta gráfica? Es el cambio de la velocidad máxima con respecto a la concentración de enzima. Descargado por Meli Chiamba (melaniachiamba@gmail.com) lOMoARcPSD|7239382
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