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Cap. 9 Genética de Poblaciones Curso: Genética Prof: Ma. Rosario Castro Muñoz Dpto: Biología Facultad de Ciencias UNALM Un conjunto de individuos de la misma especie que viven en un lugar geográfico determinado (nicho ecológico) y que real o potencialmente son capaces de cruzarse entre sí, compartiendo un acervo común de genes. (poza de genes o “pool” génico). Una población es….. Genética de Poblaciones El objetivo es comprender la composición genética de las Poblaciones y las Fuerzas que determinan y cambian dicha composición La Genética de Poblaciones estudia: • la constitución genética de los individuos que componen las poblaciones (frecuencias génicas y genotípicas). • la transmisión de los genes de una generación a la siguiente (gametos = nexos de unión entre una generación y la siguiente) • Cuantifica la variabilidad mediante la descripción de los cambios de las frecuencias génicas. • Analiza las causas que conducen a estos cambios. Polimorfismo se refiere a la coexistencia de dos o más fenotipos alternos en una misma población o entre poblaciones. A nivel molecular se refiere a coexistencia de patrones de bandas o variantes de ADN. Polimorfismo en el Color del Caparazón de Ligus fasciotus Frecuencias fenotípicas, genotípicas y alélicas o génicas. Locus A: alelos A1 y A2 Genotipos: A1A1 A1A2 A2A2 En codominancia existen 3 genotipos = 3 fenotipos En dominancia completa existen 3 genotipos = 2 fenotipos Frecuencias fenotípicas de una población son…… las proporciones o porcentajes de individuos de cada fenotipo que están presentes en la población. Número de individuos de un fenotipo Número total de individuos Frecuencias genotípicas de una población son las proporciones o porcentajes de individuos de cada genotipo que están presentes en la población Número de individuos de un genotipo Número total de individuos La suma de las frecuencias genotípicas será 1 • En Codominancia: frecuencias fenotípicas = frecuencias genotípicas. • En dominancia: frecuencias fenotípicas =/= frecuencias genotípicas. Ejemplo: • Genotipos Nº de individuos Frecuencias genotípicas A1A1 15 15/50= 0,3 => 30% A1A2 30 30/50= 0,6 => 60 % A2A2 5 5/50 = 0,1 => 10 % Total 50 1 è 100% Transmisión de los genes de una generación a la siguiente se da por los gametos Genotipos Nº de individuos Nº de genes A1 A2 A1A1 30 60 0 A1A2 60 60 60 A2A2 10 0 10 Total 100 120 80 Frecuencias del alelo A1 => 120/200 = 0,6 Frecuencias del alelo A2 => 80 / 200 = 0,4 De forma más general: H R D + H + R = 1 Genotipo N de Individuos Frecuencias Genotípicas A1A1 n1 n1/N = D A1A2 n2 n2/N = D A2A2 n3 n3/N = D Total N 1 = 100 % H R Relación entre frecuencias génicas y frecuencias genotípicas: Genes Frecuencias A1 2n1 + n2 2D + H ---------- = ---------------- = D + ½ H = p 2N 2D+2H+2R A2 2n3 + n2 2R + H ---------- = ---------------- = R + ½ H = q 2N 2D+2H+2R La relación entre la frecuencia génica y la genotípica es por tanto: p = D + ½H y q = R + ½ H Dos poblaciones pueden tener las mismas frecuencias génicas “p” y “q”, pero distintas frecuencias genotípicas. Nº de individuos A1A1 A1A2 A2A2 Total Población 1 48 20 32 100 Población 2 24 68 8 100 Población 1 : D = 0,48 H = 0,20 R = 0,32 p = 0,48 + (1/2) 0,20 = 0,58 (frecuencia génica) q = 0,32 + (1/2) 0,20 = 0,42 (frecuencia génica) Población 2 D = 0,24 H = 0,68 R = 0,08 p = 0,24 + (1/2) 0,68 = 0,58 (frecuencia génica) q = 0,08 + (1/2) 0,68 = 0,42 (frecuencia génica) Ley de Hardy-Weinberg. Equilibrio de poblaciones • “En una población panmíctica, suficientemente grande y no sometida a migración, mutación, deriva génica o selección, las frecuencias génicas y genotípicas se mantienen constantes de generación en generación”. Frecuencias de los Genotipos para alelos del locus del sistema de grupos sanguíneos MN en varias poblaciones humanas Genotipo Frecuencias de Alelos Población MM MN NN p(M) q (N) Esquimal 0.835 0.156 0.009 0.913 0.087 Australiana Aborigen 0.024 0.304 0.672 0.176 0.824 Egipcia 0.278 0.489 0.233 0.523 0.477 Alemana 0.297 0.507 0.196 0.550 0.450 China 0.332 0.486 0.182 0.575 0.425 Nigeriana 0.301 0.495 0.204 0.548 0.452 Fuente: W. C. Boyd . Genetics and the races of Man . D.C. Heath, 1950 Patrones en el Caparazón del Caracol Cepaea nemoralis Frecuencias de caracoles ( Cepaea nemoralis) con distintos colores y patrones de bandas en tres poblaciones de Francia Gel de electroforesis en el que se observan homocigotos para tres alelos diferentes del locus esterasa-5 de Drosophila pseudoobscura Ley de Hardy- Weinberg En una población infinitamente grande en la que los individuos se aparean al azar, las frecuencias génicas y genotípicas se mantienen constantes de generación en generación. • Las frecuencias genotípicas son únicamente determinadas por las frecuencias génicas siempre y cuando no exista mutación, migración o selección que puedan alterar lo antes mencionado Frecuencias del Equilibrio Hardy - Weinberg • Secuencia de flujo génico en tres eventos importantes: • (1) De los individuos de la población a los gametos que producen. • (2) De la unión de los gametos a los zigotes o genotipos a que dan orígen y • (3) De los genotipos de los zigotes a las frecuencias génicas en la generación recientemente formada. E s p e rm a Ovulos Curvas que muestran las proporciones de homocigotos AA (línea azul), heterocigotos Aa (línea verde) en poblaciones con diferentes frecuencias alélicas, si las poblaciones están en equilibrio H-W Ejercicios 1.- En una cierta población, la f(AA) = 0.3, la f(Aa) = 0.4 y la f(aa) = 0.3 Determine p y q. • NOTA: Este gen tiene solo dos alelos, así que las frecuencias genotípicas deben sumar 1. • p = f(A) p = f(AA) + ½ f(Aa) • Por lo tanto p = [0.3 + ½(0.4)] = 0.5 • q puede ser calculado de dos formas diferentes q = f(aa) + ½ F(Aa) = 0.5 ó desde que p + q = 1.0. y p = 0.5: q = 1.0 – p = 0.5 Nota: Si hay solo dos alelos por cada gen, p + q será siempre igual a 1.0 Calculando las frecuencias alélicas a partir de las frecuencias genotípicas, este método trabaja si la población está en equilibrio HW o no 2. Calculando las frecuencias alélicas en una población que se sabe que está en equilbrio Hardy-Weinberg (apareamiento al azar). NOTA: Si una población está en equilibrio H-W, f(aa) = q2 En una población de una especie de roedores el apareamiento es al azar, la frecuencia de estos roedores negros es 0.04. NOTA: el alelo negro (a) es recesivo al wild type (agouti) alelo (A). Determine p y q. • El punto clave en este problema es que ya se sabe de antemano que el apareamiento es al azar. Esto significa que la ecuación H-W se aplica a las frecuencias genotípicas en la población, y por lo tanto la frecuencia de estos roedores negros es igual a q2. Tu puedes no asumir esto, a menos que tu sepas que la población está en equilibrio H-W. • f(negros) = f(bb) = q2 = 0.04 • Por lo tanto q = raíz cuadrada de 0.4 = 0.2 • Desde que p + q = 1.0. p = 1 – q = 0.8 3.Determinando si una población está en equilibrio Hardy- Weinberg Refiriendonos al primer ejemplo : f(AA) = 0.3; f(Aa) = 0.4; f(aa) = 0.3 • Usando la técnica básica para calcular p y q para una población, si la población está o no en equilbrio, nosotros calculamos que p = 0.5 y q = 0.5. • Basados simplemente en las actuales frecuencias genotípicas en la población. • Ahora la pregunta es….. ¿Está la población en equilibrio H-W? • Si es así, entónces f(AA) debería ser igual a p2, f(Aa) debería ser igual a 2pq y f(aa) debería ser igual a q2. • p = 0.5 y q = 0.5, • así p2 = 0.25, 2pq = 0.5 y q2 = 0.25. Estos números no son obviamente los mismos que 0.3, 0,4 and 0.3,respectivamente, así que concluímos que la población no está en equilibrio H-W. Para comprobar si una población se encuentra en equilibrio H- W, se deben seguir los siguientes pasos: • Calcular las frecuencias génicas “p” y “q”, a partir de las frecuencias genotípicas observadas. • Calcular las frecuencias genotípicas esperadas, en el caso de equilibrio, es decir, en el caso de que se cumple la ley de H-W. • Convertir las frecuencias genotípicas esperadas a valores esperados basados en el tamaño de la muestra. (p2N, 2pqN, q2N; siendo N = tamaño de la muestra). • Realizar una prueba de X2. IMPORTANTE: • La prueba de chi-cuadrado no se realiza con proporciones o porcentajes. • Los grados de libertad no son (nº fenotipos – 1), hay que considerar también el nº de alelos de manera que el nº combinado de grados de libertad es: • (k-1) – (r-1) = k - r • k = nº fenotipos ó genotipos • r = nº alelos 3. Determinando si una población está en equilibrio Hardy-Weinberg • Refiriendonos al primer ejemplo : F(AA) = 0.3; f(Aa) = 0.4; f(aa) = 0.3 • Usando la técnica básica para calcular p y q para una población, si la población está o no en equilbrio, nosotros calculamos que p = 0.5 y q = 0.5. • Basados simplemente en las actuales frecuencias genotípicas en la población. • Ahora la pregunta es….. Está la población en equilibrio H-W? • Si es así, entónces f(AA) debería ser igual a p2, • f(Aa) debería ser igual a 2pq y • f(aa) debería ser igual a q2. • p = 0.5 y q = 0.5, • Así las frecuencias fenotípicas esperadas serían: • p2 = 0.25, 2pq = 0.5 y q2 = 0.25. Buscamos en la tabla con k-r grados de libertad. Donde K = 3 fenotipos y r = 2 alelos gl = 1 X2 tab= 3.84 No hay diferencias significativas entre los valores observados con los esperados. Entónces la población está en equilibrio. Genotipo Observados Esperados AA 0.3 0.25 Aa 0.4 0.5 Aa 0.3 0.25 Totales 1 1 4.- En una población grande de Mimulus guttatus una hoja fué muestreada de un gran número de plantas. Las hojas fueron aplastadas y corridas en un gel de electroforesis. • El gel fue después teñido con una enzima específica X. 6 diferentes patrones de bandas fueron observados mostrando las siguientes frecuencias. 1 2 3 4 5 6 ______ ______ _______ _______ _______ ______ ________ _______ ______ 0.04 0.09 0.25 0.12 0.20 0.30 a.- Asumiendo que estos patrones son producidos por un locus simple, proponga una explicación genética para los 6 tipos. b.- ¿Cómo puede probar su idea? c.- ¿Cuáles son las frecuencias en esta población? d.- ¿Está la población en equilibrio Hardy y Weinberg? a.- Una inspección del gel revela que hay solo 3 posiciones de bandas , las llamaremos lenta, intermedia y rápida. Más aún, un individuo puede mostrar una banda o dos. La explicación más simple para esto es que hay tres alelos de un locus (llamamémosle Al, Ai y Ar) y que los individuos con 2 bandas son heterocigotas. Así: 1 = AlAl 2= AiAi 3 =ArAr 4= AlAi 5 = AlAr y 6 = AiAr Solución b.- la hipótesis puede ser probada haciendo cruzamientos. Por ejemplo autopolinizando el tipo 5, podemos predecir ¼AlAl, ½ AlAr y ¼ ArAr c.- Las frecuencias pueden ser calculadas por simple extensión de las fórmulas de 2 alelos. Así: • f(Al) = 0.04 + ½ (0.12) + ½ (0.20) = 0.20 • f(Ai) = 0.09 + ½ (0.12) + ½ (0.30) = 0.30 • f(Ar) = 0.25 + ½ (0.20) + ½ (0.30) = 0.50 d.- Las frecuencias genotípicas de HW son: (p+q+r)2 = p2 +q2+ r2+2pq+2pr+2qr = 0.04+0.09+0.25+0.12+0.20+0.30 Que son precisamente las frecuencias observadas, así que la población está en equilibrio H-W. Los siguientes tipos sanguíneos MN fueron obtenidos de poblaciones totalmente aisladas de las villas de América del norte y en villas aisladas de América central Grupo Tamaño poblacional M MN N Indios América Central 86 53 29 4 Indios América del Norte 278 78 61 139 Calcule las frecuencias alélicas para M y N en ambas poblaciones. Liste sus resultados en forma tabular. Discuta las posibles razones para las diferencias en la frecuencia de alelos en las dos poblaciones (Como práctica adicional determine si la población está en equilibrio) América Central: • Frecuencia de M = 2(53) +29 = 0.78 2(86) • Frecuencia de N = 2(4) + 29 = 0.22 2(86) América del Norte: • Frecuencia de M = 2(78) + 61 = 0.39 2(278) • Frecuencia de N = 2(139) + 61 = 0.61 2(278) ¿Cuales son las frecuencias de los alelos A y a en la población de abajo?. ¿Cuál es el alelo recesivo? 3. Un grupo de estudiantes universitarios fueron invitados para degustar PTC. Como resultado de esta degustación, 149 individuos resultaron probadores y 63 fueron no probadores Calcule las frecuencias alélicas T y t. • Frecuencia de t = √ 63 = 0.55 212 • Frecuencia T = 1 – frecuencia t T = 0.45 Entre 798 estudiantes, 70.2 porciento fueron probadores. • A) ¿Qué proporción de los estudiantes fueron TT, Tt, and tt? • B) ¿Qué proporción de probadores quienes se casan con no probadores podría esperarse que solo tengan hijos probadores en sus familias? • C) ¿Qué proporción podrían esperar tener algunos hijos no probadores? a) 29.8% fueron no probadores , por lo tanto, la frecuencia de t = 0.298 = 0.55 • Frecuencia T = 1 – 0.55 = 0.45 • Frecuencia TT = 0.452 = 0.20 or 20% • Frecuencia tt = 0.552 = 0.30 or 30% • Frecuencia Tt = 2(0.55)(0.45) = 50% b) .20/.70 = 29% c) .50/.70 = 71% Se puede perder el equilibrio HW si: Si tenemos por ejemplo una población de plantas que solo se autopolinizan, habrá una disminución paulatina de los genotipos heterocigotas El flujo génico Es el paso y establecimiento de los genes característicos de una población en el acervo genético de otra mediante la hibridación y el retrocruzamientos naturales o artificiales. La población Y tiene una frecuencia mayor del alelo a (q = 0.90). Los insectos polinizadores que visiten esa población transportarán más copias del alelo ‘a’ cuando viajen a otra población X. El efecto resultante del flujo génico se observa en las generaciones posteriores de la población X como un aumento de la frecuencia del alelo migratorio a. Cambios de frecuencias del alelo A → a debido a mutaciones El efecto Cuello de Botella Cuando una población o especie ha sufrido un drástico descenso en el número de miembros en algún momento del pasado, llegando en algunos casos a estar al borde de la extinción. Como consecuencia se homogeneiza la población. Es decir, se halla poca variabilidad y algunas características se hacen iguales y negativas al ambiente. Cuellos de botella artificiales Afecta o ha afectado a multitud de especies y poblaciones en tiempos recientes. Dado que en el caso de la persecución humana se persigue a todos por igual, los descensos de población son aún más rápidos que en los cuellos de botella naturales y no llevan parejos una selección marcada de los caracteres de los mismos. Ejemplos en los que la diversidad genética en estos animales es reducidísima. 1. elefante marino del norte (150 000 ejemplares descendientes de solo 20 cuando se prohibió su caza en 1884), 2. el bisonte europeo (3600 descendientes de 12), 3. el bisonte americano (370 000 de 750), 4. el hámster sirio y 5. las tortugas gigantes de las Islas Galápagos. https://es.wikipedia.org/wiki/Elefante_marino https://es.wikipedia.org/wiki/1884 https://es.wikipedia.org/wiki/Bisonte_europeo https://es.wikipedia.org/wiki/Bisonte_americano https://es.wikipedia.org/wiki/H%C3%A1mster https://es.wikipedia.org/wiki/Tortuga_gigante https://es.wikipedia.org/wiki/Islas_Gal%C3%A1pagos Cuellos de botella y evolución humana Las catástrofes naturales y cósmicas también pueden causar extinciones y cuellos de botella, a las que no escapa ni siquiera la especie humana. De acuerdo con la moderna teoría de la catástrofe de Toba, la macroerupción del supervolcánToba, en Indonesia, hoy reducido a un lago de cráter y que se calcula que tuvo una potencia superior en 3000 veces a la del monte Santa Helena, hizo disminuir la población humana mundial hasta unos pocos miles de individuos hace 75 000 años. https://es.wikipedia.org/wiki/Teor%C3%ADa_de_la_cat%C3%A1strofe_de_Toba https://es.wikipedia.org/wiki/Supervolc%C3%A1n https://es.wikipedia.org/wiki/Lago_Toba https://es.wikipedia.org/wiki/Indonesia https://es.wikipedia.org/wiki/Lago_de_cr%C3%A1ter https://es.wikipedia.org/wiki/Monte_Santa_Helena En la misma época, muchas otras especies sufrieron también un descenso variable en su población. Los humanos no somos inmunes a los cuellos de botella, y el del Toba no ha sido el único que Homo sapiens sufrió a lo largo de su historia. Durante la Edad Media, la peste negra redujo un tercio la población europea de la época. Otro tanto le pasó a la de Islandia durante una gran erupción del Laki en 1783 (unida a pestes y hambrunas), que acabó con el 20 % de la población y aumentó la frecuencia de enfermedades genéticas entre los habitantes. https://es.wikipedia.org/wiki/Homo_sapiens https://es.wikipedia.org/wiki/Edad_Media https://es.wikipedia.org/wiki/Peste_negra https://es.wikipedia.org/wiki/Islandia https://es.wikipedia.org/wiki/Laki https://es.wikipedia.org/wiki/1783
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