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Teoría de Genética Cuantitativa ¿Qué es la variación fenotípica cuantitativa? Cualquier carácter fenotípico (morfológico, fisiológico, conductual) que toma distintos valores cuantificables en diferentes individuos y no sigue una patrón de herencia mendeliana simple es un carácter cuantitativo •variación continua (altura, peso, C.I., tasa metabólica, producción lechera,...) •variación discreta •Meristicas (número de quetas o facetas en Drosophila, vértebras en serpientes, bandas en caracoles, plumas en aves, escamas en peces...). •Umbral (resistencia) Variación cuantitativa vs mendeliana (o cualitativa) Caracteres cualitativos mendelianos Distribución de la altura de varones adultos de Boston Variación ambiental Altura planta aa Plantas enanas AA Plantas altas Altura planta aa AA aa AA aa AA Altura planta Sin variación ambiental Alguna variación ambiental Mucha variación ambiental F re cu e nc ia Planta guisante Maíz P F1 F2 Altura planta Altura planta Altura planta Altas 3/4 Enanas 1/4 Enanas X altas F1 X F1 = Altas X altas Longitud de la mazorca Gama completa Cortas X largas F1 X F1 Longitud de la mazorca Longitud de la mazorca Variación mendeliana vs cuantitativa F re cu e nc ia F re cu e nc ia F re cu e nc ia Preguntas qué trata de responder la genética cuantitativa •¿Qué parte de la variación fenotípica de un carácter cuantitativo se debe a diferencias genética entre los individuos y qué parte a diferencias en el ambiente? •¿Qué parte de la variación fenotípica puede ser seleccionada por un mejorador o por la selección natural? •¿Cuántos genes o loci influyen sobre el carácter? •¿Cómo se distribuyen los loci por el genoma? •¿Qué efecto tienen los loci y como interactúan entre sí? 7 Dr. Antonio Barbadilla 7 Dr. Antonio Barbadilla http://biologia.uab.es/dgm/cv/barbadilla prados.asp http://biologia.uab.es/dgm/cv/barbadilla prados.asp 8 Dr. Antonio Barbadilla 8 Dr. Antonio Barbadilla http://biologia.uab.es/dgm/cv/barbadilla prados.asp http://biologia.uab.es/dgm/cv/barbadilla prados.asp Supongamos control del carácter por dos genes idénticos con dos alelos cada uno, sin dominancia, y donde la intensidad del color rojo depende del número de alelos mayúsculas (que son los que producen el pigmento rojo) Rojo X Blanco AABB aabb Color intermedio (Rojo medio) AaBb Rojo oscuro: Rojo medio oscuro : Rojo medio : Rojo claro : Blanco AABB AaBB AaBb Aabb aabb AABb Aabb aaBb aaBB 1: 4 : 6: 4 : 1 P F1 F2 Mismo supuesto anterior pero con tres genes Rojo X Blanco AABBCC aabbcc Color intermedio X Color intermedio (autofecundación) P F1 F2 •Fenotipo Rojo -------------> Blanco •Número alelos que dan color 6 : 5 : 4 : 3 : 2 : 1 : 0 •Proporción 1 : 6 : 15 : 20 : 15 : 6 : 1 AaBbCc AaBbCc Supuestos: los genes segregan independientemente y sus efectos son aditivos 11 Dr. Antonio Barbadilla 11 Dr. Antonio Barbadilla Edward East Estudios estadisticos Longitud de corola flor de tabaco http://biologia.uab.es/dgm/cv/barbadilla prados.asp http://biologia.uab.es/dgm/cv/barbadilla prados.asp 12 Dr. Antonio Barbadilla 12 Dr. Antonio Barbadilla Caracter cualitativo Cuanitativo Clases fenotipicas discretas Clases fenotipicas continuas Variacion discontinua Diferencias de grado (variable (diferencia de clases) continua o discreta) Efecto de un solo gen Varios genes Quantitative Trait Loci(QTL) o pocos genes Genes mayores Genes menores Conteo directo Estimadores poblacionales estadisticos (X, varianza, corr) Analisis individual Analisis poblacional Casi sin efecto ambiental Importante efecto ambiental Efectos individuales de Efectos individuales de genes discernibles genes indiscernibles http://biologia.uab.es/dgm/cv/barbadilla prados.asp http://biologia.uab.es/dgm/cv/barbadilla prados.asp P F1 F2 AABBCC aabbcc F re cu e nc ia e n % 20 15 6 1 1 6 15 AaBbCc 1/64 1/4n n=3 14 Dr. Antonio Barbadilla 14 Dr. Antonio Barbadilla POLIGENES SEGREGAN INDEPENDIENTEMENTE (si no están ligados) Dentro de un gen pueden existir RELACIONES DE DOMINANCIA Entre genes puede existir EPISTASIS Principios mendelianos http://biologia.uab.es/dgm/cv/barbadilla prados.asp http://biologia.uab.es/dgm/cv/barbadilla prados.asp MODELOS DE HERENCIA CARACTERES CUANTITATIVOS “Que aporte realiza cada uno de estos genes en la definicion de un determinado fenotipo? MODELO ADITIVO: Cada gen representado por 2 alelos “activo’, “no activo” Todos contribuyen con un efecto equivalente y aditivo MODELO NO ADITIVO: Los genes contribuyen en forma desigual al efecto fenotipico local Ej. Dominancia Multiplicativo, etc 16 Dr. Antonio Barbadilla 16 Dr. Antonio Barbadilla ¿Qué aporte realiza cada uno de los QTLs al carácter? MODELOS ADITIVO NO ADITIVO Ej. Efecto de aditividad en los poligenes para tamaño de mazorca AABB=4 aabb=8 AaBb=4 Efecto de dominancia http://biologia.uab.es/dgm/cv/barbadilla prados.asp http://biologia.uab.es/dgm/cv/barbadilla prados.asp 17 Dr. Antonio Barbadilla 17 Dr. Antonio Barbadilla Caracteres de distribución continua Imposible medir los efectos individuales de cada locus. Imposible estimar frecuencias génicas ni genotípicas. Cómo realizamos el análisis genético? http://biologia.uab.es/dgm/cv/barbadilla prados.asp http://biologia.uab.es/dgm/cv/barbadilla prados.asp http://i167.photobucket.com/albums/u158/reym7/interrogacion.gif 18 Dr. Antonio Barbadilla 18 Dr. Antonio Barbadilla Variación continua genotipo + ambiente HEREDABILIDAD (H2) Proporción de la variación fenotípica total debido a diferencias genéticas http://biologia.uab.es/dgm/cv/barbadilla prados.asp http://biologia.uab.es/dgm/cv/barbadilla prados.asp Experimentos de selección artificial para la determinación de la heredabilidad de un carácter cuantitativo Cruce entre individuos con valores fenotípicos extremos (mismo ambiente) Heredabilidad=0 Heredabilidad≠0 Generación parental Media Maa MAA MAa aa Aa AA Componente genético y ambiental de la varianza fenotipica de un carácter El valor fenotípico de un carácter en un individuo de la población depende de su genotipo y de su ambiente F: valor fenotípico de un individuo G: efecto medio del genotipo A: efecto del ambiente F = G + A Varianza fenotípica en la población: Var (F) = Var (G + A) = Var (G) + Var (A) + Var (G,A) Si Var (G,A) = 0, entonces Var (F) = Var (G) + Var (A) ó 2F = 2G + 2A o VF = VG + VA Definiciones de heredabilidad para un carácter cuantitativo •Heredabilidad en sentido amplio •Heredabilidad en sentido estricto H2 = VG / V F 0 H2 1 h2 = V Ad / V F 0 h2 1 VG = VAd + VD + VI Ad: efecto aditivo de los alelos que forman el genotipo D: efecto no aditivo (o dominante) de los alelos que forman el genotipo h2 H2 22 Dr. Antonio Barbadilla 22 Dr. Antonio Barbadilla Experimentos de selección artificial para la determinación de la heredabilidad de un carácter cuantitativo Cruce entre individuos con valores fenotípicos extremos (mismo ambiente) X0 Media parental Xs Media selectos X1 Media en la progenie S= XS- X0 R = s. h2 R= X1- X0 Generación parental Media xs x0 x1 S x0 R http://biologia.uab.es/dgm/cv/barbadillaprados.asp http://biologia.uab.es/dgm/cv/barbadilla prados.asp 23 Dr. Antonio Barbadilla 23 Dr. Antonio Barbadilla Métodos para el recuento y cartografía de loci cuantitativos (QTLs) •Cruce de líneas seleccionadas artificalmente (James Crow 1957) •Ejemplo: resistencia al DDT en Drosophila melanogaster. Se demuestra que hay genes que contribuyen a la resistencia en todos los cromosomas •Estudios de ligamiento molecular (nueva frontera genética) •Líneas divergentes para distintos marcadores moleculares. Si hay muchos marcadores polimórficos (como secuencias microsatélites), se incrementa la probabilidad de detectar QTLs ligados. http://biologia.uab.es/dgm/cv/barbadilla prados.asp http://biologia.uab.es/dgm/cv/barbadilla prados.asp
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