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Trabajo Práctico N°6: Metabolismo de Aminoácidos 1 ¿Por qué es necesario eliminar el amoníaco del organismo? Describas las diferentes formas de excreción del nitrógeno de las diferentes especies animales. En el catabolismo de productos protéicos, se producen residuos ricos en grupos amino que deben ser expulsados al exterior dada su potencialidad tóxica. Estos pueden transformarse en amoniaco, que es muy afín por el agua y muy tóxico. Para limpiarlo se debe eliminar disuelto en agua; y para ello se transforma en urea, de forma que se pueda eliminar sin necesidad de expulsar tanta agua para disolverlo. Un animal es amoniotélico cuando elimina sus productos de desecho en forma de amoniaco. Pero existen otros productos químicos nitrogenados que pueden servir de sistema de excreción. Así, a los que lo eliminan en forma de urea se les llama urotélicos. Algunos animales no se pueden permitir perder el agua que se requiere para eliminar urea pueden transformarla en ácido úrico que cristaliza. Es la excreción uricotélica. La presentan algunos artrópodos, como arácnidos. Otros seres vivos, como algunos grupos de arácnidos, pueden eliminar el nitrógeno en forma de guanina. 2 ¿Cuántos moles de ATP se requieren para una ronda del ciclo de la urea? ¿Dónde se utilizan estos ATP? Explique cómo la célula reduce el costo energético global del ciclo de la urea. Se requieren 3 ATP: 2 ATP para formar el carbamoil-P y un ATP para producir argininosuccinato. La conexión entre el ciclo de la urea y el de los ácidos tricarboxílicos, reduce el coste energético de la síntesis de urea. El ciclo de la urea conlleva la conversión de oxalacetato en fumarato y la posterior conversión del fumarato hasta oxalacetato producirá un NADH, que podrá generar 3 ATP en la respiración mitocondrial, lo que reduce el coste de la síntesis de urea. 3 Describa la conexión del ciclo de la urea con otros ciclos metabólicos. ¿Qué aminoácidos en el ciclo de la urea se relacionan con el ciclo de Krebs? Mostrar cómo se producen estos enlaces. Hay una conexión entre los ciclos de la urea y de Krebs. El fumarato producido en la reacción de la argininosuccinato liasa, ingresa a la mitocondria, donde es blanco de la fumarasa y malato deshidrogenasa para formar oxalacetato. El aspartato que actúa como dador de N en el ciclo de la urea se forma a partir del oxalacetato por transaminación desde el glutamato. Dado que las reacciones de los dos ciclos están interconectados se les ha denominado como doble ciclo de Krebs. 4 El gráfico adjunto muestra la concentración de varios aminoácidos libres en plantas adaptadas a la luz y adaptadas a la oscuridad. a) De los aminoácidos mostrados, ¿cuáles son los más afectados por la adaptación luz-oscuridad? b) Sugiera una posible explicación bioquímica para las diferencias observadas. c) El espárrago blanco, considerado una delicia gastronómica, es el resultado de cultivar las plantas del espárrago en la oscuridad. ¿Cuál es el compuesto químico que, en su opinión, intensifica el sabor del espárrago blanco? a) Los más afectados son Asn (asparagina) y Gln (glutamina). b) Los aminoácidos pueden haber sufrido una mutación. O puede haber ocurrido que, como la luminosidad es un factor de stress, puede ter alterado alguna ruta metabólica o desnaturalizado algún aminoácido. c) Asparagina, porque es el aminoácido más adaptado a la obscuridad. 5 Indique, para cada una de las afirmaciones siguientes, si es verdadera o falsa, y explique brevemente su respuesta. (a) En general, la oxidación metabólica de las proteínas en los mamíferos es menos eficaz, en cuanto a conservación de energía, que la oxidación metabólica de los hidratos de carbono o de las grasas. (b) La arginina es un aminoácido no esencial para los mamíferos, debido a que las enzimas de la síntesis de arginina son abundantes en el hígado. (c) La alanina es un aminoácido esencial puesto que forma parte de todas las proteínas a) Verdadera b) Falsa - La arginina es un aminoácido condicionalmente esencial, ya que en condiciones normales el cuerpo humano es capaz de sintetizarlo en los riñones a partir de la citrulina, que proviene del metabolismo de la glutamina en el intestino. c) Falsa – La alanina es no esencial. 6 A los pocos días de haber comenzado el ayuno, la excreción de nitrógeno se acelera, alcanzando niveles más altos de lo normal. A las pocas semanas, la velocidad de eliminación de nitrógeno disminuye hasta niveles más bajos y continúa con esta velocidad reducida. Sin embargo, una vez agotadas las reservas de grasa, la excreción de nitrógeno alcanza valores elevados. a) ¿Qué sucesos desencadenan la intensa excreción de nitrógeno inicial? b) Explique el incremento de la excreción de nitrógeno una vez agotadas las reservas de grasa. En ayuno, la degradación proteica es más intensa que su incorporación, y la excreción de nitrógeno se eleva. En el caso de ayuno prolongado, se intensificará la degradación de las proteínas musculares, ya que las cadenas de carbono de estos aminoácidos se utilizarán en la neoglicogénesis; y la eliminación de los grupos amino restantes aumentará la excreción de urea. 7 Dado el siguiente gráfico en donde el eje x representa el número de pasos en la ruta metabólica para la biosíntesis y el eje y representa el número de aminoácidos ¿qué puede concluir respecto a que los seres humanos puedan sintetizar algunos aminoácidos, mientras que otros deban ingerirlos en la dieta? Los aminoácidos esenciales necesitan de más pasos en la ruta metabólica para su biosíntesis, luego son largas y energéticamente custosas. Es más fácil obtener estos aminoácidos esenciales por la dieta.
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